Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_08s0040g01170.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:8:12172198:12190752:-1 gene:VIT_08s0040g01170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCAGTCTGCCCGGGAAATTCCTTCTTGCATGGAAATTTTCTTCATATTATCAGCAGG
AGAGGTAGAGGTTATGAGTATACAGAAGAAGTATGCCCTTGGAGAAGACAAATGAGGAAT
GTGTCACGGGGGGATTTCTTAAATCGTACACCTGCAAACATGAGTAGAAATCATAGAGTA
TTTCGAAGTGTTCCTGATGCTTGTTATTTGACAGATCGTCCTTATAGCTCCCATTGCAAT
GATGAATGCACAAGGGATAATAAGTTGCTAAGAAGTATGCCAGGATTTGTGAAGATTGTG
GAAGTTGGTCCCAGAGATGGATTGCAAAATGAGAAGGACATTGTGCCTACTGTTGTAAAG
GTTGAGCTGATTAAGATGCTAGTTTCTTCAGGATTGCCTATTGTAGAGGCTACAAGTTTT
GTCTCACCAAAATGGGTGCCACAGCTAGCAGATGCAAAGGATGTAATGGAAGCCATTCGA
ACTGTTGAAGGTGGTAGATTTCCTGTGTTGACACCTAATCTTAAAGGCTTTGAAGCAGCT
GTTGCAGCTGGAGCTAAGGAAGTGGCCATCTTTGCCTCTGCTTCTGAGTCATTTTCAAAG
TCAAACATCAATTGTAGCATTGAAGATAGTCTCACTCGTTACCGTGATGTTGCTCTTGCT
GCTAGAAAGCTCTCAATCCCTGTTCGTGGATACATATCGTGCGTTGTGGGTTGTCCACTG
GAAGGAGTAGTATCTCCATCAAAAGTAACATATGTGGGTAAAGAACTTTATGATATGGGT
TGCTATGAAATTTCCCTTGGCGATACTATTGGTGTTGGTACTCCTGGTACTGTCATTCCA
ATGCTTGAAGATGTTATTGATGTTGTTCCTATTGATAAGCTTGCCGTCCATTTTCACGAT
ACTTATGGGCAGGCTCTTTCAAATATTCTAGCATCACTCCAAATGGGGATCACCACAGTG
GATTCATCAGTATCTGGTCTTGGGGGCTGCCCATATGCTAAAGGTGCTTCTGGGAATGTT
GCGACTGAGGATGTTGTTTACATGCTAAATGGACTCGGGGTGAAGACAAATGTGGATCTT
GGGAAGCTCATGTTGGCTGGGGATTTCATCTGTCAGCATTTGGGACGACAATCTGGTTCA
AAGACAGCAATTGCCTTGAGTAGAATCAGAGGTCATGCCTCCAAGCTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_08s0040g01170.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:8:12172198:12190752:-1 gene:VIT_08s0040g01170 transcript:VIT_08s0040g01170.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MAVCPGNSFLHGNFLHIISRRGRGYEYTEEVCPWRRQMRNVSRGDFLNRTPANMSRNHRV
FRSVPDACYLTDRPYSSHCNDECTRDNKLLRSMPGFVKIVEVGPRDGLQNEKDIVPTVVK
VELIKMLVSSGLPIVEATSFVSPKWVPQLADAKDVMEAIRTVEGGRFPVLTPNLKGFEAA
VAAGAKEVAIFASASESFSKSNINCSIEDSLTRYRDVALAARKLSIPVRGYISCVVGCPL
EGVVSPSKVTYVGKELYDMGCYEISLGDTIGVGTPGTVIPMLEDVIDVVPIDKLAVHFHD
TYGQALSNILASLQMGITTVDSSVSGLGGCPYAKGASGNVATEDVVYMLNGLGVKTNVDL
GKLMLAGDFICQHLGRQSGSKTAIALSRIRGHASKL

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_08s0040g01170.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:8:12172198:12190752:-1 gene:VIT_08s0040g01170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

CTTTTGTATAGTGAGTTGATTTGGGAAGGCAAAGTTCCCTGAAAACTAAAGAAATGAGTG
GTTGGTAACTTGAGAAAAGGATGATACCAATATCAATCCTAAGGTTCTTTGGATGCTATA
GAACACTTACTCTTGATTGGTGTGCCATGTGTAGAGTGAATAAGGAGACAATGGGTATTC
ATTTCCCTTTATCTTAAGAGTTATGGCAGTCTGCCCGGGAAATTCCTTCTTGCATGGAAA
TTTTCTTCATATTATCAGCAGGAGAGGTAGAGGTTATGAGTATACAGAAGAAGTATGCCC
TTGGAGAAGACAAATGAGGAATGTGTCACGGGGGGATTTCTTAAATCGTACACCTGCAAA
CATGAGTAGAAATCATAGAGTATTTCGAAGTGTTCCTGATGCTTGTTATTTGACAGATCG
TCCTTATAGCTCCCATTGCAATGATGAATGCACAAGGGATAATAAGTTGCTAAGAAGTAT
GCCAGGATTTGTGAAGATTGTGGAAGTTGGTCCCAGAGATGGATTGCAAAATGAGAAGGA
CATTGTGCCTACTGTTGTAAAGGTTGAGCTGATTAAGATGCTAGTTTCTTCAGGATTGCC
TATTGTAGAGGCTACAAGTTTTGTCTCACCAAAATGGGTGCCACAGCTAGCAGATGCAAA
GGATGTAATGGAAGCCATTCGAACTGTTGAAGGTGGTAGATTTCCTGTGTTGACACCTAA
TCTTAAAGGCTTTGAAGCAGCTGTTGCAGCTGGAGCTAAGGAAGTGGCCATCTTTGCCTC
TGCTTCTGAGTCATTTTCAAAGTCAAACATCAATTGTAGCATTGAAGATAGTCTCACTCG
TTACCGTGATGTTGCTCTTGCTGCTAGAAAGCTCTCAATCCCTGTTCGTGGATACATATC
GTGCGTTGTGGGTTGTCCACTGGAAGGAGTAGTATCTCCATCAAAAGTAACATATGTGGG
TAAAGAACTTTATGATATGGGTTGCTATGAAATTTCCCTTGGCGATACTATTGGTGTTGG
TACTCCTGGTACTGTCATTCCAATGCTTGAAGATGTTATTGATGTTGTTCCTATTGATAA
GCTTGCCGTCCATTTTCACGATACTTATGGGCAGGCTCTTTCAAATATTCTAGCATCACT
CCAAATGGGGATCACCACAGTGGATTCATCAGTATCTGGTCTTGGGGGCTGCCCATATGC
TAAAGGTGCTTCTGGGAATGTTGCGACTGAGGATGTTGTTTACATGCTAAATGGACTCGG
GGTGAAGACAAATGTGGATCTTGGGAAGCTCATGTTGGCTGGGGATTTCATCTGTCAGCA
TTTGGGACGACAATCTGGTTCAAAGACAGCAATTGCCTTGAGTAGAATCAGAGGTCATGC
CTCCAAGCTATGAGGTACAGGAGGGTAGATCATCTTATATCCCACCCATTGGAATTTTGA
GCATTGATCATCTGAAATTTTTAAATCACCCCTTGAAGAGAATGACTGTGCACAAGCCAC
AAGTTGTGGTGTTATCTTAGTTTTACTATTGCATTGTGTGTTTCCTGTTGCGTTCCATGC
GTTTGTGCCAGGAACAATACCATCAGAGTCCATTTTTGGCTGAACCAAAGTGATGCTCCC
GAATTGTAA