Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0094g01640.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:24942992:24946277:1 gene:VIT_05s0094g01640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGAAAATCCGCGGCCATTATCAAACCAGGTGAGTACCTTCTTATTCTTCTCAAACCC TACTCCTCAATCGCTTCTCTCCCTCAAATACTATCCCTCGATTCCGAACCAGTGGATCTC TCTGCCCAACTCCTCTCTATTCTCTCTCGCCCAAATTGGCAGAAACACCCTTCTCTCAGA AAGCTTCTGCCTTCTCTAACCCCATCTCATGTCTCCTCTCTCTTCGCCTTCAATCTCGAT CCCCAAACGGCCCTGAGCTTCTTCAATTGGATCGCCCTGCGACCTGGATTCAAACACAAT GTTCATTCCTATTCCTCCATGTTAAACATTCTTATTCGAGCTCGATTGCTCGGTGTGGCT GAAAAGATTCGGATTTCAATGATCAAATCCTGCTGTTCTATTGAGGATGTACTATTTGTA TTGGAAGTCTTTCGGAAAATGAATGCTGATGGTGAATTCAAATTTAAACCAACTCTTAGA TGTTATAATACCATTTTGATGTCTTTGTCAAAGTTTCTTTTGATTGATGAAATGAAGACT GTTTATTTGGAGTTATTGAATAACCAGATTTCGCCTAATATATATACGTTTAACGCAATG GTTAATGGGTATTGCAAGATTGGAAATGTGGTTGAGGCAGAATTATACGCAAGTAAGATA GTGCAAGCGGGTTTACACCCCGACACATTTACATATACTTCTTTGATATTGGGGCACTGT AGGAATAAAGGTGTAGATAATGCTTATGAGGTGTTTTTGATTATGCCGCAAAAGGGTTGT CAAAGGAATGAGGTTTCCTATACTAATCTTATTCATGGGCTTTGTGAAGCTGGAAGGATT AATGAAGCTCTTAAGTTGTTTGCTGATATGACTGAGGATAATTGTTGTCCAACTGTGCGG ACATATACAGTTCTAATATACGCATTGAGTGGATCAGGTAGGAAAGTAGAGGCATTAAAT TTGTTTAATGAGATGAAGGAGAAAGGCTGTGAACCAAATGTTCACACTTACACTGTCCTC ATTGATGGTCTATGTAAAGAAAATAAGATGGATGAAGCAAGAAAAATGCTAAGTGAGATG TCAGAGAAAGGATTGATTCCCAGTGTGGTAACATACAATGCTTTGATTGATGGGTATTGC AAGGAGGGAATGATTGATGATGCCTTTGAAATTTTGGATTTGATGGAATCAAATAGCTGT GGTCCAAACACTCGCACATACAATGAGTTGATATGTGGGCTTTGTAAGAAAAGAAAGGTG CACAAGGCAATGGCGCTACTCAATAAGATGCTTGAGCGCAAGCTGTCACCAAGCCTGATC ACGTATAACTCTTTGATTCATGGGCAATGTAAAGTCAATGATTTAGAGAGTGCTTATAGG TTACTTAGTTTGATGAATGAAAATGGTTTGGTTCCTGACCAATGGACTTATTCTGTCTTC ATAGATACCCTATGTAAAGAAGGGAGGGTTGAAGAAGCTGGTACCCTATTTGATTCTGTC AAGGCGAAAGGCGTAAAAGCAAATGAAGTGATATATACTGCTCTAATCGATGGCTATTGC AAAGTGGGGAAAATCGATGTTGCCTATTCTTTGCTTGAGAGAATGCTGAATGATGCATGC TTACCTAACTCGTACACTTACAACGTGTTGATAGAAGGGCTGTGCAAGGAGAAGAAGATG AAAGAAGCGTCATCATTAGTGGCAAAGATGTTAACAATGGGTGTGAAGCCCACAGTTGTT ACTTATACAATTCTCATTGGAGAAATGTTGAAAGATGGTGCTTTTGACCATGCTCTTAAA GTTTTCAACCACATGGTCTCCTTGGGTTATCAGCCTGATGTTTGTACATACACAGCATTT CTTCATGCATATTTCAGTCAAGGGATGCTAGAAGAAGTGGATGATGTGATTGCCAAAATG AATGAAGAGGGCATTCTGCCAGATCTGGTGACTTACACTGTATTAATTGATGGGTATGCT CGTTTGGGTTTGACACATCGTGCTTTTGATTTTCTCAAATGCATGGTCGATACTGGATGC AAGCCCTCCCTTTATATTGTTTCCATTTTAATCAAGAATCTTTCACATGAAAATCGGATG AAAGAAACAAGATCTGAAATAGGTATTGATTCTGTTTCAAATGTCAATTCTGTTGATATT GCTGATGTATGGAAGACATTGGAATATGAAATTGCTCTAAAGCTCTTTGAGAAAATGGTT GAGCATGGTTGCACAATAGATGTCAGTATATATGGAGCACTAATTGCAGGATTTTGCCAA CAGGAGCGATTGGAAGAAGCTCAGGGGTTAGTTCATCACATGAAAGAAAGAGGAATGTCC CCCAGTGAAGATATTTATAACTCTCTTCTTGACTGTTGCTGCAAGTTGGGGGTGTATGCT GAGGCAGTGAGGCTGGTGGATGCTATGGTAGAAAATGGTCTTTTACCACTTTTAGAGTCC TATAAGTTGCTTGTTTGTGGTTTGTACATAGAAGGCAGCAATGAAAAAGCCAAAGCAGTT TTCCATGGTCTGCTTTCTTGTGGGTATAACTATGATGAAGTAGCTTGGAAGGTTCTTATT GATGGCTTGCTTAAGAGGGACCTTGTTGACGAATGCTCTGAACTGATAGACATTATGGAG GAAAAGGGTTGCCAGCCTAATCCTCTAACATATTCATTGTTGATTGAGGGACTTGAAAGG ACATAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0094g01640.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:24942992:24946277:1 gene:VIT_05s0094g01640 transcript:VIT_05s0094g01640.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MRKSAAIIKPGEYLLILLKPYSSIASLPQILSLDSEPVDLSAQLLSILSRPNWQKHPSLR KLLPSLTPSHVSSLFAFNLDPQTALSFFNWIALRPGFKHNVHSYSSMLNILIRARLLGVA EKIRISMIKSCCSIEDVLFVLEVFRKMNADGEFKFKPTLRCYNTILMSLSKFLLIDEMKT VYLELLNNQISPNIYTFNAMVNGYCKIGNVVEAELYASKIVQAGLHPDTFTYTSLILGHC RNKGVDNAYEVFLIMPQKGCQRNEVSYTNLIHGLCEAGRINEALKLFADMTEDNCCPTVR TYTVLIYALSGSGRKVEALNLFNEMKEKGCEPNVHTYTVLIDGLCKENKMDEARKMLSEM SEKGLIPSVVTYNALIDGYCKEGMIDDAFEILDLMESNSCGPNTRTYNELICGLCKKRKV HKAMALLNKMLERKLSPSLITYNSLIHGQCKVNDLESAYRLLSLMNENGLVPDQWTYSVF IDTLCKEGRVEEAGTLFDSVKAKGVKANEVIYTALIDGYCKVGKIDVAYSLLERMLNDAC LPNSYTYNVLIEGLCKEKKMKEASSLVAKMLTMGVKPTVVTYTILIGEMLKDGAFDHALK VFNHMVSLGYQPDVCTYTAFLHAYFSQGMLEEVDDVIAKMNEEGILPDLVTYTVLIDGYA RLGLTHRAFDFLKCMVDTGCKPSLYIVSILIKNLSHENRMKETRSEIGIDSVSNVNSVDI ADVWKTLEYEIALKLFEKMVEHGCTIDVSIYGALIAGFCQQERLEEAQGLVHHMKERGMS PSEDIYNSLLDCCCKLGVYAEAVRLVDAMVENGLLPLLESYKLLVCGLYIEGSNEKAKAV FHGLLSCGYNYDEVAWKVLIDGLLKRDLVDECSELIDIMEEKGCQPNPLTYSLLIEGLER T

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0094g01640.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:24942992:24946277:1 gene:VIT_05s0094g01640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGAAAATCCGCGGCCATTATCAAACCAGGTGAGTACCTTCTTATTCTTCTCAAACCC TACTCCTCAATCGCTTCTCTCCCTCAAATACTATCCCTCGATTCCGAACCAGTGGATCTC TCTGCCCAACTCCTCTCTATTCTCTCTCGCCCAAATTGGCAGAAACACCCTTCTCTCAGA AAGCTTCTGCCTTCTCTAACCCCATCTCATGTCTCCTCTCTCTTCGCCTTCAATCTCGAT CCCCAAACGGCCCTGAGCTTCTTCAATTGGATCGCCCTGCGACCTGGATTCAAACACAAT GTTCATTCCTATTCCTCCATGTTAAACATTCTTATTCGAGCTCGATTGCTCGGTGTGGCT GAAAAGATTCGGATTTCAATGATCAAATCCTGCTGTTCTATTGAGGATGTACTATTTGTA TTGGAAGTCTTTCGGAAAATGAATGCTGATGGTGAATTCAAATTTAAACCAACTCTTAGA TGTTATAATACCATTTTGATGTCTTTGTCAAAGTTTCTTTTGATTGATGAAATGAAGACT GTTTATTTGGAGTTATTGAATAACCAGATTTCGCCTAATATATATACGTTTAACGCAATG GTTAATGGGTATTGCAAGATTGGAAATGTGGTTGAGGCAGAATTATACGCAAGTAAGATA GTGCAAGCGGGTTTACACCCCGACACATTTACATATACTTCTTTGATATTGGGGCACTGT AGGAATAAAGGTGTAGATAATGCTTATGAGGTGTTTTTGATTATGCCGCAAAAGGGTTGT CAAAGGAATGAGGTTTCCTATACTAATCTTATTCATGGGCTTTGTGAAGCTGGAAGGATT AATGAAGCTCTTAAGTTGTTTGCTGATATGACTGAGGATAATTGTTGTCCAACTGTGCGG ACATATACAGTTCTAATATACGCATTGAGTGGATCAGGTAGGAAAGTAGAGGCATTAAAT TTGTTTAATGAGATGAAGGAGAAAGGCTGTGAACCAAATGTTCACACTTACACTGTCCTC ATTGATGGTCTATGTAAAGAAAATAAGATGGATGAAGCAAGAAAAATGCTAAGTGAGATG TCAGAGAAAGGATTGATTCCCAGTGTGGTAACATACAATGCTTTGATTGATGGGTATTGC AAGGAGGGAATGATTGATGATGCCTTTGAAATTTTGGATTTGATGGAATCAAATAGCTGT GGTCCAAACACTCGCACATACAATGAGTTGATATGTGGGCTTTGTAAGAAAAGAAAGGTG CACAAGGCAATGGCGCTACTCAATAAGATGCTTGAGCGCAAGCTGTCACCAAGCCTGATC ACGTATAACTCTTTGATTCATGGGCAATGTAAAGTCAATGATTTAGAGAGTGCTTATAGG TTACTTAGTTTGATGAATGAAAATGGTTTGGTTCCTGACCAATGGACTTATTCTGTCTTC ATAGATACCCTATGTAAAGAAGGGAGGGTTGAAGAAGCTGGTACCCTATTTGATTCTGTC AAGGCGAAAGGCGTAAAAGCAAATGAAGTGATATATACTGCTCTAATCGATGGCTATTGC AAAGTGGGGAAAATCGATGTTGCCTATTCTTTGCTTGAGAGAATGCTGAATGATGCATGC TTACCTAACTCGTACACTTACAACGTGTTGATAGAAGGGCTGTGCAAGGAGAAGAAGATG AAAGAAGCGTCATCATTAGTGGCAAAGATGTTAACAATGGGTGTGAAGCCCACAGTTGTT ACTTATACAATTCTCATTGGAGAAATGTTGAAAGATGGTGCTTTTGACCATGCTCTTAAA GTTTTCAACCACATGGTCTCCTTGGGTTATCAGCCTGATGTTTGTACATACACAGCATTT CTTCATGCATATTTCAGTCAAGGGATGCTAGAAGAAGTGGATGATGTGATTGCCAAAATG AATGAAGAGGGCATTCTGCCAGATCTGGTGACTTACACTGTATTAATTGATGGGTATGCT CGTTTGGGTTTGACACATCGTGCTTTTGATTTTCTCAAATGCATGGTCGATACTGGATGC AAGCCCTCCCTTTATATTGTTTCCATTTTAATCAAGAATCTTTCACATGAAAATCGGATG AAAGAAACAAGATCTGAAATAGGTATTGATTCTGTTTCAAATGTCAATTCTGTTGATATT GCTGATGTATGGAAGACATTGGAATATGAAATTGCTCTAAAGCTCTTTGAGAAAATGGTT GAGCATGGTTGCACAATAGATGTCAGTATATATGGAGCACTAATTGCAGGATTTTGCCAA CAGGAGCGATTGGAAGAAGCTCAGGGGTTAGTTCATCACATGAAAGAAAGAGGAATGTCC CCCAGTGAAGATATTTATAACTCTCTTCTTGACTGTTGCTGCAAGTTGGGGGTGTATGCT GAGGCAGTGAGGCTGGTGGATGCTATGGTAGAAAATGGTCTTTTACCACTTTTAGAGTCC TATAAGTTGCTTGTTTGTGGTTTGTACATAGAAGGCAGCAATGAAAAAGCCAAAGCAGTT TTCCATGGTCTGCTTTCTTGTGGGTATAACTATGATGAAGTAGCTTGGAAGGTTCTTATT GATGGCTTGCTTAAGAGGGACCTTGTTGACGAATGCTCTGAACTGATAGACATTATGGAG GAAAAGGGTTGCCAGCCTAATCCTCTAACATATTCATTGTTGATTGAGGGACTTGAAAGG ACATAGAATGATTGGACATAATATTTGCTCTGGATATTTTTTTTTCCTCATGAATGAGTT CTCAGCCGGTACTCTTCATGTCTGATGCAGACTCTTGCTATATGGGTACCACACCAGAAT CTTTTGGCATACAATTCTGGAATAAAATTTGTGCTTCATTGAAGAATGGAAGTGACCATG CAGAGCAATGATTTGAAAAGAGTGCTTCAATGCCTTCTTACAATGAGCAACAGCAGAGAT ATAGGGCAAGAAAATACAGTACTGAATTTGATGACGTTCTCAGTTTAACTGCTAAGAAGG AAAATATTCTGGATGGTGTCCAAGGAATAGTGAAATTTGCAGAGGAGTTTTTGGATCTTA TTGACTGCAGATGCTACTGCACAAGCAGACATTGCTTGTGCAGCTCTT