Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g03630.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:5347809:5350548:1 gene:VIT_05s0020g03630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTCGCAGACTGCCTTAGCACTCCCTCCTAACCCAAACCCCGCCACACCCACCACCCTC CACAGCCACCACACCCTCTTCTCAGCTCTCTCCTCCGCTACCTCTCTTACCCACCTTAAA CAAGTCCACGCCCAAATCCTTCGATCCAAACTTGACCGCTCCACCTCACTCCTCGTCAAA CTCGTCATCTCCTCCTGCGCTCTCTCCTCCAGCCTCGACTACGCTCTCTCTGTCTTCAAC CTCATTCCCAAGCCCGAAACTCACCTCTGCAACCGCTTCCTGCGCGAGCTGTCGAGGAGT GAGGAGCCGGAGAAAACTCTTTTGGTGTACGAGAGAATGAGGACGCAAGGATTGGCCGTG GACAGGTTCAGCTTTCCGCCCCTCTTGAAAGCATTGTCGAGAGTGAAGTCTCTGGTTGAA GGGCTGGAGATTCATGGATTGGCTGCTAAGTTGGGGTTTGACTCGGACCCCTTTGTTCAA ACTGGTTTGGTACGAATGTACGCGGCTTGTGGGCGGATTGCAGAGGCGAGGTTGATGTTT GATAAAATGTTCCACCGGGATGTTGTCACATGGAGCATTATGATTGACGGATATTGTCAG AGTGGCCTTTTCAATGATGCTTTGCTGCTATTTGAAGAGATGAAGAACTATAATGTGGAG CCTGATGAGATGATGCTTTCTACAGTTCTTTCTGCTTGTGGCCGTGCTGGAAATTTAAGT TATGGGAAAATGATCCATGATTTCATTATGGAGAATAATATTGTGGTTGATCCTCATTTG CAGAGTGCTCTTGTCACCATGTATGCAAGTTGTGGCTCCATGGATTTGGCTCTGAATTTA TTTGAGAAGATGACACCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTGCTATGGTTACTGGGTATTCA AAACTTGGACAGATTGAAAATGCTCGCTCAGTTTTCAATCAAATGGTTAAAAAGGACTTG GTCTGTTGGAGTGCTATGATATCTGGTTATGCTGAGAGTGATAGTCCTCAAGAAGCTCTT AATTTGTTCAATGAAATGCAATCTTTGGGAATAAAACCTGATCAAGTTACCATGTTGAGT GTTATCACAGCTTGTGCTCATCTTGGTGCATTGGATCAAGCCAAATGGATCCATTTATTT GTTGATAAGAATGGTTTTGGGGGAGCTTTGCCTATTAACAATGCCCTTATTGAAATGTAT GCCAAATGTGGGAGTTTGGAGAGAGCAAGAAGAATTTTTGATAAGATGCCCAGAAAAAAT GTGATATCCTGGACCTGCATGATCAGTGCCTTTGCCATGCATGGGGATGCCGGTAGTGCA TTGAGGTTCTTCCATCAAATGGAAGATGAAAATATTGAACCCAATGGGATTACATTTGTT GGTGTACTTTATGCTTGTAGCCATGCAGGATTGGTTGAGGAGGGTCGCAAGATCTTTTAC TCAATGATTAATGAGCACAACATCACCCCAAAACATGTGCACTATGGTTGCATGGTAGAT CTCTTTGGCCGTGCTAATCTCCTTAGAGAAGCCCTTGAGCTTGTAGAGGCTATGCCTTTG GCACCAAATGTTATCATCTGGGGATCTTTGATGGCTGCTTGCCGAGTCCATGGTGAGATT GAATTAGGAGAATTTGCAGCAAAAAGGCTTCTTGAGCTAGATCCAGATCATGATGGGGCT CATGTGTTCTTGTCAAACATCTATGCCAAAGCAAGGAGATGGGAGGATGTTGGACAAGTG AGGAAATTGATGAAACATAAAGGGATTTCTAAGGAAAGAGGATGCAGTAGATTTGAACTG AACAATGAGATACATGAGTTTTTGGTGGCAGATAGGAGTCATAAACATGCAGATGAGATA TATGAAAAGCTATATGAGGTGGTTAGCAAGTTGAAGCTGGTTGGTTATTCTCCAAATACC TGTAGCATTTTGGTTGATTTAGAAGAAGAAGAAAAAAAGGAAGTGGTTCTATGGCACAGT GAGAAGTTGGCACTTTGTTATGGGCTTATGAGGGATGGAACAGGGTCTTGCATACGTATA ATTAAGAATCTTAGGGTCTGTGAGGACTGCCATACCTTTATTAAGTTGGCATCAAAGGTG TATGAAAGAGAGATTGTTGTCAGAGATAGGACTAGGTTTCACCATTACAAAGATGGTGTA TGTTCTTGTAAAGATTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g03630.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:5347809:5350548:1 gene:VIT_05s0020g03630 transcript:VIT_05s0020g03630.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSQTALALPPNPNPATPTTLHSHHTLFSALSSATSLTHLKQVHAQILRSKLDRSTSLLVK LVISSCALSSSLDYALSVFNLIPKPETHLCNRFLRELSRSEEPEKTLLVYERMRTQGLAV DRFSFPPLLKALSRVKSLVEGLEIHGLAAKLGFDSDPFVQTGLVRMYAACGRIAEARLMF DKMFHRDVVTWSIMIDGYCQSGLFNDALLLFEEMKNYNVEPDEMMLSTVLSACGRAGNLS YGKMIHDFIMENNIVVDPHLQSALVTMYASCGSMDLALNLFEKMTPKNLVASTAMVTGYS KLGQIENARSVFNQMVKKDLVCWSAMISGYAESDSPQEALNLFNEMQSLGIKPDQVTMLS VITACAHLGALDQAKWIHLFVDKNGFGGALPINNALIEMYAKCGSLERARRIFDKMPRKN VISWTCMISAFAMHGDAGSALRFFHQMEDENIEPNGITFVGVLYACSHAGLVEEGRKIFY SMINEHNITPKHVHYGCMVDLFGRANLLREALELVEAMPLAPNVIIWGSLMAACRVHGEI ELGEFAAKRLLELDPDHDGAHVFLSNIYAKARRWEDVGQVRKLMKHKGISKERGCSRFEL NNEIHEFLVADRSHKHADEIYEKLYEVVSKLKLVGYSPNTCSILVDLEEEEKKEVVLWHS EKLALCYGLMRDGTGSCIRIIKNLRVCEDCHTFIKLASKVYEREIVVRDRTRFHHYKDGV CSCKDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g03630.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:5347809:5350548:1 gene:VIT_05s0020g03630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TTTTGTTGGGAAGAAAAGGTGGCTTTCAGTTTCAGCCCTCCATATGCTTGTGGAAACGAC TCAATCAGTTTTTTAACGGTATTTCCCTCCATTTCTTCCAAGTTTCCGACCCCTAAACCC TTCCAGCGCCACGCCACCCCGCCCCCCACAACAACCATGTCGCAGACTGCCTTAGCACTC CCTCCTAACCCAAACCCCGCCACACCCACCACCCTCCACAGCCACCACACCCTCTTCTCA GCTCTCTCCTCCGCTACCTCTCTTACCCACCTTAAACAAGTCCACGCCCAAATCCTTCGA TCCAAACTTGACCGCTCCACCTCACTCCTCGTCAAACTCGTCATCTCCTCCTGCGCTCTC TCCTCCAGCCTCGACTACGCTCTCTCTGTCTTCAACCTCATTCCCAAGCCCGAAACTCAC CTCTGCAACCGCTTCCTGCGCGAGCTGTCGAGGAGTGAGGAGCCGGAGAAAACTCTTTTG GTGTACGAGAGAATGAGGACGCAAGGATTGGCCGTGGACAGGTTCAGCTTTCCGCCCCTC TTGAAAGCATTGTCGAGAGTGAAGTCTCTGGTTGAAGGGCTGGAGATTCATGGATTGGCT GCTAAGTTGGGGTTTGACTCGGACCCCTTTGTTCAAACTGGTTTGGTACGAATGTACGCG GCTTGTGGGCGGATTGCAGAGGCGAGGTTGATGTTTGATAAAATGTTCCACCGGGATGTT GTCACATGGAGCATTATGATTGACGGATATTGTCAGAGTGGCCTTTTCAATGATGCTTTG CTGCTATTTGAAGAGATGAAGAACTATAATGTGGAGCCTGATGAGATGATGCTTTCTACA GTTCTTTCTGCTTGTGGCCGTGCTGGAAATTTAAGTTATGGGAAAATGATCCATGATTTC ATTATGGAGAATAATATTGTGGTTGATCCTCATTTGCAGAGTGCTCTTGTCACCATGTAT GCAAGTTGTGGCTCCATGGATTTGGCTCTGAATTTATTTGAGAAGATGACACCAAAAAAC CTTGTTGCTTCAACTGCTATGGTTACTGGGTATTCAAAACTTGGACAGATTGAAAATGCT CGCTCAGTTTTCAATCAAATGGTTAAAAAGGACTTGGTCTGTTGGAGTGCTATGATATCT GGTTATGCTGAGAGTGATAGTCCTCAAGAAGCTCTTAATTTGTTCAATGAAATGCAATCT TTGGGAATAAAACCTGATCAAGTTACCATGTTGAGTGTTATCACAGCTTGTGCTCATCTT GGTGCATTGGATCAAGCCAAATGGATCCATTTATTTGTTGATAAGAATGGTTTTGGGGGA GCTTTGCCTATTAACAATGCCCTTATTGAAATGTATGCCAAATGTGGGAGTTTGGAGAGA GCAAGAAGAATTTTTGATAAGATGCCCAGAAAAAATGTGATATCCTGGACCTGCATGATC AGTGCCTTTGCCATGCATGGGGATGCCGGTAGTGCATTGAGGTTCTTCCATCAAATGGAA GATGAAAATATTGAACCCAATGGGATTACATTTGTTGGTGTACTTTATGCTTGTAGCCAT GCAGGATTGGTTGAGGAGGGTCGCAAGATCTTTTACTCAATGATTAATGAGCACAACATC ACCCCAAAACATGTGCACTATGGTTGCATGGTAGATCTCTTTGGCCGTGCTAATCTCCTT AGAGAAGCCCTTGAGCTTGTAGAGGCTATGCCTTTGGCACCAAATGTTATCATCTGGGGA TCTTTGATGGCTGCTTGCCGAGTCCATGGTGAGATTGAATTAGGAGAATTTGCAGCAAAA AGGCTTCTTGAGCTAGATCCAGATCATGATGGGGCTCATGTGTTCTTGTCAAACATCTAT GCCAAAGCAAGGAGATGGGAGGATGTTGGACAAGTGAGGAAATTGATGAAACATAAAGGG ATTTCTAAGGAAAGAGGATGCAGTAGATTTGAACTGAACAATGAGATACATGAGTTTTTG GTGGCAGATAGGAGTCATAAACATGCAGATGAGATATATGAAAAGCTATATGAGGTGGTT AGCAAGTTGAAGCTGGTTGGTTATTCTCCAAATACCTGTAGCATTTTGGTTGATTTAGAA GAAGAAGAAAAAAAGGAAGTGGTTCTATGGCACAGTGAGAAGTTGGCACTTTGTTATGGG CTTATGAGGGATGGAACAGGGTCTTGCATACGTATAATTAAGAATCTTAGGGTCTGTGAG GACTGCCATACCTTTATTAAGTTGGCATCAAAGGTGTATGAAAGAGAGATTGTTGTCAGA GATAGGACTAGGTTTCACCATTACAAAGATGGTGTATGTTCTTGTAAAGATTATTGGTAA CTATATATGTATTTCCATTAAATAATAACCCTCTAATGACTAATAATAGTGAGAAGCACG AGCTCTTTTTAGTTAAACAAAA