Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g02040.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:3793982:3795853:1 gene:VIT_05s0020g02040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCATTCGCATCTCTTCCAAACTACGTCCAAGATCGTAGCTTTAGCGAAATTGGGTAGA ATTACCTCTGCCCGCAGACTGTTCGACGAAATGCCGCACAAAGACACAGTAGCTTGGAAC GCCATGCTTGCTAGCTATTCTCAACTGGGTCTTCACCAGCAAGCTCTCTGTCTCTTCCAC CACATGAGAATCGCCAACTCCAGGCCTGACCGCTTCACCTTCACTGCGACGCTGAGTGCA TGTGCTGGCTTGGGTGAGCTGCGGCGTGGAATGAAAATCCATGCACAAGTTGTTGTTTCT GGATGCCAGTCTTCGTTGCCTGTTGGCAATTCGCTTATTGATATGTATGGGAAATGTCTG AGTGCTACCAGTGCGAGAAGAGTGTTTGAAGAGATGAGTATTATGAATGAAGTATCATGG TGTTCGTTGTTATTTGCTTACACAAGCTCTGGTCTGTTTGATGTTGCGCGTGTAGTTTTT GATGGTATGCCGAAAAAGGTGGAAATTGCATGGAATATTATGATTTCTGGCTATGGGCAA TGTGGGGATGTTGAATTGTGTCTGGGTTTGTTCAAGAAAATGCGAGAGGATTCACTCCAG CCGGATCAGTGGACGTTTAGTGCTCTCGTAAATGCATTGTGTGAACTGCAAGAGCCTTCG TATGGATACATGATGCATGGATTTATCATTAAAAGTGGCTGGGATGATGTGATGAAGGTG TTTGAGTCCATAGGAATATTAACCCAGGTATCTTGGAATGCAATGATTGATGCCCATATG AAAATAGGAGATACCCATGAAGCCTTTCTTGTATTTCAGCTGGCACCCGAGAAGAATGTG GTTTCATGGACATCTATGATCACTGGGTATGCAAGAAATGGGCATGGGGAACAAGCTCTT AGCTTCTTTGTCAAGATGATGGAAAATCACATCCAACCAGATGATTTTACATTTGGGGCT GTTCTACATGCATGTTCTAGCTTGGCAACACTAGGGCATGGTAAAATGATCCATGGCAGC ATAATCCACTATGGTTTTCATGCTTATGTCGATGTTGGAAATGGCTTAGTGAACATGTAT GCCAAGTGTGGAGACATACAAGGATCAAACACTGCATTTAAAGAGATTCTCGGGAAGGAT TTGGTTTCTTGGAATGCAATGTTATTTGGATTAGGGATGCATGGACATGCCACCCAAGCT CTAGAGCTTTATGAAGAAATGGTGGCATCTGGTATGAAACCAGATAAGGTGACTTTTATT GGCCTGCTGATGACTTGCAGCCACTCAGGGCTCATAGAGAAAGGTCAGGCTCTTTTTGAA TCAATGGTTTCAGTTTATGGGCTCTCCCAAGAAACAGAGCATGTGGTGTGCATGGTGGAT TTGCTTGGCCGGGGTGGATACTTGGCACAAGCAAGAGAGTTGGTTGATGAATATTCGAGA ACAGGTCGTGCAGAGACCAGTTTGCCTGAGGCTTTACTAGGAGCATGTTTTGCACATAGT GAGGTTAGGATGGGGGCAAATTTGGGGGAATATTTAAAGGTTTTTGAACCTCAAAAAGAG ATGAGCTATGTTTTGCTATCCAACCTGTATTGTGTGAGTGGCCAGTGGAAGGAAGCAGAA ATGGTTAGGAAGACAATGACAGATCATGGGGTGAAGAAAATGCCCGGTTGTAGCTGGATT GAGGTAAGAAATAAGGTGACAGTTTTTGTAGCCGGGAACCATTCACATCCCTACATGGAA GAGTTGTGTAAGATACTAAACTTCCTCAAATTTGAAATGAGAAATCCATTCTTTTCTGGT TTCAAGAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g02040.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:3793982:3795853:1 gene:VIT_05s0020g02040 transcript:VIT_05s0020g02040.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MHSHLFQTTSKIVALAKLGRITSARRLFDEMPHKDTVAWNAMLASYSQLGLHQQALCLFH HMRIANSRPDRFTFTATLSACAGLGELRRGMKIHAQVVVSGCQSSLPVGNSLIDMYGKCL SATSARRVFEEMSIMNEVSWCSLLFAYTSSGLFDVARVVFDGMPKKVEIAWNIMISGYGQ CGDVELCLGLFKKMREDSLQPDQWTFSALVNALCELQEPSYGYMMHGFIIKSGWDDVMKV FESIGILTQVSWNAMIDAHMKIGDTHEAFLVFQLAPEKNVVSWTSMITGYARNGHGEQAL SFFVKMMENHIQPDDFTFGAVLHACSSLATLGHGKMIHGSIIHYGFHAYVDVGNGLVNMY AKCGDIQGSNTAFKEILGKDLVSWNAMLFGLGMHGHATQALELYEEMVASGMKPDKVTFI GLLMTCSHSGLIEKGQALFESMVSVYGLSQETEHVVCMVDLLGRGGYLAQARELVDEYSR TGRAETSLPEALLGACFAHSEVRMGANLGEYLKVFEPQKEMSYVLLSNLYCVSGQWKEAE MVRKTMTDHGVKKMPGCSWIEVRNKVTVFVAGNHSHPYMEELCKILNFLKFEMRNPFFSG FKN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g02040.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:3793982:3795853:1 gene:VIT_05s0020g02040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCATTCGCATCTCTTCCAAACTACGTCCAAGATCGTAGCTTTAGCGAAATTGGGTAGA ATTACCTCTGCCCGCAGACTGTTCGACGAAATGCCGCACAAAGACACAGTAGCTTGGAAC GCCATGCTTGCTAGCTATTCTCAACTGGGTCTTCACCAGCAAGCTCTCTGTCTCTTCCAC CACATGAGAATCGCCAACTCCAGGCCTGACCGCTTCACCTTCACTGCGACGCTGAGTGCA TGTGCTGGCTTGGGTGAGCTGCGGCGTGGAATGAAAATCCATGCACAAGTTGTTGTTTCT GGATGCCAGTCTTCGTTGCCTGTTGGCAATTCGCTTATTGATATGTATGGGAAATGTCTG AGTGCTACCAGTGCGAGAAGAGTGTTTGAAGAGATGAGTATTATGAATGAAGTATCATGG TGTTCGTTGTTATTTGCTTACACAAGCTCTGGTCTGTTTGATGTTGCGCGTGTAGTTTTT GATGGTATGCCGAAAAAGGTGGAAATTGCATGGAATATTATGATTTCTGGCTATGGGCAA TGTGGGGATGTTGAATTGTGTCTGGGTTTGTTCAAGAAAATGCGAGAGGATTCACTCCAG CCGGATCAGTGGACGTTTAGTGCTCTCGTAAATGCATTGTGTGAACTGCAAGAGCCTTCG TATGGATACATGATGCATGGATTTATCATTAAAAGTGGCTGGGATGATGTGATGAAGGTG TTTGAGTCCATAGGAATATTAACCCAGGTATCTTGGAATGCAATGATTGATGCCCATATG AAAATAGGAGATACCCATGAAGCCTTTCTTGTATTTCAGCTGGCACCCGAGAAGAATGTG GTTTCATGGACATCTATGATCACTGGGTATGCAAGAAATGGGCATGGGGAACAAGCTCTT AGCTTCTTTGTCAAGATGATGGAAAATCACATCCAACCAGATGATTTTACATTTGGGGCT GTTCTACATGCATGTTCTAGCTTGGCAACACTAGGGCATGGTAAAATGATCCATGGCAGC ATAATCCACTATGGTTTTCATGCTTATGTCGATGTTGGAAATGGCTTAGTGAACATGTAT GCCAAGTGTGGAGACATACAAGGATCAAACACTGCATTTAAAGAGATTCTCGGGAAGGAT TTGGTTTCTTGGAATGCAATGTTATTTGGATTAGGGATGCATGGACATGCCACCCAAGCT CTAGAGCTTTATGAAGAAATGGTGGCATCTGGTATGAAACCAGATAAGGTGACTTTTATT GGCCTGCTGATGACTTGCAGCCACTCAGGGCTCATAGAGAAAGGTCAGGCTCTTTTTGAA TCAATGGTTTCAGTTTATGGGCTCTCCCAAGAAACAGAGCATGTGGTGTGCATGGTGGAT TTGCTTGGCCGGGGTGGATACTTGGCACAAGCAAGAGAGTTGGTTGATGAATATTCGAGA ACAGGTCGTGCAGAGACCAGTTTGCCTGAGGCTTTACTAGGAGCATGTTTTGCACATAGT GAGGTTAGGATGGGGGCAAATTTGGGGGAATATTTAAAGGTTTTTGAACCTCAAAAAGAG ATGAGCTATGTTTTGCTATCCAACCTGTATTGTGTGAGTGGCCAGTGGAAGGAAGCAGAA ATGGTTAGGAAGACAATGACAGATCATGGGGTGAAGAAAATGCCCGGTTGTAGCTGGATT GAGGTAAGAAATAAGGTGACAGTTTTTGTAGCCGGGAACCATTCACATCCCTACATGGAA GAGTTGTGTAAGATACTAAACTTCCTCAAATTTGAAATGAGAAATCCATTCTTTTCTGGT TTCAAGAATTGA