Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0049g01270.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:8499367:8501424:1 gene:VIT_05s0049g01270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGTGAGCGGCAAAGGCTCGCGAAGCTGTTGAGGAACTGTTCCAAGAATGGGTTATTT GATCAAGGATTGCAAGTTCATGCAGCTGCGGTGAATATGGGATTTGGGTTTGATTTGATA ATGAACAATGATCTCATAGATATGTACGGAAAATGTAGCAGGGTTGACTTGGCCTGCTCT GTGTTTGATAGAATGCTTGAGAGAAATGTGGTGTCTTGGACTGCTCTCATGTGTGGTTAT TTACAGGAGGGTAATGCCAAAGGATCATTGGCTCTCTTGTGCGAAATGGGATATTCGGGT GTTAAGCCAAATGAATTCACTTTCTCCACCAGTCTTAAAGCTTGTGGAGCTTTGGGTGTC GTGGAGAATGGAATGCAGATTCATGGAATGTGTGTTAAAAGTGGGTTTGAATGGGTTTCT GTGGTGGGCAATGCTACCATTGACATGTACTCAAAATGTGGGAGAATTGGTATGGCGGAG CAGGTGTTCAATAAGATGCCTTTTAGGAATCTTGTAAGTTGGAATGCAATGATTGCGGGA CATACCCATGAAGGAAATGGCAGGAAATCTCTAGTTTTATTCCAGAGAATGCAAGGACAG GGGGAAGTCCCAGATGAATTCACATTTACAAGCACTTTAAAGGCTTGTGGTGCTCTTGGA GCAATCCGCGGAGGAACCCAAATTCATGCTTCCTTAATAACAAGGGGCTTTCCAATTTCC ATTCGTAATATTATTGCAAGTGCAATTGTTGATTTGTATGCAAAATGTGGGTACTTATTT GAAGCACAAAAAGTATTTGATCGAATTGAACAGAAGAATTTGATATCATGGTCTGCTCTA ATTCAAGGTTTTGCTCAAGAGGGAAACCTACTAGAGGCCATGGACTTGTTTAGACAACTA AGGGAGAGTGTCTCTAACGTCGATGGATTTGTTCTCTCAATCATGATGGGTGTCTTTGCT GATCTTGCTCTGGTAGAGCAAGGGAAGCAAATGCATTGCTACATCCTTAAAGTGCCATCT GGTTTGGACATTTCAGTAGCTAATTCAATCATTGATATGTACCTCAAGTGTGGGTTAACA GAAGAAGCAGAAAGGCTTTTCAGTGAAATGCAGGTGAGAAATGTAGTTTCTTGGACAGTT ATGATCACTGGGTATGGAAAGCATGGTCTTGGAGAAAAAGCCATTCATCTCTTCAACAGA ATGCAGTTAGATGGCATTGAACTGGATGAGGTGGCTTACTTGGCACTGCTCTCAGCCTGT AGCCATTCAGGACTAATAAGAGAAAGTCAAGAATACTTCTCAAGATTGTGTAACAACCAT CAAATGAAACCTAACATTGAGCATTATGCTTGCATGGTTGATATCCTTGGCCGTGCTGGT CAACTAAAAGAAGCAAAGAATCTAATAGAGAACATGAAGCTAAAACCAAATGAAGGTATA TGGCAGACATTGCTCAGTGCTTGTAGAGTACATGGCAACTTGGAAATAGGGAGAGAAGTA GGAGAGATTCTATTTAGGATGGACACTGATAATCCGGTCAATTATGTAATGATGTCCAAT ATTTATGCTGAGGCCGGCTACTGGAAAGAGTGTGAAAGAGTGAGAAAATTGGTTAAGGCA AAAGGGTTGAAGAAAGAAGCAGGACAGAGTTGGGTTGAGATTAACAAGGAGATCCATTTT TTCTATGGTGGAGATGACACGCACCCATTAACAGAGAAAATTCATGAGATGTTAAAGGAA ATGGAAAGAAGGGTGAAAGAAGAGGTGGGTTATGCTTATGGGTTGAGGTTTGCATTGCAT GATGTGGAGGAGGAGTCAAAGGAGGAAAACTTGAGAGTTCACAGTGAGAAGTTGGCAATT GGATTGGCATTGGTTTGCGATGGTATGGAAAAGAAGGGAGGAGTTATTCGCGTTTTCAAG AACTTGAGAGTTTGTGGGGATTGTCATGAGTTCATCAAGGGTTTATCAAAAATTTTGAAG AAGGTGTTTGTGGTGAGAGATGCTAATAGATTTCACAGGTTTGAGGATGGATTATGTTCC TGTGGAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0049g01270.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:8499367:8501424:1 gene:VIT_05s0049g01270 transcript:VIT_05s0049g01270.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSERQRLAKLLRNCSKNGLFDQGLQVHAAAVNMGFGFDLIMNNDLIDMYGKCSRVDLACS VFDRMLERNVVSWTALMCGYLQEGNAKGSLALLCEMGYSGVKPNEFTFSTSLKACGALGV VENGMQIHGMCVKSGFEWVSVVGNATIDMYSKCGRIGMAEQVFNKMPFRNLVSWNAMIAG HTHEGNGRKSLVLFQRMQGQGEVPDEFTFTSTLKACGALGAIRGGTQIHASLITRGFPIS IRNIIASAIVDLYAKCGYLFEAQKVFDRIEQKNLISWSALIQGFAQEGNLLEAMDLFRQL RESVSNVDGFVLSIMMGVFADLALVEQGKQMHCYILKVPSGLDISVANSIIDMYLKCGLT EEAERLFSEMQVRNVVSWTVMITGYGKHGLGEKAIHLFNRMQLDGIELDEVAYLALLSAC SHSGLIRESQEYFSRLCNNHQMKPNIEHYACMVDILGRAGQLKEAKNLIENMKLKPNEGI WQTLLSACRVHGNLEIGREVGEILFRMDTDNPVNYVMMSNIYAEAGYWKECERVRKLVKA KGLKKEAGQSWVEINKEIHFFYGGDDTHPLTEKIHEMLKEMERRVKEEVGYAYGLRFALH DVEEESKEENLRVHSEKLAIGLALVCDGMEKKGGVIRVFKNLRVCGDCHEFIKGLSKILK KVFVVRDANRFHRFEDGLCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0049g01270.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:8499367:8501424:1 gene:VIT_05s0049g01270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGTGAGCGGCAAAGGCTCGCGAAGCTGTTGAGGAACTGTTCCAAGAATGGGTTATTT GATCAAGGATTGCAAGTTCATGCAGCTGCGGTGAATATGGGATTTGGGTTTGATTTGATA ATGAACAATGATCTCATAGATATGTACGGAAAATGTAGCAGGGTTGACTTGGCCTGCTCT GTGTTTGATAGAATGCTTGAGAGAAATGTGGTGTCTTGGACTGCTCTCATGTGTGGTTAT TTACAGGAGGGTAATGCCAAAGGATCATTGGCTCTCTTGTGCGAAATGGGATATTCGGGT GTTAAGCCAAATGAATTCACTTTCTCCACCAGTCTTAAAGCTTGTGGAGCTTTGGGTGTC GTGGAGAATGGAATGCAGATTCATGGAATGTGTGTTAAAAGTGGGTTTGAATGGGTTTCT GTGGTGGGCAATGCTACCATTGACATGTACTCAAAATGTGGGAGAATTGGTATGGCGGAG CAGGTGTTCAATAAGATGCCTTTTAGGAATCTTGTAAGTTGGAATGCAATGATTGCGGGA CATACCCATGAAGGAAATGGCAGGAAATCTCTAGTTTTATTCCAGAGAATGCAAGGACAG GGGGAAGTCCCAGATGAATTCACATTTACAAGCACTTTAAAGGCTTGTGGTGCTCTTGGA GCAATCCGCGGAGGAACCCAAATTCATGCTTCCTTAATAACAAGGGGCTTTCCAATTTCC ATTCGTAATATTATTGCAAGTGCAATTGTTGATTTGTATGCAAAATGTGGGTACTTATTT GAAGCACAAAAAGTATTTGATCGAATTGAACAGAAGAATTTGATATCATGGTCTGCTCTA ATTCAAGGTTTTGCTCAAGAGGGAAACCTACTAGAGGCCATGGACTTGTTTAGACAACTA AGGGAGAGTGTCTCTAACGTCGATGGATTTGTTCTCTCAATCATGATGGGTGTCTTTGCT GATCTTGCTCTGGTAGAGCAAGGGAAGCAAATGCATTGCTACATCCTTAAAGTGCCATCT GGTTTGGACATTTCAGTAGCTAATTCAATCATTGATATGTACCTCAAGTGTGGGTTAACA GAAGAAGCAGAAAGGCTTTTCAGTGAAATGCAGGTGAGAAATGTAGTTTCTTGGACAGTT ATGATCACTGGGTATGGAAAGCATGGTCTTGGAGAAAAAGCCATTCATCTCTTCAACAGA ATGCAGTTAGATGGCATTGAACTGGATGAGGTGGCTTACTTGGCACTGCTCTCAGCCTGT AGCCATTCAGGACTAATAAGAGAAAGTCAAGAATACTTCTCAAGATTGTGTAACAACCAT CAAATGAAACCTAACATTGAGCATTATGCTTGCATGGTTGATATCCTTGGCCGTGCTGGT CAACTAAAAGAAGCAAAGAATCTAATAGAGAACATGAAGCTAAAACCAAATGAAGGTATA TGGCAGACATTGCTCAGTGCTTGTAGAGTACATGGCAACTTGGAAATAGGGAGAGAAGTA GGAGAGATTCTATTTAGGATGGACACTGATAATCCGGTCAATTATGTAATGATGTCCAAT ATTTATGCTGAGGCCGGCTACTGGAAAGAGTGTGAAAGAGTGAGAAAATTGGTTAAGGCA AAAGGGTTGAAGAAAGAAGCAGGACAGAGTTGGGTTGAGATTAACAAGGAGATCCATTTT TTCTATGGTGGAGATGACACGCACCCATTAACAGAGAAAATTCATGAGATGTTAAAGGAA ATGGAAAGAAGGGTGAAAGAAGAGGTGGGTTATGCTTATGGGTTGAGGTTTGCATTGCAT GATGTGGAGGAGGAGTCAAAGGAGGAAAACTTGAGAGTTCACAGTGAGAAGTTGGCAATT GGATTGGCATTGGTTTGCGATGGTATGGAAAAGAAGGGAGGAGTTATTCGCGTTTTCAAG AACTTGAGAGTTTGTGGGGATTGTCATGAGTTCATCAAGGGTTTATCAAAAATTTTGAAG AAGGTGTTTGTGGTGAGAGATGCTAATAGATTTCACAGGTTTGAGGATGGATTATGTTCC TGTGGAGATTATTGGTGA