Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g05220.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:4723790:4732570:1 gene:VIT_04s0008g05220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H311]
Sequence	ATGGAAGCAAATGCGGGGATGGTTGCTGGATCGCACAAGAGGAACGAGCTTGTTCGGATT CGCCATGATTCTGATAGTGGGCCAAAGCCCCTGAAGCATTTGAATGGCCAAATATGCCAG ATTTGTGGAGATACTGTTGGCCTTACAGCCGCTGGTGATGTCTTTGTTGCTTGCAATGAG TGTGCCTTCCCAGTTTGTCGGCCTTGTTATGAGTATGAGCGCAAAGATGGAAACCAGTCT TGTCCCCAGTGCAAGACTAGATATAAGAGACACAAAGGGAGCCCTCGAGTTGAAGGAGAT GATGAAGAGGATGATGTTGATGATATAGAAAATGAGTTCAATTATGCCCAAGGAAATAGC AAAGCAAGACGCCAGTGGCAGGGAGAAGATGCTGACCTTTCCTCTTCCTCCAGACATGAG TCTCAACAACCTATTCCCCTTCTCACCAATGGGCAGCCACTGTCTGGAGAAATTCCCAGT GGTACACCTGACAATCAATCTGTGCGAACCACGTCTGGTCCTTTGGGCCCTGGCGAAAAG CATGTGCATTCACTGCCTTATGTTGATCCCAGGCAGCCAGTTCCCGTGAGAATTGTGGAC CCTTCAAAGGACTTGAATTCTTATGGCCTGGGTAATGTCGACTGGAAGGAAAGGGTTGAA GGTTGGAAACTCAAACAGGAGAAAAATATGATGCAGGTGACTAGCAGATACCCTGAAGGG AAGGGAGATTTAGAGGGCACTGGTTCAAATGGAGAGGAATTGCAAATGGCTGATGATGCT CGTCAACCTTTGAGTCGAGTGGTGCCTATTCCATCATCTCACCTTACGCCTTATCGTGTT GTGATCATACTTCGACTTATAATCTTGGGCTTTTTCTTACAATATCGTACAACTCACCCT GTAAAAGATGCATATCCTTTGTGGTTAACATCTGTTATCTGTGAGATTTGGTTTGCCTTA TCATGGCTGTTGGATCAGTTCCCAAAATGGTATCCAATTAATCGTGAGACCTTCCTTGAA AGGCTTGCATTGAGATATGATCGTGAAGGGGAACCTTCACAGCTGGCTCCTATAGATGTA TTTGTTAGTACGGTGGATCCTCTCAAAGAGCCTCCTCTTGTAACAGCTAACACTGTGCTG TCCATTCTTGCTGTGGATTACCCTGTCGACAAAGTCTCTTGCTATGTTTCAGATGATGGG TCTGCAATGTTGACCTTTGAAGCCCTTTCTGAAACTTCTGAATTTGCAAGGAAGTGGGTT CCCTTCTGCAAGAAGCACAACATCGAGCCTAGGGCCCCTGAGTTTTATTTTGCCCAAAAG ATCGATTACTTGAAGGACAAGATACAGCCTTCTTTTGTGAAAGAGCGCAGGGCTATGAAG AGAGAATATGAAGAGTTTAAGATACGAATCAATGCACTTGTTGCTAAAGCACAGAAGACG CCAGAAGAAGGTTGGACAATGCAGGATGGCACTCCTTGGCCTGGAAATAACCCTAGGGAT CATCCAGGAATGATTCAGGTGTTCTTAGGCCACAGTGGGGGTCTTGACACAGATGGAAAT GAGCTGCCCAGACTAGTTTATGTTTCTCGTGAGAAAAGGCCGGGCTTCCAGCATCATAAG AAAGCTGGAGCAATGAATGCTTTGATTCGAGTTTCAGCTGTCTTGACCAATGGTGCTTAT CTCTTGAATGTCGATTGTGATCACTACTTCAATAACAGCAAAGCTCTTAAAGAAGCCATG TGTTTCATGATGGATCCAGCTTTTGGAAAGAAAACCTGTTATGTACAATTCCCACAGCGG TTTGATGGCATTGATTTGCATGATCGATATGCTAATCGTAATATTGTCTTCTTTGATATC AACTTGAAAGGGCTGGATGGCGTCCAGGGGCCAGTCTATGTGGGAACAGGATGTTGTTTC AACAGGCAAGCGCTATATGGATATGATCCAGTGTTAACTGAGGCAGATTTGGAGCCAAAT ATTATTGTAAAGAGTTGTTGTGGTTCAAGAAAGAAGGGACGGGGTGGCAACAAGAAATAC ATTGATAAGAAGAGGCAAGTGAAAAGAACTGAATCAACCATCCCTATTTTCAATATGGAA GACATTGAAGAGGGTGTTGAAGGATATGATGATGAGAAGTCACTTCTTATGTCTCAGAAA AGCTTAGAGAAGCGATTTGGTCAGTCCCCTGTTTTTATTGCAGCCACCTTCATGGAACAG GGTGGCATTCCTCCATCAACTAATCCTGCAACCCTTTTAAAAGAGGCAATCCATGTTATT AGCTGTGGATATGAAGACAAGACTGACTGGGGCAAAGAGATTGGATGGATTTATGGTTCT GTGACTGAAGATATTTTGACTGGGTTTAAGATGCATGCACGAGGTTGGATTTCAATATAT TGCATGCCACCCCGCCCAGCATTTAAGGGGTCTGCTCCCATCAATCTTTCTGATCGTTTG AATCAGGTTCTTCGATGGGCCTTGGGATCTATTGAGATCCTGCTGAGCAGGCATTGCCCC ATATGGTATGGCTACAATGGGAGGCTCAAGCTCTTGGAGAGACTGGCATACATCAATACC ATTGTTTATCCTCTCACTTCTATCCCCCTGATTGCTTACTGTGTCCTTCCTGCTATTTGC CTTCTAACAGGGAAATTCATCATTCCTGAGATAAGTAACTTTGCTAGCATGTGGTTTATT CTCCTCTTTGTCTCCATTTTCGCTACTGGAATACTTGAGCTTAGATGGAGTGGTGTCAGT ATTGAAGACTGGTGGAGAAACGAGCAGTTCTGGGTCATTGGTGGTACATCAGCCCATCTC TTTGCCGTCTTCCAAGGGCTGTTGAAAGTGCTTGCTGGGATTGACACCAACTTCACTGTC ACTTCAAAGGCATCTGATGATGATGGGGACTTTGCAGAGCTCTATGTGTTCAAATGGACA TCTCTCCTCATCCCACCAACAACTGTGCTTGTCGTCAACTTGGTAGGCATTGTGGCTGGA GTTTCATATGCCATAAACAGCGGGTATCAGTCATGGGGGCCGCTTTTTGGAAAGCTCTTC TTCGCCATATGGGTGATTGTCCATCTTTACCCCTTCCTAAAGGGTTTGTTGGGTCGCCAA AATCGTACCCCCACAATTGTTATTGTCTGGTCCATTCTCCTTGCTTCCATCTTCTCCTTG CTGTGGGTGCGGATCGACCCTTTCACCAGCAGCTCCACAAAAGCCGCATCAGGTCAATGT GGCATCAACTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g05220.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:4723790:4732570:1 gene:VIT_04s0008g05220 transcript:VIT_04s0008g05220.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H311]
Sequence	MEANAGMVAGSHKRNELVRIRHDSDSGPKPLKHLNGQICQICGDTVGLTAAGDVFVACNE CAFPVCRPCYEYERKDGNQSCPQCKTRYKRHKGSPRVEGDDEEDDVDDIENEFNYAQGNS KARRQWQGEDADLSSSSRHESQQPIPLLTNGQPLSGEIPSGTPDNQSVRTTSGPLGPGEK HVHSLPYVDPRQPVPVRIVDPSKDLNSYGLGNVDWKERVEGWKLKQEKNMMQVTSRYPEG KGDLEGTGSNGEELQMADDARQPLSRVVPIPSSHLTPYRVVIILRLIILGFFLQYRTTHP VKDAYPLWLTSVICEIWFALSWLLDQFPKWYPINRETFLERLALRYDREGEPSQLAPIDV FVSTVDPLKEPPLVTANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGSAMLTFEALSETSEFARKWV PFCKKHNIEPRAPEFYFAQKIDYLKDKIQPSFVKERRAMKREYEEFKIRINALVAKAQKT PEEGWTMQDGTPWPGNNPRDHPGMIQVFLGHSGGLDTDGNELPRLVYVSREKRPGFQHHK KAGAMNALIRVSAVLTNGAYLLNVDCDHYFNNSKALKEAMCFMMDPAFGKKTCYVQFPQR FDGIDLHDRYANRNIVFFDINLKGLDGVQGPVYVGTGCCFNRQALYGYDPVLTEADLEPN IIVKSCCGSRKKGRGGNKKYIDKKRQVKRTESTIPIFNMEDIEEGVEGYDDEKSLLMSQK SLEKRFGQSPVFIAATFMEQGGIPPSTNPATLLKEAIHVISCGYEDKTDWGKEIGWIYGS VTEDILTGFKMHARGWISIYCMPPRPAFKGSAPINLSDRLNQVLRWALGSIEILLSRHCP IWYGYNGRLKLLERLAYINTIVYPLTSIPLIAYCVLPAICLLTGKFIIPEISNFASMWFI LLFVSIFATGILELRWSGVSIEDWWRNEQFWVIGGTSAHLFAVFQGLLKVLAGIDTNFTV TSKASDDDGDFAELYVFKWTSLLIPPTTVLVVNLVGIVAGVSYAINSGYQSWGPLFGKLF FAIWVIVHLYPFLKGLLGRQNRTPTIVIVWSILLASIFSLLWVRIDPFTSSSTKAASGQC GINC

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g05220.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:4723790:4732570:1 gene:VIT_04s0008g05220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H311]
Sequence	AGAGAGATGGAGTTCTGATTGGGTGAAAGAATCAGAGTCTCCGCACGACCCCCTTCACAT TCCTCTCCAAATCTTCTCACCGATTGATCTCAAAACCTACACACACACCCATTTCATGTA TTCGTAGATCTCTCTTGTGCATTTCCGAGGATTTAGACCATAGTTTAAGGAAACGGAGGA ATCCCCATCATGGAAGCAAATGCGGGGATGGTTGCTGGATCGCACAAGAGGAACGAGCTT GTTCGGATTCGCCATGATTCTGATAGTGGGCCAAAGCCCCTGAAGCATTTGAATGGCCAA ATATGCCAGATTTGTGGAGATACTGTTGGCCTTACAGCCGCTGGTGATGTCTTTGTTGCT TGCAATGAGTGTGCCTTCCCAGTTTGTCGGCCTTGTTATGAGTATGAGCGCAAAGATGGA AACCAGTCTTGTCCCCAGTGCAAGACTAGATATAAGAGACACAAAGGGAGCCCTCGAGTT GAAGGAGATGATGAAGAGGATGATGTTGATGATATAGAAAATGAGTTCAATTATGCCCAA GGAAATAGCAAAGCAAGACGCCAGTGGCAGGGAGAAGATGCTGACCTTTCCTCTTCCTCC AGACATGAGTCTCAACAACCTATTCCCCTTCTCACCAATGGGCAGCCACTGTCTGGAGAA ATTCCCAGTGGTACACCTGACAATCAATCTGTGCGAACCACGTCTGGTCCTTTGGGCCCT GGCGAAAAGCATGTGCATTCACTGCCTTATGTTGATCCCAGGCAGCCAGTTCCCGTGAGA ATTGTGGACCCTTCAAAGGACTTGAATTCTTATGGCCTGGGTAATGTCGACTGGAAGGAA AGGGTTGAAGGTTGGAAACTCAAACAGGAGAAAAATATGATGCAGGTGACTAGCAGATAC CCTGAAGGGAAGGGAGATTTAGAGGGCACTGGTTCAAATGGAGAGGAATTGCAAATGGCT GATGATGCTCGTCAACCTTTGAGTCGAGTGGTGCCTATTCCATCATCTCACCTTACGCCT TATCGTGTTGTGATCATACTTCGACTTATAATCTTGGGCTTTTTCTTACAATATCGTACA ACTCACCCTGTAAAAGATGCATATCCTTTGTGGTTAACATCTGTTATCTGTGAGATTTGG TTTGCCTTATCATGGCTGTTGGATCAGTTCCCAAAATGGTATCCAATTAATCGTGAGACC TTCCTTGAAAGGCTTGCATTGAGATATGATCGTGAAGGGGAACCTTCACAGCTGGCTCCT ATAGATGTATTTGTTAGTACGGTGGATCCTCTCAAAGAGCCTCCTCTTGTAACAGCTAAC ACTGTGCTGTCCATTCTTGCTGTGGATTACCCTGTCGACAAAGTCTCTTGCTATGTTTCA GATGATGGGTCTGCAATGTTGACCTTTGAAGCCCTTTCTGAAACTTCTGAATTTGCAAGG AAGTGGGTTCCCTTCTGCAAGAAGCACAACATCGAGCCTAGGGCCCCTGAGTTTTATTTT GCCCAAAAGATCGATTACTTGAAGGACAAGATACAGCCTTCTTTTGTGAAAGAGCGCAGG GCTATGAAGAGAGAATATGAAGAGTTTAAGATACGAATCAATGCACTTGTTGCTAAAGCA CAGAAGACGCCAGAAGAAGGTTGGACAATGCAGGATGGCACTCCTTGGCCTGGAAATAAC CCTAGGGATCATCCAGGAATGATTCAGGTGTTCTTAGGCCACAGTGGGGGTCTTGACACA GATGGAAATGAGCTGCCCAGACTAGTTTATGTTTCTCGTGAGAAAAGGCCGGGCTTCCAG CATCATAAGAAAGCTGGAGCAATGAATGCTTTGATTCGAGTTTCAGCTGTCTTGACCAAT GGTGCTTATCTCTTGAATGTCGATTGTGATCACTACTTCAATAACAGCAAAGCTCTTAAA GAAGCCATGTGTTTCATGATGGATCCAGCTTTTGGAAAGAAAACCTGTTATGTACAATTC CCACAGCGGTTTGATGGCATTGATTTGCATGATCGATATGCTAATCGTAATATTGTCTTC TTTGATATCAACTTGAAAGGGCTGGATGGCGTCCAGGGGCCAGTCTATGTGGGAACAGGA TGTTGTTTCAACAGGCAAGCGCTATATGGATATGATCCAGTGTTAACTGAGGCAGATTTG GAGCCAAATATTATTGTAAAGAGTTGTTGTGGTTCAAGAAAGAAGGGACGGGGTGGCAAC AAGAAATACATTGATAAGAAGAGGCAAGTGAAAAGAACTGAATCAACCATCCCTATTTTC AATATGGAAGACATTGAAGAGGGTGTTGAAGGATATGATGATGAGAAGTCACTTCTTATG TCTCAGAAAAGCTTAGAGAAGCGATTTGGTCAGTCCCCTGTTTTTATTGCAGCCACCTTC ATGGAACAGGGTGGCATTCCTCCATCAACTAATCCTGCAACCCTTTTAAAAGAGGCAATC CATGTTATTAGCTGTGGATATGAAGACAAGACTGACTGGGGCAAAGAGATTGGATGGATT TATGGTTCTGTGACTGAAGATATTTTGACTGGGTTTAAGATGCATGCACGAGGTTGGATT TCAATATATTGCATGCCACCCCGCCCAGCATTTAAGGGGTCTGCTCCCATCAATCTTTCT GATCGTTTGAATCAGGTTCTTCGATGGGCCTTGGGATCTATTGAGATCCTGCTGAGCAGG CATTGCCCCATATGGTATGGCTACAATGGGAGGCTCAAGCTCTTGGAGAGACTGGCATAC ATCAATACCATTGTTTATCCTCTCACTTCTATCCCCCTGATTGCTTACTGTGTCCTTCCT GCTATTTGCCTTCTAACAGGGAAATTCATCATTCCTGAGATAAGTAACTTTGCTAGCATG TGGTTTATTCTCCTCTTTGTCTCCATTTTCGCTACTGGAATACTTGAGCTTAGATGGAGT GGTGTCAGTATTGAAGACTGGTGGAGAAACGAGCAGTTCTGGGTCATTGGTGGTACATCA GCCCATCTCTTTGCCGTCTTCCAAGGGCTGTTGAAAGTGCTTGCTGGGATTGACACCAAC TTCACTGTCACTTCAAAGGCATCTGATGATGATGGGGACTTTGCAGAGCTCTATGTGTTC AAATGGACATCTCTCCTCATCCCACCAACAACTGTGCTTGTCGTCAACTTGGTAGGCATT GTGGCTGGAGTTTCATATGCCATAAACAGCGGGTATCAGTCATGGGGGCCGCTTTTTGGA AAGCTCTTCTTCGCCATATGGGTGATTGTCCATCTTTACCCCTTCCTAAAGGGTTTGTTG GGTCGCCAAAATCGTACCCCCACAATTGTTATTGTCTGGTCCATTCTCCTTGCTTCCATC TTCTCCTTGCTGTGGGTGCGGATCGACCCTTTCACCAGCAGCTCCACAAAAGCCGCATCA GGTCAATGTGGCATCAACTGCTAGGTCTTTTTTGGATGGAATTGTTTTGCTGCAAGTGAA CAAACCCCTTCTCCGTCTATGTCTGTCTCTCTCCATGTGCTGTGTAAATAAGAAGCTGTT GAGATAATTAAGTTGTATGCAAGATCTAAGTTATACTGTATTATCTATTTTATTTTCTGA AAGGGGGAGTTTGATGGATGGATGGATGCATGTGAAAGAAGCCATTTGTATCTCCTTCTT GCCTTGTTTCCTTTTGGAGATTTCTCCTCTCAAAGTGTTTGTGTTGGGTCTGTGCTGGAA TAGGTGTCTCAAAAGGCTTTATTGTGTAGTGTTATGATGAATTTTTTTTTGTCAAGAACT TAATA