Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0023g02490.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:19037316:19039835:-1 gene:VIT_04s0023g02490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTCAAATTCTGTACAAAGACATGTCTCTTCATTCTCCCGAAAACCTCCTATTGTCAG CTGCAAACTCAATCTTTCATTCCCTTCTCTGTACGCCAAGAACAAAAGATTTTAGAATCG CGGCTTGTGTCAGTCCTTCATGGCTGCACCCACATCAACCAAGTCAAACAAGTGCACGCC CACATCTTCCGAAAGGGTCTGGAACAGTGCTGCTTTGTTCTCGCCAAGCTCCTCCGTACG CTCACCAAACTCGATGTCCCAATGGACCCCTATCCGCGCCTTGTCTTCCAACAAGTTGAA TACCCCAACCCATTTCTTTGGACCGCGCTTATTCGCGGTTACGCTCTTCAAGGGCCCTTT ATGGAATCGGTTCTTCTGTATAATAGTATGAGAAGGCAAGGCATTGGCCCTGTTTCGTTT ACTTTTACTGCACTGCTCAAGGCTTGTAGCGCTGCTCTTGATGTCAATTTGGGGAGGCAG GTACATACCCAGACGATTTTGATTGGCGGGTTTGGTTCTGATTTATATGTTGGGAATACT TTGATTGATATGTATGTGAAATGCGGGTGTTTGGGTTGTGGACATCGGGTATTCGATGAA ATGCTGGACAGAGATGTGATTTCTTGGACTTCTTTGATTGTTGCATATGCGAAGGTTGGA AACATGGAGGCTGCAAGTGAGTTGTTTGATGGATTACCCATGAAGGATATGGTGGCATGG ACAGCAATGGTCACAGGGTATGCCCAAAATGCTAGGCCAAGAGAGGCATTGGAAGTTTTT GAAAGAATGCAGGCTGCAGGCGTTAAAACGGATGAGGTTACCTTGGTTGGTGTCATTTCA GCATGTGCTCAACTAGGTGCAGCTAAGTATGCTAATTGGGTCCGGGACGTTGCAGAGCAA TCTGGATTTGGGCCTACCAGTAATGTTGTTGTGGGATCTGCATTGATTGATATGTATGCG AAGTGTGGGAGCGTAGAAGATGCTTACAAGGTTTTTGAAAGAATGGAGGAAAGGAATGTG TATTCTTATAGTTCAATGATTGTGGGGTTTGCAATGCATGGTTTGGCTGGTGCTGCAATG GAATTATTTGATGAGATGTTGAAGACAGAGATAAAACCAAACAGGGTCACGTTTATAGGT GTTCTTACTGCTTGCAGCCATGCAGGTATGGTAGAACAAGGTCAGCAATTATTCGCAATG ATGGAAGAATGTCATGGTGTTGCACCATCAGAGGATCACTATGCCTGCATGGTGGATCTT CTTGGTCGAGCTGGACGCTTGGAAGAAGCTCTCAACCTTGTAAAAATGATGCCCATGAAT CCCCATGGGGGCGTGTGGGGAGCACTGCTTGGGGCATGTCGCATCCACGGGAATCCTGAT ATGGCCCAGATTGCTGCAAGCCATTTGTTTGAGCTTGAACCCAATGGTATTGGGAACTAC ATCTTGCTTTCCAATATATATGCTTCAGCAGGCAGGTGGGATGATGTTTCAAAGGTAAGG AAGTTAATGAGGGCGAAGGGTCTGAAAAAGAATCCTGGATGCAGCTGGGTTGAAGGAAAG AAAGGGATAATTCACGAGTTCTTTGCAGGTGATATGTCCCATCCGAAGTCCAGGGAGATT AAGCAGGCACTGGAGGATCTTCTCGACAGATTAAAGTATCTTGGCTACCAGCCAAACCTG AGTTCTGTGGCCTATGACATTAGTGATGAAGAGAAGAAGCGGTTGCTAATGAGTCATAGT GAGAAGCTTGCTCTGGCGTTTGGCCTGCTCACTACAAATGCTGGGTGCACCATTAGAATT GTGAAGAACCTCAGGATATGCGAAGATTGCCATTCAGTAATGTGTGGTGCTTCTCAGATC ACAGGGAGAGAAATTGTTGTCAGGGATAACATGAGATTCCACCATTTTCGCGATGGGAGA TGCTCCTGTGGTAACTTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0023g02490.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:19037316:19039835:-1 gene:VIT_04s0023g02490 transcript:VIT_04s0023g02490.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVKFCTKTCLFILPKTSYCQLQTQSFIPFSVRQEQKILESRLVSVLHGCTHINQVKQVHA HIFRKGLEQCCFVLAKLLRTLTKLDVPMDPYPRLVFQQVEYPNPFLWTALIRGYALQGPF MESVLLYNSMRRQGIGPVSFTFTALLKACSAALDVNLGRQVHTQTILIGGFGSDLYVGNT LIDMYVKCGCLGCGHRVFDEMLDRDVISWTSLIVAYAKVGNMEAASELFDGLPMKDMVAW TAMVTGYAQNARPREALEVFERMQAAGVKTDEVTLVGVISACAQLGAAKYANWVRDVAEQ SGFGPTSNVVVGSALIDMYAKCGSVEDAYKVFERMEERNVYSYSSMIVGFAMHGLAGAAM ELFDEMLKTEIKPNRVTFIGVLTACSHAGMVEQGQQLFAMMEECHGVAPSEDHYACMVDL LGRAGRLEEALNLVKMMPMNPHGGVWGALLGACRIHGNPDMAQIAASHLFELEPNGIGNY ILLSNIYASAGRWDDVSKVRKLMRAKGLKKNPGCSWVEGKKGIIHEFFAGDMSHPKSREI KQALEDLLDRLKYLGYQPNLSSVAYDISDEEKKRLLMSHSEKLALAFGLLTTNAGCTIRI VKNLRICEDCHSVMCGASQITGREIVVRDNMRFHHFRDGRCSCGNFW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0023g02490.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:19037316:19039835:-1 gene:VIT_04s0023g02490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CCAATGAACCGTGAAATCGCGTGTAATGGTCAAATTCTGTACAAAGACATGTCTCTTCAT TCTCCCGAAAACCTCCTATTGTCAGCTGCAAACTCAATCTTTCATTCCCTTCTCTGTACG CCAAGAACAAAAGATTTTAGAATCGCGGCTTGTGTCAGTCCTTCATGGCTGCACCCACAT CAACCAAGTCAAACAAGTGCACGCCCACATCTTCCGAAAGGGTCTGGAACAGTGCTGCTT TGTTCTCGCCAAGCTCCTCCGTACGCTCACCAAACTCGATGTCCCAATGGACCCCTATCC GCGCCTTGTCTTCCAACAAGTTGAATACCCCAACCCATTTCTTTGGACCGCGCTTATTCG CGGTTACGCTCTTCAAGGGCCCTTTATGGAATCGGTTCTTCTGTATAATAGTATGAGAAG GCAAGGCATTGGCCCTGTTTCGTTTACTTTTACTGCACTGCTCAAGGCTTGTAGCGCTGC TCTTGATGTCAATTTGGGGAGGCAGGTACATACCCAGACGATTTTGATTGGCGGGTTTGG TTCTGATTTATATGTTGGGAATACTTTGATTGATATGTATGTGAAATGCGGGTGTTTGGG TTGTGGACATCGGGTATTCGATGAAATGCTGGACAGAGATGTGATTTCTTGGACTTCTTT GATTGTTGCATATGCGAAGGTTGGAAACATGGAGGCTGCAAGTGAGTTGTTTGATGGATT ACCCATGAAGGATATGGTGGCATGGACAGCAATGGTCACAGGGTATGCCCAAAATGCTAG GCCAAGAGAGGCATTGGAAGTTTTTGAAAGAATGCAGGCTGCAGGCGTTAAAACGGATGA GGTTACCTTGGTTGGTGTCATTTCAGCATGTGCTCAACTAGGTGCAGCTAAGTATGCTAA TTGGGTCCGGGACGTTGCAGAGCAATCTGGATTTGGGCCTACCAGTAATGTTGTTGTGGG ATCTGCATTGATTGATATGTATGCGAAGTGTGGGAGCGTAGAAGATGCTTACAAGGTTTT TGAAAGAATGGAGGAAAGGAATGTGTATTCTTATAGTTCAATGATTGTGGGGTTTGCAAT GCATGGTTTGGCTGGTGCTGCAATGGAATTATTTGATGAGATGTTGAAGACAGAGATAAA ACCAAACAGGGTCACGTTTATAGGTGTTCTTACTGCTTGCAGCCATGCAGGTATGGTAGA ACAAGGTCAGCAATTATTCGCAATGATGGAAGAATGTCATGGTGTTGCACCATCAGAGGA TCACTATGCCTGCATGGTGGATCTTCTTGGTCGAGCTGGACGCTTGGAAGAAGCTCTCAA CCTTGTAAAAATGATGCCCATGAATCCCCATGGGGGCGTGTGGGGAGCACTGCTTGGGGC ATGTCGCATCCACGGGAATCCTGATATGGCCCAGATTGCTGCAAGCCATTTGTTTGAGCT TGAACCCAATGGTATTGGGAACTACATCTTGCTTTCCAATATATATGCTTCAGCAGGCAG GTGGGATGATGTTTCAAAGGTAAGGAAGTTAATGAGGGCGAAGGGTCTGAAAAAGAATCC TGGATGCAGCTGGGTTGAAGGAAAGAAAGGGATAATTCACGAGTTCTTTGCAGGTGATAT GTCCCATCCGAAGTCCAGGGAGATTAAGCAGGCACTGGAGGATCTTCTCGACAGATTAAA GTATCTTGGCTACCAGCCAAACCTGAGTTCTGTGGCCTATGACATTAGTGATGAAGAGAA GAAGCGGTTGCTAATGAGTCATAGTGAGAAGCTTGCTCTGGCGTTTGGCCTGCTCACTAC AAATGCTGGGTGCACCATTAGAATTGTGAAGAACCTCAGGATATGCGAAGATTGCCATTC AGTAATGTGTGGTGCTTCTCAGATCACAGGGAGAGAAATTGTTGTCAGGGATAACATGAG ATTCCACCATTTTCGCGATGGGAGATGCTCCTGTGGTAACTTCTGGTGATGGAAGCATGG ATTGGAACTGCAACATTGACCAATTGGATTTTTTCTTTTCTTTTCTCATTTGAAGTTTGG TTAATCTTACACCAGTACAGAGCCTATTGAATTTGAATCCTAATTATCCACCCAAGTTGC CACCTTTGTACACTCTTCTGCACAAGTACTTGCTCCAAACTGGGCTCTGAAGGAAGAAGA GAATAGAATTGACAAGGATGGATTTAATCCGGCGACCTACAATATCATTTACACAATGAT GAACTCCAGATGTCATCTTTAAGCAATCATCAGGAAATCGTACTGTAGCAGTCCCAGTTT TCTTTTCCATCCGTATTGGATTTATTTGAATTAATCCCCAATTTTATAAACGCCTAATAT AGCTAGCATCTCCTCTGTATTATTACAGTCAGGATTTTGCGATAACTATAATTTTGAGAA TGATTCAATTGCAACTAGGAAATTTATTTATTGGGTTCATTAGTACCCCAAGAATTTAAC ACATCATTGTAATTTTTAGAATGATTCTACTTATTGGATTTCATTAGTACCCCTAGAACC