Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0040g00270.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:11213199:11217147:-1 gene:VIT_08s0040g00270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGTCTATAGATCCGGAGATAGCGAGGACACAGGAAGAGAGGAAGAAGATGGAGCAA CAGCTCTCGTCCCTCACATCCGTTAATTATGATCCTGAGCTCTACGGCGGGACCAATAAA TTTGAAGACTACGTGAGTTCCATCCCTGTGAACGATGAGGAAGAGAATGTGGACGCCATG GATCCTGGATTGGGGAGGAGGCTGCCGTCTTATACTGCTCCGGCGTCTTTGCTGAAGGAG ATGCCCAGAGGCGGTGTGGAGGAAGACGACATGGGCTTTAAGAAGCCGCAGAGAATTATC GATCGCGAGGATGATTATAGGAGGAGGAGGTTGAATCGGGTTATATCGCCGGACCGGCAT GATGCCTTTGCGTCTGGGGATAAAACTCCCGATGTGTCGGTGAGGACGTATGCGGATGTG ATGAGGGAGGAGGCGTTGAAGAGGGAGAAGGAGGAGACTTTGAAGGCGATTGCCAAGAAG AAGAAGGAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGCAGGAGAAGGAAACTGGTGGTGGTGCTGTGCAG CAGCCGACGCAGAAGAGGAGGAACAGGTGGGACCAGTCGCAGGATGATGGAAGTGCCAAG AAGGCAAAGACAGGTTCGGATTGGGATTTGCCGGATTCAACTCCTGGGATTGGGAGGTGG GATGCGACTCCGACTCCGGGGAGGGTGGCTGATGCTACTCCCTCGATTTCTAGGAGGAAT AGGTGGGATGAGACTCCAACACCTGGTCGGTTGGCTGATGCGGATGCGACCCCAGCTGCT GGTGGGGCGACCCCAGGTGCAACCCCCGCTGGGATGACTTGGGATGCCACTCCTAAGCTG GCAGGCCTTGCAACTCCCACTCCGAAGAGGCAGAGATCAAGGTGGGATGAGACTCCAGCA ACTATGGGAAGTGCCACACCAATGGCTGGTGCTACACCTGCTGCTGCATACACGCCTGGT GTGACTCCTGTTGGTGGGGTTGAACTTGCCACGCCAACACCATCAGCAATTAATTTACGT GGTGCAATTACTCCGGAACAGTATAACTTGCTGAGGTGGGAGAAAGACATTGAAGAGAGG AATAGACCATTGACTGATGAAGAGCTTGATGCGATGTTTCCACAAGAGGGTTACAAGATT TTGGATCCACCACCATCCTATGTTCCTATTAGAACACCTGCAAGAAAGCTTCTTGCAACC CCAACTCCTTTGGGGACCCCATTGTATGCAATTCCAGAAGAGAATCGTGGGCAGCAATTT GATGTTCCAAAGGAAGCACCCGGTGGGTTGCCCTTCATGAAGCCAGAGGATTATCAGTAT TTTGGGGCATTATTGAATGATGAAGATGAGGAAGAGTTGTCTCCTGAAGAACAGAAAGAG CGAAAGATCATGAAGCTTTTACTTAAGGTGAAGAATGGGACACCTCCACAGAGGAAGACA GCTTTGAGACAGCTCACTGATAAAGCTAGAGAGTTTGGTGCAGGACCTTTGTTCAACAGA ATTTTGCCATTGCTCATGCAACCCACATTGGAAGATCAAGAGAGACACCTTCTGGTTAAG GTCATTGATAGGGTGCTTTATAAGTTGGATGAATTGGTTCGACCTTTTGTGCACAAGATA CTTGTGGTGATTGAACCTCTTTTGATTGATGAAGATTACTATGCACGTGTGGAGGGTAGA GAAATTATATCCAATCTCAGCAAAGCGGCTGGATTGGCCACTATGATTGCTGCAATGCGT CCAGATATTGATAACATCGATGAATATGTGAGGAACACGACTGCCAGAGCTTTTAGTGTA GTTGCTTCTGCATTAGGGATTCCTGCTCTCTTGCCATTCCTGAAAGCTGTGTGTCAGAGT AAGAAATCATGGCAAGCTCGGCACACTGGAATCAAAATCGTGCAGCAGATTGCTATTTTA ATTGGTTGTGCTGTTCTTCCACACCTGAGGTCTCTTGTCGAAATCATTGAGCATGGGCTC AATGATGAGAATCAAAAGGTGAGAACTATTACTGCTCTGTCATTGGCTGCTCTAGCTGAG GCTGCTGCCCCATATGGTATTGAGAGCTTTGATTCAGTCTTGAAGCCATTGTGGAAGGGT ATCAGGTCACACCGAGGGAAGGTGTTGGCTGCATTCTTGAAAGCAATTGGTTTTATCATT CCCCTCATGGATGCAATATATGCCAGTTACTATACCAAGGAAGTGGTGTTTATCTTGATT CGTGAATTCCAGTCACCTGATGAAGAAATGAAGAAAATTGTGCTGAAAGTGGTGAAGCAG TGTGTGAGTACAGAAGGGGTAGAGGCTGACTATATCCGAAATGATATTCTTCCTGAGTTC TTCAGAAATTTCTGGGTGAGAAGGATGGCATTGGATAGGAGAAATTATAGGCAGCTTGTG GACACAACTGTAGAAATTGCAAACAAGGTTGGGGTTGCTGACATAGTAGGAAGAATAGTT GAGGATCTTAAAGATGAGAGTGAACCATATAGGAGAATGGTTATGGAAACTATTGAGAAG GTGGTTGCTAACTTGGGTGCATCGGACATTGATGCTCGCTTAGAAGAGCTTCTGATTGAT GGAATTCTATATGCCTTCCAAGAGCAGACCAGCGATGATGCCAATGTGATGCTTAATGGG TTTGGTGCAGTTGTCAATGCCCTTGGGCAAAGAGTGAAACCCTATCTTCCTCAGATTTGT GGGACCATAAAATGGCGACTCAATAACAAGAGTGCAAAAGTGAGACAGCAAGCGGCAGAT CTTATTTCAAGGATTGCTGTTGTCATGAAGCAGTGCCACGAGGAACAATTAATGGGTCAT CTTGGGGTTGTATTGTATGAGTACTTGGGAGAAGAGTACCCAGAAGTTCTAGGATCAATA CTGGGAGCTCTCAAGGCAATTGTCAATGTCATTGGTATGACAAAAATGACTCCTCCAATA AAGGATTTGCTTCCTCGATTAACCCCCATATTGAAGAACAGGCATGAGAAAGTCCAGGAG AACTGTATTGACCTTGTTGGTCGAATTGCTGATCGTGGGGCTGAGTTTGTCCCTGCAAGG GAGTGGATGAGGATTTGTTTTGAACTTCTTGAGATGCTTAAAGCCCACAAGAAGGGTATT CGGCGAGCTACTGTGAATACTTTTGGGTACATTGCCAAGGCCATTGGGCCACAGGATGTC TTGGCAACCTTGTTGAACAATCTGAAGGTCCAGGAGCGTCAAAATCGTGTTTGCACAACT GTTGCTATTGCAATAGTTGCAGAAACCTGTTCTCCTTTTACAGTTCTGCCTGCCCTGATG AATGAGTATCGTGTTCCAGAGCTTAATGTGCAGAATGGTGTTTTGAAATCCCTCTCTTTT CTATTCGAGTACATTGGTGAAATGGGAAAAGACTATATCTATGCGGTGACTCCATTACTT GAGGATGCCCTTATGGACAGAGATCTGGTTCACAGGCAGACTGCAGCTTCTGCTGTCAAG CATATGGCCTTGGGGGTTGCTGGGTTAGGTTGCGAGGATGCTTTAGTCCACTTGATGAAT TATGTATGGCCAAACATTTTTGAGACTTCGCCCCATGTCATAAATGCTGTTATGGAAGCC ATTGAAGGGATGAGGGTAGCCTTGGGTGCTGCTGTTGTACTAAACTACTGTCTACAGGGG CTGTTCCATCCTGCGAGGAAAGTTAGGGAAGTGTACTGGAAGATTTATAATTCCTTGTAT ATTGGAGCTCAAGATGCACTTGTGGCAGCCTATCCTTTGCTGGAGGATGAACAGAACAAC ATATATAGTAGGCCTGAACTGGTGATGTTCATATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0040g00270.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:11213199:11217147:-1 gene:VIT_08s0040g00270 transcript:VIT_08s0040g00270.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MASIDPEIARTQEERKKMEQQLSSLTSVNYDPELYGGTNKFEDYVSSIPVNDEEENVDAM DPGLGRRLPSYTAPASLLKEMPRGGVEEDDMGFKKPQRIIDREDDYRRRRLNRVISPDRH DAFASGDKTPDVSVRTYADVMREEALKREKEETLKAIAKKKKEEEEAKEQEKETGGGAVQ QPTQKRRNRWDQSQDDGSAKKAKTGSDWDLPDSTPGIGRWDATPTPGRVADATPSISRRN RWDETPTPGRLADADATPAAGGATPGATPAGMTWDATPKLAGLATPTPKRQRSRWDETPA TMGSATPMAGATPAAAYTPGVTPVGGVELATPTPSAINLRGAITPEQYNLLRWEKDIEER NRPLTDEELDAMFPQEGYKILDPPPSYVPIRTPARKLLATPTPLGTPLYAIPEENRGQQF DVPKEAPGGLPFMKPEDYQYFGALLNDEDEEELSPEEQKERKIMKLLLKVKNGTPPQRKT ALRQLTDKAREFGAGPLFNRILPLLMQPTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDELVRPFVHKI LVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMIAAMRPDIDNIDEYVRNTTARAFSV VASALGIPALLPFLKAVCQSKKSWQARHTGIKIVQQIAILIGCAVLPHLRSLVEIIEHGL NDENQKVRTITALSLAALAEAAAPYGIESFDSVLKPLWKGIRSHRGKVLAAFLKAIGFII PLMDAIYASYYTKEVVFILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCVSTEGVEADYIRNDILPEF FRNFWVRRMALDRRNYRQLVDTTVEIANKVGVADIVGRIVEDLKDESEPYRRMVMETIEK VVANLGASDIDARLEELLIDGILYAFQEQTSDDANVMLNGFGAVVNALGQRVKPYLPQIC GTIKWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAVVMKQCHEEQLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSI LGALKAIVNVIGMTKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEFVPAR EWMRICFELLEMLKAHKKGIRRATVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTT VAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLL EDALMDRDLVHRQTAASAVKHMALGVAGLGCEDALVHLMNYVWPNIFETSPHVINAVMEA IEGMRVALGAAVVLNYCLQGLFHPARKVREVYWKIYNSLYIGAQDALVAAYPLLEDEQNN IYSRPELVMFI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0040g00270.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:11213199:11217147:-1 gene:VIT_08s0040g00270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AATATGGCGTCTATAGATCCGGAGATAGCGAGGACACAGGAAGAGAGGAAGAAGATGGAG CAACAGCTCTCGTCCCTCACATCCGTTAATTATGATCCTGAGCTCTACGGCGGGACCAAT AAATTTGAAGACTACGTGAGTTCCATCCCTGTGAACGATGAGGAAGAGAATGTGGACGCC ATGGATCCTGGATTGGGGAGGAGGCTGCCGTCTTATACTGCTCCGGCGTCTTTGCTGAAG GAGATGCCCAGAGGCGGTGTGGAGGAAGACGACATGGGCTTTAAGAAGCCGCAGAGAATT ATCGATCGCGAGGATGATTATAGGAGGAGGAGGTTGAATCGGGTTATATCGCCGGACCGG CATGATGCCTTTGCGTCTGGGGATAAAACTCCCGATGTGTCGGTGAGGACGTATGCGGAT GTGATGAGGGAGGAGGCGTTGAAGAGGGAGAAGGAGGAGACTTTGAAGGCGATTGCCAAG AAGAAGAAGGAGGAAGAGGAGGCGAAGGAGCAGGAGAAGGAAACTGGTGGTGGTGCTGTG CAGCAGCCGACGCAGAAGAGGAGGAACAGGTGGGACCAGTCGCAGGATGATGGAAGTGCC AAGAAGGCAAAGACAGGTTCGGATTGGGATTTGCCGGATTCAACTCCTGGGATTGGGAGG TGGGATGCGACTCCGACTCCGGGGAGGGTGGCTGATGCTACTCCCTCGATTTCTAGGAGG AATAGGTGGGATGAGACTCCAACACCTGGTCGGTTGGCTGATGCGGATGCGACCCCAGCT GCTGGTGGGGCGACCCCAGGTGCAACCCCCGCTGGGATGACTTGGGATGCCACTCCTAAG CTGGCAGGCCTTGCAACTCCCACTCCGAAGAGGCAGAGATCAAGGTGGGATGAGACTCCA GCAACTATGGGAAGTGCCACACCAATGGCTGGTGCTACACCTGCTGCTGCATACACGCCT GGTGTGACTCCTGTTGGTGGGGTTGAACTTGCCACGCCAACACCATCAGCAATTAATTTA CGTGGTGCAATTACTCCGGAACAGTATAACTTGCTGAGGTGGGAGAAAGACATTGAAGAG AGGAATAGACCATTGACTGATGAAGAGCTTGATGCGATGTTTCCACAAGAGGGTTACAAG ATTTTGGATCCACCACCATCCTATGTTCCTATTAGAACACCTGCAAGAAAGCTTCTTGCA ACCCCAACTCCTTTGGGGACCCCATTGTATGCAATTCCAGAAGAGAATCGTGGGCAGCAA TTTGATGTTCCAAAGGAAGCACCCGGTGGGTTGCCCTTCATGAAGCCAGAGGATTATCAG TATTTTGGGGCATTATTGAATGATGAAGATGAGGAAGAGTTGTCTCCTGAAGAACAGAAA GAGCGAAAGATCATGAAGCTTTTACTTAAGGTGAAGAATGGGACACCTCCACAGAGGAAG ACAGCTTTGAGACAGCTCACTGATAAAGCTAGAGAGTTTGGTGCAGGACCTTTGTTCAAC AGAATTTTGCCATTGCTCATGCAACCCACATTGGAAGATCAAGAGAGACACCTTCTGGTT AAGGTCATTGATAGGGTGCTTTATAAGTTGGATGAATTGGTTCGACCTTTTGTGCACAAG ATACTTGTGGTGATTGAACCTCTTTTGATTGATGAAGATTACTATGCACGTGTGGAGGGT AGAGAAATTATATCCAATCTCAGCAAAGCGGCTGGATTGGCCACTATGATTGCTGCAATG CGTCCAGATATTGATAACATCGATGAATATGTGAGGAACACGACTGCCAGAGCTTTTAGT GTAGTTGCTTCTGCATTAGGGATTCCTGCTCTCTTGCCATTCCTGAAAGCTGTGTGTCAG AGTAAGAAATCATGGCAAGCTCGGCACACTGGAATCAAAATCGTGCAGCAGATTGCTATT TTAATTGGTTGTGCTGTTCTTCCACACCTGAGGTCTCTTGTCGAAATCATTGAGCATGGG CTCAATGATGAGAATCAAAAGGTGAGAACTATTACTGCTCTGTCATTGGCTGCTCTAGCT GAGGCTGCTGCCCCATATGGTATTGAGAGCTTTGATTCAGTCTTGAAGCCATTGTGGAAG GGTATCAGGTCACACCGAGGGAAGGTGTTGGCTGCATTCTTGAAAGCAATTGGTTTTATC ATTCCCCTCATGGATGCAATATATGCCAGTTACTATACCAAGGAAGTGGTGTTTATCTTG ATTCGTGAATTCCAGTCACCTGATGAAGAAATGAAGAAAATTGTGCTGAAAGTGGTGAAG CAGTGTGTGAGTACAGAAGGGGTAGAGGCTGACTATATCCGAAATGATATTCTTCCTGAG TTCTTCAGAAATTTCTGGGTGAGAAGGATGGCATTGGATAGGAGAAATTATAGGCAGCTT GTGGACACAACTGTAGAAATTGCAAACAAGGTTGGGGTTGCTGACATAGTAGGAAGAATA GTTGAGGATCTTAAAGATGAGAGTGAACCATATAGGAGAATGGTTATGGAAACTATTGAG AAGGTGGTTGCTAACTTGGGTGCATCGGACATTGATGCTCGCTTAGAAGAGCTTCTGATT GATGGAATTCTATATGCCTTCCAAGAGCAGACCAGCGATGATGCCAATGTGATGCTTAAT GGGTTTGGTGCAGTTGTCAATGCCCTTGGGCAAAGAGTGAAACCCTATCTTCCTCAGATT TGTGGGACCATAAAATGGCGACTCAATAACAAGAGTGCAAAAGTGAGACAGCAAGCGGCA GATCTTATTTCAAGGATTGCTGTTGTCATGAAGCAGTGCCACGAGGAACAATTAATGGGT CATCTTGGGGTTGTATTGTATGAGTACTTGGGAGAAGAGTACCCAGAAGTTCTAGGATCA ATACTGGGAGCTCTCAAGGCAATTGTCAATGTCATTGGTATGACAAAAATGACTCCTCCA ATAAAGGATTTGCTTCCTCGATTAACCCCCATATTGAAGAACAGGCATGAGAAAGTCCAG GAGAACTGTATTGACCTTGTTGGTCGAATTGCTGATCGTGGGGCTGAGTTTGTCCCTGCA AGGGAGTGGATGAGGATTTGTTTTGAACTTCTTGAGATGCTTAAAGCCCACAAGAAGGGT ATTCGGCGAGCTACTGTGAATACTTTTGGGTACATTGCCAAGGCCATTGGGCCACAGGAT GTCTTGGCAACCTTGTTGAACAATCTGAAGGTCCAGGAGCGTCAAAATCGTGTTTGCACA ACTGTTGCTATTGCAATAGTTGCAGAAACCTGTTCTCCTTTTACAGTTCTGCCTGCCCTG ATGAATGAGTATCGTGTTCCAGAGCTTAATGTGCAGAATGGTGTTTTGAAATCCCTCTCT TTTCTATTCGAGTACATTGGTGAAATGGGAAAAGACTATATCTATGCGGTGACTCCATTA CTTGAGGATGCCCTTATGGACAGAGATCTGGTTCACAGGCAGACTGCAGCTTCTGCTGTC AAGCATATGGCCTTGGGGGTTGCTGGGTTAGGTTGCGAGGATGCTTTAGTCCACTTGATG AATTATGTATGGCCAAACATTTTTGAGACTTCGCCCCATGTCATAAATGCTGTTATGGAA GCCATTGAAGGGATGAGGGTAGCCTTGGGTGCTGCTGTTGTACTAAACTACTGTCTACAG GGGCTGTTCCATCCTGCGAGGAAAGTTAGGGAAGTGTACTGGAAGATTTATAATTCCTTG TATATTGGAGCTCAAGATGCACTTGTGGCAGCCTATCCTTTGCTGGAGGATGAACAGAAC AACATATATAGTAGGCCTGAACTGGTGATGTTCATATAAGGTGCTGTTTGTGGTTGAAGA AGCAGTTGGAGGCAGATCCAAAAAATACATGCTTGACGTCTTTACTTTTTACTGCTATAG TTTGTTTGTCTATTGAAGTGGATCGTCTTAATCTTCCTAGATATTTTTG