Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_06s0009g02640.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:6:15422302:15431585:-1 gene:VIT_06s0009g02640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGTCAAGTTTGGAAGAGCCGCTTGGTCTTGACAACTTGTCGAGCCTGAGTACCATTGAT
CTCCAGAGGTTCTCCTCTAATGCTTGCAGGCCCAGAGCAGAGGATATGGGGATGGGAAGC
TGCTGGATTGACGGGAGGACTTGTAGCTCATCCAATAATTGCAATGAAGATTATGAAGGC
TATACAAGAGAGGCATTCCAATGGAAAAGACAAACAAGAGAAACATCACAAGGAGACTCC
TTGAAACGAAGGACTTCAAGCCAGGGCAGGAGTTGCATGGTGTATGGAAGCAGTTGTGAT
TCATGGTACTCTTCAGATCACCAATATGGCTTCCAATGCAATAACAAAGGTGTAAGGGGC
ATGGCAAATAAGTTTTTAGGAGGTATACCAAAGTTTGTGAAGATAGTGGAAGTTGGTCCA
AGGGATGGATTGCAAAATGAGAAGAATATTGTACCTACAGCTGTAAAAGTGGAACTAATC
CATAGGCTAGTTTCTTGTGGATTGCCTGTTGTTGAGGCTACAAGTTTTGTGTCGCCAAAA
TGGGTACCTCAGTTAGCAGATGCAAAGGATGTTATGGAAGCAGTTCGGAATTTGGAGGGT
GCTAGATTACCTGTGCTGACACCTAATTTAAAAGGATTTGAAGCAGCTATTGCAGCTGGT
GCTAAGGAAGTTGCCATCTTTGCTTCAGCTTCTGAGTCCTTTTCAAAGTCAAACATCAAT
TGTAGTATTGAAGAGAGTCTCACTCGCTATCGTGCTGTTGCCCTTGCTGCTAAAAAACTC
TCAATTCCTGTCCGTGGGTATGTGTCATGTGTCGTTGGGTGTCCGGTGGAAGGAGCTATT
TCTCCCTCAAAAGTTGCATATGTGGCCAAAGAACTTTATGATATGGGTTGCTTTGAAATC
TCCCTTGGTGATACAATTGGGGTTGCTACGCCTGGCGCCATTGTTCCTATGCTTGAAGCT
GTAATGGCTGTTGTTCCTGTTGAGAAGCTTGCTGTCCACTTCCATGACACTTATGGGCAG
TCTCTTCCAAATATTTTACTATCGCTCCAGATGGGGATTAGCACCATAGATTCCTCTGTT
GCTGGTCTTGGAGGATGCCCATATGCCAAGGGAGCTTCAGGGAACGTGGCCACCGAGGAT
GTTGTTTACATGCTTAATGGCCTTGGCGTGAAAACCAACGTCGATCTGGGAAAGCTCATG
TTAGTTGGTGATTTCATCAGCAACCGTTTGGGCCGCCCTTCTGGTTCCAAGACAGCCATA
GCCTTGAGCCGCGTGAATGTTGATGCCTCTAAGATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_06s0009g02640.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:6:15422302:15431585:-1 gene:VIT_06s0009g02640 transcript:VIT_06s0009g02640.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MSSLEEPLGLDNLSSLSTIDLQRFSSNACRPRAEDMGMGSCWIDGRTCSSSNNCNEDYEG
YTREAFQWKRQTRETSQGDSLKRRTSSQGRSCMVYGSSCDSWYSSDHQYGFQCNNKGVRG
MANKFLGGIPKFVKIVEVGPRDGLQNEKNIVPTAVKVELIHRLVSCGLPVVEATSFVSPK
WVPQLADAKDVMEAVRNLEGARLPVLTPNLKGFEAAIAAGAKEVAIFASASESFSKSNIN
CSIEESLTRYRAVALAAKKLSIPVRGYVSCVVGCPVEGAISPSKVAYVAKELYDMGCFEI
SLGDTIGVATPGAIVPMLEAVMAVVPVEKLAVHFHDTYGQSLPNILLSLQMGISTIDSSV
AGLGGCPYAKGASGNVATEDVVYMLNGLGVKTNVDLGKLMLVGDFISNRLGRPSGSKTAI
ALSRVNVDASKI

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_06s0009g02640.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:6:15422302:15431585:-1 gene:VIT_06s0009g02640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

GTATTTTTTCCAGTTTCCCTTGTATCTTCTGCCACGATGTCAAGTTTGGAAGAGCCGCTT
GGTCTTGACAACTTGTCGAGCCTGAGTACCATTGATCTCCAGAGGTTCTCCTCTAATGCT
TGCAGGCCCAGAGCAGAGGATATGGGGATGGGAAGCTGCTGGATTGACGGGAGGACTTGT
AGCTCATCCAATAATTGCAATGAAGATTATGAAGGCTATACAAGAGAGGCATTCCAATGG
AAAAGACAAACAAGAGAAACATCACAAGGAGACTCCTTGAAACGAAGGACTTCAAGCCAG
GGCAGGAGTTGCATGGTGTATGGAAGCAGTTGTGATTCATGGTACTCTTCAGATCACCAA
TATGGCTTCCAATGCAATAACAAAGGTGTAAGGGGCATGGCAAATAAGTTTTTAGGAGGT
ATACCAAAGTTTGTGAAGATAGTGGAAGTTGGTCCAAGGGATGGATTGCAAAATGAGAAG
AATATTGTACCTACAGCTGTAAAAGTGGAACTAATCCATAGGCTAGTTTCTTGTGGATTG
CCTGTTGTTGAGGCTACAAGTTTTGTGTCGCCAAAATGGGTACCTCAGTTAGCAGATGCA
AAGGATGTTATGGAAGCAGTTCGGAATTTGGAGGGTGCTAGATTACCTGTGCTGACACCT
AATTTAAAAGGATTTGAAGCAGCTATTGCAGCTGGTGCTAAGGAAGTTGCCATCTTTGCT
TCAGCTTCTGAGTCCTTTTCAAAGTCAAACATCAATTGTAGTATTGAAGAGAGTCTCACT
CGCTATCGTGCTGTTGCCCTTGCTGCTAAAAAACTCTCAATTCCTGTCCGTGGGTATGTG
TCATGTGTCGTTGGGTGTCCGGTGGAAGGAGCTATTTCTCCCTCAAAAGTTGCATATGTG
GCCAAAGAACTTTATGATATGGGTTGCTTTGAAATCTCCCTTGGTGATACAATTGGGGTT
GCTACGCCTGGCGCCATTGTTCCTATGCTTGAAGCTGTAATGGCTGTTGTTCCTGTTGAG
AAGCTTGCTGTCCACTTCCATGACACTTATGGGCAGTCTCTTCCAAATATTTTACTATCG
CTCCAGATGGGGATTAGCACCATAGATTCCTCTGTTGCTGGTCTTGGAGGATGCCCATAT
GCCAAGGGAGCTTCAGGGAACGTGGCCACCGAGGATGTTGTTTACATGCTTAATGGCCTT
GGCGTGAAAACCAACGTCGATCTGGGAAAGCTCATGTTAGTTGGTGATTTCATCAGCAAC
CGTTTGGGCCGCCCTTCTGGTTCCAAGACAGCCATAGCCTTGAGCCGCGTGAATGTTGAT
GCCTCTAAGATTTAGGGACATTGAAGGCATATGATCTATTCTATGTACTTCCAAGCTTGG
AAGAGGATGATATGATTGTCACATGTCGTTTCTAATCTGTATGTTGCATTATATATCTAT
GTATCTATACCTATATATAGGAATAAAACAAACAGAGAGCCATTGTTGGCGTAACCATTA
CTTTTGGAAGCAAAGATGAAATGGGTGTGTTGAGATATGTGTGTAAGTCTCAATCTGAAA
ATAGAGGCTGCCAATTGCAGTGAATAGAGAAAGTGTAGGATGTTGGAGTCGTTGTAAGGG
GGGTAGGCCATGATTCCTGTAAGGGGTTTTGTCCTAATAAGATAAGGTTGAGGACCAGGT
GGGGTTCAAATTAATAAACAAGTATTCCACTGTTTCGGGGATCTGTCT