Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_06s0004g03900.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:6:4827983:4833862:-1 gene:VIT_06s0004g03900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGGAAAGGGGGGCAAGGCTATGGGAAAAGAAACCCTAATGATGCCAACACAGTTGAA ATCTTCGCTGCATGGGCGAAGAATGTTAAAGAATGCGAAGAGAAGCTCCAGGTGAATCAC GAATTCGGATTGTCAACGGCTGAGGTTGAAAAGCGGCGCGAGATCTATGGTTACAACGAG TTGGAGAAGCATGAGGGTCCTTCAATTTTGAGACTGATTTTGGATCAGTTCAATGACACT CTAGTTAGGATTCTGTTGGTTGCTGCAGTTATTTCATTTGTTTTGGCTTGGTACGATGGC GAAGAGGGTGGGGAAATGGAAATCACTGCGTTTGTAGAACCATTGGTGATTTTTTTGATC TTGATTGTGAATGCTATAGTTGGGGTTTGGCAGGAGAGTAATGCGGAGAAGGCATTAGAG GCTCTTAAGGAAATTCAATCAGAGCATGCAACAGTGATTCGGGATGGTAAAAAGGTTCCA AATTTGCCGGCAAAAGAACTTGTTCCAGGAGATATTGTTGAATTAAGGGTTGGTGATAAG GTACCTGCAGATATGCGGGTTTTGAGTTTGATAAGTTCGACTCTTCGGGTTGAGCAAGGA TCCTTAACAGGAGAGAGTGAAGCCGTTAATAAGACAACTAAGGTTGTGCCAGAGGATTCA GATATTCAGGGTAAGAAGTGCATGGTTTTTGCAGGGACAACTGTGGTGAATGGAAATGGT ATATGTTTGGTTACAGAGACGGGAATGAATACGGAGATAGGGAAGGTGCATTTGCAAATT CATGAAGCCTCGCAGAGTGAAGAAGATACACCTTTGAAGAAGAAGTTGAATGAGTTTGGA GAGCTTCTTACTGCCATAATTGGAGTAATTTGTGCATTGGTTTGGCTTATTAATGTAAAA TACTTCCTTACTTGGGAGTATGTTGATGGGTGGCCTAGGAATTTTAAATTCTCATTTGAG AAGTGCACTTATTACTTTGAAATTGCTGTGGCGTTAGCAGTGGCTGCAATTCCAGAAGGT TTGCCAGCAGTCATCACAACTTGTTTGGCGCTTGGAACAAGAAAGATGGCACAGAAGAAT GCACTTGTTCGGAAGTTACCTAGTGTTGAAACTCTTGGTTGTACAACTGTAATTTGTTCT GATAAAACAGGCACTTTGACTACCAACCAAATGGCAGTTGCAAAGCTTGTGGCTATGGGC CCTAGGGTGTACACTGTTCGAAATTTCAATGTGGAAGGGACCTCATATAGTCCTTTTGAT GGAAGAATACTGGACTGGCCTGCAGGTCGGATGGATGCTAATCTTCAAATGATTGCGAAG ATTGCAGCAGTGTGCAATGATGCTGATGTTGAATACTCTGGGCAACATTTTGTTGCCAAT GGAATGCCCACTGAGGCAGCCTTGAAGGTTCTGGTTGAGAAAATGGGACTTCCTGAAGGA TTTGATAATGGTTCATCTTTGGATAATAGCGCTGTACTCCGTTGTTCTCAACTATGGAAT AAAATCGAACATCGAATTGCAACCCTTGAATTCGATCGTGATCGCAAATCCATGGGAGTT ATTGTGAATTCCAGCTCAGGCAAAAAGGCATTGCTAGTGAAGGGTGCAGTAGAAAATGTG TTGGAAAGAAGCTCATATATTCAGTTGCTTGATGGTTCTATTGTAGAACTTGATAGAAAA TCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTTTATCAAATGTCAACAAGTGCATTACGCTGTTTG GGATTTGCATACAAGGAAGATCTTTTGGAGTTTGCAACATATAATGGAGATGAAGACCAT CCAGCTCATCAGCTTCTACTTAGACCATCAAATTACTCTGTAATTGAAAGTAAACTCATT TTTGTTGGTTTGGTTGGGCTGAGGGATCCACCACGGAAAGAGGTTCGTCAAGCAATTGAA GACTGTAGAGCAGCTGGAATTCGTGTTATGGTTATTACAGGTGACAACAAGAATACAGCA GAAGCTATTTGTCGTGAAATTGGAGTTTTTGGATCTAAGGAAGACATTAGTTTAAAAAGC ATAACGGGGAAAGAGTTTATGGAGCATTATGATCAGAAAACTCATTTGAGGCAAAATGGG GGCCTCCTGTTCTCTAGGGCTGAACCAAGGCATAAGCAGGAAATAGTGAGGTTGCTCAAA GAGGATAATGAGGTGGTTGCAATGACTGGTGATGGAGTGAATGATGCACCAGCCTTGAAA TTGGCTGATATTGGGATTGCAATGGGCATTACTGGGACAGAGGTTGCAAAGGAAGCCTCT GACATGGTCTTGGCAGATGATAATTTTAACACAATAGTTGCTGCTGTTGGTGAAGGCAGA TCCATTTACAACAATATGAAGGCTTTTATCAGGTACATGATTTCATCAAATATTGGCGAG GTTGCCTCTATATTTCTGACAGCTGCTTTAGGTATTCCAGAAGGCCTGATTCCTGTTCAG CTTCTGTGGGTGAATCTTGTCACTGATGGTCCCCCAGCAACAGCTTTGGGATTTAATCCA CCTGACAAAGATATAATGAAGAAACCCCCTAGAAGAAGTGATGATTCATTGATCACTCCC TGGATTTTATTCCGCTATCTGGTGATTGGGCTCTATGTTGGAATAGCAACTGTGGGAATA TTCATCATATGGTACACACATGGGACATTCCTGGGGATTGATTTGAGTGGAGATGGCCAC AGTCTTGTTACCTATTCCCAACTTGCTAACTGGGGTCAATGCCCTTCCTGGGAGGGTTTC TCGGCATCACCCTTCACAGCAGGGGCGCAAGTGTTCAGTTTTGATGCAAATCCATGTGAC TACTTCCAGACTGGAAAAATCAAAGCCATGACTCTTTCCCTCTCTGTCCTGGTTGCCATA GAGATGTTCAATTCCCTTAATGCCCTATCCGAGGATGGGAGCCTTTTGACAATGCCCCCA TGGGTCAATCCCTGGCTCCTCGTTGCCATGTCCATCTCTTTTGCCCTGCACTTCTTGATC GTGTATGTGCCATTCCTCGCACAAATTTTTGGCATTGTTGCCCTCAGCCTCAATGAATGG CTCTTGGTGTTGGTTGTGGCATTCCCGGTAATTCTGATTGATGAGCTACTCAAATTTGTG GGAAGGTGTACCAGTGGGTTGCGGTCATCGGATGCTAGAAGATATTCAAAGCACAAGGCA GAATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_06s0004g03900.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:6:4827983:4833862:-1 gene:VIT_06s0004g03900 transcript:VIT_06s0004g03900.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGKGGQGYGKRNPNDANTVEIFAAWAKNVKECEEKLQVNHEFGLSTAEVEKRREIYGYNE LEKHEGPSILRLILDQFNDTLVRILLVAAVISFVLAWYDGEEGGEMEITAFVEPLVIFLI LIVNAIVGVWQESNAEKALEALKEIQSEHATVIRDGKKVPNLPAKELVPGDIVELRVGDK VPADMRVLSLISSTLRVEQGSLTGESEAVNKTTKVVPEDSDIQGKKCMVFAGTTVVNGNG ICLVTETGMNTEIGKVHLQIHEASQSEEDTPLKKKLNEFGELLTAIIGVICALVWLINVK YFLTWEYVDGWPRNFKFSFEKCTYYFEIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRKMAQKN ALVRKLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNQMAVAKLVAMGPRVYTVRNFNVEGTSYSPFD GRILDWPAGRMDANLQMIAKIAAVCNDADVEYSGQHFVANGMPTEAALKVLVEKMGLPEG FDNGSSLDNSAVLRCSQLWNKIEHRIATLEFDRDRKSMGVIVNSSSGKKALLVKGAVENV LERSSYIQLLDGSIVELDRKSRDLILQSLYQMSTSALRCLGFAYKEDLLEFATYNGDEDH PAHQLLLRPSNYSVIESKLIFVGLVGLRDPPRKEVRQAIEDCRAAGIRVMVITGDNKNTA EAICREIGVFGSKEDISLKSITGKEFMEHYDQKTHLRQNGGLLFSRAEPRHKQEIVRLLK EDNEVVAMTGDGVNDAPALKLADIGIAMGITGTEVAKEASDMVLADDNFNTIVAAVGEGR SIYNNMKAFIRYMISSNIGEVASIFLTAALGIPEGLIPVQLLWVNLVTDGPPATALGFNP PDKDIMKKPPRRSDDSLITPWILFRYLVIGLYVGIATVGIFIIWYTHGTFLGIDLSGDGH SLVTYSQLANWGQCPSWEGFSASPFTAGAQVFSFDANPCDYFQTGKIKAMTLSLSVLVAI EMFNSLNALSEDGSLLTMPPWVNPWLLVAMSISFALHFLIVYVPFLAQIFGIVALSLNEW LLVLVVAFPVILIDELLKFVGRCTSGLRSSDARRYSKHKAE

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_06s0004g03900.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:6:4827983:4833862:-1 gene:VIT_06s0004g03900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TTCAATGGGGAAAGGGGGGCAAGGCTATGGGAAAAGAAACCCTAATGATGCCAACACAGT TGAAATCTTCGCTGCATGGGCGAAGAATGTTAAAGAATGCGAAGAGAAGCTCCAGGTGAA TCACGAATTCGGATTGTCAACGGCTGAGGTTGAAAAGCGGCGCGAGATCTATGGTTACAA CGAGTTGGAGAAGCATGAGGGTCCTTCAATTTTGAGACTGATTTTGGATCAGTTCAATGA CACTCTAGTTAGGATTCTGTTGGTTGCTGCAGTTATTTCATTTGTTTTGGCTTGGTACGA TGGCGAAGAGGGTGGGGAAATGGAAATCACTGCGTTTGTAGAACCATTGGTGATTTTTTT GATCTTGATTGTGAATGCTATAGTTGGGGTTTGGCAGGAGAGTAATGCGGAGAAGGCATT AGAGGCTCTTAAGGAAATTCAATCAGAGCATGCAACAGTGATTCGGGATGGTAAAAAGGT TCCAAATTTGCCGGCAAAAGAACTTGTTCCAGGAGATATTGTTGAATTAAGGGTTGGTGA TAAGGTACCTGCAGATATGCGGGTTTTGAGTTTGATAAGTTCGACTCTTCGGGTTGAGCA AGGATCCTTAACAGGAGAGAGTGAAGCCGTTAATAAGACAACTAAGGTTGTGCCAGAGGA TTCAGATATTCAGGGTAAGAAGTGCATGGTTTTTGCAGGGACAACTGTGGTGAATGGAAA TGGTATATGTTTGGTTACAGAGACGGGAATGAATACGGAGATAGGGAAGGTGCATTTGCA AATTCATGAAGCCTCGCAGAGTGAAGAAGATACACCTTTGAAGAAGAAGTTGAATGAGTT TGGAGAGCTTCTTACTGCCATAATTGGAGTAATTTGTGCATTGGTTTGGCTTATTAATGT AAAATACTTCCTTACTTGGGAGTATGTTGATGGGTGGCCTAGGAATTTTAAATTCTCATT TGAGAAGTGCACTTATTACTTTGAAATTGCTGTGGCGTTAGCAGTGGCTGCAATTCCAGA AGGTTTGCCAGCAGTCATCACAACTTGTTTGGCGCTTGGAACAAGAAAGATGGCACAGAA GAATGCACTTGTTCGGAAGTTACCTAGTGTTGAAACTCTTGGTTGTACAACTGTAATTTG TTCTGATAAAACAGGCACTTTGACTACCAACCAAATGGCAGTTGCAAAGCTTGTGGCTAT GGGCCCTAGGGTGTACACTGTTCGAAATTTCAATGTGGAAGGGACCTCATATAGTCCTTT TGATGGAAGAATACTGGACTGGCCTGCAGGTCGGATGGATGCTAATCTTCAAATGATTGC GAAGATTGCAGCAGTGTGCAATGATGCTGATGTTGAATACTCTGGGCAACATTTTGTTGC CAATGGAATGCCCACTGAGGCAGCCTTGAAGGTTCTGGTTGAGAAAATGGGACTTCCTGA AGGATTTGATAATGGTTCATCTTTGGATAATAGCGCTGTACTCCGTTGTTCTCAACTATG GAATAAAATCGAACATCGAATTGCAACCCTTGAATTCGATCGTGATCGCAAATCCATGGG AGTTATTGTGAATTCCAGCTCAGGCAAAAAGGCATTGCTAGTGAAGGGTGCAGTAGAAAA TGTGTTGGAAAGAAGCTCATATATTCAGTTGCTTGATGGTTCTATTGTAGAACTTGATAG AAAATCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTTTATCAAATGTCAACAAGTGCATTACGCTG TTTGGGATTTGCATACAAGGAAGATCTTTTGGAGTTTGCAACATATAATGGAGATGAAGA CCATCCAGCTCATCAGCTTCTACTTAGACCATCAAATTACTCTGTAATTGAAAGTAAACT CATTTTTGTTGGTTTGGTTGGGCTGAGGGATCCACCACGGAAAGAGGTTCGTCAAGCAAT TGAAGACTGTAGAGCAGCTGGAATTCGTGTTATGGTTATTACAGGTGACAACAAGAATAC AGCAGAAGCTATTTGTCGTGAAATTGGAGTTTTTGGATCTAAGGAAGACATTAGTTTAAA AAGCATAACGGGGAAAGAGTTTATGGAGCATTATGATCAGAAAACTCATTTGAGGCAAAA TGGGGGCCTCCTGTTCTCTAGGGCTGAACCAAGGCATAAGCAGGAAATAGTGAGGTTGCT CAAAGAGGATAATGAGGTGGTTGCAATGACTGGTGATGGAGTGAATGATGCACCAGCCTT GAAATTGGCTGATATTGGGATTGCAATGGGCATTACTGGGACAGAGGTTGCAAAGGAAGC CTCTGACATGGTCTTGGCAGATGATAATTTTAACACAATAGTTGCTGCTGTTGGTGAAGG CAGATCCATTTACAACAATATGAAGGCTTTTATCAGGTACATGATTTCATCAAATATTGG CGAGGTTGCCTCTATATTTCTGACAGCTGCTTTAGGTATTCCAGAAGGCCTGATTCCTGT TCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTCACTGATGGTCCCCCAGCAACAGCTTTGGGATTTAA TCCACCTGACAAAGATATAATGAAGAAACCCCCTAGAAGAAGTGATGATTCATTGATCAC TCCCTGGATTTTATTCCGCTATCTGGTGATTGGGCTCTATGTTGGAATAGCAACTGTGGG AATATTCATCATATGGTACACACATGGGACATTCCTGGGGATTGATTTGAGTGGAGATGG CCACAGTCTTGTTACCTATTCCCAACTTGCTAACTGGGGTCAATGCCCTTCCTGGGAGGG TTTCTCGGCATCACCCTTCACAGCAGGGGCGCAAGTGTTCAGTTTTGATGCAAATCCATG TGACTACTTCCAGACTGGAAAAATCAAAGCCATGACTCTTTCCCTCTCTGTCCTGGTTGC CATAGAGATGTTCAATTCCCTTAATGCCCTATCCGAGGATGGGAGCCTTTTGACAATGCC CCCATGGGTCAATCCCTGGCTCCTCGTTGCCATGTCCATCTCTTTTGCCCTGCACTTCTT GATCGTGTATGTGCCATTCCTCGCACAAATTTTTGGCATTGTTGCCCTCAGCCTCAATGA ATGGCTCTTGGTGTTGGTTGTGGCATTCCCGGTAATTCTGATTGATGAGCTACTCAAATT TGTGGGAAGGTGTACCAGTGGGTTGCGGTCATCGGATGCTAGAAGATATTCAAAGCACAA GGCAGAATAAAAGGCCAATAGTGTGGATTTGTGGTCTGAAAAGACTGCTATTTTACAGGG CCTTAATGGAGTTCTGGAATTTTCTAGGTTCCAACTTTTAACCCTCATCCTTTTTAGAAT GATTGAGAGTTTGTTTGGACCTTGGAATGATTTGATTAGACTGCTAAACCAAACTAGTTT TGTAATGGAATTTTTAAA