Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0124g00010.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:20346173:20353316:-1 gene:VIT_05s0124g00010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACGTACATACCAGAGGTGATTATGGTGGACATTCTGTCGAGACTACCAGTGAAGTCT CTGCTACGATTCAGGTGCGTATGCAAAGCCTGGTGCACCTTAATCTCCCATCCCCAATTC GTTGAAACCCACCTCCGTCAACAACATAAACGCCCCGTAATTGGACTCGTTGTTCCACAC TCCGTGGACGACCCTCTACATAAGGATGATTTAGCAGTGGATCTTGAACTTCACTTGGGT ATCCCAAACAAACGCACTACAACAGTTCTGGATTCTTGTAATGGGTTGCTGTGTGTGGTT GATTGCTATTATGGGTTTTATTCCCTCAAGCCCCCTCAAAAACTCATCCTTTGGAACCCA TCTACCAGACAGTGCAACCATATTCCATGCCCTAGTTTTGTTGGTTACCAGAACTGTATG TATAGCTTTTTCTATGATCCTGGTAGTGATGACTACAAGATTGTAAGGATTTTCACCTTT CTTGGTAAGGACAAAACCGGAATCGATATTTTCACGCTGAAAACTAACAAGTGGAGAAGA GTTGAGGAGACCCATTCAAGTGTAATTGGATATTGGTCCGCAACTTATTTTAACGGGAAT CTCCATTGGCTAGCGTTCAGGTATGGAGGGTATGGAGAAGATGAACGTAGTTCAATGGTT GCTTTTAGTCTCAGAGAGGAGAAGTTCCAGGAGATGGAATTGCCAAGTCAACGTGCTGTC TTTGGTTTGAGGGTTTTAGGAGGATGCCTCTGCGTGGATGGTTTATATACTAATGACAAG TGGGTGATGGAAGAATATGGCATCAAGGAGTCTTGGAAAAGCTTAATTGCTATCCCATAT AGGGTTGGAGATGGTTCAAGTTGGAAACTTCCCCGTGTGTTGCGTTTTTTGGAGAATGGT GTGCTTCTGGTGCTTCATGACGGGAAGTTTCGCAACACAAACTCAGCAGGCGGTATGTAT AGGCCCAGTTCATATTCTAGTTCAGGAGGATATGGTGACCGTTATGATGATGATCGATAT GAAGGCCGCTATGGAAGAGACGAAGATCGAAATGGTTATGGGAGAGAAAGAGAATGGGGC AGCAGAGATGATGACCGGTATGGTAGAAATGGGGACTCATATGGTCCTGAAGGGGATCGC TATGGCAGAGATTCTGATGAACGGTATGGTAGAGATGGCTATAAGGATGATGATTACAGG GGAAGAAGTCGAAGGAATGAGGACTACCAGTATGGCTCTAGAAGTAGGAGTGCTGATAGA GATAGGGACCGTGCTTTTGATGAGGAGAGCAACCATTCATCTAGAGGTGGTGCCCGAACT AATGAGCATCCTCAGTATGGAAGGCAGCTTGAACGAAAATTTTCTGAACAAAATCTTGAT GCTCCTCCTAGTTATGAAGAAGCTGTAGCTGATGCCCACAGTCCTGTTCATGATGAGAGG GATGGAGCAACCCCAGCAGCACCTGCCCCTAAAACATCTTCTCCACCTGTAAGCACTAGT CCTAGCCAAGCAACAACTGCTGTTGGTCCTTCTACATCTCCTCCTGCCAACAAGGAAGTT GATGCTTTTGATGAATTTGATCCGCGCGGTCCAGTTTCAGCTGTCCCAGCTACATCAATT AGTCCGGAAATGGACTTACTTGGCTCTCTGTCAGAGTCATTTTCTTCAAATTCATTGGCT CTTGTGCCATCTGGACCTGCAACCACAACATCTGAGGCTGCTGTCCTTGGAAATGCTGGG TCTGCACCCGCATCAGCAGCAATGCCATCTGGATCTGCTGTTATGAGCCAGTCTTTTGAA GACCCATTTGGTGACTCCCCTTTTAGAGCTTTGCCTTCAGCAGAGAGTGTACCAGCTCAA CCTCAGGATTCAGCTTCCACAACTTCCTTCCAGACCATGAATCAAACATCAGGACCACCC TTCCCAGTTAACCCAAGGAGTGGACACGGGTTCCAACTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0124g00010.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:20346173:20353316:-1 gene:VIT_05s0124g00010 transcript:VIT_05s0124g00010.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTYIPEVIMVDILSRLPVKSLLRFRCVCKAWCTLISHPQFVETHLRQQHKRPVIGLVVPH SVDDPLHKDDLAVDLELHLGIPNKRTTTVLDSCNGLLCVVDCYYGFYSLKPPQKLILWNP STRQCNHIPCPSFVGYQNCMYSFFYDPGSDDYKIVRIFTFLGKDKTGIDIFTLKTNKWRR VEETHSSVIGYWSATYFNGNLHWLAFRYGGYGEDERSSMVAFSLREEKFQEMELPSQRAV FGLRVLGGCLCVDGLYTNDKWVMEEYGIKESWKSLIAIPYRVGDGSSWKLPRVLRFLENG VLLVLHDGKFRNTNSAGGMYRPSSYSSSGGYGDRYDDDRYEGRYGRDEDRNGYGREREWG SRDDDRYGRNGDSYGPEGDRYGRDSDERYGRDGYKDDDYRGRSRRNEDYQYGSRSRSADR DRDRAFDEESNHSSRGGARTNEHPQYGRQLERKFSEQNLDAPPSYEEAVADAHSPVHDER DGATPAAPAPKTSSPPVSTSPSQATTAVGPSTSPPANKEVDAFDEFDPRGPVSAVPATSI SPEMDLLGSLSESFSSNSLALVPSGPATTTSEAAVLGNAGSAPASAAMPSGSAVMSQSFE DPFGDSPFRALPSAESVPAQPQDSASTTSFQTMNQTSGPPFPVNPRSGHGFQL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0124g00010.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:20346173:20353316:-1 gene:VIT_05s0124g00010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACGTACATACCAGAGGTGATTATGGTGGACATTCTGTCGAGACTACCAGTGAAGTCT CTGCTACGATTCAGGTGCGTATGCAAAGCCTGGTGCACCTTAATCTCCCATCCCCAATTC GTTGAAACCCACCTCCGTCAACAACATAAACGCCCCGTAATTGGACTCGTTGTTCCACAC TCCGTGGACGACCCTCTACATAAGGATGATTTAGCAGTGGATCTTGAACTTCACTTGGGT ATCCCAAACAAACGCACTACAACAGTTCTGGATTCTTGTAATGGGTTGCTGTGTGTGGTT GATTGCTATTATGGGTTTTATTCCCTCAAGCCCCCTCAAAAACTCATCCTTTGGAACCCA TCTACCAGACAGTGCAACCATATTCCATGCCCTAGTTTTGTTGGTTACCAGAACTGTATG TATAGCTTTTTCTATGATCCTGGTAGTGATGACTACAAGATTGTAAGGATTTTCACCTTT CTTGGTAAGGACAAAACCGGAATCGATATTTTCACGCTGAAAACTAACAAGTGGAGAAGA GTTGAGGAGACCCATTCAAGTGTAATTGGATATTGGTCCGCAACTTATTTTAACGGGAAT CTCCATTGGCTAGCGTTCAGGTATGGAGGGTATGGAGAAGATGAACGTAGTTCAATGGTT GCTTTTAGTCTCAGAGAGGAGAAGTTCCAGGAGATGGAATTGCCAAGTCAACGTGCTGTC TTTGGTTTGAGGGTTTTAGGAGGATGCCTCTGCGTGGATGGTTTATATACTAATGACAAG TGGGTGATGGAAGAATATGGCATCAAGGAGTCTTGGAAAAGCTTAATTGCTATCCCATAT AGGGTTGGAGATGGTTCAAGTTGGAAACTTCCCCGTGTGTTGCGTTTTTTGGAGAATGGT GTGCTTCTGGTGCTTCATGACGGGAAGTTTCGCAACACAAACTCAGCAGGCGGTATGTAT AGGCCCAGTTCATATTCTAGTTCAGGAGGATATGGTGACCGTTATGATGATGATCGATAT GAAGGCCGCTATGGAAGAGACGAAGATCGAAATGGTTATGGGAGAGAAAGAGAATGGGGC AGCAGAGATGATGACCGGTATGGTAGAAATGGGGACTCATATGGTCCTGAAGGGGATCGC TATGGCAGAGATTCTGATGAACGGTATGGTAGAGATGGCTATAAGGATGATGATTACAGG GGAAGAAGTCGAAGGAATGAGGACTACCAGTATGGCTCTAGAAGTAGGAGTGCTGATAGA GATAGGGACCGTGCTTTTGATGAGGAGAGCAACCATTCATCTAGAGGTGGTGCCCGAACT AATGAGCATCCTCAGTATGGAAGGCAGCTTGAACGAAAATTTTCTGAACAAAATCTTGAT GCTCCTCCTAGTTATGAAGAAGCTGTAGCTGATGCCCACAGTCCTGTTCATGATGAGAGG GATGGAGCAACCCCAGCAGCACCTGCCCCTAAAACATCTTCTCCACCTGTAAGCACTAGT CCTAGCCAAGCAACAACTGCTGTTGGTCCTTCTACATCTCCTCCTGCCAACAAGGAAGTT GATGCTTTTGATGAATTTGATCCGCGCGGTCCAGTTTCAGCTGTCCCAGCTACATCAATT AGTCCGGAAATGGACTTACTTGGCTCTCTGTCAGAGTCATTTTCTTCAAATTCATTGGCT CTTGTGCCATCTGGACCTGCAACCACAACATCTGAGGCTGCTGTCCTTGGAAATGCTGGG TCTGCACCCGCATCAGCAGCAATGCCATCTGGATCTGCTGTTATGAGCCAGTCTTTTGAA GACCCATTTGGTGACTCCCCTTTTAGAGCTTTGCCTTCAGCAGAGAGTGTACCAGCTCAA CCTCAGGATTCAGCTTCCACAACTTCCTTCCAGACCATGAATCAAACATCAGGACCACCC TTCCCAGTTAACCCAAGGAGTGGACACGGGTTCCAACTTTGA