Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_05s0020g03660.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:5:5364133:5383593:-1 gene:VIT_05s0020g03660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCTCCATTAACTTCAACTCCAGTCTCATTATTACCCTTCCAAAACCCATTTTTGCCC
TTGCTCTCCCTCTCTCCCATCCTCTCACAGATCCATCGGAAACCGGCTACGTTCCTCGCC
GGAATCCACGGGATCACTCATCGGAAAACACGTCGTAAACCGCCGGAAAAGAGCATGTCT
GTCAGCGTTCAGATGCCAACTCCATCACACCGGCGGGACAGGGACGACGACACTGATGTG
GATTCTAGAAATTGTGCAGGGAAAGGGGACATGCTAACAACAAATATGGAAGGAGAGACC
TGCTCACATAGTCAAGTTGCTCCACGGAAGAACAGATATCTTATGAGCAATGTCAAGTGC
TTTGGGGTGGACCTGTCCCCTGATAATGTTGCCGTTGCCATGGTATATTTTGTCCAAGGT
GTTTTAGGCCTTTCTAGGCTTGCTGTCAGTTTTTATTTAAAAGATGATCTGCATCTAGAT
CCTGCAGAGACTGCTGTGATATCTGGTTTCTCTGCACTACCATGGCTTGTCAAACCTCTT
TATGGGTTTATTAGCGATTCTTTACCACTTTTTGGTTATCGAAGAAGGTCATACTTGGTT
CTATCAGGGCTTCTTGGAGCACTCTCATGGAGTTTGATGGCCACTTTTGTGGACAGCAAG
TATGGTGCCGCTTTCTGTATACTTCTTGGTTCTCTTTCTGTTGCCTTCTCAGATGTTGTT
GTAGATTCCATGGTTGTAGAGAGGGCTCGGGGTGAGTCACAAAGCATGTCAGGATCGCTT
CAGTCTTTATGCTGGGGATCCTCTGCTTTTGGTGGAATAGTGAGCTCCTACTTTAGTGGC
TCCCTGGTGGGTGCTTATGGTGTAAGGTTTGTTTTCGGTGTCACGGCATTGCTACCTCTG
ATAACATCTGCTGTCGCTATTCTTGTTAAAGAACAGCCTGTGGCTGGTCCAGCAAGGGGA
CAGGCTTTTCCTTTGATCAGTCCTAGCTTTTATGAGAGCTCAAAACAGAACATTATTCAG
TTGTGGGATGCTGTCAGGCAGCGTAATATATTTCTTCCCACCTTATTCATTTTCCTCTGG
CAGGCAACACCACACTCGGACTCTGCCATGTTTTACTTTACCACAAATAGACTTGGTTTC
ACCCCAGAATTTTTAGGACGTGTCAAGCTTGTTACTTCGGTGGCATCACTAATTGGTGTT
GGACTGTATAATGGGTTTTTGAAAGATGTTCCATTGCGGAAGATTTTTTTTGTAACTACA
ATTTTTGGCTCAGCTCTTGGGATGACCCAGGTTTTTCTAGTCACTGGATTAAACAGGAAG
TTTGGTATAAGTGATGAATGGTTCTCCATTGGGGATTCTTTGATTCTAACTGTTCTTGGT
CAGGCTTCATTCATGCCTGTTCTTGTTTTAGCAGCAAGATTATGTCCACAGGGGATGGAA
GCAACTCTTTTTGCAACCCTTATGTCCATTTCAAATGGAGGAAGTGTTGTGGGGGGGCTG
GTGGGTGCTGGTCTGACCCAGCTGTTTGGTGTCACCAAGGATAGCTTTGATAATTTAACT
TTTTTGATAATCCTCTGCAATCTCAGCTCTCTGTTGCCATTGCCACTCCTTGGCCTCCTT
CCTCAAGACAACCCTGATGATGCTTCTACAAAGGAGACTGAAGATATCGAGATGAAGTGT
AATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_05s0020g03660.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:5:5364133:5383593:-1 gene:VIT_05s0020g03660 transcript:VIT_05s0020g03660.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MAPLTSTPVSLLPFQNPFLPLLSLSPILSQIHRKPATFLAGIHGITHRKTRRKPPEKSMS
VSVQMPTPSHRRDRDDDTDVDSRNCAGKGDMLTTNMEGETCSHSQVAPRKNRYLMSNVKC
FGVDLSPDNVAVAMVYFVQGVLGLSRLAVSFYLKDDLHLDPAETAVISGFSALPWLVKPL
YGFISDSLPLFGYRRRSYLVLSGLLGALSWSLMATFVDSKYGAAFCILLGSLSVAFSDVV
VDSMVVERARGESQSMSGSLQSLCWGSSAFGGIVSSYFSGSLVGAYGVRFVFGVTALLPL
ITSAVAILVKEQPVAGPARGQAFPLISPSFYESSKQNIIQLWDAVRQRNIFLPTLFIFLW
QATPHSDSAMFYFTTNRLGFTPEFLGRVKLVTSVASLIGVGLYNGFLKDVPLRKIFFVTT
IFGSALGMTQVFLVTGLNRKFGISDEWFSIGDSLILTVLGQASFMPVLVLAARLCPQGME
ATLFATLMSISNGGSVVGGLVGAGLTQLFGVTKDSFDNLTFLIILCNLSSLLPLPLLGLL
PQDNPDDASTKETEDIEMKCN

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_05s0020g03660.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:5:5364133:5383593:-1 gene:VIT_05s0020g03660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCTCCATTAACTTCAACTCCAGTCTCATTATTACCCTTCCAAAACCCATTTTTGCCC
TTGCTCTCCCTCTCTCCCATCCTCTCACAGATCCATCGGAAACCGGCTACGTTCCTCGCC
GGAATCCACGGGATCACTCATCGGAAAACACGTCGTAAACCGCCGGAAAAGAGCATGTCT
GTCAGCGTTCAGATGCCAACTCCATCACACCGGCGGGACAGGGACGACGACACTGATGTG
GATTCTAGAAATTGTGCAGGGAAAGGGGACATGCTAACAACAAATATGGAAGGAGAGACC
TGCTCACATAGTCAAGTTGCTCCACGGAAGAACAGATATCTTATGAGCAATGTCAAGTGC
TTTGGGGTGGACCTGTCCCCTGATAATGTTGCCGTTGCCATGGTATATTTTGTCCAAGGT
GTTTTAGGCCTTTCTAGGCTTGCTGTCAGTTTTTATTTAAAAGATGATCTGCATCTAGAT
CCTGCAGAGACTGCTGTGATATCTGGTTTCTCTGCACTACCATGGCTTGTCAAACCTCTT
TATGGGTTTATTAGCGATTCTTTACCACTTTTTGGTTATCGAAGAAGGTCATACTTGGTT
CTATCAGGGCTTCTTGGAGCACTCTCATGGAGTTTGATGGCCACTTTTGTGGACAGCAAG
TATGGTGCCGCTTTCTGTATACTTCTTGGTTCTCTTTCTGTTGCCTTCTCAGATGTTGTT
GTAGATTCCATGGTTGTAGAGAGGGCTCGGGGTGAGTCACAAAGCATGTCAGGATCGCTT
CAGTCTTTATGCTGGGGATCCTCTGCTTTTGGTGGAATAGTGAGCTCCTACTTTAGTGGC
TCCCTGGTGGGTGCTTATGGTGTAAGGTTTGTTTTCGGTGTCACGGCATTGCTACCTCTG
ATAACATCTGCTGTCGCTATTCTTGTTAAAGAACAGCCTGTGGCTGGTCCAGCAAGGGGA
CAGGCTTTTCCTTTGATCAGTCCTAGCTTTTATGAGAGCTCAAAACAGAACATTATTCAG
TTGTGGGATGCTGTCAGGCAGCGTAATATATTTCTTCCCACCTTATTCATTTTCCTCTGG
CAGGCAACACCACACTCGGACTCTGCCATGTTTTACTTTACCACAAATAGACTTGGTTTC
ACCCCAGAATTTTTAGGACGTGTCAAGCTTGTTACTTCGGTGGCATCACTAATTGGTGTT
GGACTGTATAATGGGTTTTTGAAAGATGTTCCATTGCGGAAGATTTTTTTTGTAACTACA
ATTTTTGGCTCAGCTCTTGGGATGACCCAGGTTTTTCTAGTCACTGGATTAAACAGGAAG
TTTGGTATAAGTGATGAATGGTTCTCCATTGGGGATTCTTTGATTCTAACTGTTCTTGGT
CAGGCTTCATTCATGCCTGTTCTTGTTTTAGCAGCAAGATTATGTCCACAGGGGATGGAA
GCAACTCTTTTTGCAACCCTTATGTCCATTTCAAATGGAGGAAGTGTTGTGGGGGGGCTG
GTGGGTGCTGGTCTGACCCAGCTGTTTGGTGTCACCAAGGATAGCTTTGATAATTTAACT
TTTTTGATAATCCTCTGCAATCTCAGCTCTCTGTTGCCATTGCCACTCCTTGGCCTCCTT
CCTCAAGACAACCCTGATGATGCTTCTACAAAGGAGACTGAAGATATCGAGATGAAGTGT
AATTGAATTTGAATTTTGTTGTCATCCACATTATTCAAACTTACCTGCTTCACTCTTCAA
GGGATCTTTTAGAGCCTCATTGTACCAAAATTTTGAGCTTGGTTAGCTGGAGGTTACAAA
AGTAACAGAGAGAATTTTACTTGTAAATAACACAATGTCCCATTTTGAAAGCACATGCTA
TTTGAGTTTGGAACTTGACTACTGTTGTAACTCTTCAGACAAAAAGGCAGCATTTTTTGT
CCATGTACTAAGCTCA