Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_07s0005g02210.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:7:4589049:4604749:1 gene:VIT_07s0005g02210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGAAGCAGAGTGAGTGGCGCCTCCACGGCGGCCACTACCTCGGAGAAATCTCAGCC CTCTGTTTAATCCACGCGCCACCTCTCCCTCACTTCTCTTCTCTCCCCTATCTCCTTGCT GGCACAGGATCGCAAGTTTTACTCTACGATTTGGAGTCCGTGAAAATACTGAGGTCCTTT CATGTGTTAGAAGGAATTAGAGTGCATGGAATTGCTTGCCGCTTGGTTGATTGTAAAGAA GGATCGGTATTGTCGGTTAAGATTGCTGTTTTCGGGGAAAGGAGAGTAAAGTTGTTTAAT TTGCGGATTGAGATGGTTCCTGAATCCCAAGATGAGCCCCAAGTGTGTTTGGAGTTGACT CTGTTGCATTCGTTGCCGAAATTCAGTCACTGGGTTTTAGATGTTTGCTTCTTCAAGGAG GACATTGCGACTTCTTCACATTGTCTTGTGGTGGGATGTAGCGATAATTCGGTCCATCTC TGGGATATGTTAACGTCCAGTTCGATTCTTGAAGTTAGGAATCCAGAGAGGTGCCTTCTT TATTCCATGCGGTTATGGGGTGATGAACTTCAAAACCTCCTTGTTGCATCTGGTACTATC TATAATGAGATTATTGTTTGGAAAGCAGTTCCTCAGAACTGCACTCCAAGTTTGGGAAGT TCACAATATCAAGCTCTTAATATATGTAGACTTGCTGGACATGAAGGTTCAATTTTTCGC CTAGCATGGTCCTCCAATGGATCCAAACTGGTGTCTGTCTCTGATGATCGGAGTGCTCGT ATCTGGCCAATTCATGCAGAAAGGGAAGTTTCTGATAACTCAGGAGAGATTGTTGACACA GGCTCTGCTGGTCCTGTGCTATTTGGTCACAATGCTAGGATTTGGGACTGCTGTATTTTA GATTCTTTAATTGTAACTGCTGGCGAGGATTGTACATGTCGTGTGTGGGGAACAGATGGT AACCAGCTTAAGATGATCAAAGAGCACATAGGAAGGGGTGTATGGCGATGTTTGTATGAT CCAAAGTTTTCACTTCTTGTTACTGCTGGGTTTGACTCTGCTATCAAAGTGCATCAGCTA CAAGCTTCTTTGCCTAAGGCCCCACAGGAACAGGTTGCGGAGGTAAAAGAGTTGATTGAC AGAACGGAGATATTCACTGTTTGTATCCCAAATTCATCAGAACATACTGGACTTATGGAC AGCAAAAGTGAATATGTGCGTTCCCTGCGTTTCACATGTGAAAATAGTCTCTATGTTTCC ACAAACCGTGGTTATCTTTACCATGCTAAATTATTTGATACAGGAGATGTAAAATGGACT GAACTTATCCGTGTCAGTGAAGAGGTGCCAATTGTTTGTATGGACTTACTGTCTAGAAAT GGACCCAAGCTTTCCAGTGGTGTTGAGGATTGGATTGCTGTTGGAGATGGTAAAGGAAAC ATGACAGTCACTGGAATTGTTAGTGATCTTTGCCCTCCTAAAGTAGGCCTCACTTATACT TGGTCAGCTGGAATAGAGAGGCAGCTCTTAGGAACATTTTGGTGCAAGTCCTTGGGATAT AGGTACATTTTCACTGCTGATCCAAGAGGAAAGTTGAAGTTATGGAGGTTATGTAATCCT TCACAATCAGCTTCTCAAAATTCTGCAATCAGTAACAATGTGTCTCTAATAGCAGAGTTC ATATCCAGTTTTAATATACGGATAATGTGTTTGGATGCCTCATCTGAGGAAGAGGTGCTG ATATGTGGAGATCTACGTGGTAATTTGATTTTATACCCTTTATTGAGGAGTATATTGGTG GGTTCATCTTTTGGATCAGAAGTGAAGATTACTCCATTGACTTATTTCAAAGGAGCTCAT GGGATATCAAGCGTGTCTGGCATTTCGATAGCAGGATTTGTTTCCAATCAAATTGAAATA CAATCTACTGGTGGAGATGGGTGCATATGCTATTTGGAATATCGCAGAGATCGACAGAAT TTGCAGTTTATAGGGATGAAACGGGTGAAAGAATTGAGTTTGGTCCAGTCCGTCTCTTCT GGTGCTGACTCTGTTGATGATTTGACAAGCAGCAAGTATGCAATTGGTTTTGCATCAACA GATTTCATAATATGGAACTTAATAACTGAGACAAAGGTTGTGCAAGTCCCATGTGGTGGA TGGCGGCGTCCCCATTCTTATTATCTTGGTGATGTACCAGAGATGAGAAACTGCTTTGCA TATGTTAAGGATGAAATAATTTATATTCATAGATTCTGGATTCCAGAGAGTGAAAGGAAA ATATTTCCTCAGAATCTGCATATTCAATTTCATGGGAGAGAGATGCATTCCTTATGTTTT GTGTCTAGGGATTCACAAGTTGGGTTAAATGGAAAGCATGACCTCTCTTCTAGATCTAGC TGGATTGCTACTGGGTGTGAAGATGGCACTGTGAGGTTGACAAGGTATTCTCCCGGTGTT GAGAATTGGTTTTCATCACAATTGCTTGGAGAGCATGTTGGTGGATCAGCTGTGAGGTCA ATATGCCCTGTATCAAAGATACACACAATTCCAGCAGATGCGACAAACATGCCAAATGGG ACACAGAGACAACATGCTACCTGGGACGGCAGAGAGAATCCATTCTTGCTAATTTCTGTT GGTGCAAAACGGGTCATAACTTCTTGGGTACTAAGAACTAGTACGATAGACAACAAGGGA GAAGCGTCAGATGATGGAGTGCAGGATAAAACTGGGAAGGGCTTTCCATCAATGTCATTC CAGTGGCTTTCCACTGACATGCCAACCAAGTATTCTGGTATTCGTAAGAAAACAGAAGAC TTGGAGAACATAGTTGGAATTAAAAAAGCTTCGAGTGTGAATATTGATGCAGAGTCTAGA TCACTCTTCCCAGAAAGAAAAGAGATGCAATTGAGAACTTGCATTGGGGACATGTATGAA AATGACTGGAGATACCTTGCTGTTACTGCTTTTCTTGTTAAAGATCCTGTTTCCAGAATT ACTGTCTGTTTTATTGTTGTTGGTTGTTCTGACGCCACACTTTCTCTGCGGGCTCTCATT TTACCCAGTCGACTTTGGTTTGATGTTGCTTTATTGGTTCCCCAGTCATCCCCAGTTTTG GCATTGCAACATGCTATCATCCCTTTATTTCAGCCTTCTGAAGAGAAGATTCAGATTGGA AATGCATATATTGCAATCAGTGGATCTACTGATGGCAGTATTGCCTTTTGGGATCTGACT GAAAGTGTTGAAAACTTCATGCTGCGGGCATCAACTCTCCATACAGAAAACTCTATTGAT TGTCAGAAACGACCACGCACTGGAAGAGGAAGCCAAGGTGGACGATGGTGGAGATCATTA GGCACCACTCCTAAGAAAAAACCCAGCGGCGGCTCAGTTTCCATGAGAGTTGAAGAAGGA ACTGGTGTTCTAAATTATGTTGCATGTGGAACCTCTTCAAAACTTAATGATCCTGAAAAC ACTCCAACTGCTTGTTCTCAAGCGATGTTCACTGCTTCCCTTGAGTCAGAAGTGAATACA GATGATTCCTCATCAGAAATATGTGAAATATCACCCTTACATGTTTTGAGTAGCATTCAC CAATCCGGGGTCAACTGTCTCCACATTTCAGATATGAATCATTGTCAAAGTTTTAACAAT GGTTTTCTGTATTATCTTTTAAGTGGGGGCGATGATCAAGCACTTCACTGTCTTGGATTT GATTTGACACTGCTACCAACAAGCTCAGAGTCTCAGATTAAGGCAAATTACAGAATCAGA TTTTTATACCATGACAGGGTAGCCTCAGCTCACAATTCTGCTGTGAAAGGTATTTGGACA GATGGGACGTGGGTGTTTTCTACTGGTCTTGATCAGCGTGTCAGATGCTGGTATCTTGGT GAGCATGGTAAATTAATTGAACAAGCTCATTTAGTAATTAGTGTGCCTGAGCCAGAGGCA TTGGACGCTAGAGCCTGTGGCAGGAACCATTATCAGATTGCAGTAGCTGGAAGAGGGATG CAAATGGTTGAGTTCTCTGTATCCCCTGACATGGATGGCAGAGGCGCAGATGGCTTCTGC TGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_07s0005g02210.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:7:4589049:4604749:1 gene:VIT_07s0005g02210 transcript:VIT_07s0005g02210.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEKQSEWRLHGGHYLGEISALCLIHAPPLPHFSSLPYLLAGTGSQVLLYDLESVKILRSF HVLEGIRVHGIACRLVDCKEGSVLSVKIAVFGERRVKLFNLRIEMVPESQDEPQVCLELT LLHSLPKFSHWVLDVCFFKEDIATSSHCLVVGCSDNSVHLWDMLTSSSILEVRNPERCLL YSMRLWGDELQNLLVASGTIYNEIIVWKAVPQNCTPSLGSSQYQALNICRLAGHEGSIFR LAWSSNGSKLVSVSDDRSARIWPIHAEREVSDNSGEIVDTGSAGPVLFGHNARIWDCCIL DSLIVTAGEDCTCRVWGTDGNQLKMIKEHIGRGVWRCLYDPKFSLLVTAGFDSAIKVHQL QASLPKAPQEQVAEVKELIDRTEIFTVCIPNSSEHTGLMDSKSEYVRSLRFTCENSLYVS TNRGYLYHAKLFDTGDVKWTELIRVSEEVPIVCMDLLSRNGPKLSSGVEDWIAVGDGKGN MTVTGIVSDLCPPKVGLTYTWSAGIERQLLGTFWCKSLGYRYIFTADPRGKLKLWRLCNP SQSASQNSAISNNVSLIAEFISSFNIRIMCLDASSEEEVLICGDLRGNLILYPLLRSILV GSSFGSEVKITPLTYFKGAHGISSVSGISIAGFVSNQIEIQSTGGDGCICYLEYRRDRQN LQFIGMKRVKELSLVQSVSSGADSVDDLTSSKYAIGFASTDFIIWNLITETKVVQVPCGG WRRPHSYYLGDVPEMRNCFAYVKDEIIYIHRFWIPESERKIFPQNLHIQFHGREMHSLCF VSRDSQVGLNGKHDLSSRSSWIATGCEDGTVRLTRYSPGVENWFSSQLLGEHVGGSAVRS ICPVSKIHTIPADATNMPNGTQRQHATWDGRENPFLLISVGAKRVITSWVLRTSTIDNKG EASDDGVQDKTGKGFPSMSFQWLSTDMPTKYSGIRKKTEDLENIVGIKKASSVNIDAESR SLFPERKEMQLRTCIGDMYENDWRYLAVTAFLVKDPVSRITVCFIVVGCSDATLSLRALI LPSRLWFDVALLVPQSSPVLALQHAIIPLFQPSEEKIQIGNAYIAISGSTDGSIAFWDLT ESVENFMLRASTLHTENSIDCQKRPRTGRGSQGGRWWRSLGTTPKKKPSGGSVSMRVEEG TGVLNYVACGTSSKLNDPENTPTACSQAMFTASLESEVNTDDSSSEICEISPLHVLSSIH QSGVNCLHISDMNHCQSFNNGFLYYLLSGGDDQALHCLGFDLTLLPTSSESQIKANYRIR FLYHDRVASAHNSAVKGIWTDGTWVFSTGLDQRVRCWYLGEHGKLIEQAHLVISVPEPEA LDARACGRNHYQIAVAGRGMQMVEFSVSPDMDGRGADGFC

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_07s0005g02210.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:7:4589049:4604749:1 gene:VIT_07s0005g02210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGAAGCAGAGTGAGTGGCGCCTCCACGGCGGCCACTACCTCGGAGAAATCTCAGCC CTCTGTTTAATCCACGCGCCACCTCTCCCTCACTTCTCTTCTCTCCCCTATCTCCTTGCT GGCACAGGATCGCAAGTTTTACTCTACGATTTGGAGTCCGTGAAAATACTGAGGTCCTTT CATGTGTTAGAAGGAATTAGAGTGCATGGAATTGCTTGCCGCTTGGTTGATTGTAAAGAA GGATCGGTATTGTCGGTTAAGATTGCTGTTTTCGGGGAAAGGAGAGTAAAGTTGTTTAAT TTGCGGATTGAGATGGTTCCTGAATCCCAAGATGAGCCCCAAGTGTGTTTGGAGTTGACT CTGTTGCATTCGTTGCCGAAATTCAGTCACTGGGTTTTAGATGTTTGCTTCTTCAAGGAG GACATTGCGACTTCTTCACATTGTCTTGTGGTGGGATGTAGCGATAATTCGGTCCATCTC TGGGATATGTTAACGTCCAGTTCGATTCTTGAAGTTAGGAATCCAGAGAGGTGCCTTCTT TATTCCATGCGGTTATGGGGTGATGAACTTCAAAACCTCCTTGTTGCATCTGGTACTATC TATAATGAGATTATTGTTTGGAAAGCAGTTCCTCAGAACTGCACTCCAAGTTTGGGAAGT TCACAATATCAAGCTCTTAATATATGTAGACTTGCTGGACATGAAGGTTCAATTTTTCGC CTAGCATGGTCCTCCAATGGATCCAAACTGGTGTCTGTCTCTGATGATCGGAGTGCTCGT ATCTGGCCAATTCATGCAGAAAGGGAAGTTTCTGATAACTCAGGAGAGATTGTTGACACA GGCTCTGCTGGTCCTGTGCTATTTGGTCACAATGCTAGGATTTGGGACTGCTGTATTTTA GATTCTTTAATTGTAACTGCTGGCGAGGATTGTACATGTCGTGTGTGGGGAACAGATGGT AACCAGCTTAAGATGATCAAAGAGCACATAGGAAGGGGTGTATGGCGATGTTTGTATGAT CCAAAGTTTTCACTTCTTGTTACTGCTGGGTTTGACTCTGCTATCAAAGTGCATCAGCTA CAAGCTTCTTTGCCTAAGGCCCCACAGGAACAGGTTGCGGAGGTAAAAGAGTTGATTGAC AGAACGGAGATATTCACTGTTTGTATCCCAAATTCATCAGAACATACTGGACTTATGGAC AGCAAAAGTGAATATGTGCGTTCCCTGCGTTTCACATGTGAAAATAGTCTCTATGTTTCC ACAAACCGTGGTTATCTTTACCATGCTAAATTATTTGATACAGGAGATGTAAAATGGACT GAACTTATCCGTGTCAGTGAAGAGGTGCCAATTGTTTGTATGGACTTACTGTCTAGAAAT GGACCCAAGCTTTCCAGTGGTGTTGAGGATTGGATTGCTGTTGGAGATGGTAAAGGAAAC ATGACAGTCACTGGAATTGTTAGTGATCTTTGCCCTCCTAAAGTAGGCCTCACTTATACT TGGTCAGCTGGAATAGAGAGGCAGCTCTTAGGAACATTTTGGTGCAAGTCCTTGGGATAT AGGTACATTTTCACTGCTGATCCAAGAGGAAAGTTGAAGTTATGGAGGTTATGTAATCCT TCACAATCAGCTTCTCAAAATTCTGCAATCAGTAACAATGTGTCTCTAATAGCAGAGTTC ATATCCAGTTTTAATATACGGATAATGTGTTTGGATGCCTCATCTGAGGAAGAGGTGCTG ATATGTGGAGATCTACGTGGTAATTTGATTTTATACCCTTTATTGAGGAGTATATTGGTG GGTTCATCTTTTGGATCAGAAGTGAAGATTACTCCATTGACTTATTTCAAAGGAGCTCAT GGGATATCAAGCGTGTCTGGCATTTCGATAGCAGGATTTGTTTCCAATCAAATTGAAATA CAATCTACTGGTGGAGATGGGTGCATATGCTATTTGGAATATCGCAGAGATCGACAGAAT TTGCAGTTTATAGGGATGAAACGGGTGAAAGAATTGAGTTTGGTCCAGTCCGTCTCTTCT GGTGCTGACTCTGTTGATGATTTGACAAGCAGCAAGTATGCAATTGGTTTTGCATCAACA GATTTCATAATATGGAACTTAATAACTGAGACAAAGGTTGTGCAAGTCCCATGTGGTGGA TGGCGGCGTCCCCATTCTTATTATCTTGGTGATGTACCAGAGATGAGAAACTGCTTTGCA TATGTTAAGGATGAAATAATTTATATTCATAGATTCTGGATTCCAGAGAGTGAAAGGAAA ATATTTCCTCAGAATCTGCATATTCAATTTCATGGGAGAGAGATGCATTCCTTATGTTTT GTGTCTAGGGATTCACAAGTTGGGTTAAATGGAAAGCATGACCTCTCTTCTAGATCTAGC TGGATTGCTACTGGGTGTGAAGATGGCACTGTGAGGTTGACAAGGTATTCTCCCGGTGTT GAGAATTGGTTTTCATCACAATTGCTTGGAGAGCATGTTGGTGGATCAGCTGTGAGGTCA ATATGCCCTGTATCAAAGATACACACAATTCCAGCAGATGCGACAAACATGCCAAATGGG ACACAGAGACAACATGCTACCTGGGACGGCAGAGAGAATCCATTCTTGCTAATTTCTGTT GGTGCAAAACGGGTCATAACTTCTTGGGTACTAAGAACTAGTACGATAGACAACAAGGGA GAAGCGTCAGATGATGGAGTGCAGGATAAAACTGGGAAGGGCTTTCCATCAATGTCATTC CAGTGGCTTTCCACTGACATGCCAACCAAGTATTCTGGTATTCGTAAGAAAACAGAAGAC TTGGAGAACATAGTTGGAATTAAAAAAGCTTCGAGTGTGAATATTGATGCAGAGTCTAGA TCACTCTTCCCAGAAAGAAAAGAGATGCAATTGAGAACTTGCATTGGGGACATGTATGAA AATGACTGGAGATACCTTGCTGTTACTGCTTTTCTTGTTAAAGATCCTGTTTCCAGAATT ACTGTCTGTTTTATTGTTGTTGGTTGTTCTGACGCCACACTTTCTCTGCGGGCTCTCATT TTACCCAGTCGACTTTGGTTTGATGTTGCTTTATTGGTTCCCCAGTCATCCCCAGTTTTG GCATTGCAACATGCTATCATCCCTTTATTTCAGCCTTCTGAAGAGAAGATTCAGATTGGA AATGCATATATTGCAATCAGTGGATCTACTGATGGCAGTATTGCCTTTTGGGATCTGACT GAAAGTGTTGAAAACTTCATGCTGCGGGCATCAACTCTCCATACAGAAAACTCTATTGAT TGTCAGAAACGACCACGCACTGGAAGAGGAAGCCAAGGTGGACGATGGTGGAGATCATTA GGCACCACTCCTAAGAAAAAACCCAGCGGCGGCTCAGTTTCCATGAGAGTTGAAGAAGGA ACTGGTGTTCTAAATTATGTTGCATGTGGAACCTCTTCAAAACTTAATGATCCTGAAAAC ACTCCAACTGCTTGTTCTCAAGCGATGTTCACTGCTTCCCTTGAGTCAGAAGTGAATACA GATGATTCCTCATCAGAAATATGTGAAATATCACCCTTACATGTTTTGAGTAGCATTCAC CAATCCGGGGTCAACTGTCTCCACATTTCAGATATGAATCATTGTCAAAGTTTTAACAAT GGTTTTCTGTATTATCTTTTAAGTGGGGGCGATGATCAAGCACTTCACTGTCTTGGATTT GATTTGACACTGCTACCAACAAGCTCAGAGTCTCAGATTAAGGCAAATTACAGAATCAGA TTTTTATACCATGACAGGGTAGCCTCAGCTCACAATTCTGCTGTGAAAGGTATTTGGACA GATGGGACGTGGGTGTTTTCTACTGGTCTTGATCAGCGTGTCAGATGCTGGTATCTTGGT GAGCATGGTAAATTAATTGAACAAGCTCATTTAGTAATTAGTGTGCCTGAGCCAGAGGCA TTGGACGCTAGAGCCTGTGGCAGGAACCATTATCAGATTGCAGTAGCTGGAAGAGGGATG CAAATGGTTGAGTTCTCTGTATCCCCTGACATGGATGGCAGAGGCGCAGATGGCTTCTGC TGATTTTGTGTTTCAATCCATAAGCTTTCGAGGATGGTCAGGTGGCAAAACAATTCAATT ATTACTTTTGGGAGGTTAAAAGATGCATATAGTACACTGTCTTAAGAAAGAACAATGGTA ATAATTGGATTAAGATCATGGTCATCTGAGATTTTGATGTTGTTGGGCAAGAATTGAACA AGTAATTAAAGGCTGGGAAAGCCATGTATGCCTGCTGCTAGCTGGTCATCCTCAAAGCTG CATTGATCAATAAATAAAGAATTCCAAATTAAGTGCGCTGCCCTTTTAACTTGTCACCAA TATCTGAAAAGACTGCCGTTTAGATCTGGGAAAGATGCTTCACTTAAGGAGTATAAAGAT GTCATATGACTCATAT