Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_07s0104g01480.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:7:2478417:2485282:1 gene:VIT_07s0104g01480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGAACGGAGCATGAAGACAGCATCGCATTCTCACAAGTACACCAATCGTCTCGCT GCCGAGCACAGTCCCTATCTTCTTCAGCACGCCCATAACCCTGTTGATTGGTATCCATGG GGTGAAGAAGCTTTTTCTGAATCACGAAAAAGAGACGTGCCAATATTCTTATCAATTGGA TACAGCACCTGCCACTGGTGTCATGTGATGGAGGTGGAGTCTTTTGAGAATGAAGGGGTT GCAAAATTGCTCAATGATTGGTTTGTTAGTATTAAGGTGGATCGAGAGGAGCGGCCTGAT GTTGATAAGGTATACATGACATATGTGCAGGCTTTATATGGTGGAGGGGGTTGGCCATTG AGTGTCTTCCTTTCACCTGATTTGAAACCTTTGATGGGTGGAACTTACTTTCCCCCGGAT GATAAGTATGGAAGACCTGGGTTTAAGACTGTTCTTAGAAAGGTGAAGGATGCTTGGGAA AATAAGAGGGATGTTCTTGTTAAGAGTGGAGCCTTTGCCATTGAACAGCTGTCAGAAGCA TTGTCTGCAACTGCAAGTTCAAATAAATTGGCGGATGGGATACCACAGCAAGCATTGCAT CTATGTGCAGAGCAGCTGGCTGGGAACTATGATCCTGAGTATGGTGGGTTTGGATCTGCA CCAAAGTTTCCTAGGCCAGTTGAGATTCAACTAATGCTTTATCATTATAAAAAGTTGGAA GAATCTGGGAAATCAGGTGAAGCAAATGAAGTTTTGAAGATGGTGGCTTTTAGCTTGCAA TGCATGGCAAGGGGGGGTGTTCATGATCACATTGGAGGTGGTTTTCACAGATATAGCGTG GATGAGTGTTGGCATGTTCCACATTTTGAGAAAATGTTATATGACCAGGGGCAGCTCGCT AATGCTTATCTAGATGTTTTTTCCATCACAAAAGATGTCTTCTATTCATGTGTGTCTCGG GATATCCTTGATTATTTGAGGAGAGACATGATAGGACCAGAAGGTGAAATATTTTCAGCT GAGGATGCTGACAGTGCTGAATCTGAAGATGCTGCAAGAAAAAAGGAAGGAGCCTTCTAC ATATGGACCAGTAAAGAGGTTGAAGATGTCATTGGGGAGCATGCATCTCTTTTTAAGGAT CATTATTATATAAAACCTTCAGGAAACTGTGACCTTTCTCGAATGAGTGATCCTCACAAT GAATTTAAAGGAAAAAATGTGCTCATAGAGAGAAATTGTGCGTCTGCTATGGCATCAAAA CTTGGTATGCCTGTTGAAAAATATCTTGATATTTTGGGTACATGTAGGCGAAAGCTTTTT GATGTCAGATTGAATCGTCCAAGACCGCATTTGGATGATAAGGTAATTGTATCATGGAAT GGACTTGCTATTTCATCTTTTGCAAGAGCTTCTAAAATTCTCAAAAGTGAAGCTGAGGGG ACTAAATTCCGCTTTCCTGTTGTGGGTTGTGATCCCAAGGAGTACATGGAAGTTGCAGAG AAGGCAGCATCTTTTATCAGGAAGTGGCTTTATGATGAGCAGACACGCAGGTTGCGACAT AGCTTTAGGAATGGCCCATCTAAAGCCCCTGGCTTTTTAGATGATTATGCTTTCCTAATC TCTGGATTGCTAGATATTTATGAGTTTGGTGGCAACACCAATTGGCTGGTTTGGGCAATC GAACTTCAAGACACCCAGGCATGGACTTTATATCCTGATGAACTGTTTCTTGATAAAGAG GGAGGTGGCTATTTTAATACTCCAGGGGAAGATCCCTCAGTTCTCCTCCGCGTGAAAGAA GATCATGATGGGGCAGAGCCCTCAGGGAACTCGGTGTCTGTGATCAATCTTGTAAGATTG ACCTCCATGGTTGCTGGCAGTTGGTTTGAGCGGCACAGGAGGAATGCAGAGCATCTTCTG GCCGTTTTTGAGACGAGATTGAAAGATATGGCTATGGCAGTACCTCTGATGTGTTGTGGA GCAGACATGTTCTCTGTTCCTTCCAGAAAGCAAGTTGTCCTAGTTGGTCATAAATCTTCT GTAGAGTTTGAAGATATGCTTGCTGCTGCTCATGCACAATATGATCCTAACAGAACTGTG ATTCACATAGACCCCACCGAAACCGAGCAGATGGAATTTTGGGAAGCAATGAATAGCAAC ATAGCCCTTATGGCAAAGAATAATTTTGCACCAGACAAGGTGGTGGCGCTTGTTTGTCAA AATTTCACATGCAGCTCTCCTGTCACAGACTCCACCTCACTCAAAGCTCTGCTCTGCCTG AAGCCCTCTTCTGCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_07s0104g01480.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:7:2478417:2485282:1 gene:VIT_07s0104g01480 transcript:VIT_07s0104g01480.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAERSMKTASHSHKYTNRLAAEHSPYLLQHAHNPVDWYPWGEEAFSESRKRDVPIFLSIG YSTCHWCHVMEVESFENEGVAKLLNDWFVSIKVDREERPDVDKVYMTYVQALYGGGGWPL SVFLSPDLKPLMGGTYFPPDDKYGRPGFKTVLRKVKDAWENKRDVLVKSGAFAIEQLSEA LSATASSNKLADGIPQQALHLCAEQLAGNYDPEYGGFGSAPKFPRPVEIQLMLYHYKKLE ESGKSGEANEVLKMVAFSLQCMARGGVHDHIGGGFHRYSVDECWHVPHFEKMLYDQGQLA NAYLDVFSITKDVFYSCVSRDILDYLRRDMIGPEGEIFSAEDADSAESEDAARKKEGAFY IWTSKEVEDVIGEHASLFKDHYYIKPSGNCDLSRMSDPHNEFKGKNVLIERNCASAMASK LGMPVEKYLDILGTCRRKLFDVRLNRPRPHLDDKVIVSWNGLAISSFARASKILKSEAEG TKFRFPVVGCDPKEYMEVAEKAASFIRKWLYDEQTRRLRHSFRNGPSKAPGFLDDYAFLI SGLLDIYEFGGNTNWLVWAIELQDTQAWTLYPDELFLDKEGGGYFNTPGEDPSVLLRVKE DHDGAEPSGNSVSVINLVRLTSMVAGSWFERHRRNAEHLLAVFETRLKDMAMAVPLMCCG ADMFSVPSRKQVVLVGHKSSVEFEDMLAAAHAQYDPNRTVIHIDPTETEQMEFWEAMNSN IALMAKNNFAPDKVVALVCQNFTCSSPVTDSTSLKALLCLKPSSA

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_07s0104g01480.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:7:2478417:2485282:1 gene:VIT_07s0104g01480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TCCGCTTTTCCTCACTTTCTCGTACTTTACCGCTCTTTCCTCGCCGCCACGTTCACACAC TCAAGGTCCTCGCCATGGCTGAACGGAGCATGAAGACAGCATCGCATTCTCACAAGTACA CCAATCGTCTCGCTGCCGAGCACAGTCCCTATCTTCTTCAGCACGCCCATAACCCTGTTG ATTGGTATCCATGGGGTGAAGAAGCTTTTTCTGAATCACGAAAAAGAGACGTGCCAATAT TCTTATCAATTGGATACAGCACCTGCCACTGGTGTCATGTGATGGAGGTGGAGTCTTTTG AGAATGAAGGGGTTGCAAAATTGCTCAATGATTGGTTTGTTAGTATTAAGGTGGATCGAG AGGAGCGGCCTGATGTTGATAAGGTATACATGACATATGTGCAGGCTTTATATGGTGGAG GGGGTTGGCCATTGAGTGTCTTCCTTTCACCTGATTTGAAACCTTTGATGGGTGGAACTT ACTTTCCCCCGGATGATAAGTATGGAAGACCTGGGTTTAAGACTGTTCTTAGAAAGGTGA AGGATGCTTGGGAAAATAAGAGGGATGTTCTTGTTAAGAGTGGAGCCTTTGCCATTGAAC AGCTGTCAGAAGCATTGTCTGCAACTGCAAGTTCAAATAAATTGGCGGATGGGATACCAC AGCAAGCATTGCATCTATGTGCAGAGCAGCTGGCTGGGAACTATGATCCTGAGTATGGTG GGTTTGGATCTGCACCAAAGTTTCCTAGGCCAGTTGAGATTCAACTAATGCTTTATCATT ATAAAAAGTTGGAAGAATCTGGGAAATCAGGTGAAGCAAATGAAGTTTTGAAGATGGTGG CTTTTAGCTTGCAATGCATGGCAAGGGGGGGTGTTCATGATCACATTGGAGGTGGTTTTC ACAGATATAGCGTGGATGAGTGTTGGCATGTTCCACATTTTGAGAAAATGTTATATGACC AGGGGCAGCTCGCTAATGCTTATCTAGATGTTTTTTCCATCACAAAAGATGTCTTCTATT CATGTGTGTCTCGGGATATCCTTGATTATTTGAGGAGAGACATGATAGGACCAGAAGGTG AAATATTTTCAGCTGAGGATGCTGACAGTGCTGAATCTGAAGATGCTGCAAGAAAAAAGG AAGGAGCCTTCTACATATGGACCAGTAAAGAGGTTGAAGATGTCATTGGGGAGCATGCAT CTCTTTTTAAGGATCATTATTATATAAAACCTTCAGGAAACTGTGACCTTTCTCGAATGA GTGATCCTCACAATGAATTTAAAGGAAAAAATGTGCTCATAGAGAGAAATTGTGCGTCTG CTATGGCATCAAAACTTGGTATGCCTGTTGAAAAATATCTTGATATTTTGGGTACATGTA GGCGAAAGCTTTTTGATGTCAGATTGAATCGTCCAAGACCGCATTTGGATGATAAGGTAA TTGTATCATGGAATGGACTTGCTATTTCATCTTTTGCAAGAGCTTCTAAAATTCTCAAAA GTGAAGCTGAGGGGACTAAATTCCGCTTTCCTGTTGTGGGTTGTGATCCCAAGGAGTACA TGGAAGTTGCAGAGAAGGCAGCATCTTTTATCAGGAAGTGGCTTTATGATGAGCAGACAC GCAGGTTGCGACATAGCTTTAGGAATGGCCCATCTAAAGCCCCTGGCTTTTTAGATGATT ATGCTTTCCTAATCTCTGGATTGCTAGATATTTATGAGTTTGGTGGCAACACCAATTGGC TGGTTTGGGCAATCGAACTTCAAGACACCCAGGCATGGACTTTATATCCTGATGAACTGT TTCTTGATAAAGAGGGAGGTGGCTATTTTAATACTCCAGGGGAAGATCCCTCAGTTCTCC TCCGCGTGAAAGAAGATCATGATGGGGCAGAGCCCTCAGGGAACTCGGTGTCTGTGATCA ATCTTGTAAGATTGACCTCCATGGTTGCTGGCAGTTGGTTTGAGCGGCACAGGAGGAATG CAGAGCATCTTCTGGCCGTTTTTGAGACGAGATTGAAAGATATGGCTATGGCAGTACCTC TGATGTGTTGTGGAGCAGACATGTTCTCTGTTCCTTCCAGAAAGCAAGTTGTCCTAGTTG GTCATAAATCTTCTGTAGAGTTTGAAGATATGCTTGCTGCTGCTCATGCACAATATGATC CTAACAGAACTGTGATTCACATAGACCCCACCGAAACCGAGCAGATGGAATTTTGGGAAG CAATGAATAGCAACATAGCCCTTATGGCAAAGAATAATTTTGCACCAGACAAGGTGGTGG CGCTTGTTTGTCAAAATTTCACATGCAGCTCTCCTGTCACAGACTCCACCTCACTCAAAG CTCTGCTCTGCCTGAAGCCCTCTTCTGCTTGAATCATGACACAGAAATTGTACTCATGTA CATGGAGTTAATATCTGCTCTTCATATACAGGTTGGTGACTTGATGTGTAATAGTATTTG GTGCTTTTGTATTTAATAGAGAGTAGTGATCCTTCGGTACTGGACTTTCAGAAGCTCATG GGCTGTCTATGAAGTTGTGCATTAGTTGTTGGAATGAATGTCA