Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0049g02300.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:9961385:9962981:1 gene:VIT_05s0049g02300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTGCTCTAGCGATGTCTTGCCCGATGATTTTACTCTCTCGACACTTTCTAAAGTTTCG AGCGAGCTGGGGGCCTTATTTTCCGGCAAATCTATTCATGGGAAAAGTATACGAATAGGA TTTGTTTCCGATACTGTTGTTGCTAATTCGATAATGTCAATGTATTGCAAATGCGGGAAT TTTGAGGAATCCAGGAAGGTGTTTGATGAAATGACGATTAGAAATTCTGGTTCTTGGAAC GTTTTGATTGCTGGGTACGCAGTTTCAGGGAATTGTAATTTTCGTGAGGAAACTTGGGAA TTTGTTAAACAGATGCAGATGGATGAAGTGAGACCCGATGCCTATACCATTTCTAGTCTT CTTCCTTTGTGTGATGGGGACAAGGGGAAATGGGATTATGGGAGGGAGCTTCACTGTTAC ATTGTGAAAAATGAATTGGTATTGGGCCTGGATTCTGATGTTCACCTGGGGTGTTGTTTG ATAGACATGTATTCGAGGAGCAATAAAGTGGTTGTGGGTAGACGGGTCTTTGACAGGATG AAGTGTAGGAATGTCTTTTCTTGGACAGCAATGATCAATGGTTATGTGGAGAATGGAGAT TCAGATGAAGCTTTGAGTCTTTTTCGCGATATGCAGGTTATAGATGGAATAGAACCGAAT AGAGTGTCACTTGTCAGTGTTCTCCCTGCATGTAGCTCCTTTTCTGGTTTATTGAGTGGA AGACAAATACATGGATTTGCTGTTAGAAAGGAATTGAACAATGAAGTCTCTTTATGTAAT GCTCTCATCGATATGTATTCCAAGTGTGGGAGCTTGGATTCTGCAAGGCGTGTATTTGAG GATGACTCCTTATGTAAAGATGCAATCTCTTGGAGTTCAATGATTTCAGGATATGGATTG CATGGGAAGGGTCAAGAAGCCATTCTTCTGTATGATAAGATGCTCCAAGCTGGGATCAGA CCGGACATGATAACAACAGTGGGGATTCTTTCTGCTTGTAGCCGGTCAGGATTGGTAAAC GAAGGTCTTAACATCTACAGCTCAGTTATCAATGATTATGGAATTGAACCAACATTGGAG ATTTTTGCATGCATTGTTGATATGTTAGGTCGAGCAGGGCAGCTCGATCCAGCATTAGAT TTTATCAAAGCAATGCCTGTGGAACCTGGTCCTAGTGTGTGGGGAGCTCTGGTCAGTTGC TCCATCATTCATGGTGATCTTGAGATGCAAGAATTGGCATATAGGTTCCTTATTCAGCTA GAACCCGAGAACCCCTCCAACTATGTTTCCATATCAAATTTATATGCGTCTTCAAGGAGA TGGGATGCCGTGGCTGAAGTAAGAAGAATGATGAAAGATAAGAGATTGAGGAAGGTACCT GGGTGCAGTTGGATTAGCATCAATAACAAAACTCACTGTTTCTATGTTGCTGATAAAGCA CATCCATCTGCCACTTCAATCTACAACATGTTGGATGACCTCTTATTAACTATGAATGAT GCTATATGTTCTCCTCACCTTGAAACTTCAACATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0049g02300.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:9961385:9962981:1 gene:VIT_05s0049g02300 transcript:VIT_05s0049g02300.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MCSSDVLPDDFTLSTLSKVSSELGALFSGKSIHGKSIRIGFVSDTVVANSIMSMYCKCGN FEESRKVFDEMTIRNSGSWNVLIAGYAVSGNCNFREETWEFVKQMQMDEVRPDAYTISSL LPLCDGDKGKWDYGRELHCYIVKNELVLGLDSDVHLGCCLIDMYSRSNKVVVGRRVFDRM KCRNVFSWTAMINGYVENGDSDEALSLFRDMQVIDGIEPNRVSLVSVLPACSSFSGLLSG RQIHGFAVRKELNNEVSLCNALIDMYSKCGSLDSARRVFEDDSLCKDAISWSSMISGYGL HGKGQEAILLYDKMLQAGIRPDMITTVGILSACSRSGLVNEGLNIYSSVINDYGIEPTLE IFACIVDMLGRAGQLDPALDFIKAMPVEPGPSVWGALVSCSIIHGDLEMQELAYRFLIQL EPENPSNYVSISNLYASSRRWDAVAEVRRMMKDKRLRKVPGCSWISINNKTHCFYVADKA HPSATSIYNMLDDLLLTMNDAICSPHLETST

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0049g02300.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:9961385:9962981:1 gene:VIT_05s0049g02300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTGCTCTAGCGATGTCTTGCCCGATGATTTTACTCTCTCGACACTTTCTAAAGTTTCG AGCGAGCTGGGGGCCTTATTTTCCGGCAAATCTATTCATGGGAAAAGTATACGAATAGGA TTTGTTTCCGATACTGTTGTTGCTAATTCGATAATGTCAATGTATTGCAAATGCGGGAAT TTTGAGGAATCCAGGAAGGTGTTTGATGAAATGACGATTAGAAATTCTGGTTCTTGGAAC GTTTTGATTGCTGGGTACGCAGTTTCAGGGAATTGTAATTTTCGTGAGGAAACTTGGGAA TTTGTTAAACAGATGCAGATGGATGAAGTGAGACCCGATGCCTATACCATTTCTAGTCTT CTTCCTTTGTGTGATGGGGACAAGGGGAAATGGGATTATGGGAGGGAGCTTCACTGTTAC ATTGTGAAAAATGAATTGGTATTGGGCCTGGATTCTGATGTTCACCTGGGGTGTTGTTTG ATAGACATGTATTCGAGGAGCAATAAAGTGGTTGTGGGTAGACGGGTCTTTGACAGGATG AAGTGTAGGAATGTCTTTTCTTGGACAGCAATGATCAATGGTTATGTGGAGAATGGAGAT TCAGATGAAGCTTTGAGTCTTTTTCGCGATATGCAGGTTATAGATGGAATAGAACCGAAT AGAGTGTCACTTGTCAGTGTTCTCCCTGCATGTAGCTCCTTTTCTGGTTTATTGAGTGGA AGACAAATACATGGATTTGCTGTTAGAAAGGAATTGAACAATGAAGTCTCTTTATGTAAT GCTCTCATCGATATGTATTCCAAGTGTGGGAGCTTGGATTCTGCAAGGCGTGTATTTGAG GATGACTCCTTATGTAAAGATGCAATCTCTTGGAGTTCAATGATTTCAGGATATGGATTG CATGGGAAGGGTCAAGAAGCCATTCTTCTGTATGATAAGATGCTCCAAGCTGGGATCAGA CCGGACATGATAACAACAGTGGGGATTCTTTCTGCTTGTAGCCGGTCAGGATTGGTAAAC GAAGGTCTTAACATCTACAGCTCAGTTATCAATGATTATGGAATTGAACCAACATTGGAG ATTTTTGCATGCATTGTTGATATGTTAGGTCGAGCAGGGCAGCTCGATCCAGCATTAGAT TTTATCAAAGCAATGCCTGTGGAACCTGGTCCTAGTGTGTGGGGAGCTCTGGTCAGTTGC TCCATCATTCATGGTGATCTTGAGATGCAAGAATTGGCATATAGGTTCCTTATTCAGCTA GAACCCGAGAACCCCTCCAACTATGTTTCCATATCAAATTTATATGCGTCTTCAAGGAGA TGGGATGCCGTGGCTGAAGTAAGAAGAATGATGAAAGATAAGAGATTGAGGAAGGTACCT GGGTGCAGTTGGATTAGCATCAATAACAAAACTCACTGTTTCTATGTTGCTGATAAAGCA CATCCATCTGCCACTTCAATCTACAACATGTTGGATGACCTCTTATTAACTATGAATGAT GCTATATGTTCTCCTCACCTTGAAACTTCAACATAAACCTAGACATTGAAATATTCCCTG AGACAGGTTTGTTTGATCTTATTGTTTATAATCCTTT