Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g06690.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:6678208:6682095:1 gene:VIT_04s0008g06690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATGTGATAATACTCTCCTCTTCAAGTAGTTGTTGTAGTAAGTTCAAGTATGGTTGT GCTGTAACTGGGACTAAACCCTCCGTTTTGAGCTGTAATGAGTCGTTAGGGGGAATCAAA ATTGGGAATTTGAAGGTTTTGCCATCTGGGTGTAGGGTGAATTGGAAGAAACACAGGAAA AAACAAGTGGGTGTTTGTGGGTTTGTGATTAGAAGCTCATTTGATGTGGTGGTCGTGAAA AGGAAGCCGGAAAGTACTATGTCTTCTGAGGAAGTTTATAGGGTTTTAAAGTCGATTTCA GACCCGAACCAGGCCTTTTCTTTCTTTAATTCTGTGGCGGAAATGCCCAGAGTCATTCAC ACCACAGAGACATGCAATTACGTGCTTGAAATGTTGAGGGCTCATAGGAGGGTGGAGGAT ATGGTGGTTGTGTTTAATTTGATGCAAAAGCAAATCATAAAGAGGAGTATAAACACTTAC TTGACTATTTTTAAGGTTCTTTATATAAGGGGAGGGCTTCGGGAAGCCCCAGTTGCGCTT GAAAAGATGAGAAAAGTGGGGTTTGTTTTGAACGGGTATTCGTATATTGGGTTGATCCAT TTGCTTCTTAAATCTGGTTTTTGTAGGGAGGCTTTGAAGGTGTATAGAAGAATGGTGTCT GAAGGGATTAAGCCTAGTCTCAAGACTTACTCTGCACTTATGGTAGCACTGGGAAAGAGA AGGGATATTGAAACCGTCATGGGTTTGTTACAAGAGATGGAAAGCTTGGGATTGAGGCCT AATATTTACACATTTACCATATGCATTAGAATATTGGGGAGGGCAGGAAAAATTGATGAG GCTTATGGGATTTTGAAAAGGATGGATGATGCAGGATGTGGTCCTGATGTTGTTACTTAT ACAGTTCTCATTGATGCTCTTTGTAATGCTGGGAAGCTTAATAATGCAAAGGAATTATTT CTAAAGATGAAAGCAAGCAGCCATAAACCTGATCGAGTAACTTACATAACTTTATTGGAC AAGTTTAGTGACCATGGAGACTTGGATGCCATAAAAGAATTTTGGAGTGAAATGGAAGCT GATGGTTATCTTCCTGATGTGGTTACCTTCACCATACTTATCGATGCTTTATGCAAAGTG GGGAAAGTTGATGAAGCATTTGGTACATTGGATGTCATGAAAAAGCAAGGGGTGGCACCA AATCTTCATACGTACAATACTTTGATTTGTGGGCTTTTGAGACTAAATAGATTAGATGAA GCATTAGAACTTTTCAACAGTATGGAATCTCTTGGTCTTGAAACTACTGCTTACACTTAC ATCCTTTTCATTGACTACTATGGAAAGTCAGGAGAATCCGGCAAAGCTATCAAGACATTT GAGAAGATGAAAACTAATGGAATTGTTCCTAATATTGTTGCTTGTAATGCATCTTTATAT AGTCTTGCAGAACAAGGGAGGCTTGAAGAGGCAAAAGAGTTCTTTAATGGACTTAAAAAA TGTGGGCTTGCTCCAGATGCTATAACCTATAATATTCTGATGAGATGCTATGGTAAGGCT GGGAGAGTTGATGATGCCATTAAGTTGCTCTCAGAGATGGAGGAAAATGGGTGTGATCCT GAAGTTGTTATTATCAATTCTCTGATTGACACACTTTACAAGGCCGATCGGGTAGATGAG GCATGGAAAATGTTTCAAAGAATGAAGGAAATGAAGCTTGCCCCTACAGTTGTGACTTAC AATACGTTACTAGCTGGTTTGGGAAAAGAGGGAAGAGTCCAAGAGGCCACTGCGCTATTC AAGGGTATGATTGCAGATGATTGTCCTCCAAATACAATATCTTTCAACACACTTCTAGAC TGCCTTTGCAAGAATGGTGAGGTTGATTTGGCCTTGAAGATGCTATTTAGAATGACAGAA ATGAATTGTTTTCCAGATGTTTTAACATACAACACTGTCATTTATGGCTTGATTAAAGAA AACAGAGTTAATTATGCATTCTGGTTATTCCATCAGATGAAGAAAGTGATTTATCCTGAT TATGTAACTTTGTGCACCCTCCTTCCTGGTGTCATAAAAGATGGGCGAATTGAGGATGCT TTTAGGGTTGCCAAGGAATTTGTTCATCATGTTGGAGATCATGCAGATGGGTCTTTTTGG GAAGATTTAATGGGAGGGATTTTGATAGAAGCTGAAATAGGCCAGTCTATATTATTCGCT GAAAGTTTAGTATGTAATACGATTTGTGAGGATGACTCAGTATTGATACCATTAGTTAAG TTTTTGTGCAAACATGGGAAAGCTGTTGATGCCTACAATGTGTTCCTGAAACTTACCAAA AGTTTTTGTATTACACCATCGCTAGAAGCATATAATTCTCTAATTGATGGACTCCTCAAA GCCCGGCTCACTGAAATGGCTTGGGGTCTTTTTTATAAGATGAAGAATGCTGGCTGTACA CCTGATGTTTTCACCTACAACCTGTTCCTTGATGCCCTTGGGAAGTCTGGAAAGATCAAA GAACTTTTTGATTTGTATGAAGAGATGCTCTTTAGGGGCTGCAAACCTAACACAATAACT CATAACATAGTCATCTTCGGTCTTGTGAAATCTAATAGCTTAGATAAGGCTATAGATTTA TACTATGATCTTATGAGTGGAGATTTCTCCCCAACTCCTTGGACATATGGCCCTCTTATT GATGGCCTTTTGAAGTTAGGAAGACTGGAGGAAGCGAAGCAGTTCTTTGAGGAGATGCTG GATTATGGATGCATGCCTAACTGTCCGCTTTACAATATTCTTATGAATGGATTTGGGAAA CAGGGTGATGTGGAAACTGCTTGTGAGTTGTTTAGAAGGATGGTTAAAGAGGGAATAAGA CCAGATTTGAAATCCTACAGCATTATGGTGGATTGCCTTTGCATGGTGGGGAAAGTTGAT GATGCTCTGCACTACTTTGAGGAACTAAAGCTTTCTGGCCTGGATCCTGATTTGGTTTGT TATAACCTTATGATCAATGGTCTTGGAAGATCACAGAGGGTGGAGGAAGCTCTTTCTCTT TTTGATGAGATGCGGAATAGAGGGATTACTCCTGATCTTTACACCTACAATGCCTTAATA CTCAATCTTGGGATTGCTGGAATGGTAGAGGAAGCGGGAAAGATGTATGAGGAACTCCAA CTTAAAGGCCTTGAACCTAATGTGTTTACTTATAATGCTCTCATTCGCGGGCATAGCATG TCAGGTAACCCTGACCGTGCATATGCAGTCTACAAGAAGATGATGGTTGGGGGCTGCAGA CCCAATACAGGAACATTTGCGCAACTTCCTAATCAATCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g06690.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:6678208:6682095:1 gene:VIT_04s0008g06690 transcript:VIT_04s0008g06690.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDVIILSSSSSCCSKFKYGCAVTGTKPSVLSCNESLGGIKIGNLKVLPSGCRVNWKKHRK KQVGVCGFVIRSSFDVVVVKRKPESTMSSEEVYRVLKSISDPNQAFSFFNSVAEMPRVIH TTETCNYVLEMLRAHRRVEDMVVVFNLMQKQIIKRSINTYLTIFKVLYIRGGLREAPVAL EKMRKVGFVLNGYSYIGLIHLLLKSGFCREALKVYRRMVSEGIKPSLKTYSALMVALGKR RDIETVMGLLQEMESLGLRPNIYTFTICIRILGRAGKIDEAYGILKRMDDAGCGPDVVTY TVLIDALCNAGKLNNAKELFLKMKASSHKPDRVTYITLLDKFSDHGDLDAIKEFWSEMEA DGYLPDVVTFTILIDALCKVGKVDEAFGTLDVMKKQGVAPNLHTYNTLICGLLRLNRLDE ALELFNSMESLGLETTAYTYILFIDYYGKSGESGKAIKTFEKMKTNGIVPNIVACNASLY SLAEQGRLEEAKEFFNGLKKCGLAPDAITYNILMRCYGKAGRVDDAIKLLSEMEENGCDP EVVIINSLIDTLYKADRVDEAWKMFQRMKEMKLAPTVVTYNTLLAGLGKEGRVQEATALF KGMIADDCPPNTISFNTLLDCLCKNGEVDLALKMLFRMTEMNCFPDVLTYNTVIYGLIKE NRVNYAFWLFHQMKKVIYPDYVTLCTLLPGVIKDGRIEDAFRVAKEFVHHVGDHADGSFW EDLMGGILIEAEIGQSILFAESLVCNTICEDDSVLIPLVKFLCKHGKAVDAYNVFLKLTK SFCITPSLEAYNSLIDGLLKARLTEMAWGLFYKMKNAGCTPDVFTYNLFLDALGKSGKIK ELFDLYEEMLFRGCKPNTITHNIVIFGLVKSNSLDKAIDLYYDLMSGDFSPTPWTYGPLI DGLLKLGRLEEAKQFFEEMLDYGCMPNCPLYNILMNGFGKQGDVETACELFRRMVKEGIR PDLKSYSIMVDCLCMVGKVDDALHYFEELKLSGLDPDLVCYNLMINGLGRSQRVEEALSL FDEMRNRGITPDLYTYNALILNLGIAGMVEEAGKMYEELQLKGLEPNVFTYNALIRGHSM SGNPDRAYAVYKKMMVGGCRPNTGTFAQLPNQS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g06690.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:6678208:6682095:1 gene:VIT_04s0008g06690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATGTGATAATACTCTCCTCTTCAAGTAGTTGTTGTAGTAAGTTCAAGTATGGTTGT GCTGTAACTGGGACTAAACCCTCCGTTTTGAGCTGTAATGAGTCGTTAGGGGGAATCAAA ATTGGGAATTTGAAGGTTTTGCCATCTGGGTGTAGGGTGAATTGGAAGAAACACAGGAAA AAACAAGTGGGTGTTTGTGGGTTTGTGATTAGAAGCTCATTTGATGTGGTGGTCGTGAAA AGGAAGCCGGAAAGTACTATGTCTTCTGAGGAAGTTTATAGGGTTTTAAAGTCGATTTCA GACCCGAACCAGGCCTTTTCTTTCTTTAATTCTGTGGCGGAAATGCCCAGAGTCATTCAC ACCACAGAGACATGCAATTACGTGCTTGAAATGTTGAGGGCTCATAGGAGGGTGGAGGAT ATGGTGGTTGTGTTTAATTTGATGCAAAAGCAAATCATAAAGAGGAGTATAAACACTTAC TTGACTATTTTTAAGGTTCTTTATATAAGGGGAGGGCTTCGGGAAGCCCCAGTTGCGCTT GAAAAGATGAGAAAAGTGGGGTTTGTTTTGAACGGGTATTCGTATATTGGGTTGATCCAT TTGCTTCTTAAATCTGGTTTTTGTAGGGAGGCTTTGAAGGTGTATAGAAGAATGGTGTCT GAAGGGATTAAGCCTAGTCTCAAGACTTACTCTGCACTTATGGTAGCACTGGGAAAGAGA AGGGATATTGAAACCGTCATGGGTTTGTTACAAGAGATGGAAAGCTTGGGATTGAGGCCT AATATTTACACATTTACCATATGCATTAGAATATTGGGGAGGGCAGGAAAAATTGATGAG GCTTATGGGATTTTGAAAAGGATGGATGATGCAGGATGTGGTCCTGATGTTGTTACTTAT ACAGTTCTCATTGATGCTCTTTGTAATGCTGGGAAGCTTAATAATGCAAAGGAATTATTT CTAAAGATGAAAGCAAGCAGCCATAAACCTGATCGAGTAACTTACATAACTTTATTGGAC AAGTTTAGTGACCATGGAGACTTGGATGCCATAAAAGAATTTTGGAGTGAAATGGAAGCT GATGGTTATCTTCCTGATGTGGTTACCTTCACCATACTTATCGATGCTTTATGCAAAGTG GGGAAAGTTGATGAAGCATTTGGTACATTGGATGTCATGAAAAAGCAAGGGGTGGCACCA AATCTTCATACGTACAATACTTTGATTTGTGGGCTTTTGAGACTAAATAGATTAGATGAA GCATTAGAACTTTTCAACAGTATGGAATCTCTTGGTCTTGAAACTACTGCTTACACTTAC ATCCTTTTCATTGACTACTATGGAAAGTCAGGAGAATCCGGCAAAGCTATCAAGACATTT GAGAAGATGAAAACTAATGGAATTGTTCCTAATATTGTTGCTTGTAATGCATCTTTATAT AGTCTTGCAGAACAAGGGAGGCTTGAAGAGGCAAAAGAGTTCTTTAATGGACTTAAAAAA TGTGGGCTTGCTCCAGATGCTATAACCTATAATATTCTGATGAGATGCTATGGTAAGGCT GGGAGAGTTGATGATGCCATTAAGTTGCTCTCAGAGATGGAGGAAAATGGGTGTGATCCT GAAGTTGTTATTATCAATTCTCTGATTGACACACTTTACAAGGCCGATCGGGTAGATGAG GCATGGAAAATGTTTCAAAGAATGAAGGAAATGAAGCTTGCCCCTACAGTTGTGACTTAC AATACGTTACTAGCTGGTTTGGGAAAAGAGGGAAGAGTCCAAGAGGCCACTGCGCTATTC AAGGGTATGATTGCAGATGATTGTCCTCCAAATACAATATCTTTCAACACACTTCTAGAC TGCCTTTGCAAGAATGGTGAGGTTGATTTGGCCTTGAAGATGCTATTTAGAATGACAGAA ATGAATTGTTTTCCAGATGTTTTAACATACAACACTGTCATTTATGGCTTGATTAAAGAA AACAGAGTTAATTATGCATTCTGGTTATTCCATCAGATGAAGAAAGTGATTTATCCTGAT TATGTAACTTTGTGCACCCTCCTTCCTGGTGTCATAAAAGATGGGCGAATTGAGGATGCT TTTAGGGTTGCCAAGGAATTTGTTCATCATGTTGGAGATCATGCAGATGGGTCTTTTTGG GAAGATTTAATGGGAGGGATTTTGATAGAAGCTGAAATAGGCCAGTCTATATTATTCGCT GAAAGTTTAGTATGTAATACGATTTGTGAGGATGACTCAGTATTGATACCATTAGTTAAG TTTTTGTGCAAACATGGGAAAGCTGTTGATGCCTACAATGTGTTCCTGAAACTTACCAAA AGTTTTTGTATTACACCATCGCTAGAAGCATATAATTCTCTAATTGATGGACTCCTCAAA GCCCGGCTCACTGAAATGGCTTGGGGTCTTTTTTATAAGATGAAGAATGCTGGCTGTACA CCTGATGTTTTCACCTACAACCTGTTCCTTGATGCCCTTGGGAAGTCTGGAAAGATCAAA GAACTTTTTGATTTGTATGAAGAGATGCTCTTTAGGGGCTGCAAACCTAACACAATAACT CATAACATAGTCATCTTCGGTCTTGTGAAATCTAATAGCTTAGATAAGGCTATAGATTTA TACTATGATCTTATGAGTGGAGATTTCTCCCCAACTCCTTGGACATATGGCCCTCTTATT GATGGCCTTTTGAAGTTAGGAAGACTGGAGGAAGCGAAGCAGTTCTTTGAGGAGATGCTG GATTATGGATGCATGCCTAACTGTCCGCTTTACAATATTCTTATGAATGGATTTGGGAAA CAGGGTGATGTGGAAACTGCTTGTGAGTTGTTTAGAAGGATGGTTAAAGAGGGAATAAGA CCAGATTTGAAATCCTACAGCATTATGGTGGATTGCCTTTGCATGGTGGGGAAAGTTGAT GATGCTCTGCACTACTTTGAGGAACTAAAGCTTTCTGGCCTGGATCCTGATTTGGTTTGT TATAACCTTATGATCAATGGTCTTGGAAGATCACAGAGGGTGGAGGAAGCTCTTTCTCTT TTTGATGAGATGCGGAATAGAGGGATTACTCCTGATCTTTACACCTACAATGCCTTAATA CTCAATCTTGGGATTGCTGGAATGGTAGAGGAAGCGGGAAAGATGTATGAGGAACTCCAA CTTAAAGGCCTTGAACCTAATGTGTTTACTTATAATGCTCTCATTCGCGGGCATAGCATG TCAGGTAACCCTGACCGTGCATATGCAGTCTACAAGAAGATGATGGTTGGGGGCTGCAGA CCCAATACAGGAACATTTGCGCAACTTCCTAATCAATCTTGACATCTAAGAGATGTGGTG GTCCACTCATTTGTTGTGCTTGCTGATCTATAGGCTTGGGATGTCCTAGGGATGATCCAG CCTCATTTTTGTTGATGATTTTGGTCATGGGGGGCATACATCCAAATTTAATTTTGTGGC AATTGATTTTACATCTTCTAGCAGCAGATGCTTCTGCAAGTTGGGTAGTTAACATACCTG CCTCCAGCAGATTCTGCAATGCTGGGCCATATATTTAAGGTGCGAGTGACGTTTTCCAAA TTGTTATCCACAAGTACTGTGAATACTGTTGTAAACTATGGTTGTCTTGTTCTGTACTGA AACACATTGATTGGAATGTGTAAATGACATATCTTGTCACATCCTTGCTTTGCC