Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g05080.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:4560587:4563013:1 gene:VIT_04s0008g05080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Ammonium transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H3U2]
Sequence	ATGGCTGATACTTCTTTTCCTCCCAACTTACTGCCCGACGAGGCGAGCCCTGAATGGATG AACAAAGGCGACAATGCCTGGCAACTCACTGCCGCCACTCTCGTCGGTCTCCAGACTGTT CCGGGGCTGATCATCCTTTATGGAGGTGCAGTGAAGAAGAAATGGGCTGTGAATTCAGCT TTCATGGCGTTCTACGCCTTCGCCTGTGTCCTTATCTGCTGGGTGGGGTGGGGATATAGA ATGTCGTTTGGGACGAAGCTTGTTCCATTTTGGGGGAGGGCTAATGTTGCCTTGGACCAA GTTTATCTCCTGGACCCGGCCTTTATTGGGAAGTTCCCACAGGCGACGATGGTGTTTTTT CAATTCGTTTTTGCAGCGATCACTGTGGTTTTGATTGCGGGAGCCTTGTTGGGGCGGATG AATTTTTACGCGTGGATGTTGTTTGTGCCCTTGTGGCTGACGTTTTCGTACACCTTTGTA GCATTTAGTATATGGTGTCCATCAGGTTTTCTCGCTAAGGCTGGGATTATAGACTACTCT GGTGGATATGTGATCCATTTGTCTTCTGGGGTTGCTGGCTTCACTGCAGCATATTGGGTT GGTCCTCGGCTAACCAAGGACAGAGAAAGGTTCCCTCCTAACAACATCCTTCTTATGATG GCTGGGGCAGGATTGCTGTGGATGGGTTGGACAGGGTTCAATGGTGGGGATCCTTATGTA GTGAGTGTCGATGCTTCGTTGGCCGTTTTGAACACGCATGTGTGCACTGCCACTAGCCTG CTCACATGGCTAATCCTCGACATTGCGGTCTTTGGAAAAGCTTCTATAATTGGTGCAGTG CAAGGCATGATCACTGGCTTGGTTTGCATCACACCTGCAGCTGGGGTTGTACAAGGATGG GCAGCCATAATCATGGGGATTTTCTCAGGCTCCATTCCCTGGTTCACCATGATGGTTGTC CACAAAAAATCTGAGCTCCTTCAGAAAGTGGACGACACAATGGCTGTTCTGCATACTCAC GCCATTGCTGGAAGCCTCGGAGGAATCCTGACCGGTCTATTTGCTTCCCCAAAGCTTAAC CGTTTGTTCTATGGCTACGGAGGATTCAGGCAAATTGGAATTCAGCTTCTGGGGATTGTG TTTGTGCTTGTGTTTAACGTCATAGCCACAAGCCTAATATGTCTTGTGGTGCAACTCATC GTGCCCCTGAGAATGTCTGATGAAGATATGGAGATTGGGGATGAAGCAGCTCATGGGGAG GAGGCCTATGCTATCTGGGGTCAAGGTGACAAGCTTGAGAACTCAAGGTATGGGAGTTCA GTCTACGGTGATGTTGAATTGCCTATGCCCAAGCCCAGGGGAGCTGGCCAAGTTGAGATG ACATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g05080.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:4560587:4563013:1 gene:VIT_04s0008g05080 transcript:VIT_04s0008g05080.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Ammonium transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H3U2]
Sequence	MADTSFPPNLLPDEASPEWMNKGDNAWQLTAATLVGLQTVPGLIILYGGAVKKKWAVNSA FMAFYAFACVLICWVGWGYRMSFGTKLVPFWGRANVALDQVYLLDPAFIGKFPQATMVFF QFVFAAITVVLIAGALLGRMNFYAWMLFVPLWLTFSYTFVAFSIWCPSGFLAKAGIIDYS GGYVIHLSSGVAGFTAAYWVGPRLTKDRERFPPNNILLMMAGAGLLWMGWTGFNGGDPYV VSVDASLAVLNTHVCTATSLLTWLILDIAVFGKASIIGAVQGMITGLVCITPAAGVVQGW AAIIMGIFSGSIPWFTMMVVHKKSELLQKVDDTMAVLHTHAIAGSLGGILTGLFASPKLN RLFYGYGGFRQIGIQLLGIVFVLVFNVIATSLICLVVQLIVPLRMSDEDMEIGDEAAHGE EAYAIWGQGDKLENSRYGSSVYGDVELPMPKPRGAGQVEMT

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g05080.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:4560587:4563013:1 gene:VIT_04s0008g05080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Ammonium transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H3U2]
Sequence	ATGGCTGATACTTCTTTTCCTCCCAACTTACTGCCCGACGAGGCGAGCCCTGAATGGATG AACAAAGGCGACAATGCCTGGCAACTCACTGCCGCCACTCTCGTCGGTCTCCAGACTGTT CCGGGGCTGATCATCCTTTATGGAGGTGCAGTGAAGAAGAAATGGGCTGTGAATTCAGCT TTCATGGCGTTCTACGCCTTCGCCTGTGTCCTTATCTGCTGGGTGGGGTGGGGATATAGA ATGTCGTTTGGGACGAAGCTTGTTCCATTTTGGGGGAGGGCTAATGTTGCCTTGGACCAA GTTTATCTCCTGGACCCGGCCTTTATTGGGAAGTTCCCACAGGCGACGATGGTGTTTTTT CAATTCGTTTTTGCAGCGATCACTGTGGTTTTGATTGCGGGAGCCTTGTTGGGGCGGATG AATTTTTACGCGTGGATGTTGTTTGTGCCCTTGTGGCTGACGTTTTCGTACACCTTTGTA GCATTTAGTATATGGTGTCCATCAGGTTTTCTCGCTAAGGCTGGGATTATAGACTACTCT GGTGGATATGTGATCCATTTGTCTTCTGGGGTTGCTGGCTTCACTGCAGCATATTGGGTT GGTCCTCGGCTAACCAAGGACAGAGAAAGGTTCCCTCCTAACAACATCCTTCTTATGATG GCTGGGGCAGGATTGCTGTGGATGGGTTGGACAGGGTTCAATGGTGGGGATCCTTATGTA GTGAGTGTCGATGCTTCGTTGGCCGTTTTGAACACGCATGTGTGCACTGCCACTAGCCTG CTCACATGGCTAATCCTCGACATTGCGGTCTTTGGAAAAGCTTCTATAATTGGTGCAGTG CAAGGCATGATCACTGGCTTGGTTTGCATCACACCTGCAGCTGGGGTTGTACAAGGATGG GCAGCCATAATCATGGGGATTTTCTCAGGCTCCATTCCCTGGTTCACCATGATGGTTGTC CACAAAAAATCTGAGCTCCTTCAGAAAGTGGACGACACAATGGCTGTTCTGCATACTCAC GCCATTGCTGGAAGCCTCGGAGGAATCCTGACCGGTCTATTTGCTTCCCCAAAGCTTAAC CGTTTGTTCTATGGCTACGGAGGATTCAGGCAAATTGGAATTCAGCTTCTGGGGATTGTG TTTGTGCTTGTGTTTAACGTCATAGCCACAAGCCTAATATGTCTTGTGGTGCAACTCATC GTGCCCCTGAGAATGTCTGATGAAGATATGGAGATTGGGGATGAAGCAGCTCATGGGGAG GAGGCCTATGCTATCTGGGGTCAAGGTGACAAGCTTGAGAACTCAAGGTATGGGAGTTCA GTCTACGGTGATGTTGAATTGCCTATGCCCAAGCCCAGGGGAGCTGGCCAAGTTGAGATG ACATGAGACATGAGAATGTGTTCCAGGTTTTCGGAAATTGGCAGACTTGATCGATTCAAT AAGAGCCCTTAAAGTAACTTCTGTATCTGTGATGTTGCCAAATCAATTGATTGAACTCTG TTTACTTCTTTCTGTTTGTGCTAAGAACTTGCATGAATCCTATTTATATGTTCTTTCTTT GTAGCCTTGTTCTTGAATGAAG