Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0044g01700.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:23532720:23544988:1 gene:VIT_04s0044g01700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGAGTGGAATTAGCAACCGATAGAGCTGGATTTCATGAAATGGAAGAAGTTAATTTC AGTGATTCGGAGTTAGTCTATCATGTCAGACACGCTCTTCAATCAGTCCCCTTGGGTGAT AGTGACAGTTATGACCAGCTGATTGGGGTACTGCACCATAAGGAACGCCTTGCTCCTGAC GAGGTGGCTCTGTTAGTGACGAGTTTAAAGGCCCTATCTGGAGCAGTTTCTTGTATAGAT ATGGTTCACCATAAGTCTTTGCTTTCTTCTATTTTTGGAATGAGCCTCTGGAACTATGGA CCTGATGTAATGGATGCGTTGCTTGAACTAATTTTATCCTTGGCTGCTTCTAGTGGGAAT TATCTTGATTGTTCTTTGGATATGCTTGTCAGCAACTTTATGCCCCCTTATTCTTTGCTA GATTTTCTGAAGCAGCCACGTGGTCTTGCAAGGAAAGACCAAGTTCTTTCACGTGTGCAT TCAACATTGAAGGATATTGCTGATCTGGTGCCTCTAGCCCCCTCAAGACTAGTTCCAATA GTAATCCAGAGAATGCCTAATGTGTTTACGAAGGAACCTTTGATTATGATATATGTGGAG AACATGTTAAGGTTGGAGGGTGGTGCAATTCGAGAACTTGTTGGGAACATGATGCTTGTG GCACTGATGGACAGGCTGGTAGACTTGGATGTAGAGATTGCATGGGAGGAAGTCTTACAA GATGACTGCAGCAAAGGCATATTTGAGATGGAGCTAGAAGACATGGAGGAGCCTGCAGAT GATGTTGAAAATGATGGTGGTGAGCTTCATAGAGGATCTTTAAGTCGAAAGAGTTTAGGG GGAAATTTAATTGCTGAAAAATTAGATAGCTTGATGGTGCTAACTTTCGAACATCTTGAA TCTTGTGAAGCGGGTGGCCGTTTGATTGAGGTATTTGAAACTCTCGTACTATCATTTCAG ACAACTGTTTTGAATGCATTCAAGTCAAAATTTGCTCAGTTTGTGATGTTCTATGCCTGT GCTCTCGACCCTGAAAATTGTGGTGTGAGATTTGCTAGGGTGCTTGCAGATTTTTTTGTT TGCAGTACTTTTCCACCGCTTAACAGAATGAGTGCTGTTGCTTACCTTGCAAGTTATTTG TCCCGTGGGAAGTTTCTGACAGCCTCCTTTGTTGCTAATATATTGGAAAGGCTGGTGGTT TGGTGTTTGGAATATTGCAAAATCCATGATGGTGACATAAATCCTAAAGCTCATCAAGTT TTTTATTCTGGATGTCAGGCCATCATGTATGTGCTCTGCTTCCGAATGAGGTCAATGATG AATGTTCCTCATCTCAGATCACAGCTTCTCCTTTTGCCTCTGGAGACAATCTTGAAGCAT CCATTAAGTCCATTGAAGGTATGCCTACCATCCATAGTGGAGGAATTCCTTCGCCAGGCA AAAGCAGCTCGGTTATTCACCGTGTCAGAGACCTTTATTTTTAGTGACCTGTTGGAGTCA GAACTTTCCAGGGCTTTTGGTGGGATTGAAAGGCTTGACATGTTCTTCCCATTCGACCCA TGTTTGCTGAAAAAATGTGACAGGTTCATCAGGCCAAATTTTGTGTACTGGTCAATGATC CGAACTACTTATGATGATGGAGAAGATAGCAGTGATGAAGAACCTGCTGAGGATTATGAG GCTAGTCATCCAGACGATGTTATGAATGATGATGCAATGGCTAGAAGCTATGATAGTCAT GACCTTGAACTTGATGAGTTCGACCACTCAATGAACAAAATGTCCATCACACCCAAGAAT TCTTTGTATTACAGGTTTGGAGATGAATTAAAGGTACAAATGCCCTCAAGAATCAGACCC TCTACAAGCCCAGAGTCATTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0044g01700.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:23532720:23544988:1 gene:VIT_04s0044g01700 transcript:VIT_04s0044g01700.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGVELATDRAGFHEMEEVNFSDSELVYHVRHALQSVPLGDSDSYDQLIGVLHHKERLAPD EVALLVTSLKALSGAVSCIDMVHHKSLLSSIFGMSLWNYGPDVMDALLELILSLAASSGN YLDCSLDMLVSNFMPPYSLLDFLKQPRGLARKDQVLSRVHSTLKDIADLVPLAPSRLVPI VIQRMPNVFTKEPLIMIYVENMLRLEGGAIRELVGNMMLVALMDRLVDLDVEIAWEEVLQ DDCSKGIFEMELEDMEEPADDVENDGGELHRGSLSRKSLGGNLIAEKLDSLMVLTFEHLE SCEAGGRLIEVFETLVLSFQTTVLNAFKSKFAQFVMFYACALDPENCGVRFARVLADFFV CSTFPPLNRMSAVAYLASYLSRGKFLTASFVANILERLVVWCLEYCKIHDGDINPKAHQV FYSGCQAIMYVLCFRMRSMMNVPHLRSQLLLLPLETILKHPLSPLKVCLPSIVEEFLRQA KAARLFTVSETFIFSDLLESELSRAFGGIERLDMFFPFDPCLLKKCDRFIRPNFVYWSMI RTTYDDGEDSSDEEPAEDYEASHPDDVMNDDAMARSYDSHDLELDEFDHSMNKMSITPKN SLYYRFGDELKVQMPSRIRPSTSPESL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0044g01700.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:23532720:23544988:1 gene:VIT_04s0044g01700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TGTATTAGTCGACAATGGGAGTGGAATTAGCAACCGATAGAGCTGGATTTCATGAAATGG AAGAAGTTAATTTCAGTGATTCGGAGTTAGTCTATCATGTCAGACACGCTCTTCAATCAG TCCCCTTGGGTGATAGTGACAGTTATGACCAGCTGATTGGGGTACTGCACCATAAGGAAC GCCTTGCTCCTGACGAGGTGGCTCTGTTAGTGACGAGTTTAAAGGCCCTATCTGGAGCAG TTTCTTGTATAGATATGGTTCACCATAAGTCTTTGCTTTCTTCTATTTTTGGAATGAGCC TCTGGAACTATGGACCTGATGTAATGGATGCGTTGCTTGAACTAATTTTATCCTTGGCTG CTTCTAGTGGGAATTATCTTGATTGTTCTTTGGATATGCTTGTCAGCAACTTTATGCCCC CTTATTCTTTGCTAGATTTTCTGAAGCAGCCACGTGGTCTTGCAAGGAAAGACCAAGTTC TTTCACGTGTGCATTCAACATTGAAGGATATTGCTGATCTGGTGCCTCTAGCCCCCTCAA GACTAGTTCCAATAGTAATCCAGAGAATGCCTAATGTGTTTACGAAGGAACCTTTGATTA TGATATATGTGGAGAACATGTTAAGGTTGGAGGGTGGTGCAATTCGAGAACTTGTTGGGA ACATGATGCTTGTGGCACTGATGGACAGGCTGGTAGACTTGGATGTAGAGATTGCATGGG AGGAAGTCTTACAAGATGACTGCAGCAAAGGCATATTTGAGATGGAGCTAGAAGACATGG AGGAGCCTGCAGATGATGTTGAAAATGATGGTGGTGAGCTTCATAGAGGATCTTTAAGTC GAAAGAGTTTAGGGGGAAATTTAATTGCTGAAAAATTAGATAGCTTGATGGTGCTAACTT TCGAACATCTTGAATCTTGTGAAGCGGGTGGCCGTTTGATTGAGGTATTTGAAACTCTCG TACTATCATTTCAGACAACTGTTTTGAATGCATTCAAGTCAAAATTTGCTCAGTTTGTGA TGTTCTATGCCTGTGCTCTCGACCCTGAAAATTGTGGTGTGAGATTTGCTAGGGTGCTTG CAGATTTTTTTGTTTGCAGTACTTTTCCACCGCTTAACAGAATGAGTGCTGTTGCTTACC TTGCAAGTTATTTGTCCCGTGGGAAGTTTCTGACAGCCTCCTTTGTTGCTAATATATTGG AAAGGCTGGTGGTTTGGTGTTTGGAATATTGCAAAATCCATGATGGTGACATAAATCCTA AAGCTCATCAAGTTTTTTATTCTGGATGTCAGGCCATCATGTATGTGCTCTGCTTCCGAA TGAGGTCAATGATGAATGTTCCTCATCTCAGATCACAGCTTCTCCTTTTGCCTCTGGAGA CAATCTTGAAGCATCCATTAAGTCCATTGAAGGTATGCCTACCATCCATAGTGGAGGAAT TCCTTCGCCAGGCAAAAGCAGCTCGGTTATTCACCGTGTCAGAGACCTTTATTTTTAGTG ACCTGTTGGAGTCAGAACTTTCCAGGGCTTTTGGTGGGATTGAAAGGCTTGACATGTTCT TCCCATTCGACCCATGTTTGCTGAAAAAATGTGACAGGTTCATCAGGCCAAATTTTGTGT ACTGGTCAATGATCCGAACTACTTATGATGATGGAGAAGATAGCAGTGATGAAGAACCTG CTGAGGATTATGAGGCTAGTCATCCAGACGATGTTATGAATGATGATGCAATGGCTAGAA GCTATGATAGTCATGACCTTGAACTTGATGAGTTCGACCACTCAATGAACAAAATGTCCA TCACACCCAAGAATTCTTTGTATTACAGGTTTGGAGATGAATTAAAGGTACAAATGCCCT CAAGAATCAGACCCTCTACAAGCCCAGAGTCATTATGATCCCTTCATGCCTACTGGGTAG ATGAGGAGTGGAATTTTGCTCTCACACTGACAGAAGAGTAACCTGATAATTGATGAGTGG TTGCTCCTGTCTCTTGAAAAGGTGAGCCAATTTTGATCAGAGGTTGCTCCAACCAGTCTC TTCAAAGTTAAGTTGTGGGTTGGCCTGAATAGATAGAAAATGTGTTGTATACGATTTTGC TACATCAATCGCCCGATCATATATCATATCTCATATATATATTTATATATAAGTAGCAGT CCTGTGATTGGTCAAACGTTGGTTTTAGTTCATGATTACTGTATTTCAAATTCACTCACT GGGCCGAGCTAAAATGAAGCTGAATCAGGCCTTAAAAATCTAATGTTGTATGGTGATATT ATCAAATAATGAGAAAGGATGTC