Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0009g03200.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:16405431:16407508:-1 gene:VIT_06s0009g03200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAATATTGTCTTGAAGGGTTTGTGTCGAAATGGTGGGGTTTTTGAGGCCATGGGGCTC ATTCGTGAAATGGGAAGAAAAAGTGTCTCGCCTGACATTGTTAGTTATAACACGCTCATA AATGGACTTTGCAAGGCGAAGAAATTGAAAGAAGCAGTTGGTTTGTTGCTTGAAATGGAG GCGGCAGGGTGTTTTCCTAATTCAGTTACATGCACCACTTTAATGGATGGTCTTTGTAAG GATGGTAGAATGGATGAAGCAATGGAATTATTGGAGGCGATGAAGAAGAAGGGTTTTGAT GCGGATGTTGTTTTGTATGGTACTCTTATAAGTGGTTTTTGCAATAACGGAAATCTTGAT AGGGGGAAAGAGCTTTTTGATGAGATGTTGGGAAAAGGAATTTCAGCTAATGTGGTTACT TATAGTTGTTTGGTGCATGGTCTGTGTAGGTTGGGACAATGGAAAGAAGCCAACACCGTG CTGAATGCTATGGCAGAACATGGGATCCATCCTGATGTTGTTACTTATACAGGTTTAATT GATGGGCTTTGTAAAGATGGAAGAGCTACACATGCTATGGACCTATTGAATTTAATGGTA GAGAAGGGTGAAGAGCCTAGTAATGTAACATATAATGTTCTACTTAGTGGACTGTGTAAG GAAGGCCTGGTGATTGATGCTTTTAAAATTTTAAGAATGATGATTGAAAAGGGGAAGAAG GCTGATGTGGTTACTTACAATACATTGATGAAGGGACTTTGTGATAAAGGGAAGGTTGAT GAGGCTCTAAAGCTTTTCAATTCAATGTTTGATAATGAGAACTGTCTTGAGCCAAATGTA TTTACGTTTAACATGCTAATTGGTGGGTTATGCAAGGAAGGCCGTCTAACAAAGGCTGTA AAGATTCATCGCAAGATGGTCAAGAAGGGAAGCTGTGGTAATTTGGTAACTTACAATATG CTACTTGGCGGGTGTTTAAAGGCAGGGAAGATTAAAGAAGCTATGGAACTTTGGAAACAA GTGCTTGACTTGGGATTTGTTCCAAACTCATTTACTTACAGTATCCTTATCGATGGCTTC TGTAAAATGCGGATGCTTAACATTGCAAAGGGACTTTTTTGTGAAATGAGAACTCATGGG CTTAACCCTGCATTGTTTGACTATAACACATTGATGGCCTCCTTGTGCAAGGAGGGTAGT TTGGAGCAAGCAAAGAGTTTGTTTCAAGAGATGGGGAATGCAAATTGTGAACCAGATATC ATTTCATTTAATACAATGATTGATGGAACCCTAAAAGCAGGTGATTTTCAATTTGTCAAA GAATTACAAATGAAGATGGTCGAAATGGGTTTGAGACCAGATGCTTTGACCTTTTCAACA CTAATAAATAGGTTGTCCAAATTAGGAGAGTTGGATGAGGCTAAAAGTGCTTTGGAAAGA ATGGTTGCTTCTGGATTTACACCTGATGCCTTGGTGTATGATTCTTTACTGAAAGGATTG AGTTCAAAAGGTGACACCACGGAAATCATCAATTTGCTTCATCAAATGGCGGCCAAGGGA ACTGTTCTTGACCGAAAAATAGTTTCTACTATCTTGACGTGCCTCTGTCATAGCATCCAA GAAGTTGATGTAATGGAGCTTTTACCAACCTTTTTTCAAGGAACGTCAGAAGGAGCGAGC ATATCGTGCAATGAATTGCTGATGCAACTCCATCAGTCTCATCCCAAGCTTCAATTACAT CCTTTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0009g03200.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:16405431:16407508:-1 gene:VIT_06s0009g03200 transcript:VIT_06s0009g03200.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MNIVLKGLCRNGGVFEAMGLIREMGRKSVSPDIVSYNTLINGLCKAKKLKEAVGLLLEME AAGCFPNSVTCTTLMDGLCKDGRMDEAMELLEAMKKKGFDADVVLYGTLISGFCNNGNLD RGKELFDEMLGKGISANVVTYSCLVHGLCRLGQWKEANTVLNAMAEHGIHPDVVTYTGLI DGLCKDGRATHAMDLLNLMVEKGEEPSNVTYNVLLSGLCKEGLVIDAFKILRMMIEKGKK ADVVTYNTLMKGLCDKGKVDEALKLFNSMFDNENCLEPNVFTFNMLIGGLCKEGRLTKAV KIHRKMVKKGSCGNLVTYNMLLGGCLKAGKIKEAMELWKQVLDLGFVPNSFTYSILIDGF CKMRMLNIAKGLFCEMRTHGLNPALFDYNTLMASLCKEGSLEQAKSLFQEMGNANCEPDI ISFNTMIDGTLKAGDFQFVKELQMKMVEMGLRPDALTFSTLINRLSKLGELDEAKSALER MVASGFTPDALVYDSLLKGLSSKGDTTEIINLLHQMAAKGTVLDRKIVSTILTCLCHSIQ EVDVMELLPTFFQGTSEGASISCNELLMQLHQSHPKLQLHPF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0009g03200.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:16405431:16407508:-1 gene:VIT_06s0009g03200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAATATTGTCTTGAAGGGTTTGTGTCGAAATGGTGGGGTTTTTGAGGCCATGGGGCTC ATTCGTGAAATGGGAAGAAAAAGTGTCTCGCCTGACATTGTTAGTTATAACACGCTCATA AATGGACTTTGCAAGGCGAAGAAATTGAAAGAAGCAGTTGGTTTGTTGCTTGAAATGGAG GCGGCAGGGTGTTTTCCTAATTCAGTTACATGCACCACTTTAATGGATGGTCTTTGTAAG GATGGTAGAATGGATGAAGCAATGGAATTATTGGAGGCGATGAAGAAGAAGGGTTTTGAT GCGGATGTTGTTTTGTATGGTACTCTTATAAGTGGTTTTTGCAATAACGGAAATCTTGAT AGGGGGAAAGAGCTTTTTGATGAGATGTTGGGAAAAGGAATTTCAGCTAATGTGGTTACT TATAGTTGTTTGGTGCATGGTCTGTGTAGGTTGGGACAATGGAAAGAAGCCAACACCGTG CTGAATGCTATGGCAGAACATGGGATCCATCCTGATGTTGTTACTTATACAGGTTTAATT GATGGGCTTTGTAAAGATGGAAGAGCTACACATGCTATGGACCTATTGAATTTAATGGTA GAGAAGGGTGAAGAGCCTAGTAATGTAACATATAATGTTCTACTTAGTGGACTGTGTAAG GAAGGCCTGGTGATTGATGCTTTTAAAATTTTAAGAATGATGATTGAAAAGGGGAAGAAG GCTGATGTGGTTACTTACAATACATTGATGAAGGGACTTTGTGATAAAGGGAAGGTTGAT GAGGCTCTAAAGCTTTTCAATTCAATGTTTGATAATGAGAACTGTCTTGAGCCAAATGTA TTTACGTTTAACATGCTAATTGGTGGGTTATGCAAGGAAGGCCGTCTAACAAAGGCTGTA AAGATTCATCGCAAGATGGTCAAGAAGGGAAGCTGTGGTAATTTGGTAACTTACAATATG CTACTTGGCGGGTGTTTAAAGGCAGGGAAGATTAAAGAAGCTATGGAACTTTGGAAACAA GTGCTTGACTTGGGATTTGTTCCAAACTCATTTACTTACAGTATCCTTATCGATGGCTTC TGTAAAATGCGGATGCTTAACATTGCAAAGGGACTTTTTTGTGAAATGAGAACTCATGGG CTTAACCCTGCATTGTTTGACTATAACACATTGATGGCCTCCTTGTGCAAGGAGGGTAGT TTGGAGCAAGCAAAGAGTTTGTTTCAAGAGATGGGGAATGCAAATTGTGAACCAGATATC ATTTCATTTAATACAATGATTGATGGAACCCTAAAAGCAGGTGATTTTCAATTTGTCAAA GAATTACAAATGAAGATGGTCGAAATGGGTTTGAGACCAGATGCTTTGACCTTTTCAACA CTAATAAATAGGTTGTCCAAATTAGGAGAGTTGGATGAGGCTAAAAGTGCTTTGGAAAGA ATGGTTGCTTCTGGATTTACACCTGATGCCTTGGTGTATGATTCTTTACTGAAAGGATTG AGTTCAAAAGGTGACACCACGGAAATCATCAATTTGCTTCATCAAATGGCGGCCAAGGGA ACTGTTCTTGACCGAAAAATAGTTTCTACTATCTTGACGTGCCTCTGTCATAGCATCCAA GAAGTTGATGTAATGGAGCTTTTACCAACCTTTTTTCAAGGAACGTCAGAAGGAGCGAGC ATATCGTGCAATGAATTGCTGATGCAACTCCATCAGTCTCATCCCAAGCTTCAATTACAT CCTTTTTAGTGGTTTCATTTGGAGAAATGCATATTCAGTTGCCATGACACCTCTTGATTT TCCTTTCTTGAGACACTGCAAAAACACATCAACTTT