Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0004g05100.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:6031840:6048250:1 gene:VIT_06s0004g05100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTTGTCTGAATTGGGGAGGAGGCCGATGCTCAAAAACGGTGACGGATCGTTTGGGGAT GATTTGGAGAAGGATATAGGGTTGTTGCTTCGTGAGCAGCGGCGTCAAGAGGCGGATGAT TATGAAAAGGAGCTAAATTTGTATAGAAGTGGGTCTGCTCCGCCAACTGTTGAGGGTTCT ATGAATGCAGTTGGGGGTTTGTTCGGTGGTGGAGCTGCCTTTCCGGGATTTCCAGATGAT GGGAATGGGAATGGGTTCGCGTCTGAGGAGGAGCTTAGGTCTGATCCAGCTTACCTTTCT TATTACTATTCAAATGTGAATTTGAACCCACGGCTCCCACCTCCATTGCTTTCCAAGGAG GATTGGAGGTTTGCTCAAAGACTGAAAGGAGGGAGTTCTGGATTGGGAGGGATTGGAGAT AGAAGGAAAATGAATAGAAATGATAGTGGTAGTGTTGGTAGATCGATGTATTCGATGCCA CCAGGGTTTAATTCGCGGAAAGAAGAGACTGAGGCAGACTCAGAGAAACTTTGCGGTTCA GCAGAGTGGGGTGGCGATGGACTCATCGGGTTGTCAGGGTTAGGACTAGGGAGCAAACAG AAGAGTCTTGCAGAAATTTTTCAGGATGATTTAGGGCGCACCACTCCTGTCTCTGGACAC CCTTCTCGTCCAGCAAGCCGCAATGCTTTTGATGAAAATGCTGAACCCTTGGGCTCTGTT GAAGCGGAGTTGGGTCATTTACGCCGTGAATTGAAATCTGCTGATGTTTTACGATCCGGT GCAAGTGTTCAGGGCTCATCAACGGTCCAAAATATTGGTGCACCTACTTCATATACTTAT GCCTCTGTGTTGGGTGGTTCCTTATCAAGAAGCACTACTCCTGATCCCCAACTCATTGCT AGGGCTCCTAGCCCCTGTCTTACACCCATTGGAGGAGGGAGAACTGCCATTTCTGAAAAG AGAGGAATTAATGGTTCTAGCTCTTTTAATAGTGTCCCTCCTAGCATGAATGAATCTGCA GATCTGGTGGCTGCTTTGTCTGGTATGGATCTGTCAACAAATGGCGTGATTGATGAAGAA AATCATTTGCCATCACAGATTGAACAGGATGTTGAGAATCATCAAAGCTATCTCTTCAAT CTACAAGGTGGTCAGAGCAATATTAAGCAACATTCATACCTGAAGAAATCTGAATCTGGG CATTTACAAATTCCTTCTGCTCCTCAGTCAGGAAAGGCATCATATTCTGATTCAGTTAAG AGCAATGGTGTTGGTTCAGAGCTGAACAACTCCTTGATGGCTGATAGGCAAGCTGAATTA CACAAATCTTCTGTTCCCTCCGGTAATTCGTACTTGAAAGGATCATCTATGTCTAGTCAT AACGGTGGAGGTGGCTTGCCTTCTCATTATCAGCAGTTTGTAGATAGCACAAATTCATCA ATTCCTAACTATGGTTTGGGTGCATATTCCATGAATCCAGCTTTGGCTTCCATGATGGCA AGCCAGCTTGGTGCGGCTAATTTGCCACCATTATTTGAAAATGTCGCTGCAGCATCAGCT ATGGGAGTCCCTGGGATTGATTCAAGAGTTTTGGGAGCAGGCTTGGCTTCTGGGCCAAAT ATAGGGGCTGCTACATCAGAGTCACAGAATCTCAATAGAATTGGGAATCACATGGCAGGG AATGCTCTTCAAGCACCTTTTGTGGATCCAATGTATCTTCAATATTTGAGGACGGCTGAA TATGCTGCAGCACAAGTTGCTGCTCTTAATGATCCCTCTGTAGATAGGAACTACTTAGGT AATTCGTATGTTGATTTACTTGGACTCCAGAAAGCTTATCTGGGAGCTCTGCTTTCTCCT CAGAAATCACAGTATGGTGTTCCCTTGGGCAGTAAATCTAGTGGTTCTAATCATCATGGT TACTATGGTAACCCGGCATTTGGTGTTGGCATGTCATACCCTGGAAGTCCCCTAGCAAGT CCTGTTATTCCAAATTCTCCCATTGGACCAGGAAGTCCTATCAGACACAATGATCTCAAT ATGCGATATCCATCTGGGATGAGAAACTTAGCTGGGGGAGTCATGGCACCCTGGCACTTG GATGCTGGTTGCAACATGGATGAAGGCTTTGCCTCCTCACTACTTGAAGAGTTCAAGAGT AACAAAACCAAATGTTTTGAGCTTTCAGAAATTGCTGGTCATGTTGTTGAGTTTAGTGCG GACCAGTATGGAAGCCGATTCATTCAACAAAAACTTGAAACGGCCACAACAGAAGAGAAA AACATGGTTTACCAGGAAATCATTCCCCAAGCTCTCTCTTTGATGACAGATGTGTTTGGT AACTATGTTATACAAAAGTTTTTTGAGCATGGACTAGTATCCCAGAGAAGAGAACTGGCT GGCAAGCTTTATGGTCATGTACTGACACTTAGCCTTCAAATGTATGGTTGTCGAGTGATC CAAAAGGCAATAGAAGTTGTTGATCCAGACCAAAAGATTAAAATGGTTGAGGAGCTTGAT GGTCATATCATGCGATGTGTGCGTGATCAGAATGGAAACCATGTCATCCAAAAGTGTATT GAATGTGTTCCTGAAGATGCTATTCAGTTTATCATCTCAACATTCTTTGATCAGGTTGTG ACCCTCTCAACCCATCCATATGGGTGTCGTGTGATACAGAGAGTTCTGGAGCACTGCAGG GATCCAAAAACCCAGAGTAAAGTGATGGATGAGATTTTAGGATCTGTTAGCATGCTGGCA CAAGATCAGTATGGCAATTATGTTGTTCAGCATGTTCTGGAGCATGGACAACCACACGAG CGCTCTGCTATAATTAAGGAATTAGCTGGAAAGATAGTTCAGATGAGTCAGCAGAAGTTT GCCTCCAATGTTGTGGAGAAGTGTTTAACTTTTGGCGGTCCTGCTGAGCGCCAGATCCTG GTGAATGAGATGCTTGGCACTACTGATGAGAATGAGCCTCTTCAGGCTATGATGAAAGAT CAGTTTGCAAACTATGTTGTACAAAAGGTGCTGGAGACTTGTGATGACCAGCAGCGTGAG CTGATCTTGTCCCGAATTAAGGTTCATCTTAATGCACTGAAGAAATACACTTATGGAAAG CATATTGTTGCACGTGTAGAGAAACTCGTTGCTGCTGGGGAAAGGAGAATTGCTATTCAG TCTCCACACCCTGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0004g05100.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:6031840:6048250:1 gene:VIT_06s0004g05100 transcript:VIT_06s0004g05100.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MLSELGRRPMLKNGDGSFGDDLEKDIGLLLREQRRQEADDYEKELNLYRSGSAPPTVEGS MNAVGGLFGGGAAFPGFPDDGNGNGFASEEELRSDPAYLSYYYSNVNLNPRLPPPLLSKE DWRFAQRLKGGSSGLGGIGDRRKMNRNDSGSVGRSMYSMPPGFNSRKEETEADSEKLCGS AEWGGDGLIGLSGLGLGSKQKSLAEIFQDDLGRTTPVSGHPSRPASRNAFDENAEPLGSV EAELGHLRRELKSADVLRSGASVQGSSTVQNIGAPTSYTYASVLGGSLSRSTTPDPQLIA RAPSPCLTPIGGGRTAISEKRGINGSSSFNSVPPSMNESADLVAALSGMDLSTNGVIDEE NHLPSQIEQDVENHQSYLFNLQGGQSNIKQHSYLKKSESGHLQIPSAPQSGKASYSDSVK SNGVGSELNNSLMADRQAELHKSSVPSGNSYLKGSSMSSHNGGGGLPSHYQQFVDSTNSS IPNYGLGAYSMNPALASMMASQLGAANLPPLFENVAAASAMGVPGIDSRVLGAGLASGPN IGAATSESQNLNRIGNHMAGNALQAPFVDPMYLQYLRTAEYAAAQVAALNDPSVDRNYLG NSYVDLLGLQKAYLGALLSPQKSQYGVPLGSKSSGSNHHGYYGNPAFGVGMSYPGSPLAS PVIPNSPIGPGSPIRHNDLNMRYPSGMRNLAGGVMAPWHLDAGCNMDEGFASSLLEEFKS NKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVYQEIIPQALSLMTDVFG NYVIQKFFEHGLVSQRRELAGKLYGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDPDQKIKMVEELD GHIMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEDAIQFIISTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCR DPKTQSKVMDEILGSVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGQPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKF ASNVVEKCLTFGGPAERQILVNEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRE LILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAIQSPHPA

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0004g05100.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:6031840:6048250:1 gene:VIT_06s0004g05100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CGCGGGAGGATGGTTTGTTTTGGGTTGTGGTTTCGTGTTTTGATCGAGGGGGGGTTTCGG TTTTAGGGTCCGAAGTGGTGAAGTGGAGTTGAAAAAATTGGTTTTTGGTTATAAAGTCTT GGTTTTTTGTTATCCGTTTGGAAGAGGAGATTCTGAGGTTGTAAGCATGGGTTTTAGGTG TTTGGGAGCATGGCTGTTGGTTCTGGAAGCTTTTTAGGGTTTAGGGTTTGGTTTTGGTTT GTTGGATGATCAATTGGAGCCGGTGAAAATGTTGTCTGAATTGGGGAGGAGGCCGATGCT CAAAAACGGTGACGGATCGTTTGGGGATGATTTGGAGAAGGATATAGGGTTGTTGCTTCG TGAGCAGCGGCGTCAAGAGGCGGATGATTATGAAAAGGAGCTAAATTTGTATAGAAGTGG GTCTGCTCCGCCAACTGTTGAGGGTTCTATGAATGCAGTTGGGGGTTTGTTCGGTGGTGG AGCTGCCTTTCCGGGATTTCCAGATGATGGGAATGGGAATGGGTTCGCGTCTGAGGAGGA GCTTAGGTCTGATCCAGCTTACCTTTCTTATTACTATTCAAATGTGAATTTGAACCCACG GCTCCCACCTCCATTGCTTTCCAAGGAGGATTGGAGGTTTGCTCAAAGACTGAAAGGAGG GAGTTCTGGATTGGGAGGGATTGGAGATAGAAGGAAAATGAATAGAAATGATAGTGGTAG TGTTGGTAGATCGATGTATTCGATGCCACCAGGGTTTAATTCGCGGAAAGAAGAGACTGA GGCAGACTCAGAGAAACTTTGCGGTTCAGCAGAGTGGGGTGGCGATGGACTCATCGGGTT GTCAGGGTTAGGACTAGGGAGCAAACAGAAGAGTCTTGCAGAAATTTTTCAGGATGATTT AGGGCGCACCACTCCTGTCTCTGGACACCCTTCTCGTCCAGCAAGCCGCAATGCTTTTGA TGAAAATGCTGAACCCTTGGGCTCTGTTGAAGCGGAGTTGGGTCATTTACGCCGTGAATT GAAATCTGCTGATGTTTTACGATCCGGTGCAAGTGTTCAGGGCTCATCAACGGTCCAAAA TATTGGTGCACCTACTTCATATACTTATGCCTCTGTGTTGGGTGGTTCCTTATCAAGAAG CACTACTCCTGATCCCCAACTCATTGCTAGGGCTCCTAGCCCCTGTCTTACACCCATTGG AGGAGGGAGAACTGCCATTTCTGAAAAGAGAGGAATTAATGGTTCTAGCTCTTTTAATAG TGTCCCTCCTAGCATGAATGAATCTGCAGATCTGGTGGCTGCTTTGTCTGGTATGGATCT GTCAACAAATGGCGTGATTGATGAAGAAAATCATTTGCCATCACAGATTGAACAGGATGT TGAGAATCATCAAAGCTATCTCTTCAATCTACAAGGTGGTCAGAGCAATATTAAGCAACA TTCATACCTGAAGAAATCTGAATCTGGGCATTTACAAATTCCTTCTGCTCCTCAGTCAGG AAAGGCATCATATTCTGATTCAGTTAAGAGCAATGGTGTTGGTTCAGAGCTGAACAACTC CTTGATGGCTGATAGGCAAGCTGAATTACACAAATCTTCTGTTCCCTCCGGTAATTCGTA CTTGAAAGGATCATCTATGTCTAGTCATAACGGTGGAGGTGGCTTGCCTTCTCATTATCA GCAGTTTGTAGATAGCACAAATTCATCAATTCCTAACTATGGTTTGGGTGCATATTCCAT GAATCCAGCTTTGGCTTCCATGATGGCAAGCCAGCTTGGTGCGGCTAATTTGCCACCATT ATTTGAAAATGTCGCTGCAGCATCAGCTATGGGAGTCCCTGGGATTGATTCAAGAGTTTT GGGAGCAGGCTTGGCTTCTGGGCCAAATATAGGGGCTGCTACATCAGAGTCACAGAATCT CAATAGAATTGGGAATCACATGGCAGGGAATGCTCTTCAAGCACCTTTTGTGGATCCAAT GTATCTTCAATATTTGAGGACGGCTGAATATGCTGCAGCACAAGTTGCTGCTCTTAATGA TCCCTCTGTAGATAGGAACTACTTAGGTAATTCGTATGTTGATTTACTTGGACTCCAGAA AGCTTATCTGGGAGCTCTGCTTTCTCCTCAGAAATCACAGTATGGTGTTCCCTTGGGCAG TAAATCTAGTGGTTCTAATCATCATGGTTACTATGGTAACCCGGCATTTGGTGTTGGCAT GTCATACCCTGGAAGTCCCCTAGCAAGTCCTGTTATTCCAAATTCTCCCATTGGACCAGG AAGTCCTATCAGACACAATGATCTCAATATGCGATATCCATCTGGGATGAGAAACTTAGC TGGGGGAGTCATGGCACCCTGGCACTTGGATGCTGGTTGCAACATGGATGAAGGCTTTGC CTCCTCACTACTTGAAGAGTTCAAGAGTAACAAAACCAAATGTTTTGAGCTTTCAGAAAT TGCTGGTCATGTTGTTGAGTTTAGTGCGGACCAGTATGGAAGCCGATTCATTCAACAAAA ACTTGAAACGGCCACAACAGAAGAGAAAAACATGGTTTACCAGGAAATCATTCCCCAAGC TCTCTCTTTGATGACAGATGTGTTTGGTAACTATGTTATACAAAAGTTTTTTGAGCATGG ACTAGTATCCCAGAGAAGAGAACTGGCTGGCAAGCTTTATGGTCATGTACTGACACTTAG CCTTCAAATGTATGGTTGTCGAGTGATCCAAAAGGCAATAGAAGTTGTTGATCCAGACCA AAAGATTAAAATGGTTGAGGAGCTTGATGGTCATATCATGCGATGTGTGCGTGATCAGAA TGGAAACCATGTCATCCAAAAGTGTATTGAATGTGTTCCTGAAGATGCTATTCAGTTTAT CATCTCAACATTCTTTGATCAGGTTGTGACCCTCTCAACCCATCCATATGGGTGTCGTGT GATACAGAGAGTTCTGGAGCACTGCAGGGATCCAAAAACCCAGAGTAAAGTGATGGATGA GATTTTAGGATCTGTTAGCATGCTGGCACAAGATCAGTATGGCAATTATGTTGTTCAGCA TGTTCTGGAGCATGGACAACCACACGAGCGCTCTGCTATAATTAAGGAATTAGCTGGAAA GATAGTTCAGATGAGTCAGCAGAAGTTTGCCTCCAATGTTGTGGAGAAGTGTTTAACTTT TGGCGGTCCTGCTGAGCGCCAGATCCTGGTGAATGAGATGCTTGGCACTACTGATGAGAA TGAGCCTCTTCAGGCTATGATGAAAGATCAGTTTGCAAACTATGTTGTACAAAAGGTGCT GGAGACTTGTGATGACCAGCAGCGTGAGCTGATCTTGTCCCGAATTAAGGTTCATCTTAA TGCACTGAAGAAATACACTTATGGAAAGCATATTGTTGCACGTGTAGAGAAACTCGTTGC TGCTGGGGAAAGGAGAATTGCTATTCAGTCTCCACACCCTGCTTAGGTGGGCATAGGAAA GAAAGAAGTTGTACAGCTAACTGAGGCTAGTGTGAGCTTCCTTTCTTCTTCTCTTTCTCT GGAATCTAGAGCTATGGTTCTACTATCTCTTTAAGATAGATATGAGCTGATTGGCAATAA AGCTGTTCTTGTACTGGAAAACTGTACATTGTGTAGTTTAAGGTTTATACATATAATCAA GCAAGCTGAGAGGTTCGGGTGTTCAATACACTTGAAGTCCATGCAGAGGAGATAAATGAC TATACAAGTTTTTAAGGGTGTAAAAAATGATTAAAATGGTGAGGTAGTTTATATGTTAAC GCGACTGTACAAATTTCGCCATGTGGAGAGCTGTTGATGTTTAGGTGAGGCCAGGATATT TTTGTTTAATGTATGCTTATTGACTACTTTCTTTCTTTTAAAGTACAATTTTCTCCTGTG CTC