Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0004g06420.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:7163946:7166617:1 gene:VIT_06s0004g06420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAATCCCAAACCCCTGTCTCGTCTCTCTTCCACGTTCCCACTCCCTCCCAACCCCA AACCCTAACTCCATAACCCTCAATAACGACCGATATTTCGCCAACCACCCGACACTTTCA CTCATCGACCAATGCTCCGAAACGAAACAGTTGAAGCAAATCCATGCCCAGATGCTCCGT ACTGGTCTCTTCTTCGACCCCTTCTCCGCCAGTAGACTCATCACCGCCGCCGCTCTCTCT CCCTTCCCCAGCCTCGATTATGCCCAGCAAGTGTTCGACCAAATTCCCCACCCAAATCTC TACACTTGGAACACACTCATTCGCGCTTATGCTTCCAGTTCTAATCCCCATCAGAGCCTC TTAATCTTCTTACGAATGCTTCATCAATCTCCTGATTTTCCTGACAAATTCACTTTCCCT TTTCTGATCAAAGCCGCGTCGGAACTTGAGGAGTTGTTTACAGGGAAGGCTTTTCATGGA ATGGTGATTAAGGTGTTGCTGGGTTCGGACGTCTTCATTCTTAATTCTCTGATTCATTTT TACGCCAAGTGTGGAGAGTTGGGTTTGGGGTATAGAGTTTTTGTGAATATACCTAGGAGG GATGTTGTTTCTTGGAATTCGATGATTACAGCTTTTGTGCAGGGGGGTTGTCCGGAGGAG GCATTGGAGTTGTTTCAGGAAATGGAGACGCAGAATGTGAAACCTAATGGCATAACAATG GTGGGGGTTTTGTCAGCTTGTGCCAAGAAGTCGGATTTTGAGTTTGGGAGGTGGGTGCAT TCGTATATTGAGAGGAACAGGATTGGTGAGAGCTTGACTTTGAGTAATGCTATGCTTGAT ATGTATACAAAGTGTGGGAGTGTTGAGGATGCAAAAAGGTTGTTTGATAAGATGCCGGAG AAGGATATTGTCTCATGGACAACTATGCTCGTTGGGTATGCTAAAATAGGGGAGTATGAT GCGGCTCAGGGTATTTTTGATGCAATGCCTAATCAAGATATTGCTGCATGGAATGCCCTC ATATCTGCCTACGAACAGTGTGGTAAGCCAAAGGAGGCTTTGGAGCTTTTCCATGAATTG CAGCTGAGCAAAACTGCAAAACCTGATGAGGTCACTCTTGTTAGCACACTTTCGGCTTGT GCTCAGTTGGGAGCAATGGATTTAGGTGGATGGATCCATGTGTACATAAAGAAGCAGGGA ATGAAGTTAAACTGCCATCTCACTACCTCACTTATTGACATGTACTGTAAGTGCGGGGAT CTGCAGAAGGCACTCATGGTATTTCATTCAGTGGAAAGGAAAGATGTGTTTGTTTGGAGT GCCATGATTGCAGGTTTGGCAATGCATGGGCATGGCAAGGATGCAATAGCTTTGTTTTCA AAAATGCAAGAGGATAAGGTCAAGCCCAATGCTGTGACTTTTACTAATATACTATGTGCT TGTAGCCATGTGGGATTAGTGGAGGAAGGCAGGACTTTCTTCAATCAAATGGAGCTAGTT TATGGGGTTTTGCCTGGAGTCAAGCATTATGCTTGTATGGTTGATATTCTTGGTCGAGCA GGCCTGTTGGAAGAAGCTGTGGAATTGATAGAGAAAATGCCAATGGCCCCAGCTGCTTCT GTATGGGGGGCCCTGCTTGGAGCCTGTACAATTCATGAAAATGTAGTACTCGCTGAACAG GCTTGTAGCCAGCTGATTGAGTTAGAGCCTGGAAATCATGGAGCCTATGTACTCTTATCA AATATATATGCTAAAGCAGGGAAATGGGATAGAGTTTCTGGGTTAAGGAAGCTTATGAGG GATGTTGGACTGAAGAAAGAACCAGGTTGTAGCTCAATAGAGGTTGATGGTATTGTTCAT GAGTTTCTAGTGGGAGATAATTCCCATCCTTCAGCCAAGAAAATCTATGCGAAGCTGGAT GAGATTGTGGCAAGATTAGAAACCATTGGATATGTGCCAAACAAGTCCCACCTACTACAG CTTGTTGAAGAAGAAGATGTGAAAGAGCAGGCACTATTCCTTCACAGTGAGAAGTTAGCA ATTGCTTTTGGGCTTATTAGTACAGGCCAATCTCAACCAATTCGAATTGTGAAGAATCTC CGAGTTTGTGGGGACTGCCACTCAGTTGCGAAGCTTGTGTCCAAGCTTTATGATAGAGAG ATTCTTTTGAGAGACCGGTATAGGTTCCACCATTTCAGAGAAGGGCATTGCTCATGTATG GATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0004g06420.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:7163946:7166617:1 gene:VIT_06s0004g06420 transcript:VIT_06s0004g06420.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAIPNPCLVSLPRSHSLPTPNPNSITLNNDRYFANHPTLSLIDQCSETKQLKQIHAQMLR TGLFFDPFSASRLITAAALSPFPSLDYAQQVFDQIPHPNLYTWNTLIRAYASSSNPHQSL LIFLRMLHQSPDFPDKFTFPFLIKAASELEELFTGKAFHGMVIKVLLGSDVFILNSLIHF YAKCGELGLGYRVFVNIPRRDVVSWNSMITAFVQGGCPEEALELFQEMETQNVKPNGITM VGVLSACAKKSDFEFGRWVHSYIERNRIGESLTLSNAMLDMYTKCGSVEDAKRLFDKMPE KDIVSWTTMLVGYAKIGEYDAAQGIFDAMPNQDIAAWNALISAYEQCGKPKEALELFHEL QLSKTAKPDEVTLVSTLSACAQLGAMDLGGWIHVYIKKQGMKLNCHLTTSLIDMYCKCGD LQKALMVFHSVERKDVFVWSAMIAGLAMHGHGKDAIALFSKMQEDKVKPNAVTFTNILCA CSHVGLVEEGRTFFNQMELVYGVLPGVKHYACMVDILGRAGLLEEAVELIEKMPMAPAAS VWGALLGACTIHENVVLAEQACSQLIELEPGNHGAYVLLSNIYAKAGKWDRVSGLRKLMR DVGLKKEPGCSSIEVDGIVHEFLVGDNSHPSAKKIYAKLDEIVARLETIGYVPNKSHLLQ LVEEEDVKEQALFLHSEKLAIAFGLISTGQSQPIRIVKNLRVCGDCHSVAKLVSKLYDRE ILLRDRYRFHHFREGHCSCMDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0004g06420.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:7163946:7166617:1 gene:VIT_06s0004g06420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAATCCCAAACCCCTGTCTCGTCTCTCTTCCACGTTCCCACTCCCTCCCAACCCCA AACCCTAACTCCATAACCCTCAATAACGACCGATATTTCGCCAACCACCCGACACTTTCA CTCATCGACCAATGCTCCGAAACGAAACAGTTGAAGCAAATCCATGCCCAGATGCTCCGT ACTGGTCTCTTCTTCGACCCCTTCTCCGCCAGTAGACTCATCACCGCCGCCGCTCTCTCT CCCTTCCCCAGCCTCGATTATGCCCAGCAAGTGTTCGACCAAATTCCCCACCCAAATCTC TACACTTGGAACACACTCATTCGCGCTTATGCTTCCAGTTCTAATCCCCATCAGAGCCTC TTAATCTTCTTACGAATGCTTCATCAATCTCCTGATTTTCCTGACAAATTCACTTTCCCT TTTCTGATCAAAGCCGCGTCGGAACTTGAGGAGTTGTTTACAGGGAAGGCTTTTCATGGA ATGGTGATTAAGGTGTTGCTGGGTTCGGACGTCTTCATTCTTAATTCTCTGATTCATTTT TACGCCAAGTGTGGAGAGTTGGGTTTGGGGTATAGAGTTTTTGTGAATATACCTAGGAGG GATGTTGTTTCTTGGAATTCGATGATTACAGCTTTTGTGCAGGGGGGTTGTCCGGAGGAG GCATTGGAGTTGTTTCAGGAAATGGAGACGCAGAATGTGAAACCTAATGGCATAACAATG GTGGGGGTTTTGTCAGCTTGTGCCAAGAAGTCGGATTTTGAGTTTGGGAGGTGGGTGCAT TCGTATATTGAGAGGAACAGGATTGGTGAGAGCTTGACTTTGAGTAATGCTATGCTTGAT ATGTATACAAAGTGTGGGAGTGTTGAGGATGCAAAAAGGTTGTTTGATAAGATGCCGGAG AAGGATATTGTCTCATGGACAACTATGCTCGTTGGGTATGCTAAAATAGGGGAGTATGAT GCGGCTCAGGGTATTTTTGATGCAATGCCTAATCAAGATATTGCTGCATGGAATGCCCTC ATATCTGCCTACGAACAGTGTGGTAAGCCAAAGGAGGCTTTGGAGCTTTTCCATGAATTG CAGCTGAGCAAAACTGCAAAACCTGATGAGGTCACTCTTGTTAGCACACTTTCGGCTTGT GCTCAGTTGGGAGCAATGGATTTAGGTGGATGGATCCATGTGTACATAAAGAAGCAGGGA ATGAAGTTAAACTGCCATCTCACTACCTCACTTATTGACATGTACTGTAAGTGCGGGGAT CTGCAGAAGGCACTCATGGTATTTCATTCAGTGGAAAGGAAAGATGTGTTTGTTTGGAGT GCCATGATTGCAGGTTTGGCAATGCATGGGCATGGCAAGGATGCAATAGCTTTGTTTTCA AAAATGCAAGAGGATAAGGTCAAGCCCAATGCTGTGACTTTTACTAATATACTATGTGCT TGTAGCCATGTGGGATTAGTGGAGGAAGGCAGGACTTTCTTCAATCAAATGGAGCTAGTT TATGGGGTTTTGCCTGGAGTCAAGCATTATGCTTGTATGGTTGATATTCTTGGTCGAGCA GGCCTGTTGGAAGAAGCTGTGGAATTGATAGAGAAAATGCCAATGGCCCCAGCTGCTTCT GTATGGGGGGCCCTGCTTGGAGCCTGTACAATTCATGAAAATGTAGTACTCGCTGAACAG GCTTGTAGCCAGCTGATTGAGTTAGAGCCTGGAAATCATGGAGCCTATGTACTCTTATCA AATATATATGCTAAAGCAGGGAAATGGGATAGAGTTTCTGGGTTAAGGAAGCTTATGAGG GATGTTGGACTGAAGAAAGAACCAGGTTGTAGCTCAATAGAGGTTGATGGTATTGTTCAT GAGTTTCTAGTGGGAGATAATTCCCATCCTTCAGCCAAGAAAATCTATGCGAAGCTGGAT GAGATTGTGGCAAGATTAGAAACCATTGGATATGTGCCAAACAAGTCCCACCTACTACAG CTTGTTGAAGAAGAAGATGTGAAAGAGCAGGCACTATTCCTTCACAGTGAGAAGTTAGCA ATTGCTTTTGGGCTTATTAGTACAGGCCAATCTCAACCAATTCGAATTGTGAAGAATCTC CGAGTTTGTGGGGACTGCCACTCAGTTGCGAAGCTTGTGTCCAAGCTTTATGATAGAGAG ATTCTTTTGAGAGACCGGTATAGGTTCCACCATTTCAGAGAAGGGCATTGCTCATGTATG GATTATTGGTGATTATGAAAGAATTATTCATCAAGAGTATGGATTGTTGTCGATTATGGA AGAATTAGTTATGAAGATTTCACCCAGTCCCATTATGATGTTACTAGTGCTCGGAAGAGT ATTTACATTCGAGAAGCACCAAGAGCCCAAGTTCAGTTGAAGTCTTGGGGAACAATGGTA TCCCATGTTTTCTATAAAGCTAAAGGTGAAAGGTATGATTCAAGCCTTCTCTTCCACTGG TGTCATCTGGAAGATTCTACCCTGAAGTCCTCCATTAAGCTTTAGATTGGTTGGTGGTTG GATGGTGACCCAAAGGAATACTAGGTCAAGCTAATTTTTGGAGGAGATGAGTTGTTGATT TAGTAACTCCTGTGTTGCGTCTTTTTTCCCATGAATTCTTTTCAAGAAGCACTTTATTAG AAGTGAAATGTCATTTAACATGTCTTTTAACT