Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0007g02780.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:16833777:16835635:-1 gene:VIT_08s0007g02780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCTGTCACGGAAAGAGCAATAAACAGGAGTTTTGCGCTGGGGAGTGGGAGGAGGGT TGTAAATCGGGGTCTCTGAATGAAATCAGGTGTAGGGAAAGGAGAAAGAAAAGGCGATGC CAATCCATCATCTTCCTTCCTATGACTTTTATCCGCCGGTACACTGCCCTCACCTTCCCT GATTACCTCCCAACTCTCCGAAGCTTCGACACGACCTCATCTATCTCAACTCTCCTCAAA GCCTGCACGACAACCTCTACTCTCGAACAGGTACACGCCCGTATCATCCGCAAGGGCCTC CACCAAGACCATTTTATTATATCCCAATTCCTCACTCTCTGTAATTCTCTCTCTAACTTC TCTTACACCACTAGCGTCTTCAACGGCGTTTCCTCTCCCAGCACTGTTCTGTGGAACACT TATATCAAAGGCTACTCTGAGAACTATTCCGTTTCCCTCACCGTCTCGCTTTTTATCCGC ATGAAGCGGTCCGATGCTGTTCCTGATAAATTTACATACCCCTCGTTGATTAAGGCTTGC TCCAAGGTGTGTGGGGTGAAAGAAGGCGTGGCATTTCATGGGTCGGCAGTGAGGTGTGGG GTTGGAGGTGATGTCTTTGTAATGACGAGTCTGATCGATTTGTATGGCAAGTGCGGGGAG ATTTTGTGTGCACGCAAGGTGTTTGATGAAATGGGCGAGAGGAATGTGGTTTCTTGGACG GCTATGATTGCTGGGTATGCCAGTTTTAGTGATTTGGTGGAAGCCAGGAAGTTGTTTGAC GAGATGCCGGAGAAGAATGCGGTGTCCTGGAATGCAATAATAAGTGGGTACGTGAAGTGT GGGGATTTGAGGAGTGCTAGGAAGATGTTTGATGAAATGCCTCACAGGAATGTGGTTTCT TTTACGACGATGATCGATGGGTATGCTAAGTCGGGGGATATGGCATCGGCGAGGTTTGTT TTCGAGGAAGCCCCAGAGAGAGATGTCGTTGCATGGTCTGCTTTGATATCCGGGTATGTG CAGAATGGTCAGCCTAACGAGGCCGTGAAGATTTTTCTTGAAATGTGCTCTAGGAATGTT AAGCCGGATGAGTTCATTATGGTAAGTCTAATGTCGGCTTGCTCCCAAATGGGTAGTTTG GAACTGGCTAAATGGGTTGATGATTATGTGAGAAAAAGCTCAATTGATGTTCATCGGGCT CATGTCATTGCTGCTCTTATAGATATGAACGCAAAGTGTGGGAGCATGGACAGAGCAACT AAGTTGTTTGAAGAGATGCCAAAACGGGACTTAATCTCTTATTGTTCTATGATGCAAGGG CTATCTATTCATGGGTGTGGGCCTCAGGCGGTTAGTCTCTTTTCTAGGATGCTAAATGAA GGGCTGACTCCAGATGATGTGGCATTCACAGTCATCCTGACGGCTTGTAGCCGTGCAGGG CTTGTTGATGAGGGATGCTATTACTTTGAGTCCATGAAAACTGACTACTCTATAGTCCCT TCTCCTGATCACTATGCATGTATGGTTGATCTTCTTGGCAGGGCAGGCAGACTGAAAGAA GCCTATGAGCTTTTAAAGTCAATGCCTGTGGAACCACATGCTGGTGCATGGGGTGCACTT CTTGGGGCTTGTAAGTTACATTGTGATATTGAGCTAGGTGAGGTGGTTGCGGATCAACTT TTTGAGCTTGAGCCGCAAAATGCTGGTAACTATGTGTTGTTGTCAAACATATATGCGGCA GCTGAACAATGGTTAGATGTCTCTCTTTTAAGGAACAAGATGAGGGAGAGAGGGATTAGA AAGATACCTGGTTGTAGTTGGATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0007g02780.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:16833777:16835635:-1 gene:VIT_08s0007g02780 transcript:VIT_08s0007g02780.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MICHGKSNKQEFCAGEWEEGCKSGSLNEIRCRERRKKRRCQSIIFLPMTFIRRYTALTFP DYLPTLRSFDTTSSISTLLKACTTTSTLEQVHARIIRKGLHQDHFIISQFLTLCNSLSNF SYTTSVFNGVSSPSTVLWNTYIKGYSENYSVSLTVSLFIRMKRSDAVPDKFTYPSLIKAC SKVCGVKEGVAFHGSAVRCGVGGDVFVMTSLIDLYGKCGEILCARKVFDEMGERNVVSWT AMIAGYASFSDLVEARKLFDEMPEKNAVSWNAIISGYVKCGDLRSARKMFDEMPHRNVVS FTTMIDGYAKSGDMASARFVFEEAPERDVVAWSALISGYVQNGQPNEAVKIFLEMCSRNV KPDEFIMVSLMSACSQMGSLELAKWVDDYVRKSSIDVHRAHVIAALIDMNAKCGSMDRAT KLFEEMPKRDLISYCSMMQGLSIHGCGPQAVSLFSRMLNEGLTPDDVAFTVILTACSRAG LVDEGCYYFESMKTDYSIVPSPDHYACMVDLLGRAGRLKEAYELLKSMPVEPHAGAWGAL LGACKLHCDIELGEVVADQLFELEPQNAGNYVLLSNIYAAAEQWLDVSLLRNKMRERGIR KIPGCSWI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0007g02780.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:16833777:16835635:-1 gene:VIT_08s0007g02780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCTGTCACGGAAAGAGCAATAAACAGGAGTTTTGCGCTGGGGAGTGGGAGGAGGGT TGTAAATCGGGGTCTCTGAATGAAATCAGGTGTAGGGAAAGGAGAAAGAAAAGGCGATGC CAATCCATCATCTTCCTTCCTATGACTTTTATCCGCCGGTACACTGCCCTCACCTTCCCT GATTACCTCCCAACTCTCCGAAGCTTCGACACGACCTCATCTATCTCAACTCTCCTCAAA GCCTGCACGACAACCTCTACTCTCGAACAGGTACACGCCCGTATCATCCGCAAGGGCCTC CACCAAGACCATTTTATTATATCCCAATTCCTCACTCTCTGTAATTCTCTCTCTAACTTC TCTTACACCACTAGCGTCTTCAACGGCGTTTCCTCTCCCAGCACTGTTCTGTGGAACACT TATATCAAAGGCTACTCTGAGAACTATTCCGTTTCCCTCACCGTCTCGCTTTTTATCCGC ATGAAGCGGTCCGATGCTGTTCCTGATAAATTTACATACCCCTCGTTGATTAAGGCTTGC TCCAAGGTGTGTGGGGTGAAAGAAGGCGTGGCATTTCATGGGTCGGCAGTGAGGTGTGGG GTTGGAGGTGATGTCTTTGTAATGACGAGTCTGATCGATTTGTATGGCAAGTGCGGGGAG ATTTTGTGTGCACGCAAGGTGTTTGATGAAATGGGCGAGAGGAATGTGGTTTCTTGGACG GCTATGATTGCTGGGTATGCCAGTTTTAGTGATTTGGTGGAAGCCAGGAAGTTGTTTGAC GAGATGCCGGAGAAGAATGCGGTGTCCTGGAATGCAATAATAAGTGGGTACGTGAAGTGT GGGGATTTGAGGAGTGCTAGGAAGATGTTTGATGAAATGCCTCACAGGAATGTGGTTTCT TTTACGACGATGATCGATGGGTATGCTAAGTCGGGGGATATGGCATCGGCGAGGTTTGTT TTCGAGGAAGCCCCAGAGAGAGATGTCGTTGCATGGTCTGCTTTGATATCCGGGTATGTG CAGAATGGTCAGCCTAACGAGGCCGTGAAGATTTTTCTTGAAATGTGCTCTAGGAATGTT AAGCCGGATGAGTTCATTATGGTAAGTCTAATGTCGGCTTGCTCCCAAATGGGTAGTTTG GAACTGGCTAAATGGGTTGATGATTATGTGAGAAAAAGCTCAATTGATGTTCATCGGGCT CATGTCATTGCTGCTCTTATAGATATGAACGCAAAGTGTGGGAGCATGGACAGAGCAACT AAGTTGTTTGAAGAGATGCCAAAACGGGACTTAATCTCTTATTGTTCTATGATGCAAGGG CTATCTATTCATGGGTGTGGGCCTCAGGCGGTTAGTCTCTTTTCTAGGATGCTAAATGAA GGGCTGACTCCAGATGATGTGGCATTCACAGTCATCCTGACGGCTTGTAGCCGTGCAGGG CTTGTTGATGAGGGATGCTATTACTTTGAGTCCATGAAAACTGACTACTCTATAGTCCCT TCTCCTGATCACTATGCATGTATGGTTGATCTTCTTGGCAGGGCAGGCAGACTGAAAGAA GCCTATGAGCTTTTAAAGTCAATGCCTGTGGAACCACATGCTGGTGCATGGGGTGCACTT CTTGGGGCTTGTAAGTTACATTGTGATATTGAGCTAGGTGAGGTGGTTGCGGATCAACTT TTTGAGCTTGAGCCGCAAAATGCTGGTAACTATGTGTTGTTGTCAAACATATATGCGGCA GCTGAACAATGGTTAGATGTCTCTCTTTTAAGGAACAAGATGAGGGAGAGAGGGATTAGA AAGATACCTGGTTGTAGTTGGATTTAGTTGATGGGGTTGAGTTGAGTTTCCTGACACAC