Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_07s0005g03980.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:7:7057539:7062215:-1 gene:VIT_07s0005g03980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGACTCAGACGAAGGAAAGCTATTTGTAGGAGGCATACCATGGGACACTACAGAGGAG
AAGCTCAAAGAGTACTTTAACCAGTACGGGGACGTCACGCAGACAGTTATTATGCGGGAC
AAGACCACTGGTCGACCCAGAGGCTTTGGCTTTGTGGTATTCGCAGATCCTTCCGTTCTC
GATGCAGTTCTTCAGGAGAAGCACACCATTGATGGGAGAACGGTGGAGGCTAAAAGGGCT
TTATCAAGAGAAGAACAGCACACCTCCAGACCTGGAAATTCTAATACTGGCAGAAGCTCA
TCAGGCATGGGAGGAAATTTTAAAACCAAAAAGATATTTGTTGGAGGGTTGCCTTCCACC
CTTACTGAGGAAGGATTTCGTCAGTACTTTGAGACTTATGGTCATGTAACGGATGTAGTA
GTAATGTATGACCAAAATACTCAACGTCCCCGTGGGTTTGGATTCATATCCTTTGACACT
GAAGATGCAGTTGATCGAGTTTTACATAAGACCTTCCATGATTTGAATGGTAAGCTTGTA
GAGGTGAAACGAGCCCTCCCTAAAGATGCAAATCCTGGTGGTGGTGGCCGTAGTGGAGGC
TACCAAGGCTATGGTGCTTCTGGTGCTAATACAAGTGCATATGAAGGTAGAATGGATGGT
AATAGATTCATGCCACCTCAGACCACTGGTGGTGGTTTCCCACCATATTCTGGCTATGGT
GCACCAGGTTATGGCTATGGAGCAGCAAATAGTGCTGTTGGTTATGGTGGTTATGGGAGT
TATGGTGTTGGTGGTTATGGAAGTGCCAATACTGGATTTGGCGGTCCTGCTGGGGCGTAT
GGAAACCCGAATGCTCCTAATGCTGGTTATGTAAGTGGCCCACCTGGTGCTATGAAAAGC
CAATGGAACAACCAAACTCCTTCTGGATATGGTGCTTCAGGCTATGGTTCAAATGCAGCC
TATGGAGCTACAGGTCCTTGGAATGCTCCGGGTGGTGCTGGTGTTTCTGGACCAATGGGT
CAATCTCCAAGTGGCGCTTCTGGATATGGAAGTCAAGGTTTTGGATATGGTAACTATGGT
GGGAGTGATGGTTCTTATTCTGGGGGATATGGGGCTGCTGGTGGCCGTGCTGGAAGTGCA
CCTAGTTCTGGTGGTAGTGCTAGCGGAGAACAGGGGACAGGTGGTGGCTACATGGGGAGT
GGCTATGGTGATGCCAATGGAAATCAAGGGTATTCAAATGCTGGCTGGAGGTCTGACCCT
TCACAAGGTGCTGCTGGTTATGGTGGTGGCTATGGTGGTCAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_07s0005g03980.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:7:7057539:7062215:-1 gene:VIT_07s0005g03980 transcript:VIT_07s0005g03980.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MDSDEGKLFVGGIPWDTTEEKLKEYFNQYGDVTQTVIMRDKTTGRPRGFGFVVFADPSVL
DAVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQHTSRPGNSNTGRSSSGMGGNFKTKKIFVGGLPST
LTEEGFRQYFETYGHVTDVVVMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHDLNGKLV
EVKRALPKDANPGGGGRSGGYQGYGASGANTSAYEGRMDGNRFMPPQTTGGGFPPYSGYG
APGYGYGAANSAVGYGGYGSYGVGGYGSANTGFGGPAGAYGNPNAPNAGYVSGPPGAMKS
QWNNQTPSGYGASGYGSNAAYGATGPWNAPGGAGVSGPMGQSPSGASGYGSQGFGYGNYG
GSDGSYSGGYGAAGGRAGSAPSSGGSASGEQGTGGGYMGSGYGDANGNQGYSNAGWRSDP
SQGAAGYGGGYGGQ

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_07s0005g03980.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:7:7057539:7062215:-1 gene:VIT_07s0005g03980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ACACAGTAGAGAGACACATGAAATTCTAGAGAGGCAAACAACAGATTCTAGAGAGACAGG
GATAAAGCAGATTCTAGAGAGAGAAACATGGACTCAGACGAAGGAAAGCTATTTGTAGGA
GGCATACCATGGGACACTACAGAGGAGAAGCTCAAAGAGTACTTTAACCAGTACGGGGAC
GTCACGCAGACAGTTATTATGCGGGACAAGACCACTGGTCGACCCAGAGGCTTTGGCTTT
GTGGTATTCGCAGATCCTTCCGTTCTCGATGCAGTTCTTCAGGAGAAGCACACCATTGAT
GGGAGAACGGTGGAGGCTAAAAGGGCTTTATCAAGAGAAGAACAGCACACCTCCAGACCT
GGAAATTCTAATACTGGCAGAAGCTCATCAGGCATGGGAGGAAATTTTAAAACCAAAAAG
ATATTTGTTGGAGGGTTGCCTTCCACCCTTACTGAGGAAGGATTTCGTCAGTACTTTGAG
ACTTATGGTCATGTAACGGATGTAGTAGTAATGTATGACCAAAATACTCAACGTCCCCGT
GGGTTTGGATTCATATCCTTTGACACTGAAGATGCAGTTGATCGAGTTTTACATAAGACC
TTCCATGATTTGAATGGTAAGCTTGTAGAGGTGAAACGAGCCCTCCCTAAAGATGCAAAT
CCTGGTGGTGGTGGCCGTAGTGGAGGCTACCAAGGCTATGGTGCTTCTGGTGCTAATACA
AGTGCATATGAAGGTAGAATGGATGGTAATAGATTCATGCCACCTCAGACCACTGGTGGT
GGTTTCCCACCATATTCTGGCTATGGTGCACCAGGTTATGGCTATGGAGCAGCAAATAGT
GCTGTTGGTTATGGTGGTTATGGGAGTTATGGTGTTGGTGGTTATGGAAGTGCCAATACT
GGATTTGGCGGTCCTGCTGGGGCGTATGGAAACCCGAATGCTCCTAATGCTGGTTATGTA
AGTGGCCCACCTGGTGCTATGAAAAGCCAATGGAACAACCAAACTCCTTCTGGATATGGT
GCTTCAGGCTATGGTTCAAATGCAGCCTATGGAGCTACAGGTCCTTGGAATGCTCCGGGT
GGTGCTGGTGTTTCTGGACCAATGGGTCAATCTCCAAGTGGCGCTTCTGGATATGGAAGT
CAAGGTTTTGGATATGGTAACTATGGTGGGAGTGATGGTTCTTATTCTGGGGGATATGGG
GCTGCTGGTGGCCGTGCTGGAAGTGCACCTAGTTCTGGTGGTAGTGCTAGCGGAGAACAG
GGGACAGGTGGTGGCTACATGGGGAGTGGCTATGGTGATGCCAATGGAAATCAAGGGTAT
TCAAATGCTGGCTGGAGGTCTGACCCTTCACAAGGTGCTGCTGGTTATGGTGGTGGCTAT
GGTGGTCAGTGATAAAGATGCTTTAGTTTCCTTCACATGAATCTTTGGCGTTCACACTTG
TTCCTCATTGTGAAATCTTCTGCATGATGGCGACAGATCCTGGGACTGGTTGGATTGCTT
GAATCTCAGTAGTAGTTTGCAGTTGTTTATCCTGCTAGTATATAATGGCTAGTAGTTCTG
AGTAGTAGTGTTATTTCTAATTTACTAGCATTTGCTTTTAAGTTATAGTGCTTAGCTTTG
GCTTTTCTGTGGTTGTCTGCTAGCTTATTGAAGCTTTTTTCCTCGTCTTTCTACTGTTAA
AGCTAGAGTAGCTTCTATTAAACTTCGTTATTATTGTGGGTATTGATGATAACTAGTATT
TTGTT