Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_05s0020g00520.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:5:2414688:2417615:-1 gene:VIT_05s0020g00520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGACAGGTTTCAGATTTCTGTTGTTTTGTCTTTCAATGCTTTCCGTTGCTTCCTGG GCTGTATCTACAGGGCAGTCCAGGCTTTTGATGGATGATTTCGTGGGTGAGTATGGTGAT TTGGCTAAAAATTACACCTATGTTTGCGATGAATCAAGATATGCTTTGCTGGGTCTTGAT ATGAAGAGCTTTGCCTTCTGTGATAAATCACTTTCGTACAAGGAGAGGGCAAAGGATTTG GTGAGTCGAATGACTCTACAAGAAAAGGTGATGCAGTCTGTGCATACAGCTTCTGGGGTG AGAAGACTAGGATTGCCGGAGTATTCCTGGTGGTCGGAGGCGCTGCACGGTATCTCGAAC CTCGGCCCCGGCGTCTTCTTCGACGAGACTATTCCTGGAGCAACGAGCCTTCCCACTGTT ATACTCTCAACTGCAGCCTTCAATCAAACACTGTGGAAGACTCTTGGACGGGTTGTTTCG ACGGAAGGTAGAGCCATGTACAATTTGGGGCATGCCGGGTTGACGTTTTGGAGTCCAAAC ATCAATGTAGTACGTGATACAAGATGGGGAAGGACCCAAGAGACATCCGGTGAAGATCCT TTCATTGTTGGTGAGTTTGCAGTTAACTACGTTAGAGGCCTGCAGGATGTTGAGGGGACA GAGAACGTTACGGATTTGAACTCTAGGCCTCTCAAGGTCTCCTCATGCTGCAAGCATTAT GCTGCTTATGATATTGATTCATGGCTTAACGTCGATCGACACACTTTCGATGCAAGGGTT TCTGAGCAAGATATGAAGGAGACTTTTGTCTCTCCATTTGAGAGGTGCGTCAGAGAGGGT GATGTAAGCAGTGTTATGTGCTCCTTCAATAAAATCAATGGAATCCCTCCTTGTTCTGAT CCAAGACTCTTGAAAGGAGTGATAAGAGACGAATGGGATCTTCACGGATACATAGTATCT GATTGTTATGGTCTTGAGGTGATTGTGGACAATCAAAACTACCTTAATGACTCAAAGGTG GATGCTGTTGCAAAAACCCTACAAGCAGGGTTGGATTTGGAATGTGGCCATTACTATACT GATGCCCTTAACGAATCAGTCCTGACTGGGAAAGTGAGTCAGTATGAACTAGACCGGGCG TTGAAGAATATTTATGTTCTGCTTATGAGGGTTGGATACTTTGATGGTATCCCAGCGTAT GAGTCGCTTGGACTGAAGGATATCTGTGCTGCCGATCACATTGAGTTGGCAAGGGAAGCC GCAAGACAAGGGATCGTTCTTCTGAAGAATGATTATGAAGTTTTGCCATTAAAACCTGGA AAAAAGATAGCATTGGTTGGGCCCCATGCCAATGCTACTGAAGTTATGATTGGAAACTAT GCAGGGCTGCCCTGCAAGTATGTATCTCCTCTTGAAGCCTTTTCTGCCATTGGAAACGTC ACGTATGCGACGGGCTGTTTGGATGCTTCATGCAGTAACGATACCTATTTCTCTGAAGCA AAAGAAGCTGCAAAATCTGCAGAAGTTACCATCATTTTCGTAGGGACTGACTTATCGATC GAGGCTGAGTTCGTAGATAGAGTTGATTTCCTACTCCCAGGCAACCAAACAGAGCTGATC AAACAAGTTGCTGAAGTCTCCAGTGGTCCTGTGATTCTTGTAGTCCTCAGTGGTAGCAAT ATTGACATCACTTTTGCTAAAAATAATCCCAGAATCTCAGCCATCCTCTGGGTTGGTTTT CCTGGGGAGCAAGGCGGACACGCCATTGCAGATGTTGTTTTTGGGAAGTATAATCCTGGA GGAAGACTACCAGTGACATGGTATGAAGCTGATTATGTTGATATGCTGCCGATGTCCTCC ATGTCACTAAGGCCAGTTGATGAACTAGGCTACCCAGGGAGGACATACAAATTCTTCGAT GGCTCCACAGTCTACCCCTTTGGCTATGGCATGAGCTACACCAAGTTCTCCTACTCATTA GCCACCTCGAAAATATCCATCGACATCGACTTGAACAAGTTCCAGAAATGCCGCACAGTG GCTTACACAGAAGATCAAAAGGTACCATCATGCCCAGCAGTTCTACTGGACGACATGAGT TGTGATGACACCATTGAGTTTGAGGTTGCAGTGACCAATGTGGGGATGGTGGACGGAAGT GAGGTGCTCATGGTTTACTCAATCCCTCCATCTGGAATTGTTGGAACTCATATTAAGCAA GTGATTGGATTCCAGAAAGTTTTTGTAGCTGCAGGAGATACTGAGAGGGTGAAGTTTTCC ATGAATGCTTGCAAGAGCTTGAGGATTGTTGATAGCACTGGTTATTCACTCTTGCCATCT GGGTCTCACACCATCAGGGTTGGAGATTATTCAAATTCAGCTTCATACTCTCTTCAAGTG AATTACCATTATCATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_05s0020g00520.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:5:2414688:2417615:-1 gene:VIT_05s0020g00520 transcript:VIT_05s0020g00520.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MATGFRFLLFCLSMLSVASWAVSTGQSRLLMDDFVGEYGDLAKNYTYVCDESRYALLGLD MKSFAFCDKSLSYKERAKDLVSRMTLQEKVMQSVHTASGVRRLGLPEYSWWSEALHGISN LGPGVFFDETIPGATSLPTVILSTAAFNQTLWKTLGRVVSTEGRAMYNLGHAGLTFWSPN INVVRDTRWGRTQETSGEDPFIVGEFAVNYVRGLQDVEGTENVTDLNSRPLKVSSCCKHY AAYDIDSWLNVDRHTFDARVSEQDMKETFVSPFERCVREGDVSSVMCSFNKINGIPPCSD PRLLKGVIRDEWDLHGYIVSDCYGLEVIVDNQNYLNDSKVDAVAKTLQAGLDLECGHYYT DALNESVLTGKVSQYELDRALKNIYVLLMRVGYFDGIPAYESLGLKDICAADHIELAREA ARQGIVLLKNDYEVLPLKPGKKIALVGPHANATEVMIGNYAGLPCKYVSPLEAFSAIGNV TYATGCLDASCSNDTYFSEAKEAAKSAEVTIIFVGTDLSIEAEFVDRVDFLLPGNQTELI KQVAEVSSGPVILVVLSGSNIDITFAKNNPRISAILWVGFPGEQGGHAIADVVFGKYNPG GRLPVTWYEADYVDMLPMSSMSLRPVDELGYPGRTYKFFDGSTVYPFGYGMSYTKFSYSL ATSKISIDIDLNKFQKCRTVAYTEDQKVPSCPAVLLDDMSCDDTIEFEVAVTNVGMVDGS EVLMVYSIPPSGIVGTHIKQVIGFQKVFVAAGDTERVKFSMNACKSLRIVDSTGYSLLPS GSHTIRVGDYSNSASYSLQVNYHYH

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_05s0020g00520.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:5:2414688:2417615:-1 gene:VIT_05s0020g00520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGACAGGTTTCAGATTTCTGTTGTTTTGTCTTTCAATGCTTTCCGTTGCTTCCTGG GCTGTATCTACAGGGCAGTCCAGGCTTTTGATGGATGATTTCGTGGGTGAGTATGGTGAT TTGGCTAAAAATTACACCTATGTTTGCGATGAATCAAGATATGCTTTGCTGGGTCTTGAT ATGAAGAGCTTTGCCTTCTGTGATAAATCACTTTCGTACAAGGAGAGGGCAAAGGATTTG GTGAGTCGAATGACTCTACAAGAAAAGGTGATGCAGTCTGTGCATACAGCTTCTGGGGTG AGAAGACTAGGATTGCCGGAGTATTCCTGGTGGTCGGAGGCGCTGCACGGTATCTCGAAC CTCGGCCCCGGCGTCTTCTTCGACGAGACTATTCCTGGAGCAACGAGCCTTCCCACTGTT ATACTCTCAACTGCAGCCTTCAATCAAACACTGTGGAAGACTCTTGGACGGGTTGTTTCG ACGGAAGGTAGAGCCATGTACAATTTGGGGCATGCCGGGTTGACGTTTTGGAGTCCAAAC ATCAATGTAGTACGTGATACAAGATGGGGAAGGACCCAAGAGACATCCGGTGAAGATCCT TTCATTGTTGGTGAGTTTGCAGTTAACTACGTTAGAGGCCTGCAGGATGTTGAGGGGACA GAGAACGTTACGGATTTGAACTCTAGGCCTCTCAAGGTCTCCTCATGCTGCAAGCATTAT GCTGCTTATGATATTGATTCATGGCTTAACGTCGATCGACACACTTTCGATGCAAGGGTT TCTGAGCAAGATATGAAGGAGACTTTTGTCTCTCCATTTGAGAGGTGCGTCAGAGAGGGT GATGTAAGCAGTGTTATGTGCTCCTTCAATAAAATCAATGGAATCCCTCCTTGTTCTGAT CCAAGACTCTTGAAAGGAGTGATAAGAGACGAATGGGATCTTCACGGATACATAGTATCT GATTGTTATGGTCTTGAGGTGATTGTGGACAATCAAAACTACCTTAATGACTCAAAGGTG GATGCTGTTGCAAAAACCCTACAAGCAGGGTTGGATTTGGAATGTGGCCATTACTATACT GATGCCCTTAACGAATCAGTCCTGACTGGGAAAGTGAGTCAGTATGAACTAGACCGGGCG TTGAAGAATATTTATGTTCTGCTTATGAGGGTTGGATACTTTGATGGTATCCCAGCGTAT GAGTCGCTTGGACTGAAGGATATCTGTGCTGCCGATCACATTGAGTTGGCAAGGGAAGCC GCAAGACAAGGGATCGTTCTTCTGAAGAATGATTATGAAGTTTTGCCATTAAAACCTGGA AAAAAGATAGCATTGGTTGGGCCCCATGCCAATGCTACTGAAGTTATGATTGGAAACTAT GCAGGGCTGCCCTGCAAGTATGTATCTCCTCTTGAAGCCTTTTCTGCCATTGGAAACGTC ACGTATGCGACGGGCTGTTTGGATGCTTCATGCAGTAACGATACCTATTTCTCTGAAGCA AAAGAAGCTGCAAAATCTGCAGAAGTTACCATCATTTTCGTAGGGACTGACTTATCGATC GAGGCTGAGTTCGTAGATAGAGTTGATTTCCTACTCCCAGGCAACCAAACAGAGCTGATC AAACAAGTTGCTGAAGTCTCCAGTGGTCCTGTGATTCTTGTAGTCCTCAGTGGTAGCAAT ATTGACATCACTTTTGCTAAAAATAATCCCAGAATCTCAGCCATCCTCTGGGTTGGTTTT CCTGGGGAGCAAGGCGGACACGCCATTGCAGATGTTGTTTTTGGGAAGTATAATCCTGGA GGAAGACTACCAGTGACATGGTATGAAGCTGATTATGTTGATATGCTGCCGATGTCCTCC ATGTCACTAAGGCCAGTTGATGAACTAGGCTACCCAGGGAGGACATACAAATTCTTCGAT GGCTCCACAGTCTACCCCTTTGGCTATGGCATGAGCTACACCAAGTTCTCCTACTCATTA GCCACCTCGAAAATATCCATCGACATCGACTTGAACAAGTTCCAGAAATGCCGCACAGTG GCTTACACAGAAGATCAAAAGGTACCATCATGCCCAGCAGTTCTACTGGACGACATGAGT TGTGATGACACCATTGAGTTTGAGGTTGCAGTGACCAATGTGGGGATGGTGGACGGAAGT GAGGTGCTCATGGTTTACTCAATCCCTCCATCTGGAATTGTTGGAACTCATATTAAGCAA GTGATTGGATTCCAGAAAGTTTTTGTAGCTGCAGGAGATACTGAGAGGGTGAAGTTTTCC ATGAATGCTTGCAAGAGCTTGAGGATTGTTGATAGCACTGGTTATTCACTCTTGCCATCT GGGTCTCACACCATCAGGGTTGGAGATTATTCAAATTCAGCTTCATACTCTCTTCAAGTG AATTACCATTATCATTAG