Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g00530.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:2419711:2422722:-1 gene:VIT_05s0020g00530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAAAGAGTTTCACCCGTTTGTTTTTCTCTCTATCTATCCTCGCCATTGCTTTCTTG GCTGTTTCCACAGCAAGATACACACCCAGGCCCAACTCCAGGTTTCTATCACAGGCCTTT GATGTGCCTGGGAACTACACTTATGTCTGTGACGCGTCAAGGTTCGCTGCACTAGGTCTT GATATGAAGGACTTTGTGTATTGTGATTCTTCACTTCCATATGATGTCAGGGTAAAGGAC TTAGTTGATCGAATCACGCTAGAAGAAAAAGCAAGGAATGTTATAGATGTAGCTTCTGGG GTGCCAAGGATAGGATTACCTCCTTACAAATGGTGGTCAGAGGCGCTGCATGGAGTCGCA AACGTTGGTTCGGCGACCTTCTTCGATGAGGTTGTCCCAGGCGCAACAAGCTTTCCAAAT GTTATACTCTCCGCTGCTTCATTCAATCAGTCACTATGGAAGACTCTTGGCCAGGTTGTT TCGACGGAAGCAAGAGCGATGTACAATTTAGGGCATGCGGGGTTGACGTTTTGGAGTCCA AACATCAATGTAGCGCGAGATCCCAGATGGGGAAGGATCCTAGAGACACCGGGGGAAGAT CCTCTCACTGTTGGCGTGTATGGGGTTAACTACGTTAGAGGTCTTCAGGATATTGAGGGG ACGGAGAACACCACAGATTTGAACTCTAGGCCTCTAAAGATCGCCTCCTCCTGCAAGCAT TTTGCTGCTTACGATCTTGATCAGTGGTTTAATGTTGACAGACGCCATTTTGATGCAAAG GTGTCGGAGCAAGATATGACGGAAACGTTTCTTCGTCCTTTTGAGATGTGTGTTAAAGAG GGTGATACCAGCAGTGTTATGTGCTCCTTCAATAATATCAATGGAATCCCTCCTTGTGCT GATCCAAGATTCTTGAAAGGGGTTATAAGAGAACAATGGAATCTTCATGGGTATATAGTA TCAGATTGTTGGGCCATTGATACCATTGTGCAAGACCAGAAATTCCTTGATGTCACAAGT GAGGAAGGTGTTGCATTGAGTATGAAAGCAGGTTTGGATTTGGAATGTGGGCATTACTAC AACGATTCCCTTGCTACAGCAGTGAGGGAAGGGAGAGTCAGTGAGCATGACGTCGACAAG TCCCTGAGTTACCTCTATGTCGTGCTGATGAGGGTCGGATTCTTTGATGGCATCCCGTCT CTTGCTTCTCTTGGGAAGAAGGATATCTGCAATGATGAACACATAGAGCTGGCCAGGGAA GCCGCGAGACAAGGCATTGTTCTTCTGAAGAACGATAATGCGACTTTGCCGCTGAAACCT GTAAAGAAGCTGGCTTTGGTTGGGCCTCATGCCAATGCCACTGTAGCTATGATTGGAAAT TATGCAGGGATCCCATGCCATTATGTGTCTCCTCTTGATGCCTTCTCTGAGCTTGGAGAT GTGACATATGAAGTAGGATGTGCTGATGTTAAATGTCATAATGACACCCACGTCTACAAG GCTGCAGAAGCTGCGAAAAATGCTGATGCTACTATCATTCTGGTGGGTACTGATTTATCC ATTGAGGCTGAGGAGAGGGATAGAGAGGATCTCCTCCTTCCTGGCTACCAAACTGAGATG GTCAACCAAGTTACTGATCTCTCCACTGGTCCTGTAATTCTTGTAGTAATGTGTGGTGGC CCTATTGACATTTCCTTTGCTAAGAACAACCCTAAGATCGCAGCCATCCTGTGGGCTGGT TTTCCGGGTGAGCAAGGCGGCAATGCTATTGCAGACATTGTTTTTGGGAAGTACAATCCT GGGGGAAGATCGCCAATCACATGGTATGAAAATGGTTATGTTGGCATGCTGCCCATGACC TCCATGGCACTAAGGCCAATCGAGAGCTTAGGCTATCCAGGGAGAACATACAAATTCTTC AATGGCTCCACTGTCTATCCCTTTGGCTATGGCTTGAGCTACACCAACTTCTCCTACTCC CTAACAGCCCCCACAAGGTCGGTCCACATTAGCCTGACCAGGTTGCAACAGTGCCGGAGC ATGGCTTACAGCAGTGATAGCTTCCAGCCAGAATGCTCAGCAGTCCTAGTTGACGATTTG AGCTGTGATGAAAGTTTTGAGTTTCAGGTTGCAGTGAAGAATGTGGGAAGCATGGATGGA AGTGAAGTTGTGATGGTCTACTCAAGCCCTCCATCAGGGATTGTCGGAACTCATATTAAG CAAGTGATCGGATTTGAGAGAGTGTTTGTGAAGGTAGGAAATACAGAGAAGGTGAAGTTT TCCATGAACGTTTGCAAGAGTTTGGGCCTTGTTGATAGTAGTGGTTATATCCTATTGCCT TCTGGTTCCCACACCATCATGGCTGGAGACAATTCAACTTCAGTCTCATTTCCCTTTCAA GTGAACTACCATAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g00530.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:2419711:2422722:-1 gene:VIT_05s0020g00530 transcript:VIT_05s0020g00530.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAKSFTRLFFSLSILAIAFLAVSTARYTPRPNSRFLSQAFDVPGNYTYVCDASRFAALGL DMKDFVYCDSSLPYDVRVKDLVDRITLEEKARNVIDVASGVPRIGLPPYKWWSEALHGVA NVGSATFFDEVVPGATSFPNVILSAASFNQSLWKTLGQVVSTEARAMYNLGHAGLTFWSP NINVARDPRWGRILETPGEDPLTVGVYGVNYVRGLQDIEGTENTTDLNSRPLKIASSCKH FAAYDLDQWFNVDRRHFDAKVSEQDMTETFLRPFEMCVKEGDTSSVMCSFNNINGIPPCA DPRFLKGVIREQWNLHGYIVSDCWAIDTIVQDQKFLDVTSEEGVALSMKAGLDLECGHYY NDSLATAVREGRVSEHDVDKSLSYLYVVLMRVGFFDGIPSLASLGKKDICNDEHIELARE AARQGIVLLKNDNATLPLKPVKKLALVGPHANATVAMIGNYAGIPCHYVSPLDAFSELGD VTYEVGCADVKCHNDTHVYKAAEAAKNADATIILVGTDLSIEAEERDREDLLLPGYQTEM VNQVTDLSTGPVILVVMCGGPIDISFAKNNPKIAAILWAGFPGEQGGNAIADIVFGKYNP GGRSPITWYENGYVGMLPMTSMALRPIESLGYPGRTYKFFNGSTVYPFGYGLSYTNFSYS LTAPTRSVHISLTRLQQCRSMAYSSDSFQPECSAVLVDDLSCDESFEFQVAVKNVGSMDG SEVVMVYSSPPSGIVGTHIKQVIGFERVFVKVGNTEKVKFSMNVCKSLGLVDSSGYILLP SGSHTIMAGDNSTSVSFPFQVNYHN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g00530.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:2419711:2422722:-1 gene:VIT_05s0020g00530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAAAGAGTTTCACCCGTTTGTTTTTCTCTCTATCTATCCTCGCCATTGCTTTCTTG GCTGTTTCCACAGCAAGATACACACCCAGGCCCAACTCCAGGTTTCTATCACAGGCCTTT GATGTGCCTGGGAACTACACTTATGTCTGTGACGCGTCAAGGTTCGCTGCACTAGGTCTT GATATGAAGGACTTTGTGTATTGTGATTCTTCACTTCCATATGATGTCAGGGTAAAGGAC TTAGTTGATCGAATCACGCTAGAAGAAAAAGCAAGGAATGTTATAGATGTAGCTTCTGGG GTGCCAAGGATAGGATTACCTCCTTACAAATGGTGGTCAGAGGCGCTGCATGGAGTCGCA AACGTTGGTTCGGCGACCTTCTTCGATGAGGTTGTCCCAGGCGCAACAAGCTTTCCAAAT GTTATACTCTCCGCTGCTTCATTCAATCAGTCACTATGGAAGACTCTTGGCCAGGTTGTT TCGACGGAAGCAAGAGCGATGTACAATTTAGGGCATGCGGGGTTGACGTTTTGGAGTCCA AACATCAATGTAGCGCGAGATCCCAGATGGGGAAGGATCCTAGAGACACCGGGGGAAGAT CCTCTCACTGTTGGCGTGTATGGGGTTAACTACGTTAGAGGTCTTCAGGATATTGAGGGG ACGGAGAACACCACAGATTTGAACTCTAGGCCTCTAAAGATCGCCTCCTCCTGCAAGCAT TTTGCTGCTTACGATCTTGATCAGTGGTTTAATGTTGACAGACGCCATTTTGATGCAAAG GTGTCGGAGCAAGATATGACGGAAACGTTTCTTCGTCCTTTTGAGATGTGTGTTAAAGAG GGTGATACCAGCAGTGTTATGTGCTCCTTCAATAATATCAATGGAATCCCTCCTTGTGCT GATCCAAGATTCTTGAAAGGGGTTATAAGAGAACAATGGAATCTTCATGGGTATATAGTA TCAGATTGTTGGGCCATTGATACCATTGTGCAAGACCAGAAATTCCTTGATGTCACAAGT GAGGAAGGTGTTGCATTGAGTATGAAAGCAGGTTTGGATTTGGAATGTGGGCATTACTAC AACGATTCCCTTGCTACAGCAGTGAGGGAAGGGAGAGTCAGTGAGCATGACGTCGACAAG TCCCTGAGTTACCTCTATGTCGTGCTGATGAGGGTCGGATTCTTTGATGGCATCCCGTCT CTTGCTTCTCTTGGGAAGAAGGATATCTGCAATGATGAACACATAGAGCTGGCCAGGGAA GCCGCGAGACAAGGCATTGTTCTTCTGAAGAACGATAATGCGACTTTGCCGCTGAAACCT GTAAAGAAGCTGGCTTTGGTTGGGCCTCATGCCAATGCCACTGTAGCTATGATTGGAAAT TATGCAGGGATCCCATGCCATTATGTGTCTCCTCTTGATGCCTTCTCTGAGCTTGGAGAT GTGACATATGAAGTAGGATGTGCTGATGTTAAATGTCATAATGACACCCACGTCTACAAG GCTGCAGAAGCTGCGAAAAATGCTGATGCTACTATCATTCTGGTGGGTACTGATTTATCC ATTGAGGCTGAGGAGAGGGATAGAGAGGATCTCCTCCTTCCTGGCTACCAAACTGAGATG GTCAACCAAGTTACTGATCTCTCCACTGGTCCTGTAATTCTTGTAGTAATGTGTGGTGGC CCTATTGACATTTCCTTTGCTAAGAACAACCCTAAGATCGCAGCCATCCTGTGGGCTGGT TTTCCGGGTGAGCAAGGCGGCAATGCTATTGCAGACATTGTTTTTGGGAAGTACAATCCT GGGGGAAGATCGCCAATCACATGGTATGAAAATGGTTATGTTGGCATGCTGCCCATGACC TCCATGGCACTAAGGCCAATCGAGAGCTTAGGCTATCCAGGGAGAACATACAAATTCTTC AATGGCTCCACTGTCTATCCCTTTGGCTATGGCTTGAGCTACACCAACTTCTCCTACTCC CTAACAGCCCCCACAAGGTCGGTCCACATTAGCCTGACCAGGTTGCAACAGTGCCGGAGC ATGGCTTACAGCAGTGATAGCTTCCAGCCAGAATGCTCAGCAGTCCTAGTTGACGATTTG AGCTGTGATGAAAGTTTTGAGTTTCAGGTTGCAGTGAAGAATGTGGGAAGCATGGATGGA AGTGAAGTTGTGATGGTCTACTCAAGCCCTCCATCAGGGATTGTCGGAACTCATATTAAG CAAGTGATCGGATTTGAGAGAGTGTTTGTGAAGGTAGGAAATACAGAGAAGGTGAAGTTT TCCATGAACGTTTGCAAGAGTTTGGGCCTTGTTGATAGTAGTGGTTATATCCTATTGCCT TCTGGTTCCCACACCATCATGGCTGGAGACAATTCAACTTCAGTCTCATTTCCCTTTCAA GTGAACTACCATAATTAG