Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0007g03980.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:17995965:17998924:-1 gene:VIT_08s0007g03980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGAAACGAATCCATCTCTCAAAATTCTCCGTCGGTAGTACCCTGAACAAACCCCAA AAATCCCTCTTGCTTCCTTCCTGCAAGCCCTTCTGCTCTCTCACAGAGAAGCAAGAACCT ACGTCTACTACAAACAACAGCACCACCAACCTCCAAGGTCAAGTCCAAGAACAGGCCCGC CATGAACATGTTCAAAAGCTCCAAACCCTCCTCCAACAGGGTCGTACCGAAACCGCGCGA AGGCTCATCAGGTCTATGCTTCTACCCAAATCACCTTTCTCTTCACCCTCTCATCTCTAC ACTCTCTTCTCCCTCTCTTCAACCCCCATGAAACCCCTTTTCTCCGACATGCTCTTATCC ATTTGTTCCGAGTCCAAAATGGTTTCGGAATCTGCGGAATTGTACATGTTGATGAAGAAA GATGGTGTATTGCCATCCGTAGCGTCTCTCAATCTGTTTCTTGAATCTTTGGTGTCGACA AAACGGTACGAGGATACTCTTCAGTTGTTTTCGGAGATTGTGGAGTCCGGGCTTCGACCG GATCAGTTTATGTATGGGAAGGCGATTCAGGCGGCAGTGAAGTTAGGGGACTTGAAAAGG GCTATTGAGCTTATGACTTGTATGAAGAGGGGAGGGGTGAGTCCGGGTGTTTTTGTGTAT AATGTTGTGATTGGTGGGTTGTGTAAAGAGAAGAGAATGAAGGATGCGGAGAAGCTATTT GACGAAATGCTTGATAGGAGGGTGGCACCCAATCGGATTACCTATAACACGCTTATTGAT GGGTATTGCAAAGTGGGACAGTTGGAGGAGGCATTTAATATTCGGGAGCGGATGAAGGTG GAAAATGTGGAGCCGACCATTATTACTTTCAATTCGTTGCTTAATGGGCTTTGTCGGGCA CAGATGATGGAAGAGGCACAACGGGTGTTGGAAGAGATGGAAGTTTATGGATTCGTTCCG GACAGATTTACTTATACTACTCTTTTTGATGGCCACTTGAAGTGTGGGAATGTGGATGCT TCAATTACCCTTTCTGAAGAAGCAGTAAGGAAAGGGGTTCAGATTCTTGATTATACTTGT AGCATTTTGTTGAATGCGTTATGTAAGGAAGGGAATATGGAGAAGGCTGAGGAAGTTTTG AAGAAGTTTTTGGAAAATGGGCTTGCTCCAGTAGGGGTGTTTTTTAACACAATTGTGAAT GGATACTGCCAGGTTGGTGATATTAACAAAGCATATACGACAATTGAAAAAATGGAAGCA GTTGGGTTGAGGCCCAACCATGTCACTTACAATTCCTTGGTCAAGAAGTTTTGTGAAATG AAGAATATGGAGGAGGCAGAGAAATGCATAAAGAAGATGGTGGAAAAGGGAGTTTTGCCA AATGTCGAGACATATAACACTTTAATTGATGGCTATGGGCGGAGTTGCCTTTTTGATAGG TGTTTCCAGATTCTCGAAGAAATGGAGAAAAAGGGGCTAAAGCCCAACGTTATAAGCTAT GGTTGTCTCATAAATTGTTTATGCAAGGATGCTAACATTCTTGAAGCTGAAGTAATACTT GGTGATATGGTACACAGAGGAGTGGTGCCAAACGCACAAATATACAATATGCTGATTGAT GGTAGCTGTATAGCGGGGAAGTTGAAAGATGCTTTCAGGTTTTTTGATGAGATGGTGGCA AGAGAGATTGTTCCCACGCTTGTAACATACAATATTCTTATAAATGGGCTCTGCAAAAAG GGTAAAGTAATGGAAGCTGAAAACTTGGCCTCTGAGATCACAAGGAAAGGTTTGAGTTTT GATGTGATCACATACAACTCCCTAATTTCTGGATATTCTAGTGCAGGAAATGTTCAGAAG GCTTTGGAATTATATGAAACTATGAAGAAATCAGGAATTAAACCTACTCTAAATACATAT CATCGTCTCATAGCTGGATGTGGCAAGGAAGGACTGGTGCTAGTGGAAAAAATTTATCAG GAAATGTTACAGATGAATTTGGTTCCTGATCGGGTTATATATAATGCACTTATTCATTGT TATGTTGAACATGGAGATGTCCAAAAGGCATGTTCTTTGCACTCTGCCATGGAAGCCCAG GGGATTCAGCCTGACAAGATGACCTATAATTGCTTGATTCTGGGGCACTTTAAAGAGGGT AGGATGCATAAAGTAAAGAATCTTGTCAATGATATGAAGATTAGAGGATTAATTCCTAAA ACTGAAACCTATGACATACTGATTGTGGGGCATTGCAAGCTAAAGGATTTCGATGGAGCT TATGTCTGGTACAGAGAAATGTTTGAGAATGGTTTCACTCCCAGTGTCTCTATTTGTGAC AATCTTATCACTGGCCTTAGAGAGGAGGGAAGGTCCCATGATGCTGATGTTATTTGCTCA GAAATGAATATGAAAGGAAAGGATGATTGTAGAGCAGATGAGGATGCTTCTGCTGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0007g03980.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:17995965:17998924:-1 gene:VIT_08s0007g03980 transcript:VIT_08s0007g03980.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAKRIHLSKFSVGSTLNKPQKSLLLPSCKPFCSLTEKQEPTSTTNNSTTNLQGQVQEQAR HEHVQKLQTLLQQGRTETARRLIRSMLLPKSPFSSPSHLYTLFSLSSTPMKPLFSDMLLS ICSESKMVSESAELYMLMKKDGVLPSVASLNLFLESLVSTKRYEDTLQLFSEIVESGLRP DQFMYGKAIQAAVKLGDLKRAIELMTCMKRGGVSPGVFVYNVVIGGLCKEKRMKDAEKLF DEMLDRRVAPNRITYNTLIDGYCKVGQLEEAFNIRERMKVENVEPTIITFNSLLNGLCRA QMMEEAQRVLEEMEVYGFVPDRFTYTTLFDGHLKCGNVDASITLSEEAVRKGVQILDYTC SILLNALCKEGNMEKAEEVLKKFLENGLAPVGVFFNTIVNGYCQVGDINKAYTTIEKMEA VGLRPNHVTYNSLVKKFCEMKNMEEAEKCIKKMVEKGVLPNVETYNTLIDGYGRSCLFDR CFQILEEMEKKGLKPNVISYGCLINCLCKDANILEAEVILGDMVHRGVVPNAQIYNMLID GSCIAGKLKDAFRFFDEMVAREIVPTLVTYNILINGLCKKGKVMEAENLASEITRKGLSF DVITYNSLISGYSSAGNVQKALELYETMKKSGIKPTLNTYHRLIAGCGKEGLVLVEKIYQ EMLQMNLVPDRVIYNALIHCYVEHGDVQKACSLHSAMEAQGIQPDKMTYNCLILGHFKEG RMHKVKNLVNDMKIRGLIPKTETYDILIVGHCKLKDFDGAYVWYREMFENGFTPSVSICD NLITGLREEGRSHDADVICSEMNMKGKDDCRADEDASAV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0007g03980.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:17995965:17998924:-1 gene:VIT_08s0007g03980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	GAAGCAAGTTGCAACCATGTCCCATAAATAAGTGGTAGCGCCAATCTTGCAAGGGCGTTA AATCAAATAAAGGGTGAAGAGAAGGAAAATGGCGAAACGAATCCATCTCTCAAAATTCTC CGTCGGTAGTACCCTGAACAAACCCCAAAAATCCCTCTTGCTTCCTTCCTGCAAGCCCTT CTGCTCTCTCACAGAGAAGCAAGAACCTACGTCTACTACAAACAACAGCACCACCAACCT CCAAGGTCAAGTCCAAGAACAGGCCCGCCATGAACATGTTCAAAAGCTCCAAACCCTCCT CCAACAGGGTCGTACCGAAACCGCGCGAAGGCTCATCAGGTCTATGCTTCTACCCAAATC ACCTTTCTCTTCACCCTCTCATCTCTACACTCTCTTCTCCCTCTCTTCAACCCCCATGAA ACCCCTTTTCTCCGACATGCTCTTATCCATTTGTTCCGAGTCCAAAATGGTTTCGGAATC TGCGGAATTGTACATGTTGATGAAGAAAGATGGTGTATTGCCATCCGTAGCGTCTCTCAA TCTGTTTCTTGAATCTTTGGTGTCGACAAAACGGTACGAGGATACTCTTCAGTTGTTTTC GGAGATTGTGGAGTCCGGGCTTCGACCGGATCAGTTTATGTATGGGAAGGCGATTCAGGC GGCAGTGAAGTTAGGGGACTTGAAAAGGGCTATTGAGCTTATGACTTGTATGAAGAGGGG AGGGGTGAGTCCGGGTGTTTTTGTGTATAATGTTGTGATTGGTGGGTTGTGTAAAGAGAA GAGAATGAAGGATGCGGAGAAGCTATTTGACGAAATGCTTGATAGGAGGGTGGCACCCAA TCGGATTACCTATAACACGCTTATTGATGGGTATTGCAAAGTGGGACAGTTGGAGGAGGC ATTTAATATTCGGGAGCGGATGAAGGTGGAAAATGTGGAGCCGACCATTATTACTTTCAA TTCGTTGCTTAATGGGCTTTGTCGGGCACAGATGATGGAAGAGGCACAACGGGTGTTGGA AGAGATGGAAGTTTATGGATTCGTTCCGGACAGATTTACTTATACTACTCTTTTTGATGG CCACTTGAAGTGTGGGAATGTGGATGCTTCAATTACCCTTTCTGAAGAAGCAGTAAGGAA AGGGGTTCAGATTCTTGATTATACTTGTAGCATTTTGTTGAATGCGTTATGTAAGGAAGG GAATATGGAGAAGGCTGAGGAAGTTTTGAAGAAGTTTTTGGAAAATGGGCTTGCTCCAGT AGGGGTGTTTTTTAACACAATTGTGAATGGATACTGCCAGGTTGGTGATATTAACAAAGC ATATACGACAATTGAAAAAATGGAAGCAGTTGGGTTGAGGCCCAACCATGTCACTTACAA TTCCTTGGTCAAGAAGTTTTGTGAAATGAAGAATATGGAGGAGGCAGAGAAATGCATAAA GAAGATGGTGGAAAAGGGAGTTTTGCCAAATGTCGAGACATATAACACTTTAATTGATGG CTATGGGCGGAGTTGCCTTTTTGATAGGTGTTTCCAGATTCTCGAAGAAATGGAGAAAAA GGGGCTAAAGCCCAACGTTATAAGCTATGGTTGTCTCATAAATTGTTTATGCAAGGATGC TAACATTCTTGAAGCTGAAGTAATACTTGGTGATATGGTACACAGAGGAGTGGTGCCAAA CGCACAAATATACAATATGCTGATTGATGGTAGCTGTATAGCGGGGAAGTTGAAAGATGC TTTCAGGTTTTTTGATGAGATGGTGGCAAGAGAGATTGTTCCCACGCTTGTAACATACAA TATTCTTATAAATGGGCTCTGCAAAAAGGGTAAAGTAATGGAAGCTGAAAACTTGGCCTC TGAGATCACAAGGAAAGGTTTGAGTTTTGATGTGATCACATACAACTCCCTAATTTCTGG ATATTCTAGTGCAGGAAATGTTCAGAAGGCTTTGGAATTATATGAAACTATGAAGAAATC AGGAATTAAACCTACTCTAAATACATATCATCGTCTCATAGCTGGATGTGGCAAGGAAGG ACTGGTGCTAGTGGAAAAAATTTATCAGGAAATGTTACAGATGAATTTGGTTCCTGATCG GGTTATATATAATGCACTTATTCATTGTTATGTTGAACATGGAGATGTCCAAAAGGCATG TTCTTTGCACTCTGCCATGGAAGCCCAGGGGATTCAGCCTGACAAGATGACCTATAATTG CTTGATTCTGGGGCACTTTAAAGAGGGTAGGATGCATAAAGTAAAGAATCTTGTCAATGA TATGAAGATTAGAGGATTAATTCCTAAAACTGAAACCTATGACATACTGATTGTGGGGCA TTGCAAGCTAAAGGATTTCGATGGAGCTTATGTCTGGTACAGAGAAATGTTTGAGAATGG TTTCACTCCCAGTGTCTCTATTTGTGACAATCTTATCACTGGCCTTAGAGAGGAGGGAAG GTCCCATGATGCTGATGTTATTTGCTCAGAAATGAATATGAAAGGAAAGGATGATTGTAG AGCAGATGAGGATGCTTCTGCTGTTTGAAAATTGTAGTGAGTGTTTGTTGGGGTTAAGCT CTCAGTAGAGTAATTCGTCTACAAAGAAAGGCCTAGGTATATTGGGAGACCTTTACCATA TTTTGATGTTTCTGTTAGCTTATTATTTCCTTGTTGATCCCAAAATGCAGGCAGGGGCTT AACTGGTCTCGAAGGTGGTAGATGAGGTTCTCCATTCAAAATTAGCATTAAAGCAGATAT GTTCAGAGGACTAAGCGCTGGCAGACCTTCCACAATTATGAAGATTTGGCAGGGAGATAT TCATGCTGTATAAGTTTTAACAAAATAATTAAATTGATCTCCAAAGAAAATGAGGTATCT CATACTTATAGCTTTGCTATGTTGTTCAGAGTTGTATATCTACTCTAGGCAGAATTCCTT TTCATATTTAAGGGTGTGGA