Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_07s0130g00180.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:7:20476712:20479266:-1 gene:VIT_07s0130g00180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATGAAGCTCTGTCCCTTTTCCTCGAAAGGGTACGATTCTCTGTGTAAAGGATTGCTC AACTTGTATGCAAAATCTGGAGCTCTTGATTATTGCAACAAACTATTTGGTGAGATGGAC CAACGTGATCCCGTCATTTGGAACATTGTCCTCTCTGGTTTGGCTGGATTCCAAAGTCAT GAGGCTGAGGTGATGAGGTTGTTCCGTGCAATGCATATGGTAAATGAAGCTAAGCCCAAC TCTGTCACCATTGCTATTGTTCTTCCTGTGTGCGCTCGTCTCCGAGAAGATGCTGGGAAG AGTGTGCACTCTTATGTGATTAAATCAGGGTTGGAATCACATACCCTTGCAGGAAATGCC TTAATATCAATGTATGCAAAGTGCGGGCTTGTTTGCAGTGATGCATATGCTGCATTTAAT AGAATTGAGTTCAAAGATGTGGTTTCATGGAATGCAGTGATTGCAGGGTTTTCTGAGAAT AAGTTCACAGAAGAAGCATTCAAATTATTCCATGCAATGCTTAAAGGACCGATACAACCT AATTATGCAACAATTGCAAGTATTCTACCTGTGTGTGCATCATTAGAAGAGAATGCTGGT TACCGGTATGGGAAAGAGGTCCACTGTCATGTTTTGCGAAGAATGGAGCTGGTAGAAGAT GTTTCTGTAATCAACTCTCTTATGAGCTTTTACCTGAGGATTGGACAGATGGAAAAAGCA GAATTCTTGTTCAGAAACATGAAATCAAGAGATTTGGTTTCATGGAATGCTATTATTGCA GGGTATGCCTCAAATGGTGAGTGGTTGAAAGCATTAGAGTTATTTTCGGAGTTCATCTCT CTAGAGACAATAAAGCCAGATTCTGTCACCCTTGTTAGTGTTCTTCCCGCTTGTGCCCAT GTACATAATTTGCAGGTAGCAAAGGGGATCCATGGCTATATTATCCGGCATCCTGGTCTA CGTGAGGATACATCAGTTGGAAATGCCCTTCTAAGTTTCTATGCAAAATGCAATTACACA CAAGCTGCTCTTCAGACATTCTTAATGATTTCTCGTAAAGACTTGATATCATGGAATGCT ATTCTTGATGCCTTTACAGAGAGTGGGTGTGAAACTCACCTTGTCAACCTATTACACTGG ATGCTAAGGGAAGGAATAAGACCTGATTCCATTACTATCTTAACTATAATTCAGTATTAT GCTGCTGTTTCCAGAGTCAAAAAGGTTAAAGAAACCCATAGCTATTCAATTAGATTTGGT CTTTTGCAGGGTGATGCTGGACCTACTCTTGGAAATGGGATGCTCGATGCATATGCCAAA TGTGGCAACATGAAATATGCAGTCAATATTTTTGGGAGTTTGTCAGAGAAACGGAATGTG GTCACTTGCAATTCAATGATCTCAGGTTATGTGAATAGTAGTTCTCATGATGATGCCTAT GCAATATTCAACACAATGTCTGAAACTGATTTAACTACTTGGAATTTAATGGTTCGAGTT TACGCTGAAAATGATTTTCCTGATCAAGCTCTGAGCCTTTTCCATGAGCTCCAAGGTCAG GGGATGAAGCCTGACATAGTGACTATCATGAGCATCCTTCCGGCTTGTGCTCATATGGCC TCGGTCCACATGCTGAGGCAGTGTCATGGGTATGTAATTAGAGCTTGTTTCAATGATGTT CGCTTGAATGGAGCTTTCATAGATATGTACTCAAAATGTGGAAGCGTATTTGGTGCTTAT AAGCTTTTTTTGTCAAGCCCTCAGAAAGATCTGGTCATGTTTACAGCCATGGTTGGTGGG TTCGCAATGCATGGCATGGGAGAGGAAGCACTCAGGATTTTCTCTTATATGCTTGAGTTG GGTGTGAAGCCGGATCATGTTATCATTACCGCAGTCTTGTTTGCCTGCAGTCATGCTGGC CTAGTAGATGAAGGGTGGAAGATCTTTAACTCAATTGAGAAGGTCCATGGCTTCCAACCC ACCATGGAACAGTATGCTTGTGTTGTGGATCTTCTTGCCCGAGGAGGCCGAATTAAGGAT GCTTACACTTTTGTGACCAGGATGCCAATTGAAGCTAATGCAAACATATGGGGAACATTG CTGGGAGCTTGTAGGACTCACCATGAGGTTGAATTAGGAAGAGTAGTGGCTGATCATCTC TTTAAGATTGAATCTGACAATATCGGGAACTATGTAGTGATGTCTAACCTATATGCAGCG GATGCTAGATGGGATGGCGTCATGGAGATACGGAGGCTGATGCGGACCAGAGAGTTGAAA AAGCCTGCTGGATGCAGCTGGATTGAAGTGGGGAGGAGGAAGAATGTATTCATAGCTGGG GATTCTTCCCACCCACAAAGAAGCATTATCTACAGAACATTAAGCACCTTGGATCAACTG ATGAAAGAGCCATTTCACTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_07s0130g00180.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:7:20476712:20479266:-1 gene:VIT_07s0130g00180 transcript:VIT_07s0130g00180.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MMKLCPFSSKGYDSLCKGLLNLYAKSGALDYCNKLFGEMDQRDPVIWNIVLSGLAGFQSH EAEVMRLFRAMHMVNEAKPNSVTIAIVLPVCARLREDAGKSVHSYVIKSGLESHTLAGNA LISMYAKCGLVCSDAYAAFNRIEFKDVVSWNAVIAGFSENKFTEEAFKLFHAMLKGPIQP NYATIASILPVCASLEENAGYRYGKEVHCHVLRRMELVEDVSVINSLMSFYLRIGQMEKA EFLFRNMKSRDLVSWNAIIAGYASNGEWLKALELFSEFISLETIKPDSVTLVSVLPACAH VHNLQVAKGIHGYIIRHPGLREDTSVGNALLSFYAKCNYTQAALQTFLMISRKDLISWNA ILDAFTESGCETHLVNLLHWMLREGIRPDSITILTIIQYYAAVSRVKKVKETHSYSIRFG LLQGDAGPTLGNGMLDAYAKCGNMKYAVNIFGSLSEKRNVVTCNSMISGYVNSSSHDDAY AIFNTMSETDLTTWNLMVRVYAENDFPDQALSLFHELQGQGMKPDIVTIMSILPACAHMA SVHMLRQCHGYVIRACFNDVRLNGAFIDMYSKCGSVFGAYKLFLSSPQKDLVMFTAMVGG FAMHGMGEEALRIFSYMLELGVKPDHVIITAVLFACSHAGLVDEGWKIFNSIEKVHGFQP TMEQYACVVDLLARGGRIKDAYTFVTRMPIEANANIWGTLLGACRTHHEVELGRVVADHL FKIESDNIGNYVVMSNLYAADARWDGVMEIRRLMRTRELKKPAGCSWIEVGRRKNVFIAG DSSHPQRSIIYRTLSTLDQLMKEPFHF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_07s0130g00180.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:7:20476712:20479266:-1 gene:VIT_07s0130g00180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATGAAGCTCTGTCCCTTTTCCTCGAAAGGGTACGATTCTCTGTGTAAAGGATTGCTC AACTTGTATGCAAAATCTGGAGCTCTTGATTATTGCAACAAACTATTTGGTGAGATGGAC CAACGTGATCCCGTCATTTGGAACATTGTCCTCTCTGGTTTGGCTGGATTCCAAAGTCAT GAGGCTGAGGTGATGAGGTTGTTCCGTGCAATGCATATGGTAAATGAAGCTAAGCCCAAC TCTGTCACCATTGCTATTGTTCTTCCTGTGTGCGCTCGTCTCCGAGAAGATGCTGGGAAG AGTGTGCACTCTTATGTGATTAAATCAGGGTTGGAATCACATACCCTTGCAGGAAATGCC TTAATATCAATGTATGCAAAGTGCGGGCTTGTTTGCAGTGATGCATATGCTGCATTTAAT AGAATTGAGTTCAAAGATGTGGTTTCATGGAATGCAGTGATTGCAGGGTTTTCTGAGAAT AAGTTCACAGAAGAAGCATTCAAATTATTCCATGCAATGCTTAAAGGACCGATACAACCT AATTATGCAACAATTGCAAGTATTCTACCTGTGTGTGCATCATTAGAAGAGAATGCTGGT TACCGGTATGGGAAAGAGGTCCACTGTCATGTTTTGCGAAGAATGGAGCTGGTAGAAGAT GTTTCTGTAATCAACTCTCTTATGAGCTTTTACCTGAGGATTGGACAGATGGAAAAAGCA GAATTCTTGTTCAGAAACATGAAATCAAGAGATTTGGTTTCATGGAATGCTATTATTGCA GGGTATGCCTCAAATGGTGAGTGGTTGAAAGCATTAGAGTTATTTTCGGAGTTCATCTCT CTAGAGACAATAAAGCCAGATTCTGTCACCCTTGTTAGTGTTCTTCCCGCTTGTGCCCAT GTACATAATTTGCAGGTAGCAAAGGGGATCCATGGCTATATTATCCGGCATCCTGGTCTA CGTGAGGATACATCAGTTGGAAATGCCCTTCTAAGTTTCTATGCAAAATGCAATTACACA CAAGCTGCTCTTCAGACATTCTTAATGATTTCTCGTAAAGACTTGATATCATGGAATGCT ATTCTTGATGCCTTTACAGAGAGTGGGTGTGAAACTCACCTTGTCAACCTATTACACTGG ATGCTAAGGGAAGGAATAAGACCTGATTCCATTACTATCTTAACTATAATTCAGTATTAT GCTGCTGTTTCCAGAGTCAAAAAGGTTAAAGAAACCCATAGCTATTCAATTAGATTTGGT CTTTTGCAGGGTGATGCTGGACCTACTCTTGGAAATGGGATGCTCGATGCATATGCCAAA TGTGGCAACATGAAATATGCAGTCAATATTTTTGGGAGTTTGTCAGAGAAACGGAATGTG GTCACTTGCAATTCAATGATCTCAGGTTATGTGAATAGTAGTTCTCATGATGATGCCTAT GCAATATTCAACACAATGTCTGAAACTGATTTAACTACTTGGAATTTAATGGTTCGAGTT TACGCTGAAAATGATTTTCCTGATCAAGCTCTGAGCCTTTTCCATGAGCTCCAAGGTCAG GGGATGAAGCCTGACATAGTGACTATCATGAGCATCCTTCCGGCTTGTGCTCATATGGCC TCGGTCCACATGCTGAGGCAGTGTCATGGGTATGTAATTAGAGCTTGTTTCAATGATGTT CGCTTGAATGGAGCTTTCATAGATATGTACTCAAAATGTGGAAGCGTATTTGGTGCTTAT AAGCTTTTTTTGTCAAGCCCTCAGAAAGATCTGGTCATGTTTACAGCCATGGTTGGTGGG TTCGCAATGCATGGCATGGGAGAGGAAGCACTCAGGATTTTCTCTTATATGCTTGAGTTG GGTGTGAAGCCGGATCATGTTATCATTACCGCAGTCTTGTTTGCCTGCAGTCATGCTGGC CTAGTAGATGAAGGGTGGAAGATCTTTAACTCAATTGAGAAGGTCCATGGCTTCCAACCC ACCATGGAACAGTATGCTTGTGTTGTGGATCTTCTTGCCCGAGGAGGCCGAATTAAGGAT GCTTACACTTTTGTGACCAGGATGCCAATTGAAGCTAATGCAAACATATGGGGAACATTG CTGGGAGCTTGTAGGACTCACCATGAGGTTGAATTAGGAAGAGTAGTGGCTGATCATCTC TTTAAGATTGAATCTGACAATATCGGGAACTATGTAGTGATGTCTAACCTATATGCAGCG GATGCTAGATGGGATGGCGTCATGGAGATACGGAGGCTGATGCGGACCAGAGAGTTGAAA AAGCCTGCTGGATGCAGCTGGATTGAAGTGGGGAGGAGGAAGAATGTATTCATAGCTGGG GATTCTTCCCACCCACAAAGAAGCATTATCTACAGAACATTAAGCACCTTGGATCAACTG ATGAAAGAGCCATTTCACTTTTGA