Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g01560.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:3245152:3246711:1 gene:VIT_05s0020g01560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCGCGAACCAAATGTGATCTCGTTTACTTCGCTCATGGCCGGTTTCATCAAAGTGGGT CGGCCTAAATCAGCACTCTTGATTTTTTGTAAAATGCTCGAAAGTTGGGTTTTGCCCAAT GCCTTCACATTTGCAACTGTCGTCAATGCTTGTTCAATGCTCGCCGACCTCAGAACCGGC CAAAAGATCCATTCCCATGTTGAAATGTTTGGTGTCCAATGTAACCTGGTAGTGTGTTCT TCCCTCATTGATATGTACGGGAAATGCAACAATGTAGACGATGCTCGACGGGTTTTTGAC GGCATGGATTATAGGAATGTTGTTTCTTGGACTTCCATGATCACAGCGTATGGGCAGAAT GCATTAGGCGAATGTGCACTGCAACTTTTCAGAGAATTCAATGGTTTGCCATTGAGCTCT CCAAACCATTTCATGTTAGCCAGTGTGATTAATGCTTGTGCAAGCTTGGGTAGGCTAGTT TCTGGGAAAGTGGCTCATGCAGCAGTGATTCGCCGTGGGCATGAATCAAATGATGTAGTG GCAAGTGCCCTGGTCGACATGTATGCCAAATGCGGGTGTATTGGTTATTCTGACAAGGTA TTTAGAAGAATCCCGGATCCTTCTGTAATCCCATACACTTCTATGATCGTGGGAGCTGCC AAGTATGGGCTTGGAAAATTCTCCCTTGATATCTTTAAGGAGATGCTCGATAGAAGAATA AAACCCAATGATGTCACCTTTGTTGGGGTTTTACATGCTTGTAGCCATTCGGGTCTGGTT GATGATGGCCTTGAATATCTGCATTCCATGCACAAAAAGCATGGGGTGGTGCCTGATACT AAGCACTATACTTGTGTGGTTGATATGCTTGGGCGAACTGGTAGGCTTGATGAGGCTCAC CAGTTAGCAAAGTCTATCCAAGTAGAACCAGACCAAGGAGCGCTCTTGTGGGGCACGCTT CTTTCAGCTAGTAGGCTGTATGGGAGGGTGGATATTGCTGTTGAGGCTAGCAAGTGGCTA ATAGAATCAAATCAGCAGGTAGCGGCGGCATATGTCACCATGTCCAACACATACGCAATG GCTGGGAAGTGGGAGAATGTTCATAGCATTAGATATGAAATGAAACACTATGGTGTTTAC AAGGAACCAGGTTGCAGTTGGGTGGAGATACGGGATTCGGCTTATGTGTTCTACGCTGGA GATGTATCTTTGTGTGCTAGAGGCAGTGAGGTGGCGAGCTTGTTGAGGGAGTTGGAGAGA AGAATGAAGGAAAGGGGTTATGTGGGAGGAAGCAGGGGGTTGGTGTCTATTGATGTGGAA GAGGAGGCCAAGGAGGAAATAGTGGGGCTCCACAGTGAGAGATTGGCCTTGGCTTTTGGG TTGATAAGCATACCTAAAGGAGTGACCATTAGAGTGATGAAGAACTTGAGAATGTGCCGG GACTGTCATGAAGCTTTCAAGCTGATTAGTGAGATTGTGGAGAGGGACTTTGTTGTGAGG GATGTAAACAGATTTCATCATTTTGAAAATGGTTCTTGCACTTGCAGGGATTTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g01560.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:3245152:3246711:1 gene:VIT_05s0020g01560 transcript:VIT_05s0020g01560.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MREPNVISFTSLMAGFIKVGRPKSALLIFCKMLESWVLPNAFTFATVVNACSMLADLRTG QKIHSHVEMFGVQCNLVVCSSLIDMYGKCNNVDDARRVFDGMDYRNVVSWTSMITAYGQN ALGECALQLFREFNGLPLSSPNHFMLASVINACASLGRLVSGKVAHAAVIRRGHESNDVV ASALVDMYAKCGCIGYSDKVFRRIPDPSVIPYTSMIVGAAKYGLGKFSLDIFKEMLDRRI KPNDVTFVGVLHACSHSGLVDDGLEYLHSMHKKHGVVPDTKHYTCVVDMLGRTGRLDEAH QLAKSIQVEPDQGALLWGTLLSASRLYGRVDIAVEASKWLIESNQQVAAAYVTMSNTYAM AGKWENVHSIRYEMKHYGVYKEPGCSWVEIRDSAYVFYAGDVSLCARGSEVASLLRELER RMKERGYVGGSRGLVSIDVEEEAKEEIVGLHSERLALAFGLISIPKGVTIRVMKNLRMCR DCHEAFKLISEIVERDFVVRDVNRFHHFENGSCTCRDFW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g01560.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:3245152:3246711:1 gene:VIT_05s0020g01560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCGCGAACCAAATGTGATCTCGTTTACTTCGCTCATGGCCGGTTTCATCAAAGTGGGT CGGCCTAAATCAGCACTCTTGATTTTTTGTAAAATGCTCGAAAGTTGGGTTTTGCCCAAT GCCTTCACATTTGCAACTGTCGTCAATGCTTGTTCAATGCTCGCCGACCTCAGAACCGGC CAAAAGATCCATTCCCATGTTGAAATGTTTGGTGTCCAATGTAACCTGGTAGTGTGTTCT TCCCTCATTGATATGTACGGGAAATGCAACAATGTAGACGATGCTCGACGGGTTTTTGAC GGCATGGATTATAGGAATGTTGTTTCTTGGACTTCCATGATCACAGCGTATGGGCAGAAT GCATTAGGCGAATGTGCACTGCAACTTTTCAGAGAATTCAATGGTTTGCCATTGAGCTCT CCAAACCATTTCATGTTAGCCAGTGTGATTAATGCTTGTGCAAGCTTGGGTAGGCTAGTT TCTGGGAAAGTGGCTCATGCAGCAGTGATTCGCCGTGGGCATGAATCAAATGATGTAGTG GCAAGTGCCCTGGTCGACATGTATGCCAAATGCGGGTGTATTGGTTATTCTGACAAGGTA TTTAGAAGAATCCCGGATCCTTCTGTAATCCCATACACTTCTATGATCGTGGGAGCTGCC AAGTATGGGCTTGGAAAATTCTCCCTTGATATCTTTAAGGAGATGCTCGATAGAAGAATA AAACCCAATGATGTCACCTTTGTTGGGGTTTTACATGCTTGTAGCCATTCGGGTCTGGTT GATGATGGCCTTGAATATCTGCATTCCATGCACAAAAAGCATGGGGTGGTGCCTGATACT AAGCACTATACTTGTGTGGTTGATATGCTTGGGCGAACTGGTAGGCTTGATGAGGCTCAC CAGTTAGCAAAGTCTATCCAAGTAGAACCAGACCAAGGAGCGCTCTTGTGGGGCACGCTT CTTTCAGCTAGTAGGCTGTATGGGAGGGTGGATATTGCTGTTGAGGCTAGCAAGTGGCTA ATAGAATCAAATCAGCAGGTAGCGGCGGCATATGTCACCATGTCCAACACATACGCAATG GCTGGGAAGTGGGAGAATGTTCATAGCATTAGATATGAAATGAAACACTATGGTGTTTAC AAGGAACCAGGTTGCAGTTGGGTGGAGATACGGGATTCGGCTTATGTGTTCTACGCTGGA GATGTATCTTTGTGTGCTAGAGGCAGTGAGGTGGCGAGCTTGTTGAGGGAGTTGGAGAGA AGAATGAAGGAAAGGGGTTATGTGGGAGGAAGCAGGGGGTTGGTGTCTATTGATGTGGAA GAGGAGGCCAAGGAGGAAATAGTGGGGCTCCACAGTGAGAGATTGGCCTTGGCTTTTGGG TTGATAAGCATACCTAAAGGAGTGACCATTAGAGTGATGAAGAACTTGAGAATGTGCCGG GACTGTCATGAAGCTTTCAAGCTGATTAGTGAGATTGTGGAGAGGGACTTTGTTGTGAGG GATGTAAACAGATTTCATCATTTTGAAAATGGTTCTTGCACTTGCAGGGATTTCTGGTGA