Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0009g02740.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:15569832:15572513:-1 gene:VIT_06s0009g02740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTTAACCAATCCGGATGAGTGTATTGAAATCTATGCTTCAATTCTTCAGAAATGT CGAAAACTCTATAATTTGCGACTGGGTTTTCAAGTTCATGCTCAGTTGGTTGTTAATGGT GTTGACGTGTGTGAATTTCTTGGTAGTCGGCTCTTGGAGGTTTACTGTCAGACTGGATGT GTGGAGGATGCACGCAGGATGTTTGATAAAATGTCTGAGCGAAATGTTTTTAGTTGGACA GCTATAATGGAAATGTACTGTGGATTGGGGGATTATGAGGAGACAATTAAGTTGTTTTAT TTGATGGTCAATGAAGGAGTTCGGCCTGATCATTTTGTCTTTCCTAAGGTTTTCAAAGCA TGCTCGGAGTTGAAGAATTATCGGGTTGGGAAAGATGTTTATGATTACATGTTGAGTATA GGATTTGAGGGGAACTCCTGTGTTAAAGGGTCTATCCTTGATATGTTTATAAAATGTGGG AGAATGGATATTGCAAGGCGGTTCTTTGAAGAGATTGAATTTAAGGATGTTTTTATGTGG AACATAATGGTTTCAGGCTATACATCAAAAGGTGAGTTCAAGAAAGCTTTGAAGTGTATC AGTGACATGAAGCTTTCAGGTGTGAAGCCTGACCAAGTAACATGGAATGCAATCATTTCT GGTTATGCTCAGAGTGGGCAATTTGAGGAGGCTTCCAAATATTTTCTTGAGATGGGTGGT TTGAAAGATTTCAAACCTAATGTGGTTTCCTGGACTGCATTAATAGCAGGAAGTGAGCAG AATGGTTATGATTTTGAAGCACTGAGTGTTTTCAGGAAAATGGTTCTTGAAGGAGTAAAA CCAAACTCGATTACCATTGCAAGTGCTGTCTCAGCATGCACCAACTTGTCTTTGCTTAGA CATGGCAGAGAGATCCATGGCTATTGTATAAAGGTGGAAGAGTTGGATTCAGATTTATTG GTAGGTAACTCATTGGTCGACTACTATGCTAAATGCCGATCCGTGGAGGTTGCACGTAGA AAATTTGGTATGATCAAACAAACGGATTTGGTCTCATGGAACGCGATGCTGGCTGGTTAT GCCCTTAGAGGTAGTCATGAAGAAGCCATTGAACTTCTTAGTGAGATGAAGTTCCAAGGC ATTGAACCCGACATTATTACATGGAATGGATTAGTTACTGGGTTTACACAGTATGGGGAT GGGAAGGCAGCTCTTGAATTCTTTCAGAGGATGCACAGTATGGGTATGGATCCCAACACA ACAACTATATCAGGAGCTCTAGCTGCTTGTGGCCAAGTAAGAAATTTGAAGCTAGGGAAG GAGATTCATGGTTATGTTCTTCGGAATCATATTGAACTGTCAACAGGTGTTGGGAGTGCT CTTATATCAATGTACTCAGGATGTGATTCTCTGGAAGTTGCCTGTTCTGTGTTCAGTGAA CTTTCTACAAGAGATGTAGTTGTATGGAATTCAATTATTTCTGCCTGTGCACAAAGTGGG AGAAGTGTTAATGCTTTAGACTTGTTAAGAGAGATGAATTTAAGTAATGTGGAAGTGAAC ACAGTGACAATGGTTTCAGCCCTCCCAGCTTGTTCAAAGTTAGCTGCCTTGCGCCAAGGC AAAGAGATCCACCAGTTTATTATCAGGTGTGGGCTTGATACATGTAATTTTATATTGAAC TCCCTTATTGACATGTATGGACGCTGTGGATCCATCCAAAAAAGTCGAAGAATATTTGAT TTAATGCCGCAGAGAGATCTTGTCTCTTGGAATGTGATGATCTCAGTCTATGGAATGCAT GGCTTTGGGATGGATGCTGTAAATCTTTTCCAGCAGTTCAGAACTATGGGACTAAAGCCA AATCATATTACCTTCACAAATCTTTTATCAGCTTGTAGTCACTCAGGATTAATAGAGGAA GGATGGAAGTATTTTAAAATGATGAAAACCGAGTACGCTATGGACCCTGCTGTGGAGCAA TATGCTTGTATGGTTGATCTACTGTCAAGAGCAGGTCAATTCAATGAAACATTGGAGTTC ATTGAGAAGATGCCTTTTGAGCCCAATGCAGCAGTCTGGGGGTCTTTATTGGGTGCTTGT AGGATCCATTGCAACCCCGATCTTGCAGAATATGCTGCTCGGTATCTGTTTGAACTAGAG CCCCAAAGTTCTGGGAACTATGTACTCATGGCCAATATTTACTCTGCAGCAGGAAGATGG GAGGATGCAGCTAAAATACGCTGTTTGATGAAGGAGCGAGGAGTGACAAAACCTCCAGGT TGCAGTTGGATTGAAGTGAAGAGAAAATTGCATAGCTTCGTTGTTGGGGATACTTCACAT CCATTGATGGAGCAAATATCAGCAAAGATGGAAAGCTTGTATTTTGATATAAAAGAAATC GGGTATGTCCCTGACACGAACTTTGTGCTGCAGGATGTTGATGAAGATGAAAAGGAGTTC AGCCTGTGTGGGCATAGCGAGAAGATTGCTCTAGCTTTTGGCTTGATTAGCACAACTGCT GGAACCCCTTTGAGAATAATAAAAAACTTGAGGGTGTGTGGAGACTGCCACTCTGCAACA AAGTTTATATCCAAGGTGGAAAAGAGAGACATCATAATGAGAGATAATTATAGGTTTCAC CACTTTGTTGATGGAGTATGCTCGTGCGGGGATTATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0009g02740.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:15569832:15572513:-1 gene:VIT_06s0009g02740 transcript:VIT_06s0009g02740.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDLTNPDECIEIYASILQKCRKLYNLRLGFQVHAQLVVNGVDVCEFLGSRLLEVYCQTGC VEDARRMFDKMSERNVFSWTAIMEMYCGLGDYEETIKLFYLMVNEGVRPDHFVFPKVFKA CSELKNYRVGKDVYDYMLSIGFEGNSCVKGSILDMFIKCGRMDIARRFFEEIEFKDVFMW NIMVSGYTSKGEFKKALKCISDMKLSGVKPDQVTWNAIISGYAQSGQFEEASKYFLEMGG LKDFKPNVVSWTALIAGSEQNGYDFEALSVFRKMVLEGVKPNSITIASAVSACTNLSLLR HGREIHGYCIKVEELDSDLLVGNSLVDYYAKCRSVEVARRKFGMIKQTDLVSWNAMLAGY ALRGSHEEAIELLSEMKFQGIEPDIITWNGLVTGFTQYGDGKAALEFFQRMHSMGMDPNT TTISGALAACGQVRNLKLGKEIHGYVLRNHIELSTGVGSALISMYSGCDSLEVACSVFSE LSTRDVVVWNSIISACAQSGRSVNALDLLREMNLSNVEVNTVTMVSALPACSKLAALRQG KEIHQFIIRCGLDTCNFILNSLIDMYGRCGSIQKSRRIFDLMPQRDLVSWNVMISVYGMH GFGMDAVNLFQQFRTMGLKPNHITFTNLLSACSHSGLIEEGWKYFKMMKTEYAMDPAVEQ YACMVDLLSRAGQFNETLEFIEKMPFEPNAAVWGSLLGACRIHCNPDLAEYAARYLFELE PQSSGNYVLMANIYSAAGRWEDAAKIRCLMKERGVTKPPGCSWIEVKRKLHSFVVGDTSH PLMEQISAKMESLYFDIKEIGYVPDTNFVLQDVDEDEKEFSLCGHSEKIALAFGLISTTA GTPLRIIKNLRVCGDCHSATKFISKVEKRDIIMRDNYRFHHFVDGVCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0009g02740.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:15569832:15572513:-1 gene:VIT_06s0009g02740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTTAACCAATCCGGATGAGTGTATTGAAATCTATGCTTCAATTCTTCAGAAATGT CGAAAACTCTATAATTTGCGACTGGGTTTTCAAGTTCATGCTCAGTTGGTTGTTAATGGT GTTGACGTGTGTGAATTTCTTGGTAGTCGGCTCTTGGAGGTTTACTGTCAGACTGGATGT GTGGAGGATGCACGCAGGATGTTTGATAAAATGTCTGAGCGAAATGTTTTTAGTTGGACA GCTATAATGGAAATGTACTGTGGATTGGGGGATTATGAGGAGACAATTAAGTTGTTTTAT TTGATGGTCAATGAAGGAGTTCGGCCTGATCATTTTGTCTTTCCTAAGGTTTTCAAAGCA TGCTCGGAGTTGAAGAATTATCGGGTTGGGAAAGATGTTTATGATTACATGTTGAGTATA GGATTTGAGGGGAACTCCTGTGTTAAAGGGTCTATCCTTGATATGTTTATAAAATGTGGG AGAATGGATATTGCAAGGCGGTTCTTTGAAGAGATTGAATTTAAGGATGTTTTTATGTGG AACATAATGGTTTCAGGCTATACATCAAAAGGTGAGTTCAAGAAAGCTTTGAAGTGTATC AGTGACATGAAGCTTTCAGGTGTGAAGCCTGACCAAGTAACATGGAATGCAATCATTTCT GGTTATGCTCAGAGTGGGCAATTTGAGGAGGCTTCCAAATATTTTCTTGAGATGGGTGGT TTGAAAGATTTCAAACCTAATGTGGTTTCCTGGACTGCATTAATAGCAGGAAGTGAGCAG AATGGTTATGATTTTGAAGCACTGAGTGTTTTCAGGAAAATGGTTCTTGAAGGAGTAAAA CCAAACTCGATTACCATTGCAAGTGCTGTCTCAGCATGCACCAACTTGTCTTTGCTTAGA CATGGCAGAGAGATCCATGGCTATTGTATAAAGGTGGAAGAGTTGGATTCAGATTTATTG GTAGGTAACTCATTGGTCGACTACTATGCTAAATGCCGATCCGTGGAGGTTGCACGTAGA AAATTTGGTATGATCAAACAAACGGATTTGGTCTCATGGAACGCGATGCTGGCTGGTTAT GCCCTTAGAGGTAGTCATGAAGAAGCCATTGAACTTCTTAGTGAGATGAAGTTCCAAGGC ATTGAACCCGACATTATTACATGGAATGGATTAGTTACTGGGTTTACACAGTATGGGGAT GGGAAGGCAGCTCTTGAATTCTTTCAGAGGATGCACAGTATGGGTATGGATCCCAACACA ACAACTATATCAGGAGCTCTAGCTGCTTGTGGCCAAGTAAGAAATTTGAAGCTAGGGAAG GAGATTCATGGTTATGTTCTTCGGAATCATATTGAACTGTCAACAGGTGTTGGGAGTGCT CTTATATCAATGTACTCAGGATGTGATTCTCTGGAAGTTGCCTGTTCTGTGTTCAGTGAA CTTTCTACAAGAGATGTAGTTGTATGGAATTCAATTATTTCTGCCTGTGCACAAAGTGGG AGAAGTGTTAATGCTTTAGACTTGTTAAGAGAGATGAATTTAAGTAATGTGGAAGTGAAC ACAGTGACAATGGTTTCAGCCCTCCCAGCTTGTTCAAAGTTAGCTGCCTTGCGCCAAGGC AAAGAGATCCACCAGTTTATTATCAGGTGTGGGCTTGATACATGTAATTTTATATTGAAC TCCCTTATTGACATGTATGGACGCTGTGGATCCATCCAAAAAAGTCGAAGAATATTTGAT TTAATGCCGCAGAGAGATCTTGTCTCTTGGAATGTGATGATCTCAGTCTATGGAATGCAT GGCTTTGGGATGGATGCTGTAAATCTTTTCCAGCAGTTCAGAACTATGGGACTAAAGCCA AATCATATTACCTTCACAAATCTTTTATCAGCTTGTAGTCACTCAGGATTAATAGAGGAA GGATGGAAGTATTTTAAAATGATGAAAACCGAGTACGCTATGGACCCTGCTGTGGAGCAA TATGCTTGTATGGTTGATCTACTGTCAAGAGCAGGTCAATTCAATGAAACATTGGAGTTC ATTGAGAAGATGCCTTTTGAGCCCAATGCAGCAGTCTGGGGGTCTTTATTGGGTGCTTGT AGGATCCATTGCAACCCCGATCTTGCAGAATATGCTGCTCGGTATCTGTTTGAACTAGAG CCCCAAAGTTCTGGGAACTATGTACTCATGGCCAATATTTACTCTGCAGCAGGAAGATGG GAGGATGCAGCTAAAATACGCTGTTTGATGAAGGAGCGAGGAGTGACAAAACCTCCAGGT TGCAGTTGGATTGAAGTGAAGAGAAAATTGCATAGCTTCGTTGTTGGGGATACTTCACAT CCATTGATGGAGCAAATATCAGCAAAGATGGAAAGCTTGTATTTTGATATAAAAGAAATC GGGTATGTCCCTGACACGAACTTTGTGCTGCAGGATGTTGATGAAGATGAAAAGGAGTTC AGCCTGTGTGGGCATAGCGAGAAGATTGCTCTAGCTTTTGGCTTGATTAGCACAACTGCT GGAACCCCTTTGAGAATAATAAAAAACTTGAGGGTGTGTGGAGACTGCCACTCTGCAACA AAGTTTATATCCAAGGTGGAAAAGAGAGACATCATAATGAGAGATAATTATAGGTTTCAC CACTTTGTTGATGGAGTATGCTCGTGCGGGGATTATTGGTAG