Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0004g07690.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:8486189:8488454:1 gene:VIT_06s0004g07690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGGGTGACACTAGGGCTTTCAGTGAAACTGGGCGCTTCTTCTGAACCGTCTTTTCTT CGCTGCCACTCTCCAAATAATCGTATTTCCAATAATAAGGCCAAAGTTTCAAATGCGACT CTTTCTTGTTCAAGGGTCCAGAAGTTTAAAGGAGTTGGTAGAGGAAAAGTTTGTGACCCT AGTTATACTGCTAAAACCGATCGATACCATGAATCCCATGAAGCCCAAGAGTTGGTTGAC CTGCTACGTGACAGTGCAGCAAAAGGGTCGATCAGAGAAGGAAAATCGGTTCATGGGTTG TTGTTGAAATCAAGTTTCGGTGATGAAGAATCAATAAGGCTGTTCAATCATGTGGCCTAT ATGTACGCCGAATGCTCGTGCTTTGTGGAGGCTTGGAGGGTGTTCGATGGAATGCCGCAT AGAAATTCATTCTCTTGGACTGTTATGATCGCGGGGTCGAAGAAAAATGGGTTGTTTCTT GATGGGTTTAGATTTTTTTATGATATGTTGGTTGACGGAATTCTACCGGATGAGTTTGTG TATTCTGCGGTTATTCAGTCTTGCATAGGGCTTGGTTGTATTGAATTGGGCGAAGCAGTG CATGGGCAGATTGTGAAGAGAGGGTTTTGGGATGATGTTATTGTCGGTACGTCTCTTCTT AGCATGTATGCCAAGTTACACAATAGTGAGGCTTCAGTTCGGGTGTTTAATGCTATTGCT GAACATAATCAAGTATCTTGGGGTGCAGTGATATCAGGATTGTCATCAAATGGACTATAC TTAGAAGCATTCCACCAGTTTCTTGCCATGATAACACAAGGCTTCACACCAAATATGTAC ACTTTCTCTAGTGTTCTGAAGGCGGTTGGGAAAATAAGAGATGCTACCAAAGGTAGAGAA GTTCACCATTGTGTTATGGAGTATGGTATGGAATCTAATGTTGTTGTGGGGACTTCACTC ATTGATATGTACTCGAAATGTGGGCACTTGTCTGATGCTAGATCTGTATTTGACAGGAAT TTCTATAAATCTAAAGTGAATAATCCATGGAATGCCATGATATCGAGCTATACACAATGT GGGTATTGGCAAGAGGCTTTAGATCTTTTCATTGAAATGTCCTTGAATGATGTAAAACCA GATCTCTATACTTATGGTGGTGTGTTTAGTGCCATTGCTGCATTGAAGTGGTTGTATTTT GGAAGGCAAGTTCATGGGATGGTTGTGAAGTCTGGTAATGGCTCTAGAGTTCTAAGTTTG AATAATGCAATTGTGGATGCATATTTTAAATGTCAGTCCCTAGAAGATGCAAGGAAGGTC TTTGATAGGATGCAAGAGAGAGACATGGTTTCTTGGACTACCTTGGTCAGTGCTTATGTC CAGTGCTATCAACCTAGCGAAGCATTGAGCATCTTTTCCCAAATGAGAGAACAAGGATTT ATGCCCAATCAGTTCACCTTTTCTAGTGTTCTTGTTGCATGTGCCAGCCTCTCTTTGCTT GAGTATGGTCGTCAAGTGCATGGTCTTATATGTAAGGCTGGGTTAGATGATGATAACTGC ATAGAGAGTTCTTTGACCAATATGTATGCAAAGTCCGGTAATATCATTGATGCAGTGGAA GTCTTTGAGAAAATTGTTTGTCCAGATGTTGTTTCATGGAGTGCTATCATTTATGGGTAT GCCCAACATGGCTTTCTAGACAAGGCTGTTGAACTAGTTCAGAAGATGGAACAATCTGGT ATTCAACCCAATTCTAACATACTTTTGAGCCATCTTATTTGCTTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0004g07690.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:8486189:8488454:1 gene:VIT_06s0004g07690 transcript:VIT_06s0004g07690.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGVTLGLSVKLGASSEPSFLRCHSPNNRISNNKAKVSNATLSCSRVQKFKGVGRGKVCDP SYTAKTDRYHESHEAQELVDLLRDSAAKGSIREGKSVHGLLLKSSFGDEESIRLFNHVAY MYAECSCFVEAWRVFDGMPHRNSFSWTVMIAGSKKNGLFLDGFRFFYDMLVDGILPDEFV YSAVIQSCIGLGCIELGEAVHGQIVKRGFWDDVIVGTSLLSMYAKLHNSEASVRVFNAIA EHNQVSWGAVISGLSSNGLYLEAFHQFLAMITQGFTPNMYTFSSVLKAVGKIRDATKGRE VHHCVMEYGMESNVVVGTSLIDMYSKCGHLSDARSVFDRNFYKSKVNNPWNAMISSYTQC GYWQEALDLFIEMSLNDVKPDLYTYGGVFSAIAALKWLYFGRQVHGMVVKSGNGSRVLSL NNAIVDAYFKCQSLEDARKVFDRMQERDMVSWTTLVSAYVQCYQPSEALSIFSQMREQGF MPNQFTFSSVLVACASLSLLEYGRQVHGLICKAGLDDDNCIESSLTNMYAKSGNIIDAVE VFEKIVCPDVVSWSAIIYGYAQHGFLDKAVELVQKMEQSGIQPNSNILLSHLICL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0004g07690.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:8486189:8488454:1 gene:VIT_06s0004g07690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGGGTGACACTAGGGCTTTCAGTGAAACTGGGCGCTTCTTCTGAACCGTCTTTTCTT CGCTGCCACTCTCCAAATAATCGTATTTCCAATAATAAGGCCAAAGTTTCAAATGCGACT CTTTCTTGTTCAAGGGTCCAGAAGTTTAAAGGAGTTGGTAGAGGAAAAGTTTGTGACCCT AGTTATACTGCTAAAACCGATCGATACCATGAATCCCATGAAGCCCAAGAGTTGGTTGAC CTGCTACGTGACAGTGCAGCAAAAGGGTCGATCAGAGAAGGAAAATCGGTTCATGGGTTG TTGTTGAAATCAAGTTTCGGTGATGAAGAATCAATAAGGCTGTTCAATCATGTGGCCTAT ATGTACGCCGAATGCTCGTGCTTTGTGGAGGCTTGGAGGGTGTTCGATGGAATGCCGCAT AGAAATTCATTCTCTTGGACTGTTATGATCGCGGGGTCGAAGAAAAATGGGTTGTTTCTT GATGGGTTTAGATTTTTTTATGATATGTTGGTTGACGGAATTCTACCGGATGAGTTTGTG TATTCTGCGGTTATTCAGTCTTGCATAGGGCTTGGTTGTATTGAATTGGGCGAAGCAGTG CATGGGCAGATTGTGAAGAGAGGGTTTTGGGATGATGTTATTGTCGGTACGTCTCTTCTT AGCATGTATGCCAAGTTACACAATAGTGAGGCTTCAGTTCGGGTGTTTAATGCTATTGCT GAACATAATCAAGTATCTTGGGGTGCAGTGATATCAGGATTGTCATCAAATGGACTATAC TTAGAAGCATTCCACCAGTTTCTTGCCATGATAACACAAGGCTTCACACCAAATATGTAC ACTTTCTCTAGTGTTCTGAAGGCGGTTGGGAAAATAAGAGATGCTACCAAAGGTAGAGAA GTTCACCATTGTGTTATGGAGTATGGTATGGAATCTAATGTTGTTGTGGGGACTTCACTC ATTGATATGTACTCGAAATGTGGGCACTTGTCTGATGCTAGATCTGTATTTGACAGGAAT TTCTATAAATCTAAAGTGAATAATCCATGGAATGCCATGATATCGAGCTATACACAATGT GGGTATTGGCAAGAGGCTTTAGATCTTTTCATTGAAATGTCCTTGAATGATGTAAAACCA GATCTCTATACTTATGGTGGTGTGTTTAGTGCCATTGCTGCATTGAAGTGGTTGTATTTT GGAAGGCAAGTTCATGGGATGGTTGTGAAGTCTGGTAATGGCTCTAGAGTTCTAAGTTTG AATAATGCAATTGTGGATGCATATTTTAAATGTCAGTCCCTAGAAGATGCAAGGAAGGTC TTTGATAGGATGCAAGAGAGAGACATGGTTTCTTGGACTACCTTGGTCAGTGCTTATGTC CAGTGCTATCAACCTAGCGAAGCATTGAGCATCTTTTCCCAAATGAGAGAACAAGGATTT ATGCCCAATCAGTTCACCTTTTCTAGTGTTCTTGTTGCATGTGCCAGCCTCTCTTTGCTT GAGTATGGTCGTCAAGTGCATGGTCTTATATGTAAGGCTGGGTTAGATGATGATAACTGC ATAGAGAGTTCTTTGACCAATATGTATGCAAAGTCCGGTAATATCATTGATGCAGTGGAA GTCTTTGAGAAAATTGTTTGTCCAGATGTTGTTTCATGGAGTGCTATCATTTATGGGTAT GCCCAACATGGCTTTCTAGACAAGGCTGTTGAACTAGTTCAGAAGATGGAACAATCTGGT ATTCAACCCAATTCTAACATACTTTTGAGCCATCTTATTTGCTTGTAGTCATGGAGGCGT GGCAGAGAAATGCCTCCACTATTTGTTTGGGGGGTTGCTAGCATGAACATAAACATGTCA TATACATACAGCAAATTAGAAGATCAGGGCCAAGGATAAAGACCATGGGTTATATGGTCC AATTGGAACTTTGAGTGCAAGACATGCATGAAAGAATGAAGAGTGGTAGCTTGGAAAGAT CAGCAGTACATCTATTATGTCATAAACTTCTAATTATTGTTAAATAGGAATTGCTAAAGA AATCATGAGTGATGTTTTTTTGTTTGACATTCAACTATCCATGTTTCTTTCCCTGTGTCA AATGGAATTGGCATGAAAAGGATGTGTGCCTACCGATGAATTCATAAATGAATAGAATTT CC