Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0007g08720.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:22092777:22095219:-1 gene:VIT_08s0007g08720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAACCTCTCACCTCAAATTTGTCGATCCGTCTTGCATTTCATTCCGAAGCAAAGTCGG TTTCGCTGTCTGCATGCCAACCTCTTCACCACCGCCCAAGGCGCCGCTATTTCCAATGAG GTCCTCACTGTTATGGAGACCGTAAACCCCATGGAAGACGCCTTAGAAAAGCTAGCCCCA TTTCTCTCTTCTGAAATCGTGAATGATGTTATGCGAGAACAGCGAAGACCTGAATTGGGT TTTCGGTTCTTCATATGGACAACGAGAAGACGGAGTTTTCGCAGCTGGGTTACGCATAAT TTGGTCATAGATATGCTTGCCAAGGATGATGGGTTTGATACCTACTGGAAAATTCTCGAG GAGCTCAAGAATTCTAACATTCAGATACCTCCCCCCACATTTTCCGTGCTAATTGCGGCT TATGCAAAGTCGGGTATGGCTGAAAAGGCCGTAGAATCTTTTGGTAAGATGAAAGATTTT GGCTGCAAACCTGATGTGTTCACTTACAACTCCATCTTACATGTTATGGTACAAAAAGAG GTGTTTTTGTTAGCATTAGCGGTTTATAATCAGATGTTGAAGTTGAATTATAATCCAAAT CGAGCTACATTTGTCATTTTGCTTAATGGTTTGTGTAAAAATGGGAAGACTGATGATGCG CTGAAAATGTTCGATGAAATGACCCAAAAAGGTATACCACCTAACACAATGATATATACA ATAATTTTGTCTGGTTTGTGTCAAGCGAAAAGAACTGATGATGTCCATAGATTGCTGAAT ACAATGAAAGTGAGTGGGTGCTGTCCTGACTCGATTACTTGTAATGCTTTGCTTGACGGA TTCTGTAAACTGGGTCAAATTGATGAGGCTTTTGCACTCTTGCAGTTGTTTGAGAAGGAG GGGTATGTTCTTGGGATAAAGGGATATAGTAGTCTGATTGATGGTTTGTTTAGGGCGAAG AGATATGATGAAGTGCAGGAGTGGTGTAGGAAAATGTTCAAGGCTGGTATTGAGCCTGAT GTTGTTTTGTATACAATTTTGATTCGGGGATTTTGTGAAGTAGGCATGGTTGATTATGCA CTGAATATGTTGAATGATATGACACAGAGGGGTTTGTCCCCAGATACTTATTGTTACAAT GCTTTGATTAAAGGGTTTTGTGATGTGGGTCTTTTGGATAAGGCTCGGTCCCTTCAACTT GAAATTTCAAAGAATGACTGCTTTCCCACCTCCTGCACTTACACCATTCTCATTTGTGGT ATGTGCAGGAATGGGCTGTTAGATGAGGCGCGACAAATATTTAACCAGATGGAGAATCTT GGGTGCTCTCCTTCTATAATGACCTTCAATGCTCTTATTGATGGACTTTGTAAGGCTGGG GAGCTTGAGGAAGCTCGCCATTTGTTTTACAAGATGGAGATTGGAAAAAATCCTTCGTTG TTTCTTCGTCTCTCTCAAGGGGCTGATCGGGTTATGGATACTGCAAGTCTTCAGACAATG GTGGAGCGATTGTGTGAGTCGGGATTGATTCTCAAGGCCTACAAGCTTCTCATGCAGCTT GCTGACAGTGGGGTTGTACCAGATATCATGACTTACAATGTTCTCATCAACGGCTTTTGC AAGGCAAAGAACATTAATGGTGCTTTCAAGCTCTTTAGGGAGCTCCAACTCAAGGGGCAT TCCCCTGATTCTGTCACATATGGTACACTCATAGATGGGTTTCATAGAGTTGACAGAGAA GAAGATGCCTTTAGGGTCTTAGATCAAATGGTGAAGAATGGATGTACTCCTAGCTCAGCA GTTTACAAATGTCTTATGACTTGGTCGTGCCGCAAGGGGAAGCTTTCAGTAGCTTTTAGT CTCTGGTTGAAGTATCTGAGGAGCCTCCCTAGTCAGGAAGATGAAACACTTAAACTAGCA GAGGAACATTTTGAGAAGGGAGAATTGGAAAAAGCGGTTCGATGTTTACTTGAAATGAAC TTCAAGCTGAATAATTTTGAAATAGCACCTTATACCATCTGGCTCATTGGACTGTGTCAA GCTAGAAGATCAGAGGAAGCTTTAAAGATATTTCTCGTTCTGAAGGAGTGCCAGATGGAT GTCAATCCCCCAAGTTGTGTGATGTTGATTAATGGTCTCTGTAAAGATGGGAATCTGGAG ATGGCAGTGGACATATTCCTCTACACTTTGGAGAAAGGTTTTATGTTGATGCCTCGGATT TGCAACCAATTGCTCAGGTCTCTTATTTTGCAGGATAAAATGAAGCATGCCCTTGACCTT TTAAACAGAATGAACTCTGCAGGATATGATTTGGATGAATATCTTCACCATCGAATCAAG TCCTATTTACTGAGTGTGTGGAAGGCGCAGGAAATGGAAAATGTGGCACCTGGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0007g08720.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:22092777:22095219:-1 gene:VIT_08s0007g08720 transcript:VIT_08s0007g08720.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MNLSPQICRSVLHFIPKQSRFRCLHANLFTTAQGAAISNEVLTVMETVNPMEDALEKLAP FLSSEIVNDVMREQRRPELGFRFFIWTTRRRSFRSWVTHNLVIDMLAKDDGFDTYWKILE ELKNSNIQIPPPTFSVLIAAYAKSGMAEKAVESFGKMKDFGCKPDVFTYNSILHVMVQKE VFLLALAVYNQMLKLNYNPNRATFVILLNGLCKNGKTDDALKMFDEMTQKGIPPNTMIYT IILSGLCQAKRTDDVHRLLNTMKVSGCCPDSITCNALLDGFCKLGQIDEAFALLQLFEKE GYVLGIKGYSSLIDGLFRAKRYDEVQEWCRKMFKAGIEPDVVLYTILIRGFCEVGMVDYA LNMLNDMTQRGLSPDTYCYNALIKGFCDVGLLDKARSLQLEISKNDCFPTSCTYTILICG MCRNGLLDEARQIFNQMENLGCSPSIMTFNALIDGLCKAGELEEARHLFYKMEIGKNPSL FLRLSQGADRVMDTASLQTMVERLCESGLILKAYKLLMQLADSGVVPDIMTYNVLINGFC KAKNINGAFKLFRELQLKGHSPDSVTYGTLIDGFHRVDREEDAFRVLDQMVKNGCTPSSA VYKCLMTWSCRKGKLSVAFSLWLKYLRSLPSQEDETLKLAEEHFEKGELEKAVRCLLEMN FKLNNFEIAPYTIWLIGLCQARRSEEALKIFLVLKECQMDVNPPSCVMLINGLCKDGNLE MAVDIFLYTLEKGFMLMPRICNQLLRSLILQDKMKHALDLLNRMNSAGYDLDEYLHHRIK SYLLSVWKAQEMENVAPG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0007g08720.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:22092777:22095219:-1 gene:VIT_08s0007g08720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CTAGCCTCGATCCGAAGATGAGAGTTTCTGCAATTTTACACTTACCATGAACCTCTCACC TCAAATTTGTCGATCCGTCTTGCATTTCATTCCGAAGCAAAGTCGGTTTCGCTGTCTGCA TGCCAACCTCTTCACCACCGCCCAAGGCGCCGCTATTTCCAATGAGGTCCTCACTGTTAT GGAGACCGTAAACCCCATGGAAGACGCCTTAGAAAAGCTAGCCCCATTTCTCTCTTCTGA AATCGTGAATGATGTTATGCGAGAACAGCGAAGACCTGAATTGGGTTTTCGGTTCTTCAT ATGGACAACGAGAAGACGGAGTTTTCGCAGCTGGGTTACGCATAATTTGGTCATAGATAT GCTTGCCAAGGATGATGGGTTTGATACCTACTGGAAAATTCTCGAGGAGCTCAAGAATTC TAACATTCAGATACCTCCCCCCACATTTTCCGTGCTAATTGCGGCTTATGCAAAGTCGGG TATGGCTGAAAAGGCCGTAGAATCTTTTGGTAAGATGAAAGATTTTGGCTGCAAACCTGA TGTGTTCACTTACAACTCCATCTTACATGTTATGGTACAAAAAGAGGTGTTTTTGTTAGC ATTAGCGGTTTATAATCAGATGTTGAAGTTGAATTATAATCCAAATCGAGCTACATTTGT CATTTTGCTTAATGGTTTGTGTAAAAATGGGAAGACTGATGATGCGCTGAAAATGTTCGA TGAAATGACCCAAAAAGGTATACCACCTAACACAATGATATATACAATAATTTTGTCTGG TTTGTGTCAAGCGAAAAGAACTGATGATGTCCATAGATTGCTGAATACAATGAAAGTGAG TGGGTGCTGTCCTGACTCGATTACTTGTAATGCTTTGCTTGACGGATTCTGTAAACTGGG TCAAATTGATGAGGCTTTTGCACTCTTGCAGTTGTTTGAGAAGGAGGGGTATGTTCTTGG GATAAAGGGATATAGTAGTCTGATTGATGGTTTGTTTAGGGCGAAGAGATATGATGAAGT GCAGGAGTGGTGTAGGAAAATGTTCAAGGCTGGTATTGAGCCTGATGTTGTTTTGTATAC AATTTTGATTCGGGGATTTTGTGAAGTAGGCATGGTTGATTATGCACTGAATATGTTGAA TGATATGACACAGAGGGGTTTGTCCCCAGATACTTATTGTTACAATGCTTTGATTAAAGG GTTTTGTGATGTGGGTCTTTTGGATAAGGCTCGGTCCCTTCAACTTGAAATTTCAAAGAA TGACTGCTTTCCCACCTCCTGCACTTACACCATTCTCATTTGTGGTATGTGCAGGAATGG GCTGTTAGATGAGGCGCGACAAATATTTAACCAGATGGAGAATCTTGGGTGCTCTCCTTC TATAATGACCTTCAATGCTCTTATTGATGGACTTTGTAAGGCTGGGGAGCTTGAGGAAGC TCGCCATTTGTTTTACAAGATGGAGATTGGAAAAAATCCTTCGTTGTTTCTTCGTCTCTC TCAAGGGGCTGATCGGGTTATGGATACTGCAAGTCTTCAGACAATGGTGGAGCGATTGTG TGAGTCGGGATTGATTCTCAAGGCCTACAAGCTTCTCATGCAGCTTGCTGACAGTGGGGT TGTACCAGATATCATGACTTACAATGTTCTCATCAACGGCTTTTGCAAGGCAAAGAACAT TAATGGTGCTTTCAAGCTCTTTAGGGAGCTCCAACTCAAGGGGCATTCCCCTGATTCTGT CACATATGGTACACTCATAGATGGGTTTCATAGAGTTGACAGAGAAGAAGATGCCTTTAG GGTCTTAGATCAAATGGTGAAGAATGGATGTACTCCTAGCTCAGCAGTTTACAAATGTCT TATGACTTGGTCGTGCCGCAAGGGGAAGCTTTCAGTAGCTTTTAGTCTCTGGTTGAAGTA TCTGAGGAGCCTCCCTAGTCAGGAAGATGAAACACTTAAACTAGCAGAGGAACATTTTGA GAAGGGAGAATTGGAAAAAGCGGTTCGATGTTTACTTGAAATGAACTTCAAGCTGAATAA TTTTGAAATAGCACCTTATACCATCTGGCTCATTGGACTGTGTCAAGCTAGAAGATCAGA GGAAGCTTTAAAGATATTTCTCGTTCTGAAGGAGTGCCAGATGGATGTCAATCCCCCAAG TTGTGTGATGTTGATTAATGGTCTCTGTAAAGATGGGAATCTGGAGATGGCAGTGGACAT ATTCCTCTACACTTTGGAGAAAGGTTTTATGTTGATGCCTCGGATTTGCAACCAATTGCT CAGGTCTCTTATTTTGCAGGATAAAATGAAGCATGCCCTTGACCTTTTAAACAGAATGAA CTCTGCAGGATATGATTTGGATGAATATCTTCACCATCGAATCAAGTCCTATTTACTGAG TGTGTGGAAGGCGCAGGAAATGGAAAATGTGGCACCTGGATGA