Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_07s0141g01060.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:7:686589:688386:1 gene:VIT_07s0141g01060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTGAAAAATTTTGGTTGAATGAAGAGGAAAAGGCTATGGTGGAGTCAGTATTGGGT GCAGAAGGGTGGGAGTTTTTGATCTCGTGCGCTTCTGATAAAACCCATTTGTCAGAATCG GGTGTCGCATCCAGTGATGGTGGTGTCCAGAAGGGGCTTCGTCAGCTTGTTGAAGGGTCT AATTGGAGTTACGCCATATTCTGGCGTGTTTCGAGGGTGAAGGATGTGTTGATTTGGGGT GATGGATATTGTAGAGAGGCAAAAGGGGAGGTTGGTGATGGTGGTTTGGAGGAAGTGGGG AAGAAGAAGGAGGTGCTGAAGAAGCTTCATGAGTATTTTGGGGTTGGGGAGGAGGATAAA TACTGGGCTAAATTGGATTTGTTGTCAAACATCGAGATGTTTTATCTTACTTCGATGTTT TATTCGTTTTCGGGTGATTTGCAGTATGGCCCTGCTCTGGTGCTTAAGTCTGGGAGATGG GTTTGGGTTGTTGATGCAGTTGGTTGTTCAGATCAGTATCGGGCAAGGTCGGTTTTGGCA AGATTGGCAGGGTTTCAGACAGTTGTGTTTGTGCCAGTGAAGGATGGGGTGATTGAGGTT GCTTCTTTAATGTTGGTTAAGGAGGATGAGAATGTTGTGAAGATGATTAAGGGTGTATTT GGGGGGATGAATTTTGGGCAGGCGAAGGTGTATCCAAAAATATTTGGGCATGAACTTAGT CTTGGTAGTGGGGCAAAGTCACGGTCAATGAGTATTAATTTTGCCCCCAAGTTGGAAGGG GATTCAGGGTTTGGTGCAGAATCATATGATGTCCAAGGCTTGGGTTCAAATCAGGTTTAT GGGAATTCCTCTAATGGGTGTATGAATGAGGATAATGAGGGGAAAATATTCCCTCAGCTC AATCAAATATTTAATGCTCAAGTATTGGTTTCTGGTTTTGAGCAGCCTAAGGATGACTTG TTGCCTAGGGTTGATGAACGAAAACCTAGGAAGAGAGGAAGGAAGCCAGCTAATGGGAGA GAAGAGCCATTGAATCACGTGGAAGCTGAGAGGCAGAGGAGGGAGAAGCTTAACCAAAGG TTCTATGCATTAAGAGCTGTTGTTCCTAATATATCCAAGATGGATAAGGCCTCGTTGCTT GGTGATGCCATTTCATACATTACTGATCTCCAGATGAAGATTCGGATATTGGAAGCTGAG AAGGAGATTGTAAACAATAAGCAAAACCAATCACCTGTGCCACAGATCGACTTTCAGGAT AGGCAGGAGGACACAGTTGTAAGAGTTAGCTGTCCCTTGGATGCTCATCCTGTTTCTAGA GTCATAAAGACGCTTAAGGAACACCAAGTTGTAGCTCCAGAGGCTGAAGTTTCCACTATG GAAAATGATAAGGTCCTTCACACGTTCTCCATTCGGACTCAAACTGGTGCTGCCGAGTGC TTGAAGGAGAAGCTGGTAGCTGCCCTTTCAAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_07s0141g01060.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:7:686589:688386:1 gene:VIT_07s0141g01060 transcript:VIT_07s0141g01060.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGEKFWLNEEEKAMVESVLGAEGWEFLISCASDKTHLSESGVASSDGGVQKGLRQLVEGS NWSYAIFWRVSRVKDVLIWGDGYCREAKGEVGDGGLEEVGKKKEVLKKLHEYFGVGEEDK YWAKLDLLSNIEMFYLTSMFYSFSGDLQYGPALVLKSGRWVWVVDAVGCSDQYRARSVLA RLAGFQTVVFVPVKDGVIEVASLMLVKEDENVVKMIKGVFGGMNFGQAKVYPKIFGHELS LGSGAKSRSMSINFAPKLEGDSGFGAESYDVQGLGSNQVYGNSSNGCMNEDNEGKIFPQL NQIFNAQVLVSGFEQPKDDLLPRVDERKPRKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQR FYALRAVVPNISKMDKASLLGDAISYITDLQMKIRILEAEKEIVNNKQNQSPVPQIDFQD RQEDTVVRVSCPLDAHPVSRVIKTLKEHQVVAPEAEVSTMENDKVLHTFSIRTQTGAAEC LKEKLVAALSK

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_07s0141g01060.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:7:686589:688386:1 gene:VIT_07s0141g01060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AAACGATATAATCCAAGAAAATCCACCACAGGGGTGTTTTTGGGCTCCCGAGCGCTAGCT CTCAGATCTGAAGTTCTAACCCAAGAATCCCAGGTACTTTTTGTTTCAATCTCTTCATTT CTTGTTATAGTTGGTCTATAAATTTTCAAATTTCTAATTTTGTGAGAAAGGAGGAAGAAA CCAAATATGGGTGAAAAATTTTGGTTGAATGAAGAGGAAAAGGCTATGGTGGAGTCAGTA TTGGGTGCAGAAGGGTGGGAGTTTTTGATCTCGTGCGCTTCTGATAAAACCCATTTGTCA GAATCGGGTGTCGCATCCAGTGATGGTGGTGTCCAGAAGGGGCTTCGTCAGCTTGTTGAA GGGTCTAATTGGAGTTACGCCATATTCTGGCGTGTTTCGAGGGTGAAGGATGTGTTGATT TGGGGTGATGGATATTGTAGAGAGGCAAAAGGGGAGGTTGGTGATGGTGGTTTGGAGGAA GTGGGGAAGAAGAAGGAGGTGCTGAAGAAGCTTCATGAGTATTTTGGGGTTGGGGAGGAG GATAAATACTGGGCTAAATTGGATTTGTTGTCAAACATCGAGATGTTTTATCTTACTTCG ATGTTTTATTCGTTTTCGGGTGATTTGCAGTATGGCCCTGCTCTGGTGCTTAAGTCTGGG AGATGGGTTTGGGTTGTTGATGCAGTTGGTTGTTCAGATCAGTATCGGGCAAGGTCGGTT TTGGCAAGATTGGCAGGGTTTCAGACAGTTGTGTTTGTGCCAGTGAAGGATGGGGTGATT GAGGTTGCTTCTTTAATGTTGGTTAAGGAGGATGAGAATGTTGTGAAGATGATTAAGGGT GTATTTGGGGGGATGAATTTTGGGCAGGCGAAGGTGTATCCAAAAATATTTGGGCATGAA CTTAGTCTTGGTAGTGGGGCAAAGTCACGGTCAATGAGTATTAATTTTGCCCCCAAGTTG GAAGGGGATTCAGGGTTTGGTGCAGAATCATATGATGTCCAAGGCTTGGGTTCAAATCAG GTTTATGGGAATTCCTCTAATGGGTGTATGAATGAGGATAATGAGGGGAAAATATTCCCT CAGCTCAATCAAATATTTAATGCTCAAGTATTGGTTTCTGGTTTTGAGCAGCCTAAGGAT GACTTGTTGCCTAGGGTTGATGAACGAAAACCTAGGAAGAGAGGAAGGAAGCCAGCTAAT GGGAGAGAAGAGCCATTGAATCACGTGGAAGCTGAGAGGCAGAGGAGGGAGAAGCTTAAC CAAAGGTTCTATGCATTAAGAGCTGTTGTTCCTAATATATCCAAGATGGATAAGGCCTCG TTGCTTGGTGATGCCATTTCATACATTACTGATCTCCAGATGAAGATTCGGATATTGGAA GCTGAGAAGGAGATTGTAAACAATAAGCAAAACCAATCACCTGTGCCACAGATCGACTTT CAGGATAGGCAGGAGGACACAGTTGTAAGAGTTAGCTGTCCCTTGGATGCTCATCCTGTT TCTAGAGTCATAAAGACGCTTAAGGAACACCAAGTTGTAGCTCCAGAGGCTGAAGTTTCC ACTATGGAAAATGATAAGGTCCTTCACACGTTCTCCATTCGGACTCAAACTGGTGCTGCC GAGTGCTTGAAGGAGAAGCTGGTAGCTGCCCTTTCAAAATGATTTGTCTGTAGATTTTGC GTTTGTAAGATGAATTCTAATGAATGATATACATCGTCCTGCTGAAATTCGGGATGTCTT GTTATTGACTAACTAATGTGTGTGTCTTCCTTTGTTGTTAATTGTTTCTTATCTGGCT