Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0124g00470.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:21078790:21081911:-1 gene:VIT_05s0124g00470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACAACCCACTTCTTTGCTTCTAAACCTTTCAAAATTTCAACCATCAGTAGATTCATC TGCACCTCTTCTTCCGAGGATAATCTCCACGGTTTGGTCGATTCCGATTTCAGTGTCCCC GAAAGTTCGCGGGTGGAATCCTTTTTGGCCGAGGAGTTTGCATTCTTGCGGGATTCTTTG TTGGAAACTGGTTCTGACACTGGCGCTTCAGTGAATAAATCGGTATCTGGTAGGTGTTCT AATGATGCGGTTTTGATTTCGGATGTTATTAGGAATACTGGTGATGGGTTTGGGCACAAA ACCCAGAAGTTTCTTAGGCAATTTAGGGAGAAATTGAATGAAACTTTGGTGGTTGATGTG TTGAGTCTTGTGAAAAACCCTGAATTGGGTGTTAAATTCTTTATCTGGGCAGGCAGGCAG ATTGGGTATGGTCACACGGGGCCTGTTTATCATGCCTTATTGGAGGTATTGGGTTGTGGG GGCAATGATAGAGTACCGGAACAATTTCTCCGAGAAATTAGAGATGAAGATAAGGAAATA CTTGGGAAGTTGCTTAATGTTTTGATTCGGAAGTGTTGCCGAAATGGACTGTGGAATGTG GCACTGGAGGAGTTGGGGAGGCTTAAGGACTTAGGATACAAGCCCTCAAGATTGACTTAT AATGCTTTGGTTAGAGTTTTTCTAGAGGCAGATAGGTTGGACACAGCTTATTTGGTTCAT AGAGAAATGTCTGATTCTGGTTTTAATATGGATGGGTATACACTGGGTTGCTTTGTGCAT TTGCTGTGCAAAGCAGGCAGGTGGAGGGAGGCGCTTGCACTGATTGAGAAGGAAGAATTT AAACTTGATACAGTGATTTATACACAGATGATATCTGGGTTGTGTGAAGCTTCGCTTTTT GAAGAAGCTATGGATTTCCTGAGTAGGATGCGGTCTAGTTCTTGCATTCCTAATGTTGTC ACTTATAGGATTTTGCTTTGTGGGTGTTTGAGAAAAAGACAGCTCGGTAGGTGTAAGAGG ATTCTTAGTATGATGATTACAGAAGGTTGTTATCCAAGTCGTAGAATATTTAATTCTCTT ATTCATGCCTATTGCAGATCGGGAGACTACTCTTATGCCTATAAGTTGCTCAAGAAAATG GGAGATTGTGGCTGCCAGCCAGGTTATGTGGTTTATAATATACTAATTGGTGGTATTTGT GGCAATGAGAAGTTACCTAGCTTGGATGTGTTAGAATTGGCTGAAAAAGCTTATGGTGAA ATGCTTGATGCTCACGTTGTATTAAACAAGGTCAATGTCAGCAATTTGGCACGGTGTCTC TGTGGGGCTGGAAAGTTTGAGAAAGCATATAGCATTATTCGTGAAATGATGAGTAAGGGT TTCATACCTGACACCAGCACGTACTCAAAAGTGATTGGTTTACTTTGTAATGCGTCCAAG GTAGACAACGCTTTCCTATTGTTTGAAGAAATGAAAAGTAATCATGTTGTTCCAGATGTC TTTACATATACAATTTTAATTGATAGCTTTTGTAAAGTGGGCCTTCTTCAACAGGCTCGT AAATGGTTTGATGAAATGGTAAGGGATGGTTGTGCCCCTAATGTGGTGACTTATACTGCC CTTATACATGCTTACCTTAAGGCAAGGAAGATGTCCAGTGCAAATGAGCTCTTTGAGATG ATGCTATCTGAAGGTTGCATTCCAAATGTTGTCACGTATACTGCCCTGATTGATGGTCAC TGTAAATCTGGGCAAATTGAAAAAGCTTGCCAGATTTATGCAAGAATGAGGGGAAATGCA GATATTCCGGATGTGGACATGTACTTCAAGATTGATGATGGCAACATCAGAGATCCAAAC ATTTTTACTTATGGAGCTCTGGTGGATGGTTTGTGCAAAGCACACAAGGTTAAAGAAGCA CGTGATTTATTGGATGTCATGTCAGTGGAAGGTTGTGAGCCAAATCATATTGTTTATGAT GCTCTTATCGATGGGTTTTGCAAGGTTGGAAAATTAGATGAAGCACAAATGGTTTTTACC AAGATGTCAGAACGTGGGTATGGTCCAAATGTGTATACTTATAGCTCTCTTATTGATCGG TTGTTTAAAGATAAACGGTTGGATCTCGCTTTAAAAGTCTTGTCCAGAATGCTAGAAAAT TCTTGTGCTCCCAATGTTATTATCTATACGGAGATGATTGATGGCCTCTGTAAAGTTGGG AAGACAGATGAGGCTTATAGGCTTATGTCGATGATGGAAGAAAAGGGGTGTCATCCAAAT GTTGTGACTTATACTGCAATGATAGATGGATTTGGAAAGGCCGGTAAAGTTGACAAATGT CTTGAGCTCATGAGACAAATGGGTGCCAAGGGTTGTGCTCCAAATTTTGTCACCTACAGG GTTTTGATAAACCATTGTTGTGCTGCTGGCCTTTTGGATGATGCTCACCAACTTTTGGAT GAGATGAAACAGACATATTGGCCTAAACATATGGCAGGCTATCGTAAGGTCATTGAAGGT TTCAACAGAGAGTTCATAATCTCTCTTGGCCTTCTAGATGAGATAGCTGAGAATGTTGCA GTGCCAATAATTCCAGCCTATAGAATTCTGATTGATAGCTTCTGCAAGGCGGGGAGGCTG GAATTGGCTCTAGAGCTGCATAAAGAGATGTCGTCATGTACATCTTATTCAGCTGCAGAC AAGGATTTGTACTCTTCTTTAATTGAGAGCCTCTCCCTTGCAAGTAAGGTTGATAAGGCT TTTGAGTTGTATGCTGACATGATAAAGAGGGGTGGTATTCCAGAGCTAAGCATTTTTTTC TACCTCGTGAAGGGGCTCATTAGAATTAACAGGTGGGAAGAGGCACTTCAACTTTCAGAT TGCATATGTCAAATGGTACATGTCTCTAATTCTTCCTCTCTTATTTTGAAACATGCTATA TATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0124g00470.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:21078790:21081911:-1 gene:VIT_05s0124g00470 transcript:VIT_05s0124g00470.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTTHFFASKPFKISTISRFICTSSSEDNLHGLVDSDFSVPESSRVESFLAEEFAFLRDSL LETGSDTGASVNKSVSGRCSNDAVLISDVIRNTGDGFGHKTQKFLRQFREKLNETLVVDV LSLVKNPELGVKFFIWAGRQIGYGHTGPVYHALLEVLGCGGNDRVPEQFLREIRDEDKEI LGKLLNVLIRKCCRNGLWNVALEELGRLKDLGYKPSRLTYNALVRVFLEADRLDTAYLVH REMSDSGFNMDGYTLGCFVHLLCKAGRWREALALIEKEEFKLDTVIYTQMISGLCEASLF EEAMDFLSRMRSSSCIPNVVTYRILLCGCLRKRQLGRCKRILSMMITEGCYPSRRIFNSL IHAYCRSGDYSYAYKLLKKMGDCGCQPGYVVYNILIGGICGNEKLPSLDVLELAEKAYGE MLDAHVVLNKVNVSNLARCLCGAGKFEKAYSIIREMMSKGFIPDTSTYSKVIGLLCNASK VDNAFLLFEEMKSNHVVPDVFTYTILIDSFCKVGLLQQARKWFDEMVRDGCAPNVVTYTA LIHAYLKARKMSSANELFEMMLSEGCIPNVVTYTALIDGHCKSGQIEKACQIYARMRGNA DIPDVDMYFKIDDGNIRDPNIFTYGALVDGLCKAHKVKEARDLLDVMSVEGCEPNHIVYD ALIDGFCKVGKLDEAQMVFTKMSERGYGPNVYTYSSLIDRLFKDKRLDLALKVLSRMLEN SCAPNVIIYTEMIDGLCKVGKTDEAYRLMSMMEEKGCHPNVVTYTAMIDGFGKAGKVDKC LELMRQMGAKGCAPNFVTYRVLINHCCAAGLLDDAHQLLDEMKQTYWPKHMAGYRKVIEG FNREFIISLGLLDEIAENVAVPIIPAYRILIDSFCKAGRLELALELHKEMSSCTSYSAAD KDLYSSLIESLSLASKVDKAFELYADMIKRGGIPELSIFFYLVKGLIRINRWEEALQLSD CICQMVHVSNSSSLILKHAIY

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0124g00470.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:21078790:21081911:-1 gene:VIT_05s0124g00470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACAACCCACTTCTTTGCTTCTAAACCTTTCAAAATTTCAACCATCAGTAGATTCATC TGCACCTCTTCTTCCGAGGATAATCTCCACGGTTTGGTCGATTCCGATTTCAGTGTCCCC GAAAGTTCGCGGGTGGAATCCTTTTTGGCCGAGGAGTTTGCATTCTTGCGGGATTCTTTG TTGGAAACTGGTTCTGACACTGGCGCTTCAGTGAATAAATCGGTATCTGGTAGGTGTTCT AATGATGCGGTTTTGATTTCGGATGTTATTAGGAATACTGGTGATGGGTTTGGGCACAAA ACCCAGAAGTTTCTTAGGCAATTTAGGGAGAAATTGAATGAAACTTTGGTGGTTGATGTG TTGAGTCTTGTGAAAAACCCTGAATTGGGTGTTAAATTCTTTATCTGGGCAGGCAGGCAG ATTGGGTATGGTCACACGGGGCCTGTTTATCATGCCTTATTGGAGGTATTGGGTTGTGGG GGCAATGATAGAGTACCGGAACAATTTCTCCGAGAAATTAGAGATGAAGATAAGGAAATA CTTGGGAAGTTGCTTAATGTTTTGATTCGGAAGTGTTGCCGAAATGGACTGTGGAATGTG GCACTGGAGGAGTTGGGGAGGCTTAAGGACTTAGGATACAAGCCCTCAAGATTGACTTAT AATGCTTTGGTTAGAGTTTTTCTAGAGGCAGATAGGTTGGACACAGCTTATTTGGTTCAT AGAGAAATGTCTGATTCTGGTTTTAATATGGATGGGTATACACTGGGTTGCTTTGTGCAT TTGCTGTGCAAAGCAGGCAGGTGGAGGGAGGCGCTTGCACTGATTGAGAAGGAAGAATTT AAACTTGATACAGTGATTTATACACAGATGATATCTGGGTTGTGTGAAGCTTCGCTTTTT GAAGAAGCTATGGATTTCCTGAGTAGGATGCGGTCTAGTTCTTGCATTCCTAATGTTGTC ACTTATAGGATTTTGCTTTGTGGGTGTTTGAGAAAAAGACAGCTCGGTAGGTGTAAGAGG ATTCTTAGTATGATGATTACAGAAGGTTGTTATCCAAGTCGTAGAATATTTAATTCTCTT ATTCATGCCTATTGCAGATCGGGAGACTACTCTTATGCCTATAAGTTGCTCAAGAAAATG GGAGATTGTGGCTGCCAGCCAGGTTATGTGGTTTATAATATACTAATTGGTGGTATTTGT GGCAATGAGAAGTTACCTAGCTTGGATGTGTTAGAATTGGCTGAAAAAGCTTATGGTGAA ATGCTTGATGCTCACGTTGTATTAAACAAGGTCAATGTCAGCAATTTGGCACGGTGTCTC TGTGGGGCTGGAAAGTTTGAGAAAGCATATAGCATTATTCGTGAAATGATGAGTAAGGGT TTCATACCTGACACCAGCACGTACTCAAAAGTGATTGGTTTACTTTGTAATGCGTCCAAG GTAGACAACGCTTTCCTATTGTTTGAAGAAATGAAAAGTAATCATGTTGTTCCAGATGTC TTTACATATACAATTTTAATTGATAGCTTTTGTAAAGTGGGCCTTCTTCAACAGGCTCGT AAATGGTTTGATGAAATGGTAAGGGATGGTTGTGCCCCTAATGTGGTGACTTATACTGCC CTTATACATGCTTACCTTAAGGCAAGGAAGATGTCCAGTGCAAATGAGCTCTTTGAGATG ATGCTATCTGAAGGTTGCATTCCAAATGTTGTCACGTATACTGCCCTGATTGATGGTCAC TGTAAATCTGGGCAAATTGAAAAAGCTTGCCAGATTTATGCAAGAATGAGGGGAAATGCA GATATTCCGGATGTGGACATGTACTTCAAGATTGATGATGGCAACATCAGAGATCCAAAC ATTTTTACTTATGGAGCTCTGGTGGATGGTTTGTGCAAAGCACACAAGGTTAAAGAAGCA CGTGATTTATTGGATGTCATGTCAGTGGAAGGTTGTGAGCCAAATCATATTGTTTATGAT GCTCTTATCGATGGGTTTTGCAAGGTTGGAAAATTAGATGAAGCACAAATGGTTTTTACC AAGATGTCAGAACGTGGGTATGGTCCAAATGTGTATACTTATAGCTCTCTTATTGATCGG TTGTTTAAAGATAAACGGTTGGATCTCGCTTTAAAAGTCTTGTCCAGAATGCTAGAAAAT TCTTGTGCTCCCAATGTTATTATCTATACGGAGATGATTGATGGCCTCTGTAAAGTTGGG AAGACAGATGAGGCTTATAGGCTTATGTCGATGATGGAAGAAAAGGGGTGTCATCCAAAT GTTGTGACTTATACTGCAATGATAGATGGATTTGGAAAGGCCGGTAAAGTTGACAAATGT CTTGAGCTCATGAGACAAATGGGTGCCAAGGGTTGTGCTCCAAATTTTGTCACCTACAGG GTTTTGATAAACCATTGTTGTGCTGCTGGCCTTTTGGATGATGCTCACCAACTTTTGGAT GAGATGAAACAGACATATTGGCCTAAACATATGGCAGGCTATCGTAAGGTCATTGAAGGT TTCAACAGAGAGTTCATAATCTCTCTTGGCCTTCTAGATGAGATAGCTGAGAATGTTGCA GTGCCAATAATTCCAGCCTATAGAATTCTGATTGATAGCTTCTGCAAGGCGGGGAGGCTG GAATTGGCTCTAGAGCTGCATAAAGAGATGTCGTCATGTACATCTTATTCAGCTGCAGAC AAGGATTTGTACTCTTCTTTAATTGAGAGCCTCTCCCTTGCAAGTAAGGTTGATAAGGCT TTTGAGTTGTATGCTGACATGATAAAGAGGGGTGGTATTCCAGAGCTAAGCATTTTTTTC TACCTCGTGAAGGGGCTCATTAGAATTAACAGGTGGGAAGAGGCACTTCAACTTTCAGAT TGCATATGTCAAATGGTACATGTCTCTAATTCTTCCTCTCTTATTTTGAAACATGCTATA TATTGATACAGAACCGCAGATTCAGAATTCCATCTTTGTGGCTAGAATCTTCAATTTAGG TTACATTCCTGATTCTGAACCCCAATCCTGGACTTCCTCCTTATAAACTTGATAAACTTG TGATTTTCTTGTGACAGAATCAGTGAGCTACTATTTAATCAGGGCAGAATCTTAGATAGC TT