Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0124g00030.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:20411517:20414454:-1 gene:VIT_05s0124g00030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGACTTACTTGGCTCTCTGTCAGAGTCATTTTCTTCAAATTCATTGGCTCTTGTGCCA TCTGGACCTGCAACCACAACATCTGAGGCTGCTGTCCTTGGAAATGCTGGGTCTGCACCC GCATCAGCAGCAATGCCATCTGGATCTGCTGTTATGAGCCAGTCTTTTGAAGACCCATTT GGTGACTCCCCTTTTAGAGCTTTGCCTTCAGCAGAGAGTGTACCAGCTGAACCTCAGGAT TCAGCTTCCACAACTTCCTTCCAGACCATGAATCAAACATCAGGACCACCCTTCCCAGTT ACCCAAGGAGTGGACACGGGTTCCAACTTTGACTTTGGGGACACTTTCCCTGGCATAACT TACACGCCATCCGGTGTCTCCACTGCACAACCTCCTTCTGCAAGCCCACAATTTTCACCC CAAGAGCAATGGATTCCCCAGCAGAACAATGATATCCTAGCAGACATTCTACCACCTTCA GGATCTTCAGCTCCTGCCATTTCACAGGCTGCTTTCCCAGCTCCAACTGGCCAGTCTGTG CAGCCAAACCCTAATGTTGTTGGGGGCTTTCTTGCACAGTCAGGATCTGCAGATCATGCA GCTTCACAATTTTCTCCTCAGATTCCAACTGGACCAGCTGCACAATATAACAATGGGAAC TTCCTTTCACAGTTGGGTTCTGCAGCGCCTGTACCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTCCT GTACCTTCTCAGTCTCCTTTTCAAGCTCCTGTACCTTCTCAGTCTCCTTTTCAAGCTCCA GTATCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTCCGGTATCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCCCCA GTGCCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTCCAGGACCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTCCA GTACCTTCACAGGCTCCTTTTCAAGCTCCAGGACCTTCACAGGCTCCTTTTCAATCACCA AGTGGGCCAGTTACACATCCTAGCAATGATAACCTTGGTGGCTTATTTCCACAAGCTGGA CCGCCTGGTTCAGTGATGTCACAGTCTACTCCCCCTGCTTCAACAGGTTCACTTGCTATA GTTCCTCAAGCATCCAAGGACAAGTTTGAAACGAAGTCAACGGTTTGGGCTGATACACTG AGCAGAGGATTAGTCAATTTGAATATATCTGGAGCTAAAATTAATCCATTGGCGGATATT GGAATTGATTTTGATGCCATTAATCGGAAAGAAAAGAGGATGGAGAAACCTAAGCCTGCT ACCACAGCTCCTGTATCTACTACTACAATGGGCAAGGCAATGGGATCTGGCTCTGGAATG GGTCGTGCTGGTGCAGGTGCACTCAGGCCTCCACCAAATACTATGATGGGTTCAGGTATG GGAATGGGCATGGGCATGGGTAGTGGCCCTGGTGCAGGCATGAGTATGGGTATGGGTGGT GGTCCTGGTTCAGGCATGGGTATGGGTATGGGTGGTGCCCCTGGAGTGGGCATGGGTATG GGTATGGGTGGTGCCCCTGCAGCAGCGGGTATGGGTATGGGTATGGGGATGGGAGGAGGC ATGGGCATGGGAGGATATGGAGGCATGAATCAACCTATGGGCATGGGTATGAATGTGGGC ATGGGCATGAATATGGGAATGGGGCAAGGAGCCCAGATGCAACAACCAACTGGATTGCCT CCTGGGGGTTATAACCCCATGATGGGCTCAGGTGGTTATGCTCCTCAGCAACCATATGGT GGTGGCTACCGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0124g00030.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:20411517:20414454:-1 gene:VIT_05s0124g00030 transcript:VIT_05s0124g00030.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDLLGSLSESFSSNSLALVPSGPATTTSEAAVLGNAGSAPASAAMPSGSAVMSQSFEDPF GDSPFRALPSAESVPAEPQDSASTTSFQTMNQTSGPPFPVTQGVDTGSNFDFGDTFPGIT YTPSGVSTAQPPSASPQFSPQEQWIPQQNNDILADILPPSGSSAPAISQAAFPAPTGQSV QPNPNVVGGFLAQSGSADHAASQFSPQIPTGPAAQYNNGNFLSQLGSAAPVPSQSPFQAP VPSQSPFQAPVPSQSPFQAPVSSQSPFQAPVSSQSPFQAPVPSQSPFQAPGPSQSPFQAP VPSQAPFQAPGPSQAPFQSPSGPVTHPSNDNLGGLFPQAGPPGSVMSQSTPPASTGSLAI VPQASKDKFETKSTVWADTLSRGLVNLNISGAKINPLADIGIDFDAINRKEKRMEKPKPA TTAPVSTTTMGKAMGSGSGMGRAGAGALRPPPNTMMGSGMGMGMGMGSGPGAGMSMGMGG GPGSGMGMGMGGAPGVGMGMGMGGAPAAAGMGMGMGMGGGMGMGGYGGMNQPMGMGMNVG MGMNMGMGQGAQMQQPTGLPPGGYNPMMGSGGYAPQQPYGGGYR

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0124g00030.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:20411517:20414454:-1 gene:VIT_05s0124g00030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CAGCTGTCCCAGCTACATCAATTAGTCCGGAAATGGACTTACTTGGCTCTCTGTCAGAGT CATTTTCTTCAAATTCATTGGCTCTTGTGCCATCTGGACCTGCAACCACAACATCTGAGG CTGCTGTCCTTGGAAATGCTGGGTCTGCACCCGCATCAGCAGCAATGCCATCTGGATCTG CTGTTATGAGCCAGTCTTTTGAAGACCCATTTGGTGACTCCCCTTTTAGAGCTTTGCCTT CAGCAGAGAGTGTACCAGCTGAACCTCAGGATTCAGCTTCCACAACTTCCTTCCAGACCA TGAATCAAACATCAGGACCACCCTTCCCAGTTACCCAAGGAGTGGACACGGGTTCCAACT TTGACTTTGGGGACACTTTCCCTGGCATAACTTACACGCCATCCGGTGTCTCCACTGCAC AACCTCCTTCTGCAAGCCCACAATTTTCACCCCAAGAGCAATGGATTCCCCAGCAGAACA ATGATATCCTAGCAGACATTCTACCACCTTCAGGATCTTCAGCTCCTGCCATTTCACAGG CTGCTTTCCCAGCTCCAACTGGCCAGTCTGTGCAGCCAAACCCTAATGTTGTTGGGGGCT TTCTTGCACAGTCAGGATCTGCAGATCATGCAGCTTCACAATTTTCTCCTCAGATTCCAA CTGGACCAGCTGCACAATATAACAATGGGAACTTCCTTTCACAGTTGGGTTCTGCAGCGC CTGTACCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTCCTGTACCTTCTCAGTCTCCTTTTCAAGCTC CTGTACCTTCTCAGTCTCCTTTTCAAGCTCCAGTATCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTC CGGTATCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCCCCAGTGCCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTC CAGGACCTTCACAGTCTCCTTTTCAAGCTCCAGTACCTTCACAGGCTCCTTTTCAAGCTC CAGGACCTTCACAGGCTCCTTTTCAATCACCAAGTGGGCCAGTTACACATCCTAGCAATG ATAACCTTGGTGGCTTATTTCCACAAGCTGGACCGCCTGGTTCAGTGATGTCACAGTCTA CTCCCCCTGCTTCAACAGGTTCACTTGCTATAGTTCCTCAAGCATCCAAGGACAAGTTTG AAACGAAGTCAACGGTTTGGGCTGATACACTGAGCAGAGGATTAGTCAATTTGAATATAT CTGGAGCTAAAATTAATCCATTGGCGGATATTGGAATTGATTTTGATGCCATTAATCGGA AAGAAAAGAGGATGGAGAAACCTAAGCCTGCTACCACAGCTCCTGTATCTACTACTACAA TGGGCAAGGCAATGGGATCTGGCTCTGGAATGGGTCGTGCTGGTGCAGGTGCACTCAGGC CTCCACCAAATACTATGATGGGTTCAGGTATGGGAATGGGCATGGGCATGGGTAGTGGCC CTGGTGCAGGCATGAGTATGGGTATGGGTGGTGGTCCTGGTTCAGGCATGGGTATGGGTA TGGGTGGTGCCCCTGGAGTGGGCATGGGTATGGGTATGGGTGGTGCCCCTGCAGCAGCGG GTATGGGTATGGGTATGGGGATGGGAGGAGGCATGGGCATGGGAGGATATGGAGGCATGA ATCAACCTATGGGCATGGGTATGAATGTGGGCATGGGCATGAATATGGGAATGGGGCAAG GAGCCCAGATGCAACAACCAACTGGATTGCCTCCTGGGGGTTATAACCCCATGATGGGCT CAGGTGGTTATGCTCCTCAGCAACCATATGGTGGTGGCTACCGATGAGAATGATATACAT ATATATGTATATATATCCCCTTGAACCAAAATTGGGGATGGTCATGGATACCTATTATTA TATCATAAGATGAGAAGGAGAATAGCATAGTGAACCCCCCAGTGTTCTAATGAGAATCCC AACGCAGGCAGAGAGAGCTGTATTTTGTTTCAGTGGAGTAAACGGTGGTAGCACATGCCC ATGTATGTTTATTCAGCTTAAAAAAGTTTTACTTACTGTCAGTTACCCTATGATTCCTTT TTGTGCTTCAAGAGTTGTGTTGTGAATGTGTAACAATGAAGATAAGCCTTTAACAGGTTG TTTTTGAGATATATATATATTTTTTTGGATGAC