Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_05s0020g00540.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:5:2429184:2432197:1 gene:VIT_05s0020g00540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGGAAAGTTGTTGAGGTCTTTGTTTTTCTCTCTTTCCATTGTTTGGATTGCGTTCTTT
GCTGTTTGTTCAGCAATAAAATCTCCGTTGAAGGATGGTCCAGCTGCAGCTCCAATGGCT
GCAAGAGGTCCAATAGATGGAAATTACACTTACGTCTGTGATGAATCAAGGTTTGCTGCA
CTAGGCCTTGATATGAAAGATTTCCATTACTGTGATTCCTCATCCCCATATGAGGTTCGG
GCGAAGGATTTAGTAGACAGAATGACTCTGTCAGAAAAGGTGATGCAGACCGGAGACCAA
GCTTCCGGGGTGGAAAGAATAGGATTGCCCAAGTACAATTGGTGGTCGGAGGCCCTCCAC
GGCGTCTCTAACTTCGGCCGGTGTGTCTTCTTCGACGAAGTTGTTCCGGGAGCCACCAGC
TTTCCCACTGTAATCCTCTCAGCTGCATCTTTCAACCAGTCGCTGTGGAAAACCCTTGGC
CAGGCGGTTTCCACTGAGGCAAGAGCCATGTACAATTCAGGGAACGCGGGGTTGACATTT
TGGAGTCCAAACATCAACGTAGTGCGGGATCCCAGATGGGGAAGAATCCTCGAGACGCCC
GGGGAAGATCCTCATCTCGTTGGTTTGTATGCTGTTAATTACGTTAGAGGCCTGCAGGAT
GTTGTGGGAGCTGAGAACACCACGGACTTGAACTCTAGGCCCCTCAAGGTCTCTTCATGC
TGCAAGCATTATGCTGCCTATGATCTTGATAACTGGAAGGGCGCGGATCGGGTGCATTTT
GATGCAAGGGTTTCGGTGCAAGATATGGCTGAGACGTTTGTTCTTCCATTTGAGATGTGT
GTGAAAGAGGGTGATGTTAGCAGTGTGATGTGCTCTTACAATAAAATTAATGGAATTCCT
TCTTGTGCTGATTCAAGACTCCTCAAACAGACCATTAGAGGAGAATGGGATCTTCACGGA
TACATAGTTTCGGACTGTGATTCAGTGGAAGTGATGGCGGTTGATCAAAAATGGCTGGAT
AGTTCGTTTAGCGATTCTGCTGCACAAGCCCTAAATGCAGGCATGAACTTGGACTGCGGT
ACATTCAACAATCGTTCCCTGACTGAAGCAGTGAACCAAGGGAAAGCCAACCAGGCTGAC
CTAGACCACTCACTGAGGTACCTCTATGTTTTGCTGATGAGGGTGGGGTTCTTTGATGGT
ATCCCGGCTTTTGCCTCTCTTGGAAAGGATGATATCTGCAGTGCTGAACACATCGAGTTA
GCAAGGGAAGCTGCAAGACAAGGAATCGTTCTTTTGAAGAACGATAATGCGACTTTGCCA
CTGAAATCTGTTAAGAATATAGCGCTTGTTGGGCCTCATGCTAATGCCACTGATGCTATG
ATCGGAAACTATGCAGGTATCCCATGCTACTATGTCTCCCCACTTGATGCCTTTTCCTCA
ATGGGAGAAGTGAGATACGAGAAGGGATGCGCTGATGTTCAATGTCTGAACGAGACCTAC
ATCTTCAATGCCATGGAAGCTGCAAAGCGAGCAGATGCTACGATAATATTTGCAGGGACT
GATTTATCCATTGAGGCTGAGGCCTTGGACAGAGTGGATCTCCTGCTTCCAGGCTACCAA
ACTCAGCTGATCAACCAAGTTGCCGACCTTTCCACCGGTCCTGTGGTTCTTGTGATCATG
TCTGGTGGCGGTGTCGATATTTCCTTTGCTCGGGACAACCCGAAAATCGCTGCCATCCTG
TGGGCCGGTTATCCTGGTGAGCAAGGAGGCAACGCCATTGCAGATGTTATCCTTGGGAAA
TACAATCCTGGAGGGAGATTACCAATCACATGGTATGAAGCAGATTATGTTGATATGCTG
CCCATGACATCTATGGCCCTGAGGCCAGTTGATAGCTTAGGGTATCCAGGGAGGACATAC
AAATTCTTCAATGGCTCCACTGTCTACCCATTTGGCTATGGAATGAGCTACACCAACTTC
TCCTACTCACTGTCAACTTCCCAAAGGTGGACCAACATCAACTTGAGAAAGCTCCAAAGG
TGCCGCAGCATGGTTTACATCAACGATACTTTCGTACCAGACTGTCCAGCAGTTCTCGTT
GATGATTTAAGTTGTAAGGAGAGTATTGAGTTTGAGGTTGCAGTGAAGAATGTGGGGAGG
ATGGATGGAAGTGAAGTGGTTGTTGTTTACTCAAGCCCTCCATTGGGGATTGCTGGGACT
CATATCAAGAAAGTGGTTGGATTTGAGAGGGTTTTTGTGAAGGTAGGAGGTACAGAGAAG
GTGAAGTTTTCTATGAATGTCTGCAAGAGCTTGGGTATTGTGGACAGTACTGGTTATGCC
CTTTTGCCTTCTGGTTCTCACACCATCAAGGTTGGGGGTGATAATACAACTTCAGTCGCG
TTTCCTTTTCATGTCAACTACGTTAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_05s0020g00540.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:5:2429184:2432197:1 gene:VIT_05s0020g00540 transcript:VIT_05s0020g00540.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MGKLLRSLFFSLSIVWIAFFAVCSAIKSPLKDGPAAAPMAARGPIDGNYTYVCDESRFAA
LGLDMKDFHYCDSSSPYEVRAKDLVDRMTLSEKVMQTGDQASGVERIGLPKYNWWSEALH
GVSNFGRCVFFDEVVPGATSFPTVILSAASFNQSLWKTLGQAVSTEARAMYNSGNAGLTF
WSPNINVVRDPRWGRILETPGEDPHLVGLYAVNYVRGLQDVVGAENTTDLNSRPLKVSSC
CKHYAAYDLDNWKGADRVHFDARVSVQDMAETFVLPFEMCVKEGDVSSVMCSYNKINGIP
SCADSRLLKQTIRGEWDLHGYIVSDCDSVEVMAVDQKWLDSSFSDSAAQALNAGMNLDCG
TFNNRSLTEAVNQGKANQADLDHSLRYLYVLLMRVGFFDGIPAFASLGKDDICSAEHIEL
AREAARQGIVLLKNDNATLPLKSVKNIALVGPHANATDAMIGNYAGIPCYYVSPLDAFSS
MGEVRYEKGCADVQCLNETYIFNAMEAAKRADATIIFAGTDLSIEAEALDRVDLLLPGYQ
TQLINQVADLSTGPVVLVIMSGGGVDISFARDNPKIAAILWAGYPGEQGGNAIADVILGK
YNPGGRLPITWYEADYVDMLPMTSMALRPVDSLGYPGRTYKFFNGSTVYPFGYGMSYTNF
SYSLSTSQRWTNINLRKLQRCRSMVYINDTFVPDCPAVLVDDLSCKESIEFEVAVKNVGR
MDGSEVVVVYSSPPLGIAGTHIKKVVGFERVFVKVGGTEKVKFSMNVCKSLGIVDSTGYA
LLPSGSHTIKVGGDNTTSVAFPFHVNYVN

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_05s0020g00540.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:5:2429184:2432197:1 gene:VIT_05s0020g00540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGGAAAGTTGTTGAGGTCTTTGTTTTTCTCTCTTTCCATTGTTTGGATTGCGTTCTTT
GCTGTTTGTTCAGCAATAAAATCTCCGTTGAAGGATGGTCCAGCTGCAGCTCCAATGGCT
GCAAGAGGTCCAATAGATGGAAATTACACTTACGTCTGTGATGAATCAAGGTTTGCTGCA
CTAGGCCTTGATATGAAAGATTTCCATTACTGTGATTCCTCATCCCCATATGAGGTTCGG
GCGAAGGATTTAGTAGACAGAATGACTCTGTCAGAAAAGGTGATGCAGACCGGAGACCAA
GCTTCCGGGGTGGAAAGAATAGGATTGCCCAAGTACAATTGGTGGTCGGAGGCCCTCCAC
GGCGTCTCTAACTTCGGCCGGTGTGTCTTCTTCGACGAAGTTGTTCCGGGAGCCACCAGC
TTTCCCACTGTAATCCTCTCAGCTGCATCTTTCAACCAGTCGCTGTGGAAAACCCTTGGC
CAGGCGGTTTCCACTGAGGCAAGAGCCATGTACAATTCAGGGAACGCGGGGTTGACATTT
TGGAGTCCAAACATCAACGTAGTGCGGGATCCCAGATGGGGAAGAATCCTCGAGACGCCC
GGGGAAGATCCTCATCTCGTTGGTTTGTATGCTGTTAATTACGTTAGAGGCCTGCAGGAT
GTTGTGGGAGCTGAGAACACCACGGACTTGAACTCTAGGCCCCTCAAGGTCTCTTCATGC
TGCAAGCATTATGCTGCCTATGATCTTGATAACTGGAAGGGCGCGGATCGGGTGCATTTT
GATGCAAGGGTTTCGGTGCAAGATATGGCTGAGACGTTTGTTCTTCCATTTGAGATGTGT
GTGAAAGAGGGTGATGTTAGCAGTGTGATGTGCTCTTACAATAAAATTAATGGAATTCCT
TCTTGTGCTGATTCAAGACTCCTCAAACAGACCATTAGAGGAGAATGGGATCTTCACGGA
TACATAGTTTCGGACTGTGATTCAGTGGAAGTGATGGCGGTTGATCAAAAATGGCTGGAT
AGTTCGTTTAGCGATTCTGCTGCACAAGCCCTAAATGCAGGCATGAACTTGGACTGCGGT
ACATTCAACAATCGTTCCCTGACTGAAGCAGTGAACCAAGGGAAAGCCAACCAGGCTGAC
CTAGACCACTCACTGAGGTACCTCTATGTTTTGCTGATGAGGGTGGGGTTCTTTGATGGT
ATCCCGGCTTTTGCCTCTCTTGGAAAGGATGATATCTGCAGTGCTGAACACATCGAGTTA
GCAAGGGAAGCTGCAAGACAAGGAATCGTTCTTTTGAAGAACGATAATGCGACTTTGCCA
CTGAAATCTGTTAAGAATATAGCGCTTGTTGGGCCTCATGCTAATGCCACTGATGCTATG
ATCGGAAACTATGCAGGTATCCCATGCTACTATGTCTCCCCACTTGATGCCTTTTCCTCA
ATGGGAGAAGTGAGATACGAGAAGGGATGCGCTGATGTTCAATGTCTGAACGAGACCTAC
ATCTTCAATGCCATGGAAGCTGCAAAGCGAGCAGATGCTACGATAATATTTGCAGGGACT
GATTTATCCATTGAGGCTGAGGCCTTGGACAGAGTGGATCTCCTGCTTCCAGGCTACCAA
ACTCAGCTGATCAACCAAGTTGCCGACCTTTCCACCGGTCCTGTGGTTCTTGTGATCATG
TCTGGTGGCGGTGTCGATATTTCCTTTGCTCGGGACAACCCGAAAATCGCTGCCATCCTG
TGGGCCGGTTATCCTGGTGAGCAAGGAGGCAACGCCATTGCAGATGTTATCCTTGGGAAA
TACAATCCTGGAGGGAGATTACCAATCACATGGTATGAAGCAGATTATGTTGATATGCTG
CCCATGACATCTATGGCCCTGAGGCCAGTTGATAGCTTAGGGTATCCAGGGAGGACATAC
AAATTCTTCAATGGCTCCACTGTCTACCCATTTGGCTATGGAATGAGCTACACCAACTTC
TCCTACTCACTGTCAACTTCCCAAAGGTGGACCAACATCAACTTGAGAAAGCTCCAAAGG
TGCCGCAGCATGGTTTACATCAACGATACTTTCGTACCAGACTGTCCAGCAGTTCTCGTT
GATGATTTAAGTTGTAAGGAGAGTATTGAGTTTGAGGTTGCAGTGAAGAATGTGGGGAGG
ATGGATGGAAGTGAAGTGGTTGTTGTTTACTCAAGCCCTCCATTGGGGATTGCTGGGACT
CATATCAAGAAAGTGGTTGGATTTGAGAGGGTTTTTGTGAAGGTAGGAGGTACAGAGAAG
GTGAAGTTTTCTATGAATGTCTGCAAGAGCTTGGGTATTGTGGACAGTACTGGTTATGCC
CTTTTGCCTTCTGGTTCTCACACCATCAAGGTTGGGGGTGATAATACAACTTCAGTCGCG
TTTCCTTTTCATGTCAACTACGTTAATTAA