Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g04660.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:6530595:6532523:1 gene:VIT_05s0020g04660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAATCCTCCTATTTTGCATATCATCCACAACTGCAAAACTCTCAAATCCTTGAAATCC ATCCATGCCCGTCTTTTGATCGAAAGCTCAGTTGCTTCCTCGGAGTTTGTTATCAACAAA CTTCTCCGTCTCTACTCACGCTTTGGAGCCACTGACTACGCCCATAAGGTTTTTGATGAA ATTACTCAGCCAAATGCTTATCTATGGACATCCTTGATTCATGGGTATGTTGAAAATCGT CAATATGATGAAGCTTTTTCTCTGTTTATCCAAATGCGGAGGGAACCCATCTCAGTTTTG AATTTCACTATTTCTTCTGTGCTCAAGGCTCTTGCCCGGCTTACAAGATTCAAAGGTGGG CAAGCTGTTTATGGGTTTGTCTTGAAATATGGATTTGCTTTTGATTTGATTGTGCAGAAT TCAGTGCTTGATCTGTTCATGAGATGCAGGAAAGTGGATACTGCAAGGCAGGCATTCGAT GAGATGTGCGAGAAGGATATTGTGTCTTGGAATATGATGATTTCTGGTTATGGGAATAAT GACAGAGTTGATATTGCGCGCAAGTTTTTTGATAGAATGCCAGAGAGGAATGTGGTTTCA TGGACTAGCATGATTTGTGGATATGTTAAGGCTGGTGACATGGCAGAGGCACAGGTTCTT TTTGATTCAATGCCTGTCAAAGACTTGGCATCATGGAATGTGATGGTTTCTGGGTACATG GATATTGGTGATTGTGTGAATGCTAGGATAATTTTTGGGAAAATGCCCATTCATGATACT GGGAGTTGGAATATAATGATTTCAGGATTCTGTAAAGCAGGGGAATTAGAATCTGCAAAA GACTTTTTTGATAGAATGCCAAATAAAAATGTTATATCTTGGGGTATTATGCTAGATGGA TACATTAAAAACGGAGATACTAATGGTGCAAGATGTTTATTTGATCAGATGCCCATGAAG AATCTCGTCACTTGGTCTACCATGATTGGAGGTTATGCTAGAAATGGACAGCCTCTTAAG GCTTTGGAATTGTTTGAACGGTTCAAGGAGCAGGACATCAAGCCAGATGAGACTTTTATT TTGGGAATCATCTCAGCTTGCTCGCAGTTGGGGATTATAGATGCAGCTGAATCGATTATT CACAACTATGTGGGGCCCTCACTTCTTTCTGATCTGAGAGTTTTCACTAGTTTGATAGAC ATGTATGCAAAATGTGGCAGCATTGAAAAGGCTCTGCAAATGTTTGAAATGGCTCACCCA AAAGACTTACTATGCTATAGCACAATGATTGCAGCCTTGGCAAATCATGGATTGGGCCGT GATGCTATTTTCTTGTTTGATAAAATGCAAAGGGCAAATATAAAACCTGATAGTGTGACT TTTCTTGGAGTTCTGACTGCTTGTAATCATGGAGGCCTTGTTGATGAAGGCAGGAAGTAC TTTAAACAAATGACTGAAGAATTTGGAATTCAACCCTCAGAAAAGCATTATGCATGTGTG GTTGATCTTCTGGGTCGTGTTGGATGCCTTGAGGAGGCATATAACCTTATACGTAATATG CCAATAGCACCACATTCGGTTGTATGGGGTGCTTTGCTTGCAGCTTGTAGGGTCCACTGC AATGTTCAGCTGGCTGAAGTTGCAGCAGCTGAGTTATTCAAGATTGAACCAGATAACTCT GGTAATTATATTCTTTTATCCAATATTTATGCTGCTGCTGGAAGATGGGGCAGTGTTGCT AAAGTGAGAGCAAAGATTAGGGAGCATCGGGTGAGAAAGAATAGAGGCTCAAGCTGGATT GAGTTGAGCCATGTAGTTCATGAGTTTGTTATGGGAGATATGTCACATACAGATTCAGAT AGCATATCGTTGATCTTGTATTTACTCTGTGAAGATATGAAACTTTCAGGATATTTAATT GACTCCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g04660.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:6530595:6532523:1 gene:VIT_05s0020g04660 transcript:VIT_05s0020g04660.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MNPPILHIIHNCKTLKSLKSIHARLLIESSVASSEFVINKLLRLYSRFGATDYAHKVFDE ITQPNAYLWTSLIHGYVENRQYDEAFSLFIQMRREPISVLNFTISSVLKALARLTRFKGG QAVYGFVLKYGFAFDLIVQNSVLDLFMRCRKVDTARQAFDEMCEKDIVSWNMMISGYGNN DRVDIARKFFDRMPERNVVSWTSMICGYVKAGDMAEAQVLFDSMPVKDLASWNVMVSGYM DIGDCVNARIIFGKMPIHDTGSWNIMISGFCKAGELESAKDFFDRMPNKNVISWGIMLDG YIKNGDTNGARCLFDQMPMKNLVTWSTMIGGYARNGQPLKALELFERFKEQDIKPDETFI LGIISACSQLGIIDAAESIIHNYVGPSLLSDLRVFTSLIDMYAKCGSIEKALQMFEMAHP KDLLCYSTMIAALANHGLGRDAIFLFDKMQRANIKPDSVTFLGVLTACNHGGLVDEGRKY FKQMTEEFGIQPSEKHYACVVDLLGRVGCLEEAYNLIRNMPIAPHSVVWGALLAACRVHC NVQLAEVAAAELFKIEPDNSGNYILLSNIYAAAGRWGSVAKVRAKIREHRVRKNRGSSWI ELSHVVHEFVMGDMSHTDSDSISLILYLLCEDMKLSGYLIDS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g04660.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:6530595:6532523:1 gene:VIT_05s0020g04660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAATCCTCCTATTTTGCATATCATCCACAACTGCAAAACTCTCAAATCCTTGAAATCC ATCCATGCCCGTCTTTTGATCGAAAGCTCAGTTGCTTCCTCGGAGTTTGTTATCAACAAA CTTCTCCGTCTCTACTCACGCTTTGGAGCCACTGACTACGCCCATAAGGTTTTTGATGAA ATTACTCAGCCAAATGCTTATCTATGGACATCCTTGATTCATGGGTATGTTGAAAATCGT CAATATGATGAAGCTTTTTCTCTGTTTATCCAAATGCGGAGGGAACCCATCTCAGTTTTG AATTTCACTATTTCTTCTGTGCTCAAGGCTCTTGCCCGGCTTACAAGATTCAAAGGTGGG CAAGCTGTTTATGGGTTTGTCTTGAAATATGGATTTGCTTTTGATTTGATTGTGCAGAAT TCAGTGCTTGATCTGTTCATGAGATGCAGGAAAGTGGATACTGCAAGGCAGGCATTCGAT GAGATGTGCGAGAAGGATATTGTGTCTTGGAATATGATGATTTCTGGTTATGGGAATAAT GACAGAGTTGATATTGCGCGCAAGTTTTTTGATAGAATGCCAGAGAGGAATGTGGTTTCA TGGACTAGCATGATTTGTGGATATGTTAAGGCTGGTGACATGGCAGAGGCACAGGTTCTT TTTGATTCAATGCCTGTCAAAGACTTGGCATCATGGAATGTGATGGTTTCTGGGTACATG GATATTGGTGATTGTGTGAATGCTAGGATAATTTTTGGGAAAATGCCCATTCATGATACT GGGAGTTGGAATATAATGATTTCAGGATTCTGTAAAGCAGGGGAATTAGAATCTGCAAAA GACTTTTTTGATAGAATGCCAAATAAAAATGTTATATCTTGGGGTATTATGCTAGATGGA TACATTAAAAACGGAGATACTAATGGTGCAAGATGTTTATTTGATCAGATGCCCATGAAG AATCTCGTCACTTGGTCTACCATGATTGGAGGTTATGCTAGAAATGGACAGCCTCTTAAG GCTTTGGAATTGTTTGAACGGTTCAAGGAGCAGGACATCAAGCCAGATGAGACTTTTATT TTGGGAATCATCTCAGCTTGCTCGCAGTTGGGGATTATAGATGCAGCTGAATCGATTATT CACAACTATGTGGGGCCCTCACTTCTTTCTGATCTGAGAGTTTTCACTAGTTTGATAGAC ATGTATGCAAAATGTGGCAGCATTGAAAAGGCTCTGCAAATGTTTGAAATGGCTCACCCA AAAGACTTACTATGCTATAGCACAATGATTGCAGCCTTGGCAAATCATGGATTGGGCCGT GATGCTATTTTCTTGTTTGATAAAATGCAAAGGGCAAATATAAAACCTGATAGTGTGACT TTTCTTGGAGTTCTGACTGCTTGTAATCATGGAGGCCTTGTTGATGAAGGCAGGAAGTAC TTTAAACAAATGACTGAAGAATTTGGAATTCAACCCTCAGAAAAGCATTATGCATGTGTG GTTGATCTTCTGGGTCGTGTTGGATGCCTTGAGGAGGCATATAACCTTATACGTAATATG CCAATAGCACCACATTCGGTTGTATGGGGTGCTTTGCTTGCAGCTTGTAGGGTCCACTGC AATGTTCAGCTGGCTGAAGTTGCAGCAGCTGAGTTATTCAAGATTGAACCAGATAACTCT GGTAATTATATTCTTTTATCCAATATTTATGCTGCTGCTGGAAGATGGGGCAGTGTTGCT AAAGTGAGAGCAAAGATTAGGGAGCATCGGGTGAGAAAGAATAGAGGCTCAAGCTGGATT GAGTTGAGCCATGTAGTTCATGAGTTTGTTATGGGAGATATGTCACATACAGATTCAGAT AGCATATCGTTGATCTTGTATTTACTCTGTGAAGATATGAAACTTTCAGGATATTTAATT GACTCCTGA