Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0049g01660.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:9111201:9114889:-1 gene:VIT_05s0049g01660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTCAGATCAAGGCAAGTTATTCATCGGTGGGATTTCATGGGAAACCTCGGAAGAT AAGCTGAAGGAGTATTTTGGGAGCTACGGTGAGGTTTCTCAGGCGGTGGTGATGAGGGAC AAGGCCACTGGGAGGCCCAGAGGGTTTGGCTTTGTGGTCTTTGCAGATCCTTCGATTCTC GATAGGGTTCTTCAGGAAAAACACATCATCGATGGTAGAACGGTTGAAGCTAAGAGGGCC TTATCAAGAGAGGAGCAGCAAACCTCCTCTAGAGCTGGAAATTTTAATTCTGCAAGGAAC TCTGGAGGTGGTGGAAATGTAAAGACCAAGAAAATATTTGTTGGAGGGTTGCCTCCCACC CTGAGTGAAGAAGGATTTCGTCAGTATTTTGAAGCTTTTGGTCATGTGACTGATGTAGTA GTAATGTATGACCAGAGTACCCAGCGGCCTCGTGGGTTTGGATTTGTTTCCTTTGACACT GAAGATGCAGTTGATAGGGTTTTATACAAAACTTTTCATGATTTGAATGGTAAGCAAGTG GAAGTTAAGCGGGCCCTTCCTAAAGATGCCAACCCAGGTGGGGGAAGCCGTTCTATGGGT GGTGGTGCAGGTGCGGTTGCAGGAGGTTATCAGGGCTATGGTGCTTCTGGGGGTAACCCA ACTACATATGATGGTCGAATGGATTCCAATAGATACATGCAACCTCAGAATACAGGAGGT GGTTTTCCACCTTATGGTTCTTCTGGGTACAGTGCACCTGGCTATGGGTATGGTCCTGCC AATAATGGTATGGGATATGGTGGTTATGGTGGTTACGGTGGTGCCAATCCTGGATATGGA GGCCCTGCTGGTGCACCCTATGGAAACCCAAATGTCCCAAATGCTGGTTATGCAGGTGGA CCACCTGGTGCCCCTAGAAGTTCATGGAACTCTCAAGCACCCTCAGGATATGGTGGTGTG GGCTATGGAAATGCTGCTTCTTGGGGTTCAAGCGCTGGTGGTGGTGCTGGAAGTGGTGGT ACTGGTTCAGCATCTTCAGGTCAATCTCCTAGCGGAGCTGCTGGGTATGGAAATCAAAGT TATGGATATGGAGGGTATGGTGGAAGTGAGGGATCTTACGCAAATCCAACTGGTTATGGT GCTGTTGGAGGGCGTACTGGTAGTGGTCCAAATAGCAATGCTGGTGGGGGAGAGCTACAG GGGAGTGGTGGTGGCTACATGGGAGGTGGCTATGGTGATGCTAATGGGAATTCAGGATAT GGAAATGCAGCATGGAAATCTGATCCATCACAGGCTTCTGGAAATTATGGAGCTCAGACA AATGGTCCTCATGGTGGGCAAGTTGGCTATGGTGGTGGATATAGTGCTCAGTCCCGACAA GCCCAGCAGCAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0049g01660.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:9111201:9114889:-1 gene:VIT_05s0049g01660 transcript:VIT_05s0049g01660.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKEYFGSYGEVSQAVVMRDKATGRPRGFGFVVFADPSIL DRVLQEKHIIDGRTVEAKRALSREEQQTSSRAGNFNSARNSGGGGNVKTKKIFVGGLPPT LSEEGFRQYFEAFGHVTDVVVMYDQSTQRPRGFGFVSFDTEDAVDRVLYKTFHDLNGKQV EVKRALPKDANPGGGSRSMGGGAGAVAGGYQGYGASGGNPTTYDGRMDSNRYMQPQNTGG GFPPYGSSGYSAPGYGYGPANNGMGYGGYGGYGGANPGYGGPAGAPYGNPNVPNAGYAGG PPGAPRSSWNSQAPSGYGGVGYGNAASWGSSAGGGAGSGGTGSASSGQSPSGAAGYGNQS YGYGGYGGSEGSYANPTGYGAVGGRTGSGPNSNAGGGELQGSGGGYMGGGYGDANGNSGY GNAAWKSDPSQASGNYGAQTNGPHGGQVGYGGGYSAQSRQAQQQ

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0049g01660.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:9111201:9114889:-1 gene:VIT_05s0049g01660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TCCATATTTTCTCTCTCACTCGGCAGATAAATCCCTCCTTTTCTCCAAATCCACAAACCC TTACACCCATCCCTCCCAAATCCAAATCTCCCATTTTATTTTTTCAGAGAGATAACGTTA AGTTTTAGAGAGAGAGGAAGCTATGGATTCAGATCAAGGCAAGTTATTCATCGGTGGGAT TTCATGGGAAACCTCGGAAGATAAGCTGAAGGAGTATTTTGGGAGCTACGGTGAGGTTTC TCAGGCGGTGGTGATGAGGGACAAGGCCACTGGGAGGCCCAGAGGGTTTGGCTTTGTGGT CTTTGCAGATCCTTCGATTCTCGATAGGGTTCTTCAGGAAAAACACATCATCGATGGTAG AACGGTTGAAGCTAAGAGGGCCTTATCAAGAGAGGAGCAGCAAACCTCCTCTAGAGCTGG AAATTTTAATTCTGCAAGGAACTCTGGAGGTGGTGGAAATGTAAAGACCAAGAAAATATT TGTTGGAGGGTTGCCTCCCACCCTGAGTGAAGAAGGATTTCGTCAGTATTTTGAAGCTTT TGGTCATGTGACTGATGTAGTAGTAATGTATGACCAGAGTACCCAGCGGCCTCGTGGGTT TGGATTTGTTTCCTTTGACACTGAAGATGCAGTTGATAGGGTTTTATACAAAACTTTTCA TGATTTGAATGGTAAGCAAGTGGAAGTTAAGCGGGCCCTTCCTAAAGATGCCAACCCAGG TGGGGGAAGCCGTTCTATGGGTGGTGGTGCAGGTGCGGTTGCAGGAGGTTATCAGGGCTA TGGTGCTTCTGGGGGTAACCCAACTACATATGATGGTCGAATGGATTCCAATAGATACAT GCAACCTCAGAATACAGGAGGTGGTTTTCCACCTTATGGTTCTTCTGGGTACAGTGCACC TGGCTATGGGTATGGTCCTGCCAATAATGGTATGGGATATGGTGGTTATGGTGGTTACGG TGGTGCCAATCCTGGATATGGAGGCCCTGCTGGTGCACCCTATGGAAACCCAAATGTCCC AAATGCTGGTTATGCAGGTGGACCACCTGGTGCCCCTAGAAGTTCATGGAACTCTCAAGC ACCCTCAGGATATGGTGGTGTGGGCTATGGAAATGCTGCTTCTTGGGGTTCAAGCGCTGG TGGTGGTGCTGGAAGTGGTGGTACTGGTTCAGCATCTTCAGGTCAATCTCCTAGCGGAGC TGCTGGGTATGGAAATCAAAGTTATGGATATGGAGGGTATGGTGGAAGTGAGGGATCTTA CGCAAATCCAACTGGTTATGGTGCTGTTGGAGGGCGTACTGGTAGTGGTCCAAATAGCAA TGCTGGTGGGGGAGAGCTACAGGGGAGTGGTGGTGGCTACATGGGAGGTGGCTATGGTGA TGCTAATGGGAATTCAGGATATGGAAATGCAGCATGGAAATCTGATCCATCACAGGCTTC TGGAAATTATGGAGCTCAGACAAATGGTCCTCATGGTGGGCAAGTTGGCTATGGTGGTGG ATATAGTGCTCAGTCCCGACAAGCCCAGCAGCAGTAGTTTTGTTAACATCAGTTTCCAAC CGGTTCATCATCTTTGCAAATCCATTCCCCTTCCTTCTCATGTGGGTTATAATGGTTTCT TATTTCAAGCGGCAGAGGGGGTGGTCCTAGCAGGATGTCAAGCATGCTTTGGGACTGGTT GGATTGCTTGAAATCCCAGTAGTTTCCATAATATATTTTGCTAGTCTATAATGAGTACTA GTTTCAAGGAGTACTAGATGCCTCTTATTTCGTATTTTCTTTTGAGTGTAGTTTTAATGT TTGGCGTGCCTATAGTTGTCTCTACTCTCTACTAGCTGTTCTGGAGGTTTTCCTTTTATC TCGTAGTGTTTAAGCTATGCTAGCTTATAATAAATCTTATTTTTATGGAGAAATGCTGGA GTTCTGAAAGTGGGGTCAAGTGTCCACTCATGGCTGACAGGTGATTCCAAGCCAGGCCAT GACAACACTGTCAATTTCGTGGATTCTTGCCTTTTCAAGTCATCACAAAATATCCTAATC TTCATTCTCGTTTTGGTGGGTTGATGGATTTTTCTGAGGTGAACAGCCTG