Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g01260.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:3000478:3003939:1 gene:VIT_05s0020g01260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTCGGAATACAGAGTTTGACCATCTGGAACGTATATTGGAAGAAATGAGTCTTTCT GGGTTTGGCCCATCTAGTAACATATCTATTGAGCTGGTTGCAAACTGTGTCAAGTCTCGG AAGTTGCGAGAGGCTTTTGATATTATACAAACCATGCGAAAGTTCAAGTTCCGCCCAGCA TTTTCAGCGTATACAATTTTAATTGGTGCTCTGTCTGAGGTTCGTGAGCCTGATCCCATG CTCATTCTCTTTCATCAGATGCAGGAGCTAGGTTATGAAGTAAATGTGCATCTCTTTACA ACTCTCATTCGTGTATTTGCCAGGGAAGGTCGGGTTGATGCTGCTCTTTCCCTGTTGGAT GAGATGAAGAGCAACTCTTTAGATGCAGATATCGTTCTTTATAATGTCTGTATAGATTGC TTTGGCAAGGCAGGTAAGGTGGATATGTCCTGGAAATTCTTTCATGAGATGAAATCACAT GGCCTTATGCCTGATGATGTGACATATACTAGCATGATAGGGGTTCTCTGCAAAGCTAAT AGACTGGATGAAGCTGTGGAGCTATTTGAACAGTTGGAACAGAATAGGAAAGTTCCATGT GCTTATGCTTACAACACCATGATCATGGGTTATGGATCAGCTGGAAAATTTGATGAAGCT TATGGTTTACTTGAGAGGCAAAAGGCAAAGGGAAGCATTCCCAGTGTTATTGCATACAAC TGCATTCTTACTTGTCTTGGGAAGAAAAGGAGAGTTGAGGAGGCTTTAAGAATCTTTGAG GAGATGAAGAGAGATGCAGTTCCCAATGTTCCAACTTATAATATTCTCATAGACATGCTT TGCAGGGAAGGGAAACTCAACGCTGCTTTGGAAATTCGGGATGACATGGAAAGAGCTGGC CTGTTTCCTAATGTTTTGACTGTGAACATAATGATTGATAGGCTATGTAAAGCTCAAAAA CTTGAGGAAGCTTGTTCTATATTTGAAGGGATGGATGATAAAGTTTGCACCCCAAATGCA GTTACATTTTCGTCTCTCATAGATGGTTTGGGTAAATGTGGTAGAGTGGATGATGCCTAC AGCCTATATGAAAAGATGCTGGATTGTGGTCATGTTCCTGGTGCTATTGTCTATACATCC CTCATTAGAAGCTTCTTCAAGTGCGGTAGGAAGGAAGATGGTCACAAGATCTACAAGGAG ATGGTCCATACAGGCTGTTCTCCTGATCTAACCCTTATTAATACCTACATGGATTGTGTT TTCAAAGCTGGTGAAACTGAGAAAGGCAGGGCTTTGTTTCGGGAGATTAATGCCCATGGC TTCATTCCAGACGCTCGGAGCTATTCTATCCTTATCCATGGTCTTGTAAAAGCAGGTTTG GCAAATGAGACCTATGAACTGTTCTATGCAATGAAGGAGCAAGGCTGTGTTCTGGACACC CATGCTTACAATGCTGTGATTGATGGATTCTGCAAGTCAGGTAAGGTGAACAAAGCTTAC CAGCTACTGGAGGAAATGAAGGTGAAGGGTCACCCACCCACTGTGGTTACCTATGGTTCT GTCATTGATGGGCTTGCCAAGATTGACAGACTTGATGAAGCATACATGCTCTTTGAAGAA GCAAAATCAAATGGAATAAAATTAAATGTAGTTGTGTATAGTAGTCTTATTGATGGGTTC GGGAAGGTGGGTAGAATTGATGAAGCATATCTAATCATGGAAGAGTTGATGCAGAAAGGT TTGACACCTAATGTATATACATGGAATTGCTTGCTTGACGCACTGGTAAAAGCCGAAGAA ATTAATGAAGCCCTCATCTGCTTTCAGTCTATGAAAGACTTGAAATGCCCTCCCAACCAG ATAACATACAGCATTCTCATAAATGGTCTCTGTAGGGTTCGAAAATTCAACAAGGCCTTT GTGTTTTGGCAAGAGATGCAGAAGCTGGGATTAAAACCCAATACAATCACCTACACCACC ATGATCTCAGGACTTGCAAAGGCTGGAAACATATTAGAGGCCAGTGGGCTCTTCAGTAGG TTCAAGGCAAATGGGGGCATACCTGACTCAGCTAGTTATAATGCTATGATAGAAGGATTG AGCAGTGCAAACAAGGCCATGGATGCATATGCACTTTTTGAGGAAACTCGTTTGAAAGGT TGCAATATACATACCAAAACCTGTGTCGTTCTTTTAGACGCACTGCATAAGGCTGAATGC CTTGAACAGGCTGCAATTGTGGGTGCTGTATTAAAGGAAACAGCCAAGTCTCAACATGCT TCAAGATCCTTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g01260.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:3000478:3003939:1 gene:VIT_05s0020g01260 transcript:VIT_05s0020g01260.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MARNTEFDHLERILEEMSLSGFGPSSNISIELVANCVKSRKLREAFDIIQTMRKFKFRPA FSAYTILIGALSEVREPDPMLILFHQMQELGYEVNVHLFTTLIRVFAREGRVDAALSLLD EMKSNSLDADIVLYNVCIDCFGKAGKVDMSWKFFHEMKSHGLMPDDVTYTSMIGVLCKAN RLDEAVELFEQLEQNRKVPCAYAYNTMIMGYGSAGKFDEAYGLLERQKAKGSIPSVIAYN CILTCLGKKRRVEEALRIFEEMKRDAVPNVPTYNILIDMLCREGKLNAALEIRDDMERAG LFPNVLTVNIMIDRLCKAQKLEEACSIFEGMDDKVCTPNAVTFSSLIDGLGKCGRVDDAY SLYEKMLDCGHVPGAIVYTSLIRSFFKCGRKEDGHKIYKEMVHTGCSPDLTLINTYMDCV FKAGETEKGRALFREINAHGFIPDARSYSILIHGLVKAGLANETYELFYAMKEQGCVLDT HAYNAVIDGFCKSGKVNKAYQLLEEMKVKGHPPTVVTYGSVIDGLAKIDRLDEAYMLFEE AKSNGIKLNVVVYSSLIDGFGKVGRIDEAYLIMEELMQKGLTPNVYTWNCLLDALVKAEE INEALICFQSMKDLKCPPNQITYSILINGLCRVRKFNKAFVFWQEMQKLGLKPNTITYTT MISGLAKAGNILEASGLFSRFKANGGIPDSASYNAMIEGLSSANKAMDAYALFEETRLKG CNIHTKTCVVLLDALHKAECLEQAAIVGAVLKETAKSQHASRSF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g01260.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:3000478:3003939:1 gene:VIT_05s0020g01260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATAGCAGCAACTCAGAATGCATAGATGAAGATGCTCTTAACTAAGAATCAAGGACAAATC TTTCGTTCTTTTCCAAAAGGCTGTTATATTTCCAGCATTTGTAAGAAGTTCTCATCCTCA TGTAATGGACCTTCTGAGGTGGATGGGAAAGTTGTTTTTTCGGCCGATGGTGTTGATAAA AAAATCCCTAGAAACAATGAGGGTATAAGAAAAGGAGTGGATGATGTATGCTGTATCTTG GAGAGTGGTCCTTGGGGACCAACCTTGGAGAACTCTCTATCTGCACTTGGTGAAAAACCT CTACCAGAATTAGTAATTGGAGTCTTGAAGAGACTTAAGGATGCCAATACTGCAGTAAAT TATTTTCAATGGGCTGAGAAACAAACTGAAAAAGTACATTGTCCAGAAGCATATAATTCG CTTCTCATGGTAATGGCTCGGAATACAGAGTTTGACCATCTGGAACGTATATTGGAAGAA ATGAGTCTTTCTGGGTTTGGCCCATCTAGTAACATATCTATTGAGCTGGTTGCAAACTGT GTCAAGTCTCGGAAGTTGCGAGAGGCTTTTGATATTATACAAACCATGCGAAAGTTCAAG TTCCGCCCAGCATTTTCAGCGTATACAATTTTAATTGGTGCTCTGTCTGAGGTTCGTGAG CCTGATCCCATGCTCATTCTCTTTCATCAGATGCAGGAGCTAGGTTATGAAGTAAATGTG CATCTCTTTACAACTCTCATTCGTGTATTTGCCAGGGAAGGTCGGGTTGATGCTGCTCTT TCCCTGTTGGATGAGATGAAGAGCAACTCTTTAGATGCAGATATCGTTCTTTATAATGTC TGTATAGATTGCTTTGGCAAGGCAGGTAAGGTGGATATGTCCTGGAAATTCTTTCATGAG ATGAAATCACATGGCCTTATGCCTGATGATGTGACATATACTAGCATGATAGGGGTTCTC TGCAAAGCTAATAGACTGGATGAAGCTGTGGAGCTATTTGAACAGTTGGAACAGAATAGG AAAGTTCCATGTGCTTATGCTTACAACACCATGATCATGGGTTATGGATCAGCTGGAAAA TTTGATGAAGCTTATGGTTTACTTGAGAGGCAAAAGGCAAAGGGAAGCATTCCCAGTGTT ATTGCATACAACTGCATTCTTACTTGTCTTGGGAAGAAAAGGAGAGTTGAGGAGGCTTTA AGAATCTTTGAGGAGATGAAGAGAGATGCAGTTCCCAATGTTCCAACTTATAATATTCTC ATAGACATGCTTTGCAGGGAAGGGAAACTCAACGCTGCTTTGGAAATTCGGGATGACATG GAAAGAGCTGGCCTGTTTCCTAATGTTTTGACTGTGAACATAATGATTGATAGGCTATGT AAAGCTCAAAAACTTGAGGAAGCTTGTTCTATATTTGAAGGGATGGATGATAAAGTTTGC ACCCCAAATGCAGTTACATTTTCGTCTCTCATAGATGGTTTGGGTAAATGTGGTAGAGTG GATGATGCCTACAGCCTATATGAAAAGATGCTGGATTGTGGTCATGTTCCTGGTGCTATT GTCTATACATCCCTCATTAGAAGCTTCTTCAAGTGCGGTAGGAAGGAAGATGGTCACAAG ATCTACAAGGAGATGGTCCATACAGGCTGTTCTCCTGATCTAACCCTTATTAATACCTAC ATGGATTGTGTTTTCAAAGCTGGTGAAACTGAGAAAGGCAGGGCTTTGTTTCGGGAGATT AATGCCCATGGCTTCATTCCAGACGCTCGGAGCTATTCTATCCTTATCCATGGTCTTGTA AAAGCAGGTTTGGCAAATGAGACCTATGAACTGTTCTATGCAATGAAGGAGCAAGGCTGT GTTCTGGACACCCATGCTTACAATGCTGTGATTGATGGATTCTGCAAGTCAGGTAAGGTG AACAAAGCTTACCAGCTACTGGAGGAAATGAAGGTGAAGGGTCACCCACCCACTGTGGTT ACCTATGGTTCTGTCATTGATGGGCTTGCCAAGATTGACAGACTTGATGAAGCATACATG CTCTTTGAAGAAGCAAAATCAAATGGAATAAAATTAAATGTAGTTGTGTATAGTAGTCTT ATTGATGGGTTCGGGAAGGTGGGTAGAATTGATGAAGCATATCTAATCATGGAAGAGTTG ATGCAGAAAGGTTTGACACCTAATGTATATACATGGAATTGCTTGCTTGACGCACTGGTA AAAGCCGAAGAAATTAATGAAGCCCTCATCTGCTTTCAGTCTATGAAAGACTTGAAATGC CCTCCCAACCAGATAACATACAGCATTCTCATAAATGGTCTCTGTAGGGTTCGAAAATTC AACAAGGCCTTTGTGTTTTGGCAAGAGATGCAGAAGCTGGGATTAAAACCCAATACAATC ACCTACACCACCATGATCTCAGGACTTGCAAAGGCTGGAAACATATTAGAGGCCAGTGGG CTCTTCAGTAGGTTCAAGGCAAATGGGGGCATACCTGACTCAGCTAGTTATAATGCTATG ATAGAAGGATTGAGCAGTGCAAACAAGGCCATGGATGCATATGCACTTTTTGAGGAAACT CGTTTGAAAGGTTGCAATATACATACCAAAACCTGTGTCGTTCTTTTAGACGCACTGCAT AAGGCTGAATGCCTTGAACAGGCTGCAATTGTGGGTGCTGTATTAAAGGAAACAGCCAAG TCTCAACATGCTTCAAGATCCTTCTAACATCAGGATTAAGTTTTTGGTAATTACTGGAGA CCTGGATATCTTGTAGTTCACCTTTTTTTCTTGTTGATGAGACAAGGGCCCTCCTTAGTT TTGTTGATGAGGAACAAATAGCATTCTGTTCCTAAAGATTCTTTGTAGCATCACATTATT CTACAGGGATGAACTCGCTTTCCCTGGGAATACCTTGTGACAGACAGTTCAGCAATCTGC AATTGAGGAGTCATTTTATTCAGGTTGAGTGCAGGGAAAGAGTGAATTCGACTGAAAAAG ATGAGCTGGTGAGAAACACCAGATGTTTTAATTTTTTGGAGGTGGATATGAACCTAACTA A