Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0032g00690.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:4126797:4169706:1 gene:VIT_08s0032g00690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCTACTCTTCATGGTTTTCGCGTCTCCGTTCTTCCTCAAGAACCATTTACGCTAAT TTCAGAAACCCACGCTTCAAAACCAATCACACCAACCCGATCAACACCACCGATGTTGTC ACCTCAACTAAGCCAATTTTATCATGGTCAAGCTCCCTGCTTCCCCTGGCCCTTGCTGTC TCTGCTGGCTCACTTGCCATTCACGTCCAAACCAACCCATCTCTCTGTGATTCTTTTGAT GTCGATGCTCGAGGTGTCAGTGTTGGGGGCAAAGGTAGCACTGAGTTTGTGGTGAAGGGC TCTCACAAGGATATACCAAGGGAGCTTCTTGATGAATTGAAGGCTATCTGTCAAGATGAC ATGACGATGGATTATGAAGAGAGGTATATTCATGGAAAACCACAGAACAGCTTTCACAAA GCAGTAAATATCCCTGATGTTGTTGTTTTTCCAAGGTCTGAAGAGGAAGTTTCCAAGATA GTCAAATCTTGTGACATGCATAAGGTTCCTATTGTACCATATGGTGGAGCTACATCAATT GAGGGTCACACCTTATCTCCTCATGGAGGTGTTTGCATTGACATGACATTGATGAAAAGT GTTAAAGCATTACATGTTGAGGACATGGATGTGGTTGTTGAGCCTGGAATTGGGTGGCTG GAGCTTAATGAATACCTGGAGCCTTATGGTCTATTTTTCCCACTTGATCCTGGGCCAGGT GCAACCATTGGGGGTATGTGTGCTACACGTTGCTCTGGTTCTTTAGCCGTGAGGTATGGA ACTATGCGTGATAATGTCATCAACCTCAAGGTAGTTCTAGCCAATGGAGATGTAGTCAAG ACAGGATCTCGTGCTCGAAAGAGTGCTGCGGGGTATGATTTGACCCGCTTGGTGATTGGA AGCGAAGGAACCTTGGGTGTAATAACTGAAGTAACCCTAAGGCTTCAGAAAATTCCACAG TATTCAGTGGTTGCAATGTGTAATTTCCCTACGATTAAGGATGCAGCAGATGTTGCTATT GCCACTATGTTATCTGGAATTCAGGTCTCAAGGGTAGAGTTACTGGATGAAGTTCAAGTG AAAGCTATCAATATTGCTAATGGGAAGAGCTTGCCTGAAGCTCCCACATTGATGTTTGAA TTTATAGGCACAGAAGCATATTCACGCGAGCAAGCACTAATCGTTCAGAGAATTGCTTCT GAGCACAATAGCTCAGATTTTGTTTTTACGGAAGATCCTCAAGCTAAAAAGGAACTTTGG AAGATTAGGAAGGAGGCACTCTGGGCATGCTTTGCAATGGAACCTAGTTTTGAAGCAATG ATTTCGGATGTTTGTGTTCCTCTATCCCACCTTGCGGAATTGATTTCGAAGTCCAAGCAA CAGTTGGATGCATCCTCCTTGATTTGCCCCGTAGTTGCTCATGCTGGTGATGGGAACTTC CACACAATAATTCTATTTGATCCCATCAATGACGAACATCGGCGGGAAGCAGAGAGACTA AATCATTTCATGGTCCGTACTGCCTTGAAGATGGAAGGGACATGTACTGGAGAACATGGT GTTGGCACAGGGAAAATGAAGTACCTTGAAGAAGAACTTGGAATTGAGGCTTTGCAGACG ATGAAAAGAATAAAAACAGTTTTGGATCCCAACAATATCATGAACCCAGGAAAGCTCATC CCTCCTCATGTTTGCTTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0032g00690.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:4126797:4169706:1 gene:VIT_08s0032g00690 transcript:VIT_08s0032g00690.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAYSSWFSRLRSSSRTIYANFRNPRFKTNHTNPINTTDVVTSTKPILSWSSSLLPLALAV SAGSLAIHVQTNPSLCDSFDVDARGVSVGGKGSTEFVVKGSHKDIPRELLDELKAICQDD MTMDYEERYIHGKPQNSFHKAVNIPDVVVFPRSEEEVSKIVKSCDMHKVPIVPYGGATSI EGHTLSPHGGVCIDMTLMKSVKALHVEDMDVVVEPGIGWLELNEYLEPYGLFFPLDPGPG ATIGGMCATRCSGSLAVRYGTMRDNVINLKVVLANGDVVKTGSRARKSAAGYDLTRLVIG SEGTLGVITEVTLRLQKIPQYSVVAMCNFPTIKDAADVAIATMLSGIQVSRVELLDEVQV KAINIANGKSLPEAPTLMFEFIGTEAYSREQALIVQRIASEHNSSDFVFTEDPQAKKELW KIRKEALWACFAMEPSFEAMISDVCVPLSHLAELISKSKQQLDASSLICPVVAHAGDGNF HTIILFDPINDEHRREAERLNHFMVRTALKMEGTCTGEHGVGTGKMKYLEEELGIEALQT MKRIKTVLDPNNIMNPGKLIPPHVCF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0032g00690.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:4126797:4169706:1 gene:VIT_08s0032g00690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCTACTCTTCATGGTTTTCGCGTCTCCGTTCTTCCTCAAGAACCATTTACGCTAAT TTCAGAAACCCACGCTTCAAAACCAATCACACCAACCCGATCAACACCACCGATGTTGTC ACCTCAACTAAGCCAATTTTATCATGGTCAAGCTCCCTGCTTCCCCTGGCCCTTGCTGTC TCTGCTGGCTCACTTGCCATTCACGTCCAAACCAACCCATCTCTCTGTGATTCTTTTGAT GTCGATGCTCGAGGTGTCAGTGTTGGGGGCAAAGGTAGCACTGAGTTTGTGGTGAAGGGC TCTCACAAGGATATACCAAGGGAGCTTCTTGATGAATTGAAGGCTATCTGTCAAGATGAC ATGACGATGGATTATGAAGAGAGGTATATTCATGGAAAACCACAGAACAGCTTTCACAAA GCAGTAAATATCCCTGATGTTGTTGTTTTTCCAAGGTCTGAAGAGGAAGTTTCCAAGATA GTCAAATCTTGTGACATGCATAAGGTTCCTATTGTACCATATGGTGGAGCTACATCAATT GAGGGTCACACCTTATCTCCTCATGGAGGTGTTTGCATTGACATGACATTGATGAAAAGT GTTAAAGCATTACATGTTGAGGACATGGATGTGGTTGTTGAGCCTGGAATTGGGTGGCTG GAGCTTAATGAATACCTGGAGCCTTATGGTCTATTTTTCCCACTTGATCCTGGGCCAGGT GCAACCATTGGGGGTATGTGTGCTACACGTTGCTCTGGTTCTTTAGCCGTGAGGTATGGA ACTATGCGTGATAATGTCATCAACCTCAAGGTAGTTCTAGCCAATGGAGATGTAGTCAAG ACAGGATCTCGTGCTCGAAAGAGTGCTGCGGGGTATGATTTGACCCGCTTGGTGATTGGA AGCGAAGGAACCTTGGGTGTAATAACTGAAGTAACCCTAAGGCTTCAGAAAATTCCACAG TATTCAGTGGTTGCAATGTGTAATTTCCCTACGATTAAGGATGCAGCAGATGTTGCTATT GCCACTATGTTATCTGGAATTCAGGTCTCAAGGGTAGAGTTACTGGATGAAGTTCAAGTG AAAGCTATCAATATTGCTAATGGGAAGAGCTTGCCTGAAGCTCCCACATTGATGTTTGAA TTTATAGGCACAGAAGCATATTCACGCGAGCAAGCACTAATCGTTCAGAGAATTGCTTCT GAGCACAATAGCTCAGATTTTGTTTTTACGGAAGATCCTCAAGCTAAAAAGGAACTTTGG AAGATTAGGAAGGAGGCACTCTGGGCATGCTTTGCAATGGAACCTAGTTTTGAAGCAATG ATTTCGGATGTTTGTGTTCCTCTATCCCACCTTGCGGAATTGATTTCGAAGTCCAAGCAA CAGTTGGATGCATCCTCCTTGATTTGCCCCGTAGTTGCTCATGCTGGTGATGGGAACTTC CACACAATAATTCTATTTGATCCCATCAATGACGAACATCGGCGGGAAGCAGAGAGACTA AATCATTTCATGGTCCGTACTGCCTTGAAGATGGAAGGGACATGTACTGGAGAACATGGT GTTGGCACAGGGAAAATGAAGTACCTTGAAGAAGAACTTGGAATTGAGGCTTTGCAGACG ATGAAAAGAATAAAAACAGTTTTGGATCCCAACAATATCATGAACCCAGGAAAGCTCATC CCTCCTCATGTTTGCTTTTAAGAGCTCTCTGCACACCCAATGCGGTTTCGAAATGTAGTT GCAGAATAATCGAAAATCTGGACTGTGCCGAGTTGAGAGATGAGCAAGACTGGTAGTTTC AATTTCATT