Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g05840.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:5443405:5446625:-1 gene:VIT_04s0008g05840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTATCACCCTTTCAGATTTCTAGTATTTCTAGGATTTCTCTTCACTTTGATTCTCCAC TGCCATGCGGATCCGGGTTCAGGTTGCTCTAAAACTAGCCCTCTCCTTCATTTCGAATCC GATATCGAAATGGTCCAGCACCAATTACGAGGTCTCATCAAAGTCCTCGATGATTGTTCT TTTAGGGTTTCTGAATTCGATATGCTTCCTGGGTCCGACGTCCACTGGTGGGGCGCCGCC GGACCCGATTTTGCTAATCTCACTTCTGGGTTTGTCATTGCCGATGATAAATTGAACAAA ACCTATAAAAATGAGAGCTTTGTGGTTCGTTTGAGGAGTAATTTGACTTGGGATCGAATC GGCGTGCTGGCCGTTTGGGACATTCCCACAGCTTCAGATTTTGGGCATGTCGTTATGGGA GATCCTAGGAATGGATCGGGGAATATTGCTGTAAGCCCGGATTTAGCGCCATCGCCGGCG ATGGAGCCCAACTCGAGTACAGTTAGGAACAGGACTGGTGGGGTGCCCACGATGTTTGAG AATTGTAAGGTGCTGTCGCCAAACTATAGGGTTAGGTGGACGTTGAGTGCTGATGAGGAT TCAATTGATATTGGCTTGGAGGCAGCAACTGGGTCAATGAATTACATGGCATTCGGATGG GCAGACCCAAAGTCAACTTACTCACCTATGCTGGGGGCTGATGTGGCGGTGGCAGGGTTT ACAGAGGACGGTTTGCCATTTTCTGATGATTATTACATTACCAAATATAATGAGTGTATG ATAAACAAGAATGGATTGGTTCAGGGGGTTTGTCCAGACACAATGTATGAAGGGTCAGAC CCTGATGGGTTGGTGAACAATACCAGATTGGTTTATGGGCATAGGAAGGATGGTGTGTCC TTCGTTCGGTATCGGCGGCCATTGAAGTCTGTTGACAAGAAGTATGATTTGCCAGTGAAT CATACTGGTAATATGACAGTGATTTGGGCTTTGGGGTTGATACGCCCGCCCGATACTCTT CGCCCATACTATCTGCCCCAAAATCATGGTGGTCCCATGCTAGTGACATATGGGCATTTG GTTCTTAATGTTTCGGAACATGTGAATGATTGCTTGGGGCCATTAGATGCAGAAGACAAG GAGGATCAGGATTTGATTATTGCAGATGCCAATGTTCCTCTTGTTGTTGTGACAAGTCCT GCACTGCACTATCCTAACCCGCCAAACCCGTCAAAGGTTCTATACATTAACAAGAAAGAG GCTCCATTTTTGAGAGTAGAAAGAGGAGTACCTGTGAAGTTTTCAATACAAGCTGGGCAT GATGTTGCACTATACATTACTTCTGATCCACTTGGTGGGAATGCTACTTTGAGGAATGTG TCTGAAACTGTTTATGCAGGAGGAGCAAATGCACAAGGAGTACTAGCTAGTCCAATGGAG TTAGTTTGGGCACCTGATAGGAATACCCCGGATCAAGTTTACTATCAGTCTTTGTATACA CAAAAAATGGGTTGGAAAATTCAGGTGGTCGACGGGGGTCTATCAGACATGTATAATAAC AGTGTTCTTTTGGATGATCAGCAGGTTACATTATTTTGGACCTTGTCTGAAGATTCAATA TCTATTGCAGCTCGAGGTGAGAAGAAAAGTGGTTATCTTGCTATAGGATTTGGTAGTGGA ATGGTGAATTCATATGCTTATGTGGGTTGGATTGATAATGACATAGGGAGGGTAAACACT TACTGGATTGATGGGAAGGATGCGTCCAGCGTGCATCCGACTAATGAGAATTTGTCACAT GTAAGGTGCAAGTCAGAAAATGGCATGATCACCTTTGAGTTTACCAGGCCCTTGAAGCCA CCATGTAGTCGGGCTGAAAGGCGGGAGTGTAACAACATTGTTGACCCCACAACTCCTCTT AAAGTTGTTTGGGCCATGGGAGCTAAATGGTCAGGAGACCACTTAAGCGAGAGAAATATG CATTCTGCTACAAGCAGTAGGCCTGTCCGTGTGCTGCTTATGCGTGGTTCGGCAGAGGCA GAGCAGGACCTACGACCAGTATTGGCTGTACATGGCTTTATGATGTTTCTTGCATGGGGT ATTTTGCTTCCAGGTGGAATATTGGCAGCTAGATACTTAAAACATGTGAAGGGTGACGGA TGGTTCCAGATTCATGTATACTTGCAGTACTCAGGATTGGCAATTGTCCTACTTGGCTTT CTTTTTGCTGTTGCTGAGCTTCGTGGTTTCTATTTCAGCTCATTACATGTTAAGTTTGGA ATTACAGCTATCTTTTTGGCTTGTGTGCAGCCAGTGAATGCATCACTAAGGCCCAAGAGA TCTGCTAATGGAGAAACGGTCTCCAGTAAAAGACTTGCATGGGAGTATCTCCACGTTATT GTTGGTAGATGTGCCATCGTTGCAGGGATTGCGGCACTTATCAGTGGGATGAAGCATTTA GGAGATAGATATGGTGGTGAAAATGTTGAAGGACTTAATTGGGCTTTAATAATTTGGTTC TTGCTTGGTGCGTTAACAGTCGTATATTTAGAGTATCGTGAGAAAAAGCGAGAGAAGGAT AGGAACTCTGAAAGAAGCAGTTGGGTTTTGGGAAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g05840.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:5443405:5446625:-1 gene:VIT_04s0008g05840 transcript:VIT_04s0008g05840.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MYHPFRFLVFLGFLFTLILHCHADPGSGCSKTSPLLHFESDIEMVQHQLRGLIKVLDDCS FRVSEFDMLPGSDVHWWGAAGPDFANLTSGFVIADDKLNKTYKNESFVVRLRSNLTWDRI GVLAVWDIPTASDFGHVVMGDPRNGSGNIAVSPDLAPSPAMEPNSSTVRNRTGGVPTMFE NCKVLSPNYRVRWTLSADEDSIDIGLEAATGSMNYMAFGWADPKSTYSPMLGADVAVAGF TEDGLPFSDDYYITKYNECMINKNGLVQGVCPDTMYEGSDPDGLVNNTRLVYGHRKDGVS FVRYRRPLKSVDKKYDLPVNHTGNMTVIWALGLIRPPDTLRPYYLPQNHGGPMLVTYGHL VLNVSEHVNDCLGPLDAEDKEDQDLIIADANVPLVVVTSPALHYPNPPNPSKVLYINKKE APFLRVERGVPVKFSIQAGHDVALYITSDPLGGNATLRNVSETVYAGGANAQGVLASPME LVWAPDRNTPDQVYYQSLYTQKMGWKIQVVDGGLSDMYNNSVLLDDQQVTLFWTLSEDSI SIAARGEKKSGYLAIGFGSGMVNSYAYVGWIDNDIGRVNTYWIDGKDASSVHPTNENLSH VRCKSENGMITFEFTRPLKPPCSRAERRECNNIVDPTTPLKVVWAMGAKWSGDHLSERNM HSATSSRPVRVLLMRGSAEAEQDLRPVLAVHGFMMFLAWGILLPGGILAARYLKHVKGDG WFQIHVYLQYSGLAIVLLGFLFAVAELRGFYFSSLHVKFGITAIFLACVQPVNASLRPKR SANGETVSSKRLAWEYLHVIVGRCAIVAGIAALISGMKHLGDRYGGENVEGLNWALIIWF LLGALTVVYLEYREKKREKDRNSERSSWVLGR

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g05840.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:5443405:5446625:-1 gene:VIT_04s0008g05840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AGAGGTGACGTTGAAATGACGAAAATGCCACTCAGATAGATGGTGTCTTCCCCACGGAAA CGGGCACCCAAGGAGACAGGGAGAGACTCCAGAGCCAAAGCCAAATTCTTCAACCTCCAC CCTGCAACGTGTTCCTCACTCGCTTCCCTGTCTCCGAGTCAACTCGCTTCACGCGTCTCA GGTACATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTCA TTACTCTCTCGAATTGGGATACAGTTGCACCCTAGATCCGGATCCAATTTCCATGTATCA CCCTTTCAGATTTCTAGTATTTCTAGGATTTCTCTTCACTTTGATTCTCCACTGCCATGC GGATCCGGGTTCAGGTTGCTCTAAAACTAGCCCTCTCCTTCATTTCGAATCCGATATCGA AATGGTCCAGCACCAATTACGAGGTCTCATCAAAGTCCTCGATGATTGTTCTTTTAGGGT TTCTGAATTCGATATGCTTCCTGGGTCCGACGTCCACTGGTGGGGCGCCGCCGGACCCGA TTTTGCTAATCTCACTTCTGGGTTTGTCATTGCCGATGATAAATTGAACAAAACCTATAA AAATGAGAGCTTTGTGGTTCGTTTGAGGAGTAATTTGACTTGGGATCGAATCGGCGTGCT GGCCGTTTGGGACATTCCCACAGCTTCAGATTTTGGGCATGTCGTTATGGGAGATCCTAG GAATGGATCGGGGAATATTGCTGTAAGCCCGGATTTAGCGCCATCGCCGGCGATGGAGCC CAACTCGAGTACAGTTAGGAACAGGACTGGTGGGGTGCCCACGATGTTTGAGAATTGTAA GGTGCTGTCGCCAAACTATAGGGTTAGGTGGACGTTGAGTGCTGATGAGGATTCAATTGA TATTGGCTTGGAGGCAGCAACTGGGTCAATGAATTACATGGCATTCGGATGGGCAGACCC AAAGTCAACTTACTCACCTATGCTGGGGGCTGATGTGGCGGTGGCAGGGTTTACAGAGGA CGGTTTGCCATTTTCTGATGATTATTACATTACCAAATATAATGAGTGTATGATAAACAA GAATGGATTGGTTCAGGGGGTTTGTCCAGACACAATGTATGAAGGGTCAGACCCTGATGG GTTGGTGAACAATACCAGATTGGTTTATGGGCATAGGAAGGATGGTGTGTCCTTCGTTCG GTATCGGCGGCCATTGAAGTCTGTTGACAAGAAGTATGATTTGCCAGTGAATCATACTGG TAATATGACAGTGATTTGGGCTTTGGGGTTGATACGCCCGCCCGATACTCTTCGCCCATA CTATCTGCCCCAAAATCATGGTGGTCCCATGCTAGTGACATATGGGCATTTGGTTCTTAA TGTTTCGGAACATGTGAATGATTGCTTGGGGCCATTAGATGCAGAAGACAAGGAGGATCA GGATTTGATTATTGCAGATGCCAATGTTCCTCTTGTTGTTGTGACAAGTCCTGCACTGCA CTATCCTAACCCGCCAAACCCGTCAAAGGTTCTATACATTAACAAGAAAGAGGCTCCATT TTTGAGAGTAGAAAGAGGAGTACCTGTGAAGTTTTCAATACAAGCTGGGCATGATGTTGC ACTATACATTACTTCTGATCCACTTGGTGGGAATGCTACTTTGAGGAATGTGTCTGAAAC TGTTTATGCAGGAGGAGCAAATGCACAAGGAGTACTAGCTAGTCCAATGGAGTTAGTTTG GGCACCTGATAGGAATACCCCGGATCAAGTTTACTATCAGTCTTTGTATACACAAAAAAT GGGTTGGAAAATTCAGGTGGTCGACGGGGGTCTATCAGACATGTATAATAACAGTGTTCT TTTGGATGATCAGCAGGTTACATTATTTTGGACCTTGTCTGAAGATTCAATATCTATTGC AGCTCGAGGTGAGAAGAAAAGTGGTTATCTTGCTATAGGATTTGGTAGTGGAATGGTGAA TTCATATGCTTATGTGGGTTGGATTGATAATGACATAGGGAGGGTAAACACTTACTGGAT TGATGGGAAGGATGCGTCCAGCGTGCATCCGACTAATGAGAATTTGTCACATGTAAGGTG CAAGTCAGAAAATGGCATGATCACCTTTGAGTTTACCAGGCCCTTGAAGCCACCATGTAG TCGGGCTGAAAGGCGGGAGTGTAACAACATTGTTGACCCCACAACTCCTCTTAAAGTTGT TTGGGCCATGGGAGCTAAATGGTCAGGAGACCACTTAAGCGAGAGAAATATGCATTCTGC TACAAGCAGTAGGCCTGTCCGTGTGCTGCTTATGCGTGGTTCGGCAGAGGCAGAGCAGGA CCTACGACCAGTATTGGCTGTACATGGCTTTATGATGTTTCTTGCATGGGGTATTTTGCT TCCAGGTGGAATATTGGCAGCTAGATACTTAAAACATGTGAAGGGTGACGGATGGTTCCA GATTCATGTATACTTGCAGTACTCAGGATTGGCAATTGTCCTACTTGGCTTTCTTTTTGC TGTTGCTGAGCTTCGTGGTTTCTATTTCAGCTCATTACATGTTAAGTTTGGAATTACAGC TATCTTTTTGGCTTGTGTGCAGCCAGTGAATGCATCACTAAGGCCCAAGAGATCTGCTAA TGGAGAAACGGTCTCCAGTAAAAGACTTGCATGGGAGTATCTCCACGTTATTGTTGGTAG ATGTGCCATCGTTGCAGGGATTGCGGCACTTATCAGTGGGATGAAGCATTTAGGAGATAG ATATGGTGGTGAAAATGTTGAAGGACTTAATTGGGCTTTAATAATTTGGTTCTTGCTTGG TGCGTTAACAGTCGTATATTTAGAGTATCGTGAGAAAAAGCGAGAGAAGGATAGGAACTC TGAAAGAAGCAGTTGGGTTTTGGGAAGATGATTCTACTGATCTGTTGAGCCCGAGGAATG CAGAAAAGGAGTCACATCCATCTGAAATACTGGAAGTTCAGCTACAACCTCTGAGCAGAT AGGAAAGTTTATTCAATTATTTTCTCAATATGAACTTGACACTCTTCACCAGTTTTGATG ATTTTCTTACTTATAAAGGAGATAGTGGGCCTGTTTATTTGGTTGAAAGGATTTTTCTGG TGTAGGGTTTGGGTCTTGATCCCTAGTACTTTGCCCCAGCCATTCATATTGAAGAGTAAT TACAATATGACTTGTATTTTGTATACTTGA