Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0007g08310.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:21658791:21665614:1 gene:VIT_08s0007g08310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGCGATGGCGTGATGATGGTTTGAAGATCGAAGATTCTCTAAGGTGCTCAAAGATG ACGGTTACACCGAAGATCTCTATCAACGAGGGTAACCTTGTGGTTCAGGGGAAGACTATC CTGACTGGTGTGCCGGATAACATTGTTTTGACTCCGGGATCCGGCGGGGGGCTTGTTGCT GGTACCTTCATTGGTGCCACGGCTTCCCACAGCAAAAGCCTCCATGTTTTCCCCATGGGT ACTCTGGATGGTCTACGGTTCATGTGCTGTTTCCGCTTCAAGTTATGGTGGATGACTCAA AGAATGGGAACATGTGGAAAGGATGTTCCTTTTGAGACCCAGTTCATGCTCATAGAGAGC AAAGAAACCACAGAAGGAGGTGAACATGACGATGCCCCGACCATCTACACTGTCTTCCTC CCTCTCCTCGAAGGCCAGTTCCGAGCTGTTCTGCAAGGCAACGACAAAAACGAGATAGAG ATTTGCCTTGAGAGTGGAGATACTGCTGTTGAAACAAACCAAGGCCTTCACCTTGTGTAC ATGCATTCTGGGACCAATCCTTTTGAAGTTATCGACCAGGCAGTAAAGGCTGTGGAGAAA CACATGCAAACTTTTCTTCACCGTGAGAAGAAAAAGTTGCCTTCTTTCCTTGACTGGTTT GGCTGGTGCACTTGGGATGCTTTCTACACTGATGTCACTGCCGAGGGCATTGAAGAAGGC CTGCAAAGCTTGTCCAAGGGAGGTGCACCTCCTAAGTTCCTAATCATTGATGATGGTTGG CAGCAGATTGGTAATGAGAACAAGGACAACAATTGCGTTGTGCAAGAAGGCGCTCAATTT GCAAATAGATTAACAGGAATAAAGGAGAATGAGAAATTCCAAAAGAATGGCCGGAACAAT GAGCAAGTCCCAGGCCTTAAGCATGTGGTTGAGGATGCTAAGCAGCGGCATAATGTCAAG TTTGTTTATGTATGGCATGCTCTAGCGGGTTATTGGGGTGGAGTGAAGCCAGCAGCTGCT GGTATGGAACATTATGAATGTGCATTGGCATATCCGGTTCAGTCCCCTGGTGTAATGGGT AATCAGCCAGACATTGTCATGGACAGTCTATCTGTTCATGGCCTAGGTCTCGTACCCCCA AGGACGGTTTTCAACTTCTACAATGAGCTCCATGCCTACCTGGCTTCTTGTGGTGTAGAT GGAGTTAAGGTTGACGTGCAGAATATCATTGAGACCCTTGGTGCTGGTCATGGTGGCAGA GTTGCTCTCACCCGCAGCTATCAGCAGGCCCTTGAAGCCTCCATAGCAAGGAACTTCACT GACAATGGATGCATATCTTGCATGTGCCATAACACTGATGGACTCTATAGCACTAAGCAA ACTGCTGTAGTGAGAGCATCTGATGACTTCTATCCTCGTGACCCTGCTTCTCACACCATC CACATTTCTTCAGTGGCTTACAATACTCTCTTCCTTGGTGAATTTATGCAACCTGATTGG GATATGTTCCATAGCCTACACCCAGCTGCAGAGTACCATGGTGCAGCTCGAGCTGTTGGT GGATGTGCAATTTATGTCAGTGACAAGCCAGGTCATCACAACTTTGAGCTTTTGAGGAAG CTGGTTCTCCCTGATGGATCTGTACTCCGTGCCCAGCTACCTGGTAGGCCCACGCGTGAT TGCCTCTTTGCTGATCCAGCACGAGATGGGACCAGCTTGCTTAAAATCTGGAATGTGAAC AAATGCTCTGGTGTGGTGGGTGTGTTCAACTGCCAGGGTGCTGGTTGGTGCAAGATTGAG AAGAAGACCCGTGTCCATGATACATCACCTGACACCCTCACTGGTTCTGTCTGTGCGGCT GATGTTGACCAAATTGCTCATGTTGCTGGCACAAATTGGAAGGGGGATGTAGTAGTCTAC GCTTATAAATCAGGTGAGGTAGTCAGATTACCAGAGGGTGCTTCCCTGCCAGTGACTCTT AAAGTTCTCGAATTCGAAGTTTTCCATTTCTGTCCTCTCAAGGAAATTGCAACCAACATT TCCTTTGCCCCAATTGGCTTGCTCGACATGCTCAACTCCGGTGGTGCTGTGGAGCAATTT GAGGTTCATATGGCTTCTGAGAAACCCGAGCTCTTTGATGGCGAAATTCCCTTCGAACTG TCAACTTCTCTCAGTGAGAACAGATCTCCAACTGCAACAATTGCGCTAACAGCCAGGGGA TGTGGCCGGTTCGGCGCTTACTCATCTCAGCGCCCCTTGAAATGCCAGGTGGGCGATGCT GAGGTTGAATTCAGCTATGACCCCAACAATGGATTGTTGACTTTCACCATCCCCATTCCA GAGGAGGAGATGTACAGATGGTCCATCGCAATTCAAGTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0007g08310.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:21658791:21665614:1 gene:VIT_08s0007g08310 transcript:VIT_08s0007g08310.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MRRWRDDGLKIEDSLRCSKMTVTPKISINEGNLVVQGKTILTGVPDNIVLTPGSGGGLVA GTFIGATASHSKSLHVFPMGTLDGLRFMCCFRFKLWWMTQRMGTCGKDVPFETQFMLIES KETTEGGEHDDAPTIYTVFLPLLEGQFRAVLQGNDKNEIEICLESGDTAVETNQGLHLVY MHSGTNPFEVIDQAVKAVEKHMQTFLHREKKKLPSFLDWFGWCTWDAFYTDVTAEGIEEG LQSLSKGGAPPKFLIIDDGWQQIGNENKDNNCVVQEGAQFANRLTGIKENEKFQKNGRNN EQVPGLKHVVEDAKQRHNVKFVYVWHALAGYWGGVKPAAAGMEHYECALAYPVQSPGVMG NQPDIVMDSLSVHGLGLVPPRTVFNFYNELHAYLASCGVDGVKVDVQNIIETLGAGHGGR VALTRSYQQALEASIARNFTDNGCISCMCHNTDGLYSTKQTAVVRASDDFYPRDPASHTI HISSVAYNTLFLGEFMQPDWDMFHSLHPAAEYHGAARAVGGCAIYVSDKPGHHNFELLRK LVLPDGSVLRAQLPGRPTRDCLFADPARDGTSLLKIWNVNKCSGVVGVFNCQGAGWCKIE KKTRVHDTSPDTLTGSVCAADVDQIAHVAGTNWKGDVVVYAYKSGEVVRLPEGASLPVTL KVLEFEVFHFCPLKEIATNISFAPIGLLDMLNSGGAVEQFEVHMASEKPELFDGEIPFEL STSLSENRSPTATIALTARGCGRFGAYSSQRPLKCQVGDAEVEFSYDPNNGLLTFTIPIP EEEMYRWSIAIQV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0007g08310.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:21658791:21665614:1 gene:VIT_08s0007g08310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGCGATGGCGTGATGATGGTTTGAAGATCGAAGATTCTCTAAGGTGCTCAAAGATG ACGGTTACACCGAAGATCTCTATCAACGAGGGTAACCTTGTGGTTCAGGGGAAGACTATC CTGACTGGTGTGCCGGATAACATTGTTTTGACTCCGGGATCCGGCGGGGGGCTTGTTGCT GGTACCTTCATTGGTGCCACGGCTTCCCACAGCAAAAGCCTCCATGTTTTCCCCATGGGT ACTCTGGATGGTCTACGGTTCATGTGCTGTTTCCGCTTCAAGTTATGGTGGATGACTCAA AGAATGGGAACATGTGGAAAGGATGTTCCTTTTGAGACCCAGTTCATGCTCATAGAGAGC AAAGAAACCACAGAAGGAGGTGAACATGACGATGCCCCGACCATCTACACTGTCTTCCTC CCTCTCCTCGAAGGCCAGTTCCGAGCTGTTCTGCAAGGCAACGACAAAAACGAGATAGAG ATTTGCCTTGAGAGTGGAGATACTGCTGTTGAAACAAACCAAGGCCTTCACCTTGTGTAC ATGCATTCTGGGACCAATCCTTTTGAAGTTATCGACCAGGCAGTAAAGGCTGTGGAGAAA CACATGCAAACTTTTCTTCACCGTGAGAAGAAAAAGTTGCCTTCTTTCCTTGACTGGTTT GGCTGGTGCACTTGGGATGCTTTCTACACTGATGTCACTGCCGAGGGCATTGAAGAAGGC CTGCAAAGCTTGTCCAAGGGAGGTGCACCTCCTAAGTTCCTAATCATTGATGATGGTTGG CAGCAGATTGGTAATGAGAACAAGGACAACAATTGCGTTGTGCAAGAAGGCGCTCAATTT GCAAATAGATTAACAGGAATAAAGGAGAATGAGAAATTCCAAAAGAATGGCCGGAACAAT GAGCAAGTCCCAGGCCTTAAGCATGTGGTTGAGGATGCTAAGCAGCGGCATAATGTCAAG TTTGTTTATGTATGGCATGCTCTAGCGGGTTATTGGGGTGGAGTGAAGCCAGCAGCTGCT GGTATGGAACATTATGAATGTGCATTGGCATATCCGGTTCAGTCCCCTGGTGTAATGGGT AATCAGCCAGACATTGTCATGGACAGTCTATCTGTTCATGGCCTAGGTCTCGTACCCCCA AGGACGGTTTTCAACTTCTACAATGAGCTCCATGCCTACCTGGCTTCTTGTGGTGTAGAT GGAGTTAAGGTTGACGTGCAGAATATCATTGAGACCCTTGGTGCTGGTCATGGTGGCAGA GTTGCTCTCACCCGCAGCTATCAGCAGGCCCTTGAAGCCTCCATAGCAAGGAACTTCACT GACAATGGATGCATATCTTGCATGTGCCATAACACTGATGGACTCTATAGCACTAAGCAA ACTGCTGTAGTGAGAGCATCTGATGACTTCTATCCTCGTGACCCTGCTTCTCACACCATC CACATTTCTTCAGTGGCTTACAATACTCTCTTCCTTGGTGAATTTATGCAACCTGATTGG GATATGTTCCATAGCCTACACCCAGCTGCAGAGTACCATGGTGCAGCTCGAGCTGTTGGT GGATGTGCAATTTATGTCAGTGACAAGCCAGGTCATCACAACTTTGAGCTTTTGAGGAAG CTGGTTCTCCCTGATGGATCTGTACTCCGTGCCCAGCTACCTGGTAGGCCCACGCGTGAT TGCCTCTTTGCTGATCCAGCACGAGATGGGACCAGCTTGCTTAAAATCTGGAATGTGAAC AAATGCTCTGGTGTGGTGGGTGTGTTCAACTGCCAGGGTGCTGGTTGGTGCAAGATTGAG AAGAAGACCCGTGTCCATGATACATCACCTGACACCCTCACTGGTTCTGTCTGTGCGGCT GATGTTGACCAAATTGCTCATGTTGCTGGCACAAATTGGAAGGGGGATGTAGTAGTCTAC GCTTATAAATCAGGTGAGGTAGTCAGATTACCAGAGGGTGCTTCCCTGCCAGTGACTCTT AAAGTTCTCGAATTCGAAGTTTTCCATTTCTGTCCTCTCAAGGAAATTGCAACCAACATT TCCTTTGCCCCAATTGGCTTGCTCGACATGCTCAACTCCGGTGGTGCTGTGGAGCAATTT GAGGTTCATATGGCTTCTGAGAAACCCGAGCTCTTTGATGGCGAAATTCCCTTCGAACTG TCAACTTCTCTCAGTGAGAACAGATCTCCAACTGCAACAATTGCGCTAACAGCCAGGGGA TGTGGCCGGTTCGGCGCTTACTCATCTCAGCGCCCCTTGAAATGCCAGGTGGGCGATGCT GAGGTTGAATTCAGCTATGACCCCAACAATGGATTGTTGACTTTCACCATCCCCATTCCA GAGGAGGAGATGTACAGATGGTCCATCGCAATTCAAGTTTAAGTAGTTCCTAGATTATTA GAGAAGCCAATAAAATAAGAAAAAAAAAAGGGAAAAATGCCACTGCTGTTACTAGCTTCC GTGCATGTTGGAAGTGACGGCGGTGCGTTTAGATGAATGATTATCTATCTACGGCATAAG GGAGAGAGATTGGGGATATTGTTTCGTGATGTGCTTCGTCTGTGTTGGGTTGGGTTTGGG AGTGGTTCATCTCTTCTTCCTTCGGGAATAAATTATGTTATCTGTATGGATCTTCATCTC TATTTAATCGAAGAATTTCAGTTTTATCTTTT