Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_04s0008g05470.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:4:4918804:4922981:1 gene:VIT_04s0008g05470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGTCAAAGCTCTTCGATTATACCGGAAATGATGCCTTCTGCCCCGGGGGGTCAATATAC
TCAAACATCAAGGATTCCAGCCTCTTTTTGTCCCTTGGTCGCCATGTGGATGTGTATTTC
CCTCCTCGCAAGAGATCTCGCATCAGTGCCCCATTTGTTGTCAGCGGAGACAAGTTTGAG
CAGAAGGAGCAGGTCTCCATTGATGTTCTTCCTGATGAGTGTCTTTTTGAGATCCTCAGA
CGGTTGCCTGAAGGCCAAGAGAAGAGTGCCTGTGCTTGTGTCTCCAAGCGCTGGCTTATG
CTTCTAAGCAGTATCCAGAGAGACGAGATCTGCAGTAACAAAACAACTGGGTTTTTGAAG
CCTAAGGAAACTTTGATTTCAAGAAACACAGATGAGTCTTCTGAGGCTAAAAAGAAGGGT
GGTGATGAAGTGACACCTGAGGCTGTAGATCTGGAAATTGAAAGTGATGGATACCTTTCC
AGATGCTTGGAAGGGAAGAAAGCAACGGATGTCAGACTTGCTGCCATTGCTGTTGGAACT
GGTGGCCACGGAGGGCTAGGCAAGCTTTTGATCCGTGGAAGCAATTCTAGTTGCAGGGTC
ACAAACCTTGGCCTTGGGGCAATTGCTCGTGGTTGTCCTTCTTTGAGGGTTCTGTCTCTA
TGGAATGTATCTTCAATTGCTGATGAAGGTCTGATTGAGATTGCTAATGGATGTCACCAA
TTAGAGAAGCTTGACCTTTGTGGGTGTCCCACAATTTCTGATAAGGCTTTGGTTGCAATT
GCAAAGAACTGCCATAATTTGACTGCTTTAACAATAGAGTCCTGCCCAAGAATTGGGAAT
GCGGGTTTGCAAGCTGTTGGCCAGTTCTGCCCCAATTTGAAGTCCATTTCAATCAAGAAC
TGCCCTCTTGTTGGGGATCAAGGAGTTGCAAGCTTGTTATCATCAGCCTCGTATGCCCTG
ACAAAGGTTAAGCTCCATGCTTTGAACATCACTGATGTGTCTCTTGCTGTGATTGGACAC
TATGGCAAAGCCATTACTGATCTAGACCTTACTGGCCTCCAAAACGTGGGCGAGAGGGGC
TTCTGGGTCATGGGTAGTGGTCATGGACTGCAGAAGCTGAAGTCCCTCACTGTTACATCC
TGCCAAGGTGTGACAGATATGGGACTTGAAGCTGTGGGAAAGGGTTGCCCAAATTTGAAA
CAGTTTTGCCTCCGAAAATGTGCATTCTTATCTGACAATGGCCTAGTCTCTCTAGCCAAA
GTTGCAGCTTCCCTTGAGAGTCTACAACTGGAGGAGTGCCACCACATTACCCAATATGGA
GTTTTTGGTGCACTTGTAAGCTGTGGGGGGAAGTTGAAATCCCTTGCTCTGGTGAACTGC
TTTGGGATTAAGGACACTGTTGAGGGATTGCCTCTAATGACTCCTTGCAAATCACTGAGC
TCCTTGTCCATCCGTAACTGCCCTGGATTTGGTAATGCTAGCTTGTGTATGGTGGGGAAG
CTGTGTCCTCAACTGCAGCGTTTGGACCTCAGTGGGGCTCTCAGAATAACAAATGCAGGG
TTTCTGCCACTGCTTGAGAGCTGTGAGGCTAGTCTGATAAAGGTTAATCTTAGCGGTTGC
ATGAATTTGACGGACAATGTGGTCTCAGCCTTGGCTAAGGTGCATGGTGGGACTCTTGAA
CAGCTGAATCTTGATGGTTGCCAGAAGATCACTGATGCCAGCATGTTTGCAATTGCAGAA
AACTGTGCATTGCTTTCAGATCTTGATGTTTCAAAGACTGCAATCACTGACTATGGCGTT
GCAGCTCTGGCTTCTGCAAAACATCTCAATGTGCAGATCCTCTCTCTGTCTGGTTGCTCT
TTGATATCAAACCAAAGTGTCCCATTCTTGCGAAAATTGGGTCAGACCCTGTTGGGGTTG
AACCTTCAGCAGTGCAATACAATCAGCAGCAGCATGGTTAACATGCTTGTGGAGCAGCTA
TGGAGGTGCGACATCCTTTTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_04s0008g05470.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:4:4918804:4922981:1 gene:VIT_04s0008g05470 transcript:VIT_04s0008g05470.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MSKLFDYTGNDAFCPGGSIYSNIKDSSLFLSLGRHVDVYFPPRKRSRISAPFVVSGDKFE
QKEQVSIDVLPDECLFEILRRLPEGQEKSACACVSKRWLMLLSSIQRDEICSNKTTGFLK
PKETLISRNTDESSEAKKKGGDEVTPEAVDLEIESDGYLSRCLEGKKATDVRLAAIAVGT
GGHGGLGKLLIRGSNSSCRVTNLGLGAIARGCPSLRVLSLWNVSSIADEGLIEIANGCHQ
LEKLDLCGCPTISDKALVAIAKNCHNLTALTIESCPRIGNAGLQAVGQFCPNLKSISIKN
CPLVGDQGVASLLSSASYALTKVKLHALNITDVSLAVIGHYGKAITDLDLTGLQNVGERG
FWVMGSGHGLQKLKSLTVTSCQGVTDMGLEAVGKGCPNLKQFCLRKCAFLSDNGLVSLAK
VAASLESLQLEECHHITQYGVFGALVSCGGKLKSLALVNCFGIKDTVEGLPLMTPCKSLS
SLSIRNCPGFGNASLCMVGKLCPQLQRLDLSGALRITNAGFLPLLESCEASLIKVNLSGC
MNLTDNVVSALAKVHGGTLEQLNLDGCQKITDASMFAIAENCALLSDLDVSKTAITDYGV
AALASAKHLNVQILSLSGCSLISNQSVPFLRKLGQTLLGLNLQQCNTISSSMVNMLVEQL
WRCDILF

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_04s0008g05470.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:4:4918804:4922981:1 gene:VIT_04s0008g05470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGACCTTTGAACCTCTGATTCTTCTCTTCGTACCCGTCTTCTTCTTTCTCTCCTGCCTT
TTTGCTCTTGATCGAGGGTTATTTGGCTCTGAACGCGTCCGATTTGACCTCCCGGGGTTC
CTTCACCTGCAACCATGTCAAAGCTCTTCGATTATACCGGAAATGATGCCTTCTGCCCCG
GGGGGTCAATATACTCAAACATCAAGGATTCCAGCCTCTTTTTGTCCCTTGGTCGCCATG
TGGATGTGTATTTCCCTCCTCGCAAGAGATCTCGCATCAGTGCCCCATTTGTTGTCAGCG
GAGACAAGTTTGAGCAGAAGGAGCAGGTCTCCATTGATGTTCTTCCTGATGAGTGTCTTT
TTGAGATCCTCAGACGGTTGCCTGAAGGCCAAGAGAAGAGTGCCTGTGCTTGTGTCTCCA
AGCGCTGGCTTATGCTTCTAAGCAGTATCCAGAGAGACGAGATCTGCAGTAACAAAACAA
CTGGGTTTTTGAAGCCTAAGGAAACTTTGATTTCAAGAAACACAGATGAGTCTTCTGAGG
CTAAAAAGAAGGGTGGTGATGAAGTGACACCTGAGGCTGTAGATCTGGAAATTGAAAGTG
ATGGATACCTTTCCAGATGCTTGGAAGGGAAGAAAGCAACGGATGTCAGACTTGCTGCCA
TTGCTGTTGGAACTGGTGGCCACGGAGGGCTAGGCAAGCTTTTGATCCGTGGAAGCAATT
CTAGTTGCAGGGTCACAAACCTTGGCCTTGGGGCAATTGCTCGTGGTTGTCCTTCTTTGA
GGGTTCTGTCTCTATGGAATGTATCTTCAATTGCTGATGAAGGTCTGATTGAGATTGCTA
ATGGATGTCACCAATTAGAGAAGCTTGACCTTTGTGGGTGTCCCACAATTTCTGATAAGG
CTTTGGTTGCAATTGCAAAGAACTGCCATAATTTGACTGCTTTAACAATAGAGTCCTGCC
CAAGAATTGGGAATGCGGGTTTGCAAGCTGTTGGCCAGTTCTGCCCCAATTTGAAGTCCA
TTTCAATCAAGAACTGCCCTCTTGTTGGGGATCAAGGAGTTGCAAGCTTGTTATCATCAG
CCTCGTATGCCCTGACAAAGGTTAAGCTCCATGCTTTGAACATCACTGATGTGTCTCTTG
CTGTGATTGGACACTATGGCAAAGCCATTACTGATCTAGACCTTACTGGCCTCCAAAACG
TGGGCGAGAGGGGCTTCTGGGTCATGGGTAGTGGTCATGGACTGCAGAAGCTGAAGTCCC
TCACTGTTACATCCTGCCAAGGTGTGACAGATATGGGACTTGAAGCTGTGGGAAAGGGTT
GCCCAAATTTGAAACAGTTTTGCCTCCGAAAATGTGCATTCTTATCTGACAATGGCCTAG
TCTCTCTAGCCAAAGTTGCAGCTTCCCTTGAGAGTCTACAACTGGAGGAGTGCCACCACA
TTACCCAATATGGAGTTTTTGGTGCACTTGTAAGCTGTGGGGGGAAGTTGAAATCCCTTG
CTCTGGTGAACTGCTTTGGGATTAAGGACACTGTTGAGGGATTGCCTCTAATGACTCCTT
GCAAATCACTGAGCTCCTTGTCCATCCGTAACTGCCCTGGATTTGGTAATGCTAGCTTGT
GTATGGTGGGGAAGCTGTGTCCTCAACTGCAGCGTTTGGACCTCAGTGGGGCTCTCAGAA
TAACAAATGCAGGGTTTCTGCCACTGCTTGAGAGCTGTGAGGCTAGTCTGATAAAGGTTA
ATCTTAGCGGTTGCATGAATTTGACGGACAATGTGGTCTCAGCCTTGGCTAAGGTGCATG
GTGGGACTCTTGAACAGCTGAATCTTGATGGTTGCCAGAAGATCACTGATGCCAGCATGT
TTGCAATTGCAGAAAACTGTGCATTGCTTTCAGATCTTGATGTTTCAAAGACTGCAATCA
CTGACTATGGCGTTGCAGCTCTGGCTTCTGCAAAACATCTCAATGTGCAGATCCTCTCTC
TGTCTGGTTGCTCTTTGATATCAAACCAAAGTGTCCCATTCTTGCGAAAATTGGGTCAGA
CCCTGTTGGGGTTGAACCTTCAGCAGTGCAATACAATCAGCAGCAGCATGGTTAACATGC
TTGTGGAGCAGCTATGGAGGTGCGACATCCTTTTCTAAGCAGGGAAGGAACAAAAGCCCC
CTTTCAGAATTAGGATGGTTAGATTCGCGAAGGAGGGTAATCAACTAATCAGGAAGTTTC
AGCATTCTAGTCAGCTTTCATGGTAGCAGCAGTTTGTGTAGTTTTTGGGTCCATCAGCTA
TGGGTCTTGTCAATCGGTAACCTGGCTTCTTTTTGCAGGGAGTATGGCCAATTCCTCCCC
TTTTTTTGCAGGTTTTCACCCAATGAAGATCTGTTGCAAGAGTTTTGGTCCCCAATGATG
GGTATCACATTCTTTGTGGCCATATTTCCCCGAGAATACAGTCGCCAGGTTATGGATTTG
TTTCCTATGTTCATGGTTTTGTGTTGCTGGGTATCGGTACCTGGTGTTTTAGCTTAGCTT
TTCGCTGGTCTTGCCAGTATGCTTCAACTAAGCTTTATACCCCTTTCAGTAAACTTTTGG
AGTCTGTCCACTGTAGGTTTTACAACCCTTCGCTTACTTGAGGGTTGGGTTGCTATTTTC
CTCATAGGGTGGGTTAAGATCTCGTAGTCAGTCAGTCACCTTTTGTTTGTGGTTGCTTTT
AGCAGTTCGAATTTTGGTGGCCTTTGTGTTCATGGGTTTTGGCTGTGGCAGCACTAGTCT
GCCATTACAACCCTCCTCTTTTTTGGGGAGGTTGTTTTTTCCCTTTTGTCAAACCCTAGT
TTTTCAGGCCTCTCATCTTTCCTTCAACTGTACTCCGCAACCTCTTTATTATGTAATGAA
ATTCACATCTCTTTTGTGTTGTATGCTTC