Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_05s0020g03830.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:5:5503547:5505344:-1 gene:VIT_05s0020g03830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGTATAAAGGTAATAATCTTCTTCTCAATGCGCTCCATTACTTGTCACTTAATCCTTTC
TGCACCACGACTGGGTCACCCACTACGGCCGAGTCACCCGAGCTTCCGGACTGGGTCAAA
TTCTCTCAGAATAACAACCCTGCTGGCTCAGATTCTGATGATGATTTCGTGATTCCTAAA
CTTGCTTATTGGGCGGAGAATCAAAAGCATGATCATCGCAGTAAAGTTGATGGGTACGTG
CTAAAGGAGACTATTGACAGTGATATCGATAAAATTAGTGAACTTCTCAAGTTTAGGCAC
TCCTCGGCTGATGCTGTTGTCCAAGCTCTAGGTGGGTGTGGCGTGAGTGTATCCGAAAGC
TTGGTTGAGCAAGTTTTGAAGAGATTCAGCAATGATTGGATCCCGGCTTTTGGGTTTTTC
AAGTGGGCAAAAGCTCAAACGGGTTATAGGCATTCTATGAATTCCTACAACTCAATGGTT
GACATCTTAGGGAAGTTGAAGAAGTTTGATCTTATGTGGGAGTTGGTGGAGGAGATGGAT
CGATTGGGGGGATATGTTTCCTTGGCCACAATGACTAAGGTCATGAGAAGGCTTGCAAGG
GCGAGTCGGTGGAAGGATGCCATAGAGGCATTTCGAGGAATGGAGAGGTTTGGCGTGAAG
AAGGACACATTGGCGATGAATACACTTATGGATGCCCTGGTTAAGGAGAATAGCGTTGAG
CATGCTAATGATGTGTTTGTAGAGTTCAAGGATTCAATTCTTTTGAACCCTCATACTTTC
AATGTATTGATTCATGGTTGGTGCAAAGCTAGGAAGATGGATAATGCCCTGAAGTCTATG
GCAGAGATGAAGGAACATGGGTTCTGCCCAGATGTGATTTCTTACACGTCCATTGTGGAA
GCTTACTGTCGCGAGAAAGATTTTCGCAAAGTCAATTCTGTACTAAATGAGATGGAGGAA
AAGGGGTGTCCCCCAAATGTAGTGACATACACCATTGTTATGCATGCTTTGGGCAAGGGA
AAGGAAATATCTAAAGCTTTGGAGGTGTATGAGAAGATGAAGGGAAGCAGTTGTGTTCCT
GATACTTCATTTTACAGTTCCTTGATTTACATACTAAGCAAAGCAGGTAGGCTTAAGGAT
GCTCGGGATGTATTTGAGGACATGACAAAGCAGGGTGCAATCCCAGATGTGTTGACATAT
AATACCATGATCTCTGCTGCCTGCATGCATTCCCAGGAAGAAGATGCCTTGAAGCTGCTT
CTGAAAATGGAAGAAAGTTCCTGCAAGCCTGATCTTAATACTTACTCCCCTTTACTGAAA
ATGTGCTGCAGAAACAACAGAATGAAGGTGCTTTCAGCATTGTTGAACCACATGTTTAAG
AACGACATAAGTCTTGAAGTTGGAACCTATTCTCTCTTGGTGCATGGACTGTGTAAGAGT
GGGAAACTTGAACATGCTTGCTTGTTTTTTGAGGAAATGGTGTCAAAGGGATTGGTTCCT
AAGGACTGTACCCACAAGTTGTTGCTGAAAGAGCTTGAAAAGAAGAGTATGGTAGAAGCC
AAGGAAAGGGTTGAAAAGTTGATGTCACAGGCAAGACAACAAGGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_05s0020g03830.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:5:5503547:5505344:-1 gene:VIT_05s0020g03830 transcript:VIT_05s0020g03830.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MYKGNNLLLNALHYLSLNPFCTTTGSPTTAESPELPDWVKFSQNNNPAGSDSDDDFVIPK
LAYWAENQKHDHRSKVDGYVLKETIDSDIDKISELLKFRHSSADAVVQALGGCGVSVSES
LVEQVLKRFSNDWIPAFGFFKWAKAQTGYRHSMNSYNSMVDILGKLKKFDLMWELVEEMD
RLGGYVSLATMTKVMRRLARASRWKDAIEAFRGMERFGVKKDTLAMNTLMDALVKENSVE
HANDVFVEFKDSILLNPHTFNVLIHGWCKARKMDNALKSMAEMKEHGFCPDVISYTSIVE
AYCREKDFRKVNSVLNEMEEKGCPPNVVTYTIVMHALGKGKEISKALEVYEKMKGSSCVP
DTSFYSSLIYILSKAGRLKDARDVFEDMTKQGAIPDVLTYNTMISAACMHSQEEDALKLL
LKMEESSCKPDLNTYSPLLKMCCRNNRMKVLSALLNHMFKNDISLEVGTYSLLVHGLCKS
GKLEHACLFFEEMVSKGLVPKDCTHKLLLKELEKKSMVEAKERVEKLMSQARQQG

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_05s0020g03830.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:5:5503547:5505344:-1 gene:VIT_05s0020g03830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGTATAAAGGTAATAATCTTCTTCTCAATGCGCTCCATTACTTGTCACTTAATCCTTTC
TGCACCACGACTGGGTCACCCACTACGGCCGAGTCACCCGAGCTTCCGGACTGGGTCAAA
TTCTCTCAGAATAACAACCCTGCTGGCTCAGATTCTGATGATGATTTCGTGATTCCTAAA
CTTGCTTATTGGGCGGAGAATCAAAAGCATGATCATCGCAGTAAAGTTGATGGGTACGTG
CTAAAGGAGACTATTGACAGTGATATCGATAAAATTAGTGAACTTCTCAAGTTTAGGCAC
TCCTCGGCTGATGCTGTTGTCCAAGCTCTAGGTGGGTGTGGCGTGAGTGTATCCGAAAGC
TTGGTTGAGCAAGTTTTGAAGAGATTCAGCAATGATTGGATCCCGGCTTTTGGGTTTTTC
AAGTGGGCAAAAGCTCAAACGGGTTATAGGCATTCTATGAATTCCTACAACTCAATGGTT
GACATCTTAGGGAAGTTGAAGAAGTTTGATCTTATGTGGGAGTTGGTGGAGGAGATGGAT
CGATTGGGGGGATATGTTTCCTTGGCCACAATGACTAAGGTCATGAGAAGGCTTGCAAGG
GCGAGTCGGTGGAAGGATGCCATAGAGGCATTTCGAGGAATGGAGAGGTTTGGCGTGAAG
AAGGACACATTGGCGATGAATACACTTATGGATGCCCTGGTTAAGGAGAATAGCGTTGAG
CATGCTAATGATGTGTTTGTAGAGTTCAAGGATTCAATTCTTTTGAACCCTCATACTTTC
AATGTATTGATTCATGGTTGGTGCAAAGCTAGGAAGATGGATAATGCCCTGAAGTCTATG
GCAGAGATGAAGGAACATGGGTTCTGCCCAGATGTGATTTCTTACACGTCCATTGTGGAA
GCTTACTGTCGCGAGAAAGATTTTCGCAAAGTCAATTCTGTACTAAATGAGATGGAGGAA
AAGGGGTGTCCCCCAAATGTAGTGACATACACCATTGTTATGCATGCTTTGGGCAAGGGA
AAGGAAATATCTAAAGCTTTGGAGGTGTATGAGAAGATGAAGGGAAGCAGTTGTGTTCCT
GATACTTCATTTTACAGTTCCTTGATTTACATACTAAGCAAAGCAGGTAGGCTTAAGGAT
GCTCGGGATGTATTTGAGGACATGACAAAGCAGGGTGCAATCCCAGATGTGTTGACATAT
AATACCATGATCTCTGCTGCCTGCATGCATTCCCAGGAAGAAGATGCCTTGAAGCTGCTT
CTGAAAATGGAAGAAAGTTCCTGCAAGCCTGATCTTAATACTTACTCCCCTTTACTGAAA
ATGTGCTGCAGAAACAACAGAATGAAGGTGCTTTCAGCATTGTTGAACCACATGTTTAAG
AACGACATAAGTCTTGAAGTTGGAACCTATTCTCTCTTGGTGCATGGACTGTGTAAGAGT
GGGAAACTTGAACATGCTTGCTTGTTTTTTGAGGAAATGGTGTCAAAGGGATTGGTTCCT
AAGGACTGTACCCACAAGTTGTTGCTGAAAGAGCTTGAAAAGAAGAGTATGGTAGAAGCC
AAGGAAAGGGTTGAAAAGTTGATGTCACAGGCAAGACAACAAGGATGACTGTTGAGATTT
AGGATGCATCCCTTGATCCATCACTTTTCTTTACTCTTTTTCTTTCTGGGCATGGGTCAT
TTTGTGTAATGGTTTTGTTAGTTTCCAAGACATTGCTAATGGCAAAAGCAACTCTCCGCA
GTACATCATGTTGGAGAGATCGGCTATTAGGGGGAGCATGATATTCAGATGATAAAAT