Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0029g00490.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:15291833:15293125:-1 gene:VIT_05s0029g00490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGCAGCTATGCTTCCAACTACCTACGCTTACTGTCTTACACCAAGCTCTTGGCCTCT CACGTGAACCAGGGCCGCCACCACGATGCCCTCTCTCTCTTCCACCATATGCACGCCTCC TCCGCTCCCGCCCTCGATGCTTTCGTCTTCCCTCTCGCCCTCAAGTCCTGCGCCGCAGCC CACCGCCCCAATCTCGGCGCCGCCATTCACGCCCACGTCACTAAGTTCTCCCTCGTCTCC AACCCCTTCGTCGCCTGCGCTCTCGTTGACATGTATGGCAAGTGCGTATCTGTTTCTTCC GCGCGCCACCTGTTCGACGAAATTCCCCACCGAAATATCGTGGTTTGGAATGCTATGATT TCTATCTACACGCATTCGGGTCGTGTTGCTGATGCTTTGGGGTTGTTCGAAGTGATGGAT GTTGAGCCCAATGCGTCCACTTTCAATGCTATTATTTCGGGTTTGTCAGGGTTGGAGGAT GGATCATTTAAGGCGCTCTCGTTTTATAGGAGAATGGGAGAGGTCGGGTTGAAGCAGAAT TTGATCACGCTTCTTGCTTTGTTACCAGCTTGTGTGGATTTAGCGGCATTGACTTTGATT AAGGAAATTCATGGTTATGCAATTAGGAATGGTATTGACCCTCATCCCCATTTAAGGAGT TGCCTGGTGGAGGCCTATGGGCGATGTGGATGTATTGTGAATTCACAATGTGTGTTTCAG AGTATTAGTATGAGTGAAAGAGATGTGGTTGCATGGAGCAGCTTAATATCAGCTTATGCT CTACATGGGGATGCAAGAACTGCGCTGGAAACTTTTGAACAAATGGAAATGGCCAAAGTT CAGCCTGATGGGATCACTTTTCTTGGGGTTTTGAAGGCTTGTAGCCACGCTGGGTTAGCT GATGAGGCATTGGGGTACTTTGGGCGGATGTGTAAAGATTATGGCGTGGAAGCAAGTAGT GATCACTATTCGTGTGTGGTGGATGCTTTGAGTAGAGCAGGGAGGCTGTATGAAGCGTAT GAGATCATACAGGGAATGCCTGTGAAGTCTACTGCAAAAACCTGGGGGGCCCTTCTCGGG GCATGTCGGACATATGGAGAAGTGGAGCTTGCAGAGATTGCTGGGAGAGCTTTGTTTGAG TTAGAGCCTGACAATGCTGCCAATTATGTGCTGTTGGCTAGAATATATGCTAGTGTGGGC AGACATGAAGAGGCACAGAGAATGAGAAGGGAAATGAATGAGATGGGAGTGAAGGCAGCG CCTGGCAGTAGTTGGGTAGTGTATCAAGTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0029g00490.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:15291833:15293125:-1 gene:VIT_05s0029g00490 transcript:VIT_05s0029g00490.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGSYASNYLRLLSYTKLLASHVNQGRHHDALSLFHHMHASSAPALDAFVFPLALKSCAAA HRPNLGAAIHAHVTKFSLVSNPFVACALVDMYGKCVSVSSARHLFDEIPHRNIVVWNAMI SIYTHSGRVADALGLFEVMDVEPNASTFNAIISGLSGLEDGSFKALSFYRRMGEVGLKQN LITLLALLPACVDLAALTLIKEIHGYAIRNGIDPHPHLRSCLVEAYGRCGCIVNSQCVFQ SISMSERDVVAWSSLISAYALHGDARTALETFEQMEMAKVQPDGITFLGVLKACSHAGLA DEALGYFGRMCKDYGVEASSDHYSCVVDALSRAGRLYEAYEIIQGMPVKSTAKTWGALLG ACRTYGEVELAEIAGRALFELEPDNAANYVLLARIYASVGRHEEAQRMRREMNEMGVKAA PGSSWVVYQV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0029g00490.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:15291833:15293125:-1 gene:VIT_05s0029g00490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGCAGCTATGCTTCCAACTACCTACGCTTACTGTCTTACACCAAGCTCTTGGCCTCT CACGTGAACCAGGGCCGCCACCACGATGCCCTCTCTCTCTTCCACCATATGCACGCCTCC TCCGCTCCCGCCCTCGATGCTTTCGTCTTCCCTCTCGCCCTCAAGTCCTGCGCCGCAGCC CACCGCCCCAATCTCGGCGCCGCCATTCACGCCCACGTCACTAAGTTCTCCCTCGTCTCC AACCCCTTCGTCGCCTGCGCTCTCGTTGACATGTATGGCAAGTGCGTATCTGTTTCTTCC GCGCGCCACCTGTTCGACGAAATTCCCCACCGAAATATCGTGGTTTGGAATGCTATGATT TCTATCTACACGCATTCGGGTCGTGTTGCTGATGCTTTGGGGTTGTTCGAAGTGATGGAT GTTGAGCCCAATGCGTCCACTTTCAATGCTATTATTTCGGGTTTGTCAGGGTTGGAGGAT GGATCATTTAAGGCGCTCTCGTTTTATAGGAGAATGGGAGAGGTCGGGTTGAAGCAGAAT TTGATCACGCTTCTTGCTTTGTTACCAGCTTGTGTGGATTTAGCGGCATTGACTTTGATT AAGGAAATTCATGGTTATGCAATTAGGAATGGTATTGACCCTCATCCCCATTTAAGGAGT TGCCTGGTGGAGGCCTATGGGCGATGTGGATGTATTGTGAATTCACAATGTGTGTTTCAG AGTATTAGTATGAGTGAAAGAGATGTGGTTGCATGGAGCAGCTTAATATCAGCTTATGCT CTACATGGGGATGCAAGAACTGCGCTGGAAACTTTTGAACAAATGGAAATGGCCAAAGTT CAGCCTGATGGGATCACTTTTCTTGGGGTTTTGAAGGCTTGTAGCCACGCTGGGTTAGCT GATGAGGCATTGGGGTACTTTGGGCGGATGTGTAAAGATTATGGCGTGGAAGCAAGTAGT GATCACTATTCGTGTGTGGTGGATGCTTTGAGTAGAGCAGGGAGGCTGTATGAAGCGTAT GAGATCATACAGGGAATGCCTGTGAAGTCTACTGCAAAAACCTGGGGGGCCCTTCTCGGG GCATGTCGGACATATGGAGAAGTGGAGCTTGCAGAGATTGCTGGGAGAGCTTTGTTTGAG TTAGAGCCTGACAATGCTGCCAATTATGTGCTGTTGGCTAGAATATATGCTAGTGTGGGC AGACATGAAGAGGCACAGAGAATGAGAAGGGAAATGAATGAGATGGGAGTGAAGGCAGCG CCTGGCAGTAGTTGGGTAGTGTATCAAGTCTGA