Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0069g00930.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:9378968:9380842:-1 gene:VIT_04s0069g00930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGCTCGCTCCAACTCCTTCAAGCCTCCCCACCCTCTCTAAGCTCTGCCAAGGCTCAC AAATTGCCATTATATGGCCTTGATTCATGTTCAACCATGGCCGAGCTCAAGCAGTATCAT TCCCAAATCATCCGACTTGGCCTTTCAGCAGATAATGATGCAATGGGCAGAGTGATAAAG TTCTGTGCTATCTCCAAATCAGGTGATTTAAACTATGCTCTCGAAGTGTTTGATAAAATT CCTCACCCTGATGCATACATTTACAATACCATCTTTCGAGGTTACTTGCGGTGGCAGCTT GCCAGAAACTGCATTTTCATGTACTCCCGAATGTTACATAAATCTGTCTCACCCAACAAA TTCACCTACCCTCCTCTGATAAGAGCTTGTTGCATTGATTACGCTATTGAAGAAGGGAAG CAAATACATGCACATGTTTTAAAATTCGGGTTTGGTGCTGATGGGTTTTCTTTGAATAAT TTGATCCATATGTATGTGAATTTTCAATCTTTGGAGCAAGCAAGGAGGGTTTTTGATAAT ATGCCTCAGCGGGATGTTGTCTCCTGGACCAGTTTAATTACGGGGTATTCGCAATGGGGT TTTGTCGATAAAGCTCGTGAAGTTTTTGAATTGATGCCTGAGAGAAATTCTGTTTCTTGG AATGCCATGATTGCTGCTTATGTCCAGAGTAACCGTTTGCATGAGGCATTTGCTCTTTTT GATAGAATGAGATTGGAAAATGTGGTATTGGATAAATTTGTAGCAGCAAGTATGTTATCA GCCTGTACTGGATTAGGAGCCTTGGAGCAAGGGAAGTGGATACATGGATATATTGAGAAG AGTGGGATTGAATTGGACTCAAAACTTGCTACAACAGTTATTGACATGTACTGCAAATGT GGTTGCTTGGAAAAGGCCTCCGAAGTCTTTAATGAGTTGCCCCAAAAAGGAATTTCTTCT TGGAATTGTATGATTGGTGGGCTGGCAATGCATGGAAAAGGCGAGGCTGCCATTGAGCTT TTTAAGGAGATGGAGAGGGAGATGGTAGCCCCTGATGGCATCACTTTTGTGAATGTCCTC AGTGCATGCGCTCATTCAGGATTAGTTGAAGAGGGGAAACATTACTTTCAATATATGACT GAAGTTCTTGGTCTTAAGCCTGGTATGGAGCATTTTGGATGCATGGTTGACTTGCTTGGA AGAGCTGGACTGCTGGAGGAGGCAAGAAAGCTCATAAATGAGATGCCTGTGAATCCTGAT GCAGGTGTATTAGGTGCTCTTGTTGGTGCTTGTAGAATCCATGGAAACACTGAATTGGGT GAGCAAATAGGAAAGAAAGTAATTGAACTAGAGCCTCATAACAGTGGCCGCTATGTTTTA TTAGCTAATTTGTATGCCAGTGCTGGTCGATGGGAAGATGTTGCTAAGGTGAGAAAATTG ATGAATGACAGAGGAGTGAAGAAGGCTCCTGGTTTTTCCATGATTGAATCAGAAAGTGGT GTAGATGAATTCATTGCTGGAGGAAGGGCTCACCCACAAGCTAAAGAGATATATGCCAAA CTTGACGAGATATTAGAAACTATAAGATCTATTGGTTATGTGCCTGACACTGATGGGGTA TTGCATGATATTGACGAGGAGGAAAAGGAGAACCCCTTATACTACCACAGCGAGAAACTT GCAATTGCCTTTGGGTTGTTGAAGACTAAGCCTGGGGAAACTCTTCGCATCTCTAAGAAT TTGCGGATATGTAGAGATTGTCACCAAGCAAGTAAGCTTATCTCAAAAGTTTATGATCGT GAAATAATTATAAGGGACAGGAACAGATTCCACCATTTTAGAATGGGAGGGTGTTCTTGT AAGGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0069g00930.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:9378968:9380842:-1 gene:VIT_04s0069g00930 transcript:VIT_04s0069g00930.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSSLQLLQASPPSLSSAKAHKLPLYGLDSCSTMAELKQYHSQIIRLGLSADNDAMGRVIK FCAISKSGDLNYALEVFDKIPHPDAYIYNTIFRGYLRWQLARNCIFMYSRMLHKSVSPNK FTYPPLIRACCIDYAIEEGKQIHAHVLKFGFGADGFSLNNLIHMYVNFQSLEQARRVFDN MPQRDVVSWTSLITGYSQWGFVDKAREVFELMPERNSVSWNAMIAAYVQSNRLHEAFALF DRMRLENVVLDKFVAASMLSACTGLGALEQGKWIHGYIEKSGIELDSKLATTVIDMYCKC GCLEKASEVFNELPQKGISSWNCMIGGLAMHGKGEAAIELFKEMEREMVAPDGITFVNVL SACAHSGLVEEGKHYFQYMTEVLGLKPGMEHFGCMVDLLGRAGLLEEARKLINEMPVNPD AGVLGALVGACRIHGNTELGEQIGKKVIELEPHNSGRYVLLANLYASAGRWEDVAKVRKL MNDRGVKKAPGFSMIESESGVDEFIAGGRAHPQAKEIYAKLDEILETIRSIGYVPDTDGV LHDIDEEEKENPLYYHSEKLAIAFGLLKTKPGETLRISKNLRICRDCHQASKLISKVYDR EIIIRDRNRFHHFRMGGCSCKDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0069g00930.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:9378968:9380842:-1 gene:VIT_04s0069g00930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGCTCGCTCCAACTCCTTCAAGCCTCCCCACCCTCTCTAAGCTCTGCCAAGGCTCAC AAATTGCCATTATATGGCCTTGATTCATGTTCAACCATGGCCGAGCTCAAGCAGTATCAT TCCCAAATCATCCGACTTGGCCTTTCAGCAGATAATGATGCAATGGGCAGAGTGATAAAG TTCTGTGCTATCTCCAAATCAGGTGATTTAAACTATGCTCTCGAAGTGTTTGATAAAATT CCTCACCCTGATGCATACATTTACAATACCATCTTTCGAGGTTACTTGCGGTGGCAGCTT GCCAGAAACTGCATTTTCATGTACTCCCGAATGTTACATAAATCTGTCTCACCCAACAAA TTCACCTACCCTCCTCTGATAAGAGCTTGTTGCATTGATTACGCTATTGAAGAAGGGAAG CAAATACATGCACATGTTTTAAAATTCGGGTTTGGTGCTGATGGGTTTTCTTTGAATAAT TTGATCCATATGTATGTGAATTTTCAATCTTTGGAGCAAGCAAGGAGGGTTTTTGATAAT ATGCCTCAGCGGGATGTTGTCTCCTGGACCAGTTTAATTACGGGGTATTCGCAATGGGGT TTTGTCGATAAAGCTCGTGAAGTTTTTGAATTGATGCCTGAGAGAAATTCTGTTTCTTGG AATGCCATGATTGCTGCTTATGTCCAGAGTAACCGTTTGCATGAGGCATTTGCTCTTTTT GATAGAATGAGATTGGAAAATGTGGTATTGGATAAATTTGTAGCAGCAAGTATGTTATCA GCCTGTACTGGATTAGGAGCCTTGGAGCAAGGGAAGTGGATACATGGATATATTGAGAAG AGTGGGATTGAATTGGACTCAAAACTTGCTACAACAGTTATTGACATGTACTGCAAATGT GGTTGCTTGGAAAAGGCCTCCGAAGTCTTTAATGAGTTGCCCCAAAAAGGAATTTCTTCT TGGAATTGTATGATTGGTGGGCTGGCAATGCATGGAAAAGGCGAGGCTGCCATTGAGCTT TTTAAGGAGATGGAGAGGGAGATGGTAGCCCCTGATGGCATCACTTTTGTGAATGTCCTC AGTGCATGCGCTCATTCAGGATTAGTTGAAGAGGGGAAACATTACTTTCAATATATGACT GAAGTTCTTGGTCTTAAGCCTGGTATGGAGCATTTTGGATGCATGGTTGACTTGCTTGGA AGAGCTGGACTGCTGGAGGAGGCAAGAAAGCTCATAAATGAGATGCCTGTGAATCCTGAT GCAGGTGTATTAGGTGCTCTTGTTGGTGCTTGTAGAATCCATGGAAACACTGAATTGGGT GAGCAAATAGGAAAGAAAGTAATTGAACTAGAGCCTCATAACAGTGGCCGCTATGTTTTA TTAGCTAATTTGTATGCCAGTGCTGGTCGATGGGAAGATGTTGCTAAGGTGAGAAAATTG ATGAATGACAGAGGAGTGAAGAAGGCTCCTGGTTTTTCCATGATTGAATCAGAAAGTGGT GTAGATGAATTCATTGCTGGAGGAAGGGCTCACCCACAAGCTAAAGAGATATATGCCAAA CTTGACGAGATATTAGAAACTATAAGATCTATTGGTTATGTGCCTGACACTGATGGGGTA TTGCATGATATTGACGAGGAGGAAAAGGAGAACCCCTTATACTACCACAGCGAGAAACTT GCAATTGCCTTTGGGTTGTTGAAGACTAAGCCTGGGGAAACTCTTCGCATCTCTAAGAAT TTGCGGATATGTAGAGATTGTCACCAAGCAAGTAAGCTTATCTCAAAAGTTTATGATCGT GAAATAATTATAAGGGACAGGAACAGATTCCACCATTTTAGAATGGGAGGGTGTTCTTGT AAGGATTACTGGTGA