Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_07s0005g04070.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:7:7170087:7175303:1 gene:VIT_07s0005g04070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGAAGAGCACTTCTCTTGTTCTTATTCATCTTCTCTTCCTATCCTTACTTCCTTTCAGA
ATCACATCGTCGCCGAGAGCACAAGCAGAAGCTCTTGTCAAATGGAAAAACAGCTTATCT
TCTTCTACTTCTCTCAATTCATCATGGTCCCTCGCCAACCTTGGGAACCTCTGTAACTGG
ACAGGCATTGTTTGCGATGTTGCCGGAAGCATATCTGAGATAAACCTCTCAGATGCAAAA
CTTCGAGGAACAATTGTGGAGTTCAATTGCAGTTCATTTCCTAATCTTACCAGCCTCAAC
CTCAACACCAACAGACTCAAGGGATCGATACCAACTGCTGTTGCCAACCTCTCCAAGCTC
ACTTTCTTGGACATGGGCAGCAACCTTTTCAGTGGCCGCATCACTTCGGAGATTGGCCAG
TTGACAGAGCTTCGATATCTTAGCCTCCATGACAACTATCTCATTGGTGACATCCCCTAT
CAAATTACCAATCTTCAAAAGGTATGGTACTTAGACCTTGGTTCAAACTACTTAGTATCG
CCAGACTGGTCTAGGTTTTTGGGCATGCCTTTGTTGACACACCTGAGCTTTAATTTCAAT
GACCTTATACTGGAATTCCCCGAGTTCATAACTGATTGTCGGAACCTGACATACCTCGAC
TTGTCACAGAATTATTTTACTGGCCCAATACCAGAGTGGGTATTTAGCAATCTGGTAAAG
CTTGAATTCCTATATCTCTTTGAAAATTCATTTCAAGGGCTGTTGTCCCCAAACATATCC
AGGCTTTCCAACCTCCAAAATCTTCGCCTTGGCAGGAACCAATTTAGTGGTCCAATTCCA
GAAGATATTGGTATGATCTCTGATCTTCAGAACATAGAAATGTATGACAATTGGTTTGAA
GGGAAGATTCCTTCTTCTATAGGTCAGCTCAGGAAGCTTCAGGGCCTTGATCTTCACATG
AATGGCTTGAATTCTACAATTCCTACCGAGCTTGGTCTTTGTACCAGTCTCACCTTTTTG
AATCTAGCTATGAACTCACTCACTGGGGTCCTTCCTTTGTCCTTGACCAATCTGAGCATG
ATATCAGAGTTGGGTTTGGCCGACAATTTTTTGTCTGGTGTGATATCGTCTTATTTAATC
ACCAATTGGACGGAATTGATATCTTTACAACTACAGAACAATCTCTTCAGTGGAAAAATT
CCATTGGAAATCGGCCTTTTAACAAAGCTGAATTACCTTTTTCTGTACAATAACACGCTC
TATGGCTCAATCCCCTCAGAGATTGGGAACTTGAAGGATTTGTTTGAATTAGACCTTTCA
GAAAACCATCTTTCAGGTCCAATTCCTCTAGCGGTGGGAAATCTCACAAAACTTACCCGC
TTAGAGCTTTTCTCCAACAATCTCAGTGGGAAAATTCCTATGGAGATTGGTAATCTGAAA
TCATTGAAGGTTCTTGATCTCAACACTAACAAATTGCATGGAGAGCTGCCAGAGACATTG
TCACTCCTCAATAATCTAGAGAGACTCTCCATGTTCACCAACAATTTCTCAGGCACCATT
CCGACTGAACTTGGGAAGAACAGCCTCAAGTTGATGTATGTCAGTTTTACCAACAACAGC
TTCTCAGGAGAATTGCCTCCTGGATTATGTAATGGCTTTGCTCTTCAATATTTAACGGTA
AATGGAGGCAACAACTTCACAGGACCATTGCCAGATTGCTTGAGGAACTGCACGGGGCTA
ACTCAAGTCCGTCTTGAAGGGAACCAATTCACTGGAAATATTTCAGAAGTATTTGGAGTT
CATCGAAGTCTTAAGTTTATTTCTCTTAGTGGCAATCGATTTTCTGGTGTGCTCTCACCT
AAGTGGGGAGAATGTCAAAATCTCACAATACTACAGATGGATGGAAATCAAATTTCCGGC
AAAATCCCAGTCGAGTTTGTGAACTGTGTGCTTTTGTTGATCTTGAAGCTAAGAAACAAT
GATTTGTCAGGTGAGATACCGCCAGAGCTTGGAAACTTGTCCACGTTGAATGTTTTGGAT
CTCAGCAGCAATTCACTCTCAGGAGCAATCCCTTCAAACTTAGGGAAGCTTGTAGCATTA
CAGATCCTCAATCTTTCACATAATAATCTCACTGGGAAAATCCCGCCATCATTGTCAGAC
ATGATGAATCTGAGTTCAATCGATTTCTCATACAATACATTGACAGGTCCAATTCCAACT
GGCGATGTTTTCAAGCAGGCAGATTATACTGGAAACTCAGGTTTGTGTGGAAATGCAGAG
AGAGTGGTTCCCTGTTATTCCAATTCCACCGGTGGCAAGTCTACAAAAATTCTCATTGGC
ATTACTGTCCCTATCTGCAGCCTCTTAGTTCTTGCAACTATTATTGCTGTTATTCTAATA
TCTTCCCGACGAAACAAACACCCAGATGAAAAGGCTGAAAGTACAGAAAAATATGAGAAT
CCCATGTTGCTAATTTGGGAAAAACAAGGAAAATTCACATTTGGGGATATTGTAAAAGCC
ACTGCTGACCTAAGTGATGAGTATTGCATTGGAAAAGGAGGGTCTGGGAGTGTTTACAAG
GTGGTCTTGCCACAGGGTCAGACACTTGCAGTCAAAAGACTCGATATATCAGATACCAGC
GATACTTCATGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_07s0005g04070.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:7:7170087:7175303:1 gene:VIT_07s0005g04070 transcript:VIT_07s0005g04070.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MKSTSLVLIHLLFLSLLPFRITSSPRAQAEALVKWKNSLSSSTSLNSSWSLANLGNLCNW
TGIVCDVAGSISEINLSDAKLRGTIVEFNCSSFPNLTSLNLNTNRLKGSIPTAVANLSKL
TFLDMGSNLFSGRITSEIGQLTELRYLSLHDNYLIGDIPYQITNLQKVWYLDLGSNYLVS
PDWSRFLGMPLLTHLSFNFNDLILEFPEFITDCRNLTYLDLSQNYFTGPIPEWVFSNLVK
LEFLYLFENSFQGLLSPNISRLSNLQNLRLGRNQFSGPIPEDIGMISDLQNIEMYDNWFE
GKIPSSIGQLRKLQGLDLHMNGLNSTIPTELGLCTSLTFLNLAMNSLTGVLPLSLTNLSM
ISELGLADNFLSGVISSYLITNWTELISLQLQNNLFSGKIPLEIGLLTKLNYLFLYNNTL
YGSIPSEIGNLKDLFELDLSENHLSGPIPLAVGNLTKLTRLELFSNNLSGKIPMEIGNLK
SLKVLDLNTNKLHGELPETLSLLNNLERLSMFTNNFSGTIPTELGKNSLKLMYVSFTNNS
FSGELPPGLCNGFALQYLTVNGGNNFTGPLPDCLRNCTGLTQVRLEGNQFTGNISEVFGV
HRSLKFISLSGNRFSGVLSPKWGECQNLTILQMDGNQISGKIPVEFVNCVLLLILKLRNN
DLSGEIPPELGNLSTLNVLDLSSNSLSGAIPSNLGKLVALQILNLSHNNLTGKIPPSLSD
MMNLSSIDFSYNTLTGPIPTGDVFKQADYTGNSGLCGNAERVVPCYSNSTGGKSTKILIG
ITVPICSLLVLATIIAVILISSRRNKHPDEKAESTEKYENPMLLIWEKQGKFTFGDIVKA
TADLSDEYCIGKGGSGSVYKVVLPQGQTLAVKRLDISDTSDTSC

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_07s0005g04070.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:7:7170087:7175303:1 gene:VIT_07s0005g04070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGAAGAGCACTTCTCTTGTTCTTATTCATCTTCTCTTCCTATCCTTACTTCCTTTCAGA
ATCACATCGTCGCCGAGAGCACAAGCAGAAGCTCTTGTCAAATGGAAAAACAGCTTATCT
TCTTCTACTTCTCTCAATTCATCATGGTCCCTCGCCAACCTTGGGAACCTCTGTAACTGG
ACAGGCATTGTTTGCGATGTTGCCGGAAGCATATCTGAGATAAACCTCTCAGATGCAAAA
CTTCGAGGAACAATTGTGGAGTTCAATTGCAGTTCATTTCCTAATCTTACCAGCCTCAAC
CTCAACACCAACAGACTCAAGGGATCGATACCAACTGCTGTTGCCAACCTCTCCAAGCTC
ACTTTCTTGGACATGGGCAGCAACCTTTTCAGTGGCCGCATCACTTCGGAGATTGGCCAG
TTGACAGAGCTTCGATATCTTAGCCTCCATGACAACTATCTCATTGGTGACATCCCCTAT
CAAATTACCAATCTTCAAAAGGTATGGTACTTAGACCTTGGTTCAAACTACTTAGTATCG
CCAGACTGGTCTAGGTTTTTGGGCATGCCTTTGTTGACACACCTGAGCTTTAATTTCAAT
GACCTTATACTGGAATTCCCCGAGTTCATAACTGATTGTCGGAACCTGACATACCTCGAC
TTGTCACAGAATTATTTTACTGGCCCAATACCAGAGTGGGTATTTAGCAATCTGGTAAAG
CTTGAATTCCTATATCTCTTTGAAAATTCATTTCAAGGGCTGTTGTCCCCAAACATATCC
AGGCTTTCCAACCTCCAAAATCTTCGCCTTGGCAGGAACCAATTTAGTGGTCCAATTCCA
GAAGATATTGGTATGATCTCTGATCTTCAGAACATAGAAATGTATGACAATTGGTTTGAA
GGGAAGATTCCTTCTTCTATAGGTCAGCTCAGGAAGCTTCAGGGCCTTGATCTTCACATG
AATGGCTTGAATTCTACAATTCCTACCGAGCTTGGTCTTTGTACCAGTCTCACCTTTTTG
AATCTAGCTATGAACTCACTCACTGGGGTCCTTCCTTTGTCCTTGACCAATCTGAGCATG
ATATCAGAGTTGGGTTTGGCCGACAATTTTTTGTCTGGTGTGATATCGTCTTATTTAATC
ACCAATTGGACGGAATTGATATCTTTACAACTACAGAACAATCTCTTCAGTGGAAAAATT
CCATTGGAAATCGGCCTTTTAACAAAGCTGAATTACCTTTTTCTGTACAATAACACGCTC
TATGGCTCAATCCCCTCAGAGATTGGGAACTTGAAGGATTTGTTTGAATTAGACCTTTCA
GAAAACCATCTTTCAGGTCCAATTCCTCTAGCGGTGGGAAATCTCACAAAACTTACCCGC
TTAGAGCTTTTCTCCAACAATCTCAGTGGGAAAATTCCTATGGAGATTGGTAATCTGAAA
TCATTGAAGGTTCTTGATCTCAACACTAACAAATTGCATGGAGAGCTGCCAGAGACATTG
TCACTCCTCAATAATCTAGAGAGACTCTCCATGTTCACCAACAATTTCTCAGGCACCATT
CCGACTGAACTTGGGAAGAACAGCCTCAAGTTGATGTATGTCAGTTTTACCAACAACAGC
TTCTCAGGAGAATTGCCTCCTGGATTATGTAATGGCTTTGCTCTTCAATATTTAACGGTA
AATGGAGGCAACAACTTCACAGGACCATTGCCAGATTGCTTGAGGAACTGCACGGGGCTA
ACTCAAGTCCGTCTTGAAGGGAACCAATTCACTGGAAATATTTCAGAAGTATTTGGAGTT
CATCGAAGTCTTAAGTTTATTTCTCTTAGTGGCAATCGATTTTCTGGTGTGCTCTCACCT
AAGTGGGGAGAATGTCAAAATCTCACAATACTACAGATGGATGGAAATCAAATTTCCGGC
AAAATCCCAGTCGAGTTTGTGAACTGTGTGCTTTTGTTGATCTTGAAGCTAAGAAACAAT
GATTTGTCAGGTGAGATACCGCCAGAGCTTGGAAACTTGTCCACGTTGAATGTTTTGGAT
CTCAGCAGCAATTCACTCTCAGGAGCAATCCCTTCAAACTTAGGGAAGCTTGTAGCATTA
CAGATCCTCAATCTTTCACATAATAATCTCACTGGGAAAATCCCGCCATCATTGTCAGAC
ATGATGAATCTGAGTTCAATCGATTTCTCATACAATACATTGACAGGTCCAATTCCAACT
GGCGATGTTTTCAAGCAGGCAGATTATACTGGAAACTCAGGTTTGTGTGGAAATGCAGAG
AGAGTGGTTCCCTGTTATTCCAATTCCACCGGTGGCAAGTCTACAAAAATTCTCATTGGC
ATTACTGTCCCTATCTGCAGCCTCTTAGTTCTTGCAACTATTATTGCTGTTATTCTAATA
TCTTCCCGACGAAACAAACACCCAGATGAAAAGGCTGAAAGTACAGAAAAATATGAGAAT
CCCATGTTGCTAATTTGGGAAAAACAAGGAAAATTCACATTTGGGGATATTGTAAAAGCC
ACTGCTGACCTAAGTGATGAGTATTGCATTGGAAAAGGAGGGTCTGGGAGTGTTTACAAG
GTGGTCTTGCCACAGGGTCAGACACTTGCAGTCAAAAGACTCGATATATCAGATACCAGC
GATACTTCATGTTGATGGCTGACTAATTGGATGAGTTTTGACAATGAGATTCGAACCCTG
ACAGAAGTTCAGCACCGAAATATCATTAAGTTTTATGGGTTCTGCTCCAGCAAGGGATTC
ATGTACTTGGTTTATAAATAT