Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_04s0023g00320.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:4:16483873:16487262:1 gene:VIT_04s0023g00320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Auxin efflux carrier component [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7SPS3]

Sequence

ATGATAGGATGGGAGGATGTATACAAGGTGGTGGTTGCCATGTTACCACTCTATGTTGCA
CTGGTCCTAGGGTATGGCTCTGTGAAGTGGTGGCGAATTTTTACGCCTGATCAGTGTGAC
GCGATCAACCGCCTTGTTTGCTACTTCACTCTCCCCCTTTTCACCTTTGAGTTCACTGCC
CATGTTGATCCCTTCAAGATGAACTACCTCTTCATTGGTGCGGATGCCGTCTCCAAGTTG
ATAATTGTATTGGTGCTTGCCCTTTGGGCCAAGTGCAGCAGCAAGGGCAGCTATTGCTGG
TCTATAACAAGCTTCTCTTTGGCCACCTTGACCAACTCCCTGGTTGTGGGGGTGCCTTTG
ATAAAAGCCATGTATGGGCCGCTAGGAGTTGATCTTGTCGTCCAATCATCAGTCGTGCAG
GCCATCATCTGGCTCACACTTCTGCTATTTGTTCTGGAGTTTCGAAGGACAGGTACCGGC
ATTTCTTCAAATACTACTATGGGAGACTCTGGTGTGATAGAGGTTGAGCCTGGAAAAGAT
TTAGAAACTAATGAGATGGTGGTGAGCACTAGACTATCTTTCTGGTCATTGATGAGGAAA
GTATGGCTGAAACTTGCACAAAACCCTAACTCCTACGCTTGTATTATCGGTATCGTCTGG
GCTTTCATAGCGAACAGGTGGCATTTTGAAATGCCAAGCATCATGGAGGGATCGATATTG
ATCATGTCAAGAGCTGGAACAGGCACTGCCATGTTTAGTATGGGGCTCTTCATGGCTATG
CAAGAGAAGATTATAGCTTGTGGCACAACCCTAACGGTGTTCGGGATGGTCTTGCGGTTT
ATTGCTGGACCAGCAGCAATGGCTATCGGCGCTATTGCTGTTGGTCTGCATGGTGACGTT
TTGCGCATTGCTATCATACAAGCCGCGGTACCACAATCGATCACATCATTTATCTATGCT
AAAGAATATGGATTGCATGCAGATGTGCTTAGCACAGCGGTGATTTTTGGCATGATCGTC
TCCCTTCCGTTGTTGGTCGGTTACTATGCGGTTTTAGAGTTTTTGAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_04s0023g00320.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:4:16483873:16487262:1 gene:VIT_04s0023g00320 transcript:VIT_04s0023g00320.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Auxin efflux carrier component [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7SPS3]

Sequence

MIGWEDVYKVVVAMLPLYVALVLGYGSVKWWRIFTPDQCDAINRLVCYFTLPLFTFEFTA
HVDPFKMNYLFIGADAVSKLIIVLVLALWAKCSSKGSYCWSITSFSLATLTNSLVVGVPL
IKAMYGPLGVDLVVQSSVVQAIIWLTLLLFVLEFRRTGTGISSNTTMGDSGVIEVEPGKD
LETNEMVVSTRLSFWSLMRKVWLKLAQNPNSYACIIGIVWAFIANRWHFEMPSIMEGSIL
IMSRAGTGTAMFSMGLFMAMQEKIIACGTTLTVFGMVLRFIAGPAAMAIGAIAVGLHGDV
LRIAIIQAAVPQSITSFIYAKEYGLHADVLSTAVIFGMIVSLPLLVGYYAVLEFLN

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_04s0023g00320.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:4:16483873:16487262:1 gene:VIT_04s0023g00320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Auxin efflux carrier component [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7SPS3]

Sequence

AAATAAGGCAAGATGATAGGATGGGAGGATGTATACAAGGTGGTGGTTGCCATGTTACCA
CTCTATGTTGCACTGGTCCTAGGGTATGGCTCTGTGAAGTGGTGGCGAATTTTTACGCCT
GATCAGTGTGACGCGATCAACCGCCTTGTTTGCTACTTCACTCTCCCCCTTTTCACCTTT
GAGTTCACTGCCCATGTTGATCCCTTCAAGATGAACTACCTCTTCATTGGTGCGGATGCC
GTCTCCAAGTTGATAATTGTATTGGTGCTTGCCCTTTGGGCCAAGTGCAGCAGCAAGGGC
AGCTATTGCTGGTCTATAACAAGCTTCTCTTTGGCCACCTTGACCAACTCCCTGGTTGTG
GGGGTGCCTTTGATAAAAGCCATGTATGGGCCGCTAGGAGTTGATCTTGTCGTCCAATCA
TCAGTCGTGCAGGCCATCATCTGGCTCACACTTCTGCTATTTGTTCTGGAGTTTCGAAGG
ACAGGTACCGGCATTTCTTCAAATACTACTATGGGAGACTCTGGTGTGATAGAGGTTGAG
CCTGGAAAAGATTTAGAAACTAATGAGATGGTGGTGAGCACTAGACTATCTTTCTGGTCA
TTGATGAGGAAAGTATGGCTGAAACTTGCACAAAACCCTAACTCCTACGCTTGTATTATC
GGTATCGTCTGGGCTTTCATAGCGAACAGGTGGCATTTTGAAATGCCAAGCATCATGGAG
GGATCGATATTGATCATGTCAAGAGCTGGAACAGGCACTGCCATGTTTAGTATGGGGCTC
TTCATGGCTATGCAAGAGAAGATTATAGCTTGTGGCACAACCCTAACGGTGTTCGGGATG
GTCTTGCGGTTTATTGCTGGACCAGCAGCAATGGCTATCGGCGCTATTGCTGTTGGTCTG
CATGGTGACGTTTTGCGCATTGCTATCATACAAGCCGCGGTACCACAATCGATCACATCA
TTTATCTATGCTAAAGAATATGGATTGCATGCAGATGTGCTTAGCACAGCGGTGATTTTT
GGCATGATCGTCTCCCTTCCGTTGTTGGTCGGTTACTATGCGGTTTTAGAGTTTTTGAAT
TGATTTTCCCTATATATGGATAACTTTTCGATGTGGGAAGTGAGTTAGGGAGAGATCAAT
GAACATTTTAATTTTTTGTGCTTGAAGCTATTGCAGACTAAATCAGTCCACTGCTATTGC
AATCTTA