Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0007g03150.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:17167523:17169413:-1 gene:VIT_08s0007g03150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACCAGACCACACCCACTCTTTCCATACGCAAACAAATGGTTGGACCTTCAGAACACA ACCGCCTCATGGAACGCTCGCTTAAGAGAGCTAGCAAGACAGCGCCATTTTCAAGAAGCT CTCAATCTCTACTGCCAAATGCTTGCCTCTGGAGACTCTCCCAACGCATTCACCTTTCCT TTCGCATTCAAATCATGCGCCTCCCTCTCACTGCCTCTCGCCGGTTCACAACTCCATGGT CACGTAATCAAGACTGGGTGCGAGCCCGAACCTTTCGTCCAGACTTCTTTGATTTCAATG TATTGTAAGTGCTCGACTATTGCAAGCGCACGTAAAGTGTTTGATGAAAATCATCACTCG AGAAACCTTGCTGTTTGTTACAATGCCTTGATTGCTGGGTATTCGTTGAACTCTCGATTT TCGGATGCGGTTTTGTTGTTTCGTCAAATGAGGAAGGAGGGTGTTTCGGTTAATGCAGTG ACAATGTTGGGCTTAATTCCGGTTTGTGCCGGTCCCATTCATTTGGGTTTTGGAACGTCT CTTCATGCTTGTAGCGTGAGGTTTGGATTGGATGGTGATTTGTCAGTTGGGAATTGTTTG CTAACAATGTATGTGCGATGTGGGTCGGTTGATTTTGCGAGGAAGTTGTTTGATGGAATG CCCGAAAAGGGGTTGATTACTTGGAATGCAATGATATCTGGATATGCTCAAAATGGGCTT GCAGGCCATGTTTTGGACCTTTATCGGAAGATGGAGTTTACAGGAATTGTTCCCGACCCG GTGACACTAGTTGGGGTTCTGTCATCCTGTGCTCACCTTGGGGCCCATGCCGCTGGAAGG GAGGTAGAACAGCGGATAGAGTTAAGTGGATTTGGCTTCAATCCCTTCTTGAAAAATGCT TTAATTAATATGTATGCTAGGTGTGGAAACTTGGTAAAGGCTCGTGCTATTTTTGATGGC ATGACTGAGAAAAATGTAATTTCATGGACAGCAATTATAGCCGGATATGGAATGCATGGA CAAGGTGAACTTGCAGTGCAACTCTTCGATGAAATGATTAGTTCTGATGAACTGCCGGAT GGAGCAGCTTTTGTGAGTGTTTTATCTGCTTGTAGCCATGCGGGACTGACTGAGAAGGGC TTGTATTATTTTACTGCAATGGAGAGGGATTATGGATTGCAGCCTGGTCCAGAGCATTAC TCTTGTGTTGTGGATCTTTTAGGTAGGGCAGGACGACTTGAGGAAGCTCGCAAACTCATT GGGTCAATGTCAGTGGAACCTGATGGTGCAGTATGGGGAGCCCTTTTGGGTGCTTGTAAG ATCCACAGAAATGTAGAGCTGGCCGAGTTAGCTTTTGAAAAGGTCATTGAGTTTGAACCT ACAAATATTGGTTATTATGTATTGTTATCAAATATATTCTCTGAGGCAGGGAATATGGAG GGGATATTAAGGGTTAGAGTGATGATGAGAGAGCGGAAGCTCAAAAAGGAGCCAGGTTGT AGCTATGTTGAATATCAAGGGAGGATTCACCTCTTCTTGGCTGGGGATAGAACCCATCCA CAGGCACAGGAGATATATCACATGTTGGATGGATTGGAAGATATCATCAAGAGACGTGGT GGGTCTAATGATAATGATCAAGAGAGTAGAAATGAAGAGCTTATAACTGGTATGGGAGTG CATAGCGAAAAGTTAGCAATTGCATTTGGACTCATAAACACTGAGCCAGGGACAGAGATT ACTGTGATAAAGAACCTGAGGGTATGTGGAGATTGTCATCTATTTCTAAAGTTGGTCAGT GAGATTGTGGACAGGCAGCTTGTTGTTAGGGATGCCACTCGTTTTCACCATTTTAAGAAT GGAGTTTGTTCTTGTAAAGACTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0007g03150.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:17167523:17169413:-1 gene:VIT_08s0007g03150 transcript:VIT_08s0007g03150.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTRPHPLFPYANKWLDLQNTTASWNARLRELARQRHFQEALNLYCQMLASGDSPNAFTFP FAFKSCASLSLPLAGSQLHGHVIKTGCEPEPFVQTSLISMYCKCSTIASARKVFDENHHS RNLAVCYNALIAGYSLNSRFSDAVLLFRQMRKEGVSVNAVTMLGLIPVCAGPIHLGFGTS LHACSVRFGLDGDLSVGNCLLTMYVRCGSVDFARKLFDGMPEKGLITWNAMISGYAQNGL AGHVLDLYRKMEFTGIVPDPVTLVGVLSSCAHLGAHAAGREVEQRIELSGFGFNPFLKNA LINMYARCGNLVKARAIFDGMTEKNVISWTAIIAGYGMHGQGELAVQLFDEMISSDELPD GAAFVSVLSACSHAGLTEKGLYYFTAMERDYGLQPGPEHYSCVVDLLGRAGRLEEARKLI GSMSVEPDGAVWGALLGACKIHRNVELAELAFEKVIEFEPTNIGYYVLLSNIFSEAGNME GILRVRVMMRERKLKKEPGCSYVEYQGRIHLFLAGDRTHPQAQEIYHMLDGLEDIIKRRG GSNDNDQESRNEELITGMGVHSEKLAIAFGLINTEPGTEITVIKNLRVCGDCHLFLKLVS EIVDRQLVVRDATRFHHFKNGVCSCKDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0007g03150.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:17167523:17169413:-1 gene:VIT_08s0007g03150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACCAGACCACACCCACTCTTTCCATACGCAAACAAATGGTTGGACCTTCAGAACACA ACCGCCTCATGGAACGCTCGCTTAAGAGAGCTAGCAAGACAGCGCCATTTTCAAGAAGCT CTCAATCTCTACTGCCAAATGCTTGCCTCTGGAGACTCTCCCAACGCATTCACCTTTCCT TTCGCATTCAAATCATGCGCCTCCCTCTCACTGCCTCTCGCCGGTTCACAACTCCATGGT CACGTAATCAAGACTGGGTGCGAGCCCGAACCTTTCGTCCAGACTTCTTTGATTTCAATG TATTGTAAGTGCTCGACTATTGCAAGCGCACGTAAAGTGTTTGATGAAAATCATCACTCG AGAAACCTTGCTGTTTGTTACAATGCCTTGATTGCTGGGTATTCGTTGAACTCTCGATTT TCGGATGCGGTTTTGTTGTTTCGTCAAATGAGGAAGGAGGGTGTTTCGGTTAATGCAGTG ACAATGTTGGGCTTAATTCCGGTTTGTGCCGGTCCCATTCATTTGGGTTTTGGAACGTCT CTTCATGCTTGTAGCGTGAGGTTTGGATTGGATGGTGATTTGTCAGTTGGGAATTGTTTG CTAACAATGTATGTGCGATGTGGGTCGGTTGATTTTGCGAGGAAGTTGTTTGATGGAATG CCCGAAAAGGGGTTGATTACTTGGAATGCAATGATATCTGGATATGCTCAAAATGGGCTT GCAGGCCATGTTTTGGACCTTTATCGGAAGATGGAGTTTACAGGAATTGTTCCCGACCCG GTGACACTAGTTGGGGTTCTGTCATCCTGTGCTCACCTTGGGGCCCATGCCGCTGGAAGG GAGGTAGAACAGCGGATAGAGTTAAGTGGATTTGGCTTCAATCCCTTCTTGAAAAATGCT TTAATTAATATGTATGCTAGGTGTGGAAACTTGGTAAAGGCTCGTGCTATTTTTGATGGC ATGACTGAGAAAAATGTAATTTCATGGACAGCAATTATAGCCGGATATGGAATGCATGGA CAAGGTGAACTTGCAGTGCAACTCTTCGATGAAATGATTAGTTCTGATGAACTGCCGGAT GGAGCAGCTTTTGTGAGTGTTTTATCTGCTTGTAGCCATGCGGGACTGACTGAGAAGGGC TTGTATTATTTTACTGCAATGGAGAGGGATTATGGATTGCAGCCTGGTCCAGAGCATTAC TCTTGTGTTGTGGATCTTTTAGGTAGGGCAGGACGACTTGAGGAAGCTCGCAAACTCATT GGGTCAATGTCAGTGGAACCTGATGGTGCAGTATGGGGAGCCCTTTTGGGTGCTTGTAAG ATCCACAGAAATGTAGAGCTGGCCGAGTTAGCTTTTGAAAAGGTCATTGAGTTTGAACCT ACAAATATTGGTTATTATGTATTGTTATCAAATATATTCTCTGAGGCAGGGAATATGGAG GGGATATTAAGGGTTAGAGTGATGATGAGAGAGCGGAAGCTCAAAAAGGAGCCAGGTTGT AGCTATGTTGAATATCAAGGGAGGATTCACCTCTTCTTGGCTGGGGATAGAACCCATCCA CAGGCACAGGAGATATATCACATGTTGGATGGATTGGAAGATATCATCAAGAGACGTGGT GGGTCTAATGATAATGATCAAGAGAGTAGAAATGAAGAGCTTATAACTGGTATGGGAGTG CATAGCGAAAAGTTAGCAATTGCATTTGGACTCATAAACACTGAGCCAGGGACAGAGATT ACTGTGATAAAGAACCTGAGGGTATGTGGAGATTGTCATCTATTTCTAAAGTTGGTCAGT GAGATTGTGGACAGGCAGCTTGTTGTTAGGGATGCCACTCGTTTTCACCATTTTAAGAAT GGAGTTTGTTCTTGTAAAGACTATTGGTAAA