Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0009g00810.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:11743011:11747586:-1 gene:VIT_06s0009g00810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTGAAGTTTTCCATGCCCTTGATGGGTTTGATGCTGTTATGCTTGTGGGCAACTGTT ACAGAAGCAAAATACATCAAGTACAAAGACCCTAAACAGCCATTGGGCGTTCGAATCAAG GACCTCATGGCCCGGATGACTCTACAAGAAAAGATTGGCCAAATGGTGCAGATCGAGCGC GAAGCTGCATCTGCCGATATCATGAAGAAGTACTTCATTGGGAGTATTTTGAGTGGTGGA GGGAGTGTCCCGGCCAAGAGAGCATCGCCTGAGACATGGGTGAGTGTTGTGAATGAATTC CAGAAGGGTTCTCTATCCACCCGTCTTGGGATTCCCATGATTTATGGGATTGATGCAGTT CATGGCCACAACAATGTGTACAACGCAACAGTTTTTCCTCACAATGTTGGTCTTGGAGCT ACTAGGCAAGTGATGGATCCTGAGCTTGTGAAGAAGATTGGAGCTGCAACTGCTCTTGAA GTTAGAGCTACAGGAATTCCCTATGCTTTTGCTCCATGTATTGCGGTTTGCAGGGATCCA AGATGGGGTCGGTGTTATGAAAGCTATAGCGAAGATCATAAAATTGTTCAAGCAATGACC GAGATCATACCTGGTTTGCAAGGAGATTTACCTGCTGGTTCTAAGAAGGGTGTTCCCTTT GTTGGTGGAAAGACAAAGGTTGCAGCTTGTGCCAAGCACTATGTGGGGGATGGTGGTACT ACCAAGGGCATCAATGAGAATAACACTATAATTGATTTTAATGGATTGCTCAACATCCAC ATGCCTGCATATCGTAACTCCATCAGCAAAGGTGTTGCTACAGTTATGGTTTCCTACTCA AGCTGGAATGGAAAGAAGATGCATGCTAACCATGATCTTATCATTGGATTCCTCAAGAAT AAACTACGGTTCAGGGGTTTTGTCATATCGGATTGGCAGGGTATTGACAGGATTACATCT CCACCCCATGCTAATTATTCTTATTCTGTCGAAGCTGGAGTTGGTGCTGGAATAGACATG GTCATGGTTCCATACAACTTCACAGAATTCCTTGATGATCTAACCTTCCAGGTGAAGAAT GGCATCATCCCCATGGCCAGGATTGATGATGCAGTGAAGAGGATCCTGAGAGTCAAATTT GTCATGGGATTATTTGAGAACCCAATGGCTGATCTCAGCCTGGTCAACCAACTTGGGAGC CAGGAGCATAGAGAGTTGGCAAGGGAAGCTGTGAGGAAGTCACTTGTGCTGCTGAAGAAT GGTAAATCTGCCAAGAATCCATTACTTCCCCTTCCTAAGAAAGCACCAAAGATACTTGTT GCAGGAAGTCATGCTGACAACTTGGGTTATCAATGTGGAGGCTGGACAATTGAATGGCAG GGTCTTGGAGGCAATGACCTAACATCAGGAACCACAATCCTAACTGCGGTGAAGAATACC GTTGAATCTGGCACTCAAATTGTCTACAATGAGAACCCTGACTTAGAATACGTCAAGTCA AACAAATTCTCATACGCAATTGTTGTTGTGGGTGAGCCTCCTTATGCAGAAACTGCTGGT GATAGCATGAGTCTGACAATAGCTGAACCTGGTGCAAGCACCATCTCCAATGTCTGCGCA GCTGTCAAATGTGTCGTTGTTATCGTTTCTGGCCGCCCTGTTGTGATCCAGCCCTATCTA GCAAAAATAGATGCACTTGTAGCTGCTTGGCTTCCGGGAACTGAAGGCCAAGGTGTTGCA GATGTGCTGTTTGGTGACTATGGATTCACTGGAAAGCTGGCACGAACTTGGTTCAAGACA GTGGAGCAGCTCCCCATGAATGTTGGTGATCCACACTATGACCCTCTATTTCCCTTTGGG TTTGGTCTAACGACTAAACCCACCAAGCAGATCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0009g00810.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:11743011:11747586:-1 gene:VIT_06s0009g00810 transcript:VIT_06s0009g00810.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVKFSMPLMGLMLLCLWATVTEAKYIKYKDPKQPLGVRIKDLMARMTLQEKIGQMVQIER EAASADIMKKYFIGSILSGGGSVPAKRASPETWVSVVNEFQKGSLSTRLGIPMIYGIDAV HGHNNVYNATVFPHNVGLGATRQVMDPELVKKIGAATALEVRATGIPYAFAPCIAVCRDP RWGRCYESYSEDHKIVQAMTEIIPGLQGDLPAGSKKGVPFVGGKTKVAACAKHYVGDGGT TKGINENNTIIDFNGLLNIHMPAYRNSISKGVATVMVSYSSWNGKKMHANHDLIIGFLKN KLRFRGFVISDWQGIDRITSPPHANYSYSVEAGVGAGIDMVMVPYNFTEFLDDLTFQVKN GIIPMARIDDAVKRILRVKFVMGLFENPMADLSLVNQLGSQEHRELAREAVRKSLVLLKN GKSAKNPLLPLPKKAPKILVAGSHADNLGYQCGGWTIEWQGLGGNDLTSGTTILTAVKNT VESGTQIVYNENPDLEYVKSNKFSYAIVVVGEPPYAETAGDSMSLTIAEPGASTISNVCA AVKCVVVIVSGRPVVIQPYLAKIDALVAAWLPGTEGQGVADVLFGDYGFTGKLARTWFKT VEQLPMNVGDPHYDPLFPFGFGLTTKPTKQI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0009g00810.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:11743011:11747586:-1 gene:VIT_06s0009g00810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TTCAAAATGGTGAAGTTTTCCATGCCCTTGATGGGTTTGATGCTGTTATGCTTGTGGGCA ACTGTTACAGAAGCAAAATACATCAAGTACAAAGACCCTAAACAGCCATTGGGCGTTCGA ATCAAGGACCTCATGGCCCGGATGACTCTACAAGAAAAGATTGGCCAAATGGTGCAGATC GAGCGCGAAGCTGCATCTGCCGATATCATGAAGAAGTACTTCATTGGGAGTATTTTGAGT GGTGGAGGGAGTGTCCCGGCCAAGAGAGCATCGCCTGAGACATGGGTGAGTGTTGTGAAT GAATTCCAGAAGGGTTCTCTATCCACCCGTCTTGGGATTCCCATGATTTATGGGATTGAT GCAGTTCATGGCCACAACAATGTGTACAACGCAACAGTTTTTCCTCACAATGTTGGTCTT GGAGCTACTAGGCAAGTGATGGATCCTGAGCTTGTGAAGAAGATTGGAGCTGCAACTGCT CTTGAAGTTAGAGCTACAGGAATTCCCTATGCTTTTGCTCCATGTATTGCGGTTTGCAGG GATCCAAGATGGGGTCGGTGTTATGAAAGCTATAGCGAAGATCATAAAATTGTTCAAGCA ATGACCGAGATCATACCTGGTTTGCAAGGAGATTTACCTGCTGGTTCTAAGAAGGGTGTT CCCTTTGTTGGTGGAAAGACAAAGGTTGCAGCTTGTGCCAAGCACTATGTGGGGGATGGT GGTACTACCAAGGGCATCAATGAGAATAACACTATAATTGATTTTAATGGATTGCTCAAC ATCCACATGCCTGCATATCGTAACTCCATCAGCAAAGGTGTTGCTACAGTTATGGTTTCC TACTCAAGCTGGAATGGAAAGAAGATGCATGCTAACCATGATCTTATCATTGGATTCCTC AAGAATAAACTACGGTTCAGGGGTTTTGTCATATCGGATTGGCAGGGTATTGACAGGATT ACATCTCCACCCCATGCTAATTATTCTTATTCTGTCGAAGCTGGAGTTGGTGCTGGAATA GACATGGTCATGGTTCCATACAACTTCACAGAATTCCTTGATGATCTAACCTTCCAGGTG AAGAATGGCATCATCCCCATGGCCAGGATTGATGATGCAGTGAAGAGGATCCTGAGAGTC AAATTTGTCATGGGATTATTTGAGAACCCAATGGCTGATCTCAGCCTGGTCAACCAACTT GGGAGCCAGGAGCATAGAGAGTTGGCAAGGGAAGCTGTGAGGAAGTCACTTGTGCTGCTG AAGAATGGTAAATCTGCCAAGAATCCATTACTTCCCCTTCCTAAGAAAGCACCAAAGATA CTTGTTGCAGGAAGTCATGCTGACAACTTGGGTTATCAATGTGGAGGCTGGACAATTGAA TGGCAGGGTCTTGGAGGCAATGACCTAACATCAGGAACCACAATCCTAACTGCGGTGAAG AATACCGTTGAATCTGGCACTCAAATTGTCTACAATGAGAACCCTGACTTAGAATACGTC AAGTCAAACAAATTCTCATACGCAATTGTTGTTGTGGGTGAGCCTCCTTATGCAGAAACT GCTGGTGATAGCATGAGTCTGACAATAGCTGAACCTGGTGCAAGCACCATCTCCAATGTC TGCGCAGCTGTCAAATGTGTCGTTGTTATCGTTTCTGGCCGCCCTGTTGTGATCCAGCCC TATCTAGCAAAAATAGATGCACTTGTAGCTGCTTGGCTTCCGGGAACTGAAGGCCAAGGT GTTGCAGATGTGCTGTTTGGTGACTATGGATTCACTGGAAAGCTGGCACGAACTTGGTTC AAGACAGTGGAGCAGCTCCCCATGAATGTTGGTGATCCACACTATGACCCTCTATTTCCC TTTGGGTTTGGTCTAACGACTAAACCCACCAAGCAGATCTAGAAATCCCA