Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_05s0020g00850.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:5:2687849:2691043:-1 gene:VIT_05s0020g00850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCCGCAAAGAAAGTTATAGCTATATGTCAGTCAGGAGGAGAGTTTGTGACGAACAAG
GATGGTTCATTATCGTATAATGGGGGAGAGGCATATGCAATTGATGTTGATCAGCAAACG
CAGTTGAGTGATTTTAAGCTGGAAGTGGCGGAAATGTTTAATTGTAGTATTGATACCATG
TCTATCAAGTACTTCCTTCCTGATAACAAGAAGACTCTCATCACAATCTCTAAAGATAAG
GACCTAAAGCGCATGGTGAAATTCCTGGGGGATTCTGTCACGGTTGATATATTCATCATG
ACAGAGGAAGCTGTTCCTCGGAACCAATCCATCATGCCTGCTAGTAGGTCAAGCAGGACA
ACTGTATCTGAAGCAGTGGTTCCTGCAGTTGCCCCTGTGGATGCTGTTGTCGACATGACC
CATGCCATCGATAAGGTTGATATGGACATGGCTAATTATACCCATTCAGATAATGCTCCT
GTTATTTCCAATGATGACAAGCATCAAAAAGCTGCTCAACAGTGGGAGAACACTATCACT
GGCGTAGACCAAAGGTTTAATAGTTTTAATGAATTTCGAGAAGCATTGCATAAATACTCA
ATTGCACATGGTTTCGCTTACAAATATAAGAAAAATGACAGTCATCGTGTGACTGTAAAA
TGCAAATCGCAAGGTTGCCCATGGAGGATATATGCATCTAGATTGTCCACAACCCAGTTA
ATTTGTATTAAGAAAATGCATACAACACACACATGTGAAGGTGCCATTGTGAAAGCTGGG
TATCGGGCTACAAGGGGTTGGGTGGGAACTATCATAAAGGAGAAGTTGAAAGTCTCCCCA
AATTACAAGCCAAAAGATATTGCAGATGATATCAAACGAGAGTATGGGATTCAACTGAAC
TATTCACAAGCATGGCGTGCAAAAGAGATTGCTAGGGAGCAGCTTCAGGGCTCATATAAA
GAGGCTTATAGTCAATTACCCTTTTTCTGTGAGAAGATAAAGGAGACTAATCCCGGTAGT
TTTGCTACATTTGAGACCAAGGAGGATTCAAGCTTCCATCGTCTCTTTATCTCTTTCCAT
GCTGCAATATCTGGTTTCCAGCAGGGTTGCCGCCCTCTCCTTTTCCTTGATAGCACTCCT
TTAAACTCAAAATACCAAGGGATGTTGTTGACTGCAACAGCTGCAGATGGGGATGATGGT
GTATTTCCAGTGGCATTTGCCGTAGTTGATGCTGAGACTGATGACAACTGGAGTTGGTTT
CTGCTGGAACTGAAATCTGCAGTGTCAACAGCTCGACCAATTACCTTTGTTGCAGATTTT
CAAAAGGGTTTAAAGAAGTCTTTGGCTGAGATATTTGACAATGGCTACCACAGCTATTGT
CTTCGCTATTTAACTGAGAAATTAAACAAAGACTTGAAGGGGCAGTTTTCTCATGAAGCA
AGACGTTTCATGATTAATGATTTTTATGCTGCTGCTTATGCTTCCAGACTTGAAACTTTC
CAGCGTTGTACTGAAAACATAAAAGGCATTTCACCTGAAGCTTACAATTGGGTCATACAG
AGCGAGCCAGACCATTGGTCTAATGCATTCTTTGGAGGAGCAAGGTATAGCCACATGGCA
TCAAACTTTGGACAACTGTTCTACAATTGGGTATCTGAGGCAAATGACTTGCCCATAACA
CAGATGGTTGATGTGTTACGAGGTAAGATGATGGAATTGATCTATAAACGTCGGGTGGAT
TCCAGTCAATGGATAACAAAGCTAACACCATCTAAGGAGGAAAAACTCCTAAAGGATACT
TCCACAGCACGATCGCTTCAAGTGTTACTCTCGCATGGTAGCACATTTGAGGTTCGTGGG
GAATCTATTGATATTGTTGATATTGATCATTGGGACTGTTCCTGCAAAGATTGGCAGCTC
AGTGGGTTGCCTTGCTGCCATGCTATTGCTGTCTTTGAATGGATTGGTAGGAACCCATAT
GACTATTGCTCAAGATACTTCACAGTTGAGAGTTACCGCTTAACGTATGCAGAATCAATT
CACCCTGTTCCAAATGTAGACAGACCAGTGAAGACTGAGTCTACTCAGGTGGGAATTATC
GTGACTCCTCCACCTACTAAACGTCCACCAGGCCGGCCAAAGATGAAGCAGGCTGGATCA
GTAGAAACAATTAAACGCCAACTCCAATGCAGCAAGTGCAAGGGCCTTGGCCACAATAAG
AAGACATGCAAAGATTTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_05s0020g00850.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:5:2687849:2691043:-1 gene:VIT_05s0020g00850 transcript:VIT_05s0020g00850.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MAAKKVIAICQSGGEFVTNKDGSLSYNGGEAYAIDVDQQTQLSDFKLEVAEMFNCSIDTM
SIKYFLPDNKKTLITISKDKDLKRMVKFLGDSVTVDIFIMTEEAVPRNQSIMPASRSSRT
TVSEAVVPAVAPVDAVVDMTHAIDKVDMDMANYTHSDNAPVISNDDKHQKAAQQWENTIT
GVDQRFNSFNEFREALHKYSIAHGFAYKYKKNDSHRVTVKCKSQGCPWRIYASRLSTTQL
ICIKKMHTTHTCEGAIVKAGYRATRGWVGTIIKEKLKVSPNYKPKDIADDIKREYGIQLN
YSQAWRAKEIAREQLQGSYKEAYSQLPFFCEKIKETNPGSFATFETKEDSSFHRLFISFH
AAISGFQQGCRPLLFLDSTPLNSKYQGMLLTATAADGDDGVFPVAFAVVDAETDDNWSWF
LLELKSAVSTARPITFVADFQKGLKKSLAEIFDNGYHSYCLRYLTEKLNKDLKGQFSHEA
RRFMINDFYAAAYASRLETFQRCTENIKGISPEAYNWVIQSEPDHWSNAFFGGARYSHMA
SNFGQLFYNWVSEANDLPITQMVDVLRGKMMELIYKRRVDSSQWITKLTPSKEEKLLKDT
STARSLQVLLSHGSTFEVRGESIDIVDIDHWDCSCKDWQLSGLPCCHAIAVFEWIGRNPY
DYCSRYFTVESYRLTYAESIHPVPNVDRPVKTESTQVGIIVTPPPTKRPPGRPKMKQAGS
VETIKRQLQCSKCKGLGHNKKTCKDF

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_05s0020g00850.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:5:2687849:2691043:-1 gene:VIT_05s0020g00850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

TGCGGAAGCACCTCTCGCTCTCCCTATCCCTCCGGCCACCGGCGGACACCGTCGACCACA
GAGAGAAGGTCTCTCCCCGGTCTTGGATTTGAAAAGAGGGCATGGCCGCAAAGAAAGTTA
TAGCTATATGTCAGTCAGGAGGAGAGTTTGTGACGAACAAGGATGGTTCATTATCGTATA
ATGGGGGAGAGGCATATGCAATTGATGTTGATCAGCAAACGCAGTTGAGTGATTTTAAGC
TGGAAGTGGCGGAAATGTTTAATTGTAGTATTGATACCATGTCTATCAAGTACTTCCTTC
CTGATAACAAGAAGACTCTCATCACAATCTCTAAAGATAAGGACCTAAAGCGCATGGTGA
AATTCCTGGGGGATTCTGTCACGGTTGATATATTCATCATGACAGAGGAAGCTGTTCCTC
GGAACCAATCCATCATGCCTGCTAGTAGGTCAAGCAGGACAACTGTATCTGAAGCAGTGG
TTCCTGCAGTTGCCCCTGTGGATGCTGTTGTCGACATGACCCATGCCATCGATAAGGTTG
ATATGGACATGGCTAATTATACCCATTCAGATAATGCTCCTGTTATTTCCAATGATGACA
AGCATCAAAAAGCTGCTCAACAGTGGGAGAACACTATCACTGGCGTAGACCAAAGGTTTA
ATAGTTTTAATGAATTTCGAGAAGCATTGCATAAATACTCAATTGCACATGGTTTCGCTT
ACAAATATAAGAAAAATGACAGTCATCGTGTGACTGTAAAATGCAAATCGCAAGGTTGCC
CATGGAGGATATATGCATCTAGATTGTCCACAACCCAGTTAATTTGTATTAAGAAAATGC
ATACAACACACACATGTGAAGGTGCCATTGTGAAAGCTGGGTATCGGGCTACAAGGGGTT
GGGTGGGAACTATCATAAAGGAGAAGTTGAAAGTCTCCCCAAATTACAAGCCAAAAGATA
TTGCAGATGATATCAAACGAGAGTATGGGATTCAACTGAACTATTCACAAGCATGGCGTG
CAAAAGAGATTGCTAGGGAGCAGCTTCAGGGCTCATATAAAGAGGCTTATAGTCAATTAC
CCTTTTTCTGTGAGAAGATAAAGGAGACTAATCCCGGTAGTTTTGCTACATTTGAGACCA
AGGAGGATTCAAGCTTCCATCGTCTCTTTATCTCTTTCCATGCTGCAATATCTGGTTTCC
AGCAGGGTTGCCGCCCTCTCCTTTTCCTTGATAGCACTCCTTTAAACTCAAAATACCAAG
GGATGTTGTTGACTGCAACAGCTGCAGATGGGGATGATGGTGTATTTCCAGTGGCATTTG
CCGTAGTTGATGCTGAGACTGATGACAACTGGAGTTGGTTTCTGCTGGAACTGAAATCTG
CAGTGTCAACAGCTCGACCAATTACCTTTGTTGCAGATTTTCAAAAGGGTTTAAAGAAGT
CTTTGGCTGAGATATTTGACAATGGCTACCACAGCTATTGTCTTCGCTATTTAACTGAGA
AATTAAACAAAGACTTGAAGGGGCAGTTTTCTCATGAAGCAAGACGTTTCATGATTAATG
ATTTTTATGCTGCTGCTTATGCTTCCAGACTTGAAACTTTCCAGCGTTGTACTGAAAACA
TAAAAGGCATTTCACCTGAAGCTTACAATTGGGTCATACAGAGCGAGCCAGACCATTGGT
CTAATGCATTCTTTGGAGGAGCAAGGTATAGCCACATGGCATCAAACTTTGGACAACTGT
TCTACAATTGGGTATCTGAGGCAAATGACTTGCCCATAACACAGATGGTTGATGTGTTAC
GAGGTAAGATGATGGAATTGATCTATAAACGTCGGGTGGATTCCAGTCAATGGATAACAA
AGCTAACACCATCTAAGGAGGAAAAACTCCTAAAGGATACTTCCACAGCACGATCGCTTC
AAGTGTTACTCTCGCATGGTAGCACATTTGAGGTTCGTGGGGAATCTATTGATATTGTTG
ATATTGATCATTGGGACTGTTCCTGCAAAGATTGGCAGCTCAGTGGGTTGCCTTGCTGCC
ATGCTATTGCTGTCTTTGAATGGATTGGTAGGAACCCATATGACTATTGCTCAAGATACT
TCACAGTTGAGAGTTACCGCTTAACGTATGCAGAATCAATTCACCCTGTTCCAAATGTAG
ACAGACCAGTGAAGACTGAGTCTACTCAGGTGGGAATTATCGTGACTCCTCCACCTACTA
AACGTCCACCAGGCCGGCCAAAGATGAAGCAGGCTGGATCAGTAGAAACAATTAAACGCC
AACTCCAATGCAGCAAGTGCAAGGGCCTTGGCCACAATAAGAAGACATGCAAAGATTTCT
AGTGCATATTTTAGGATATTGTAAGTGGTATACTCAGCATTGCTCTCCGCCTCATGTTTT
TTAGGCAATTTTGGCCAGTGTAGGTTTGTGCTTGGGAGCCTAAGACGCTTCAGATTATCC
CCTTTGCTCGTATAAGCTATCCAGTCCAGATGCAAGTAAATGCAACGGTATTTAGTTAGC
TCTGCCTTGTAATTTTGCTGTGAAATTTCCTTTTATAGTTGATATATTTGTTAATGAGGT
AGCGTGCAGAAGCATGTATGTGCATGTATAAATTTGTCTTGTGCTCACTAATTTACAAGA
GCAAAAGTGGTGTTTCA